• МИНДУБАЕВ А.З., ЧАПОРГИНА А.А., МЯЗИН В.А., БАБЫНИН Э.В., БАЛЫМОВА Е.С.Культурально-морфологические и биохимические особенности штаммов Aspergillus niger в условиях роста на среде с трибутилфосфатом // Микология и фитопатология. – 2025. – Т. 59, № 1. – С. 63-73. – DOI 10.31857/S0026364825010089
• Дубровная С.А. Состояние ценопопуляций Bupleurum aureum (Apiaceae) в Республике Татарстан / С.А. Дубровная, Л.З. Хуснетдинова, Э.В. Бабынин, Л.В. Рыжова, О.А. Тимофеева // Растительные ресурсы. – 2025. – Том 61, вып. 4. – С. 91–109.
• Гусманова Ю.Р. Биоинформатическое предсказание плазмид штамма Stutzerimonas stutzeri DIA-8 и их верификация методом секвенирования / Гусманова Ю.Р., Бабынин Э.В. // Сборник тезисов 28-й Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА. - Пущино: ФИЦ ПНЦБИ РАН. - 2025. - с. 34.

• Гусманова Ю.Р. Гены денитрификации в геноме штамма Stutzerimonas stutzeri / Ю.Р. Гусманова, Э.В. Бабынин, И. А. Дегтярева // Сборник тезисов 27-й Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием Биология - наука XXI века. Пущино: ФИЦ ПНЦБИ РАН. - 2024. - С. 25.
• Бабынин Э.В. Геномное разнообразие генов катехолдиоксигеназ у штаммов Stutzerimonas stutzeri / Э.В. Бабынин, Ю.Р. Гусманова, И.А. Дегтярева // Международный Конгресс VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300‐летию российской науки и высшей школы: сборник тезисов. - Издательский дом Петрополис, Санкт‐Петербург, 2024. - С. 545.
• Dubrovnaya S., Makeeva M., Babynin E., Khusnetdinova L., Timofeeva O. Creation of GIS-maps for information structuring and an integrated approach in the use of resource species of forest ecosystems // BIO Web of Conferences. – 2024. – 145, 04002.
  F_bioconf_ForestryForum2024_04002.pdf
• Гусманова Ю.Р. Идентификация и характеристика плазмиды из штамма Stutzerimonas stutzeri DIA-8 биоинформатическими методами / Гусманова Ю.Р., Бабынин Э.В. // Материалы IX Молодежной школы-конференции по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН, С.-Петербург, 15-18 октября 2024 г. - СПб. : Астерион, 2024. - 332 с. - DOI: 10.53115/9785001885320
• История биологии [Электронный ресурс] : кафедра биологического образования / Ярмиев И.З., Дубровная С.А.,Мавлюдова Л.У, Камахина Р.С., Ахмадиева З.Ш., Яковенко Т.В., Харитонова М.А., Бабынин Э.В., Хайрутдинов И.З., Надеева Г.В., Садыков А.М. - К. : КФУ, 2024. - Режим доступа: https://edu.kpfu.ru/course/view.php?id=6839 - 26.11.2024
• Бабынин Э.В. Геномное разнообразие генов катехолдиоксигеназ у штаммов Stutzerimonas stutzeri / Э.В. Бабынин, Ю.Р. Гусманова, И.А. Дегтярева // Международный Конгресс VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300‐летию российской науки и высшей школы: сборник тезисов. - Издательский дом Петрополис, Санкт‐Петербург, 2024. - С. 545.

• Бабынин Э.В., Дубровная С.А. Каюмов А.Р. Влияние экологических факторов на генетический полиморфизм в природных популяциях Fragaria vesca / Э.В.Бабынин, С.А.Дубровная, А.Р. Каюмов // Теоретическая и прикладная экология. 2023. № 3. С. 171–178. doi: 10.25750/1995-4301-2023-3-171-178
• Пренатальная диагностика хромосомных болезней: учебно-методическое пособие/Л.Р. Самойлова,Э.В.Бабынин.-Казань:Издательство Казанского университета, 2023.-70 с.
• Гусманова Ю.Р. Обнаружение генов биодеградации углеводородов у почвенных микроорганизмов с помощью ПЦР / Ю.Р. Гусманова, Э.В. Бабынин, И.А. Дегтярева // Актуальные проблемы природопользования и природообустройства: сборник статей VI Международной научно-практической конференции. - 2023. - С. 92-96.
• Гусманова Ю.Р. Синергизм новых галогенированных фуранонов с антибиотиками для штаммов с различным профилем антибиотикорезистентности / Ю.Р. Гусманова, Э.В. Бабынин // Актуальные проблемы биологии и экологии: материалы докладов XXX Всероссийской молодежной научной конференции. – 2023. – С. 204-208.
• Гусманова Ю.Р. Обнаружение генов биодеградации углеводородов у почвенных микроорганизмов с помощью ПЦР / Ю.Р. Гусманова, Э.В. Бабынин, И.А. Дегтярева // Актуальные проблемы природопользования и природообустройства: сборник статей VI Международной научно-практической конференции. – 2023. – С. 92-96.

• Рекультивация нарушенных почв : монография / Е.А. Прищепенко, И.А. Дегтярева, Г.Ф. Рахманова, В.В. Ревенко, Э.В. Бабынин ; Татарский научно-исследовательский институт агрохимии и почвоведения - обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Казанский научный центр Российской академии наук«Казань : Логос-Пресс, 2022-251 с. : табл.ISBN 978-5-00205-026-0
• Мутационный процесс Дисциплина: Данная учебная дисциплина включена в раздел «ФТД.Б.1 Факультативные дисциплины« основной профессиональной образовательной программы 06.03.01 «Биология (не предусмотрено)« и относится к базовой (общепрофессиональной) части.

• Mindubaev A.Z. Effect of White Phosphorus on the Survival, Cellular Morphology, and Proteome of Aspergillus niger / A.Z. Mindubaev, S.V. Kuznetsova, V.G. Evtyugin, A.G. Daminova, T.V. Grigoryeva, Y.D. Romanova, V.A. Romanova, V.M. Babaev, D.N. Buzyurova, E.V. Babynin, E.K. Badeeva, S.T. Minzanova, L.G. Mironova // Applied Biochemistry and Microbiology. - 2020. - Vol.56, Is.2. - P.194-201.
• Миндубаев, А.З. Биодеградация элементного фосфора и фосфорных соединений / А.З. Миндубаев, Э.В. Бабынин, Е.К. Бадеева, С.Т. Минзанова, И.С. Низамов // Экология родного края: проблемы и пути их решения: материалы XV Всероссийской с международным участием научно-практической конференции. Книга 2. Киров: ВятГУ, 2020. C. 12-16.
• Миндубаев, А.З. Биодеградация элементного фосфора и фосфорных соединений культурами Aspergillus niger / А.З. Миндубаев, Э.В. Бабынин, Е.К. Бадеева, И.С. Низамов, С.Т. Минзанова, Л.Г. Миронова / Теоретические и прикладные аспекты естественнонаучного образования: материалы Всероссийской научно-практической конференции. Чебоксары: Чуваш. гос. пед. ун-т, 2020. C. 169-174.
• Миндубаев, А.З. Биодеградация ряда соединений фосфора культурами Aspergillus niger / А.З. Миндубаев, Э.В. Бабынин, Е.К. Бадеева, И.С. Низамов, С.Т. Минзанова, Л.Г. Миронова // Культура. Наука. Производство. 2020. № 5. С. 37-44.

• Миндубаев А.З., Бабынин Э.В., Бадеева Е.К., Пискунов Д.Б., Махиянов А.Н., Минзанова С.Т., Миронова Л.Г., Волошина А.Д. Генотоксичность и цитогенетическое действие белого фосфора // Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология. 2019. Т. 9, N 1. С. 81–94. DOI: 10.21285/2227- 2925-2019-9-1-81-94.
• Дегтярева И.А., Бабынин Э.В., Мотина Т.Ю., Давлетшина А.Я., Яппаров И.А. Оценка мутагенных и антимутагенных свойств наноструктурного фосфорита – компонента комплексного удобрения // Агрохимический вестник. – Москва, 2019. – №1 – С. 41-45.
• Акосах Й.А., Миндубаев А.З., Бабынин Э.В., Бадеева Е.К., Минзанова С.Т. Влияние на биодеградацию белого фосфора состава культуральных сред. 23-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых ?БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА?. г. Пущино. С. 196., 5-19 апреля 2019.
• Миндубаев А.З., Бабынин Э.В., Волошина А.Д., Хаяров Х.Р., Бадеева Е.К., Минзанова С.Т., Миронова Л.Г., Акосах Й.А. Обоснование метода биологической очистки природных сред от загрязнения белым фосфором // Научные ведомости Белгородского государственного университета. Серия: Естественные науки. 2019. Т. 43, No1. С. 87?97. doi: 10.18413/2075-4671- 2019-43-1-87-97
• Миндубаев, А.З. Биодеградация соединений фосфора культурой черного аспергилла / А.З. Миндубаев, Э.В. Бабынин, Е.К. Бадеева, С.Т. Минзанова, Л.Г. Миронова, И.С. Низамов, Н.Р. Хасиятуллина, Л.М. Пирут, Е.Е. Барская, Й.А. Акосах // Бутлеровские сообщения. – 2019. – Т. 60. – № 12. – С. 1-24.
• Бабынин Э.В., Дубровная С.А. Хамидуллин И.И. ВЛИЯНИЕ ВЫРУБКИ ЛЕСА НА ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ЦЕНОПОПУЛЯЦИЙ FRAGARIA VESCA L. / В сборнике тезисов Международного Конгресса «VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 100-летию кафедры генетики СПбГУ, и ассоциированные симпозиумы» (18-22 июня 2019 г., Санкт-Петербург, Россия) - 1041 с.
• Миндубаев А.З., Бабынин Э.В., Волошина А.Д., Бадеева Е.К., Минзанова С.Т., Миронова Л.Г., Акосах Й.А. Влияние меди на устойчивость штаммов черного Аспергилла к белому фосфору // Биомика. 2019.Т.11(1). С. 7 – 13.
• Сибиева Л.М., Дегтярева И.А., Сироткин А.С., Бабынин Э.В. Состав микробного сообщества активного ила в процессах совместной биологической и реагентной очистки сточных вод // Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология. – 2019. – Том 9, №2 – С. 302-312.
• Миндубаев А. З. , Бабынин Э. В., Бадеева Е. К., Минзанова С. Т. , Миронова Л. Г. , Акосах Й. А. Влияние состава культуральных сред на биодеградацию белого фосфора грибами Aspergillus niger //Бутлеровские сообщения. 2019. Т.58. №5. C. 1-23.

• Костенко В.В. Возрастные изменения локомоторного и полового поведения на модели Drosophila melanogaster / В.В. Костенко, Ю.А. Емелина, Э.В. Бабынин // Обзоры по клинической фармакологии и лекарственной терапии. - 2018. - Т.16 - СВ №1 - с.76
• Акосах Й.А., Миндубаев А.З., Бабынин Э.В., Бадеева Е.К. Появление мутантной культуры A. Niger, более устойчивой к белому фосфору. 22-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых ?БИОЛОГИЯ - НАУКА XXI ВЕКА?. Пушина. 2018
• Mindubaev A.Z. , BabyninE.V., Badeeva E.K. , Akosah Y.A. Neutralization of white phosphorus by culture Aspergillus niger // 4rd International Scientific Conference on Microbial Biotechnology, Chisinau, Moldova, October 11-12, 2018, р.137.
• Миндубаев А.З. , Бабынин Э.В., Бадеева Е.К. Про генотоксичность белого фосфора // Системы обеспечения техносферной безопасности: материалы V Всероссийской конференции и школы для молодых ученых (c международным участием) (Таганрог, Россия, 5-6 октября 2018 г.) – Таганрог: ЮФУ, 2018. – С. 147-149с.
• Миндубаев А.З., Бабынин Э.В., Бадеева Е.К., Минзанова С.Т., Волошина А.Д. , Иванушкина Н.Е., Озерская С.М. Устойчивость штаммов черного аспергилла к белому фосфору. Его генотоксичность для эукариот // Химическая технология и биотехнология новых материалов и продуктов. IX Международная конференция Российского химического общества имени Д. И. Менделеева : тезисы докладов. – М. : РХО им. Д. И. Менделеева : РХТУ им. Д. И. Менделеева, 2018 – С. 40-42
• Глазкова Р.М., Бабынин Э.В. Цитотоксичные свойства галогенированных фуранонов // 22 Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых. Биология - наука XXI века: матер.конф. - Пущино, 2018. - С. 284.
• Бабынин Э.В., Дубровная С.А. ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ЦЕНОПОПУЛЯЦИЙ FRAGARIA VESCA L ЗАПОВЕДНИКА «БОЛЬШАЯ КОКШАГА» (РЕСПУБЛИКА ЭЛ/ Э.В.Бабынин, С.А. Дубровная// ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОЛИМОРФИЗМ ЦЕНОПОПУЛЯЦИЙ FRAGARIA VESCA L ЗАПОВЕДНИКА «БОЛЬШАЯ КОКШАГА» (РЕСПУБЛИКА ЭЛ):СБОРНИК ТЕЗИСОВ Международного семинара «Life of genomes -2018».-Казань, 2018.- С.12-19.
• Дегтярева И.А., Бабынин Э.В., Сироткин А.С., Яппаров И.А., Биоремедиация почв: методы и подходы. / . 2018, с.100-6,25
• Миндубаев А. З., Бабынин Э. В., Пискунов Д. Б., Махиянов А. Н., Бадеева Е. К., Минзанова С. Т., Миронова Л. Г., Акосах Й. А., Волошина А. Д. (2018). Цитогенетическое действие белого фосфора. Бутлеровские сообщения. Т.55. №9. С.1-21. ROI: jbc-02/18-55-9-1
• Миндубаев А. З., Бабынин Э. В., Бадеева Е. К., Кабирова Г. Г., Синицина А. А., Шайхутдинов Р. К. У., Шарипов А. А., Минзанова С. Т., Миронова Л. Г. и Акосах Й. А.Устойчивость штаммов Aspergillus niger и бактерий к белому фосфору. Влияние двухвалентной меди на биодеградацию.Бутлеровские сообщения. 2018. Т.55. No10. С.1-24.ROI: jbc-02/18-56-11-1.
• Обзоры по клинической фармакологии и лекарственной терапии. - 2018. - Т.16 - СВ №1 - с.76
• Миндубаев А.З., Волошина А. Д., Бабынин Э. В., Яхваров Д. Г. Микроорганизм, обезвреживающий белый фосфор// Биосистемы: организация, поведение, управление: Тезисы докладов 71-й Всероссийской с международным участием школы-конференции молодых ученых (Н.Новгород, 17–20 апреля 2018 г.). Н.Новгород, Университет Лобачевского. 2018. С. 153.

• Бабынин Э.В., Глазкова Р.М., Курбангалиева А.Р. Оценка потенциальной генотоксичности новых производных фуранона - QS-ингибиторов // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. - 2017. - Т. 159, кн. 2. - С. 283?292.
• Миндубаев А.З., Бабынин Э.В., Волошина А.Д., Сахапов И.Ф., Яхваров Д.Г. ИЗУЧЕНИЕ ГЕНОТОКСИЧНОСТИ БЕЛОГО ФОСФОРА // Российский журнал прикладной экологии. 2017. № 2 (10). С. 42-46.
• Миндубаев А. З. , Волошина А. Д., Бабынин Э. В., Валидов Ш. З., Сапармырадов К. А., Хаяров Х. Р., Бадеева Е. К., Барсукова Т. А. , Минзанова С. Т. , Миронова Л. Г. , Акосах Й. А., Яхваров Д. Г. Обезвреживание белого фосфора посредством микробиологического разложения. Бутлеровские сообщения. 2017. Т.52. №12. С.87-118. ROI: jbc-01/17-52-12-87
• Мотина Т.Ю., Дегтярева И.А., Давлетшина А.Я., Яппаров И.А., Алиев Ш.А., Бабынин Э.В. БИОУДОБРЕНИЯ КОМПЛЕКСНОГО ДЕЙСТВИЯ НА ОСНОВЕ КОНСОРЦИУМА МИКРООРГАНИЗМОВ И НАНОСТРУКТУРНЫХ АГРОМИНЕРАЛОВ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ЭКОЛОГИЧЕСКИ БЕЗОПАСНОЙ ПРОДУКЦИИ РАСТЕНИЕВОДСТВА Вестник Казанского технологического университета. 2017. Т. 20. № 12. С. 122-126.
• Бабынин Э. В. Цитогенетические методы в медицине. Учебное пособие по курсу «Методы генетических исследований»/Э. В. Бабынин , И.А. Дегтярева – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2017. -44 с.

• Бабынин Э.В. Теория эволюции: методические указания к самостоятельной работе / Э.В. Бабынин. – Казань: Изд-во Казанского ун-та, 2016. – 24 с.
• Degtyareva I.A. Production of nano-bentonite and the study of its effect on mutagenesis in bacteria Salmonella typhimurium/ I.A. Degtyareva, A.M. Ezhkova, A.Kh. Yapparov, I.A. Yapparov, V.O. Ezhkov, E.V. Babynin, A.Ya. Davletshina, T.Yu. Motina, D.A. Yapparov // Rossiiskie Nanotekhnologii. 2016 - Vol. 11. - pp 663–670.
• Миндубаев А. З. Оценка генотоксичности белого фосфора. Развитие бактериальной культуры в среде с фосфитом калия в качестве единственного источника фосфора / А. З. Миндубаев, Э. В. Бабынин, Ш. З. Валидов, А. Д. Волошина, Н. В. Кулик, С. Т. Минзанова , Л. Г. Миронова, А. Ю. Аккизов, Д. Г. Яхваров // Бутлеровские сообщения. 2016. - Т.47. №7. - С.1-20.
• Бабынин Э.В. Влияние ингибиторов QUORUM-SENSING на частоту спонтанных HIS+ реверсий у Salmonella typhimurium при различной плотности бактериальной культуры / Э.В. Бабынин, И.И. Хамидуллин // Сборник тезисов Всероссийской конференции «50 лет ВОГиС: успехи и перспективы«, Москва, 2016 г. - С. 77

• Trizna E. Yu. Thio Derivatives of 2(5H)-Furanone as Inhibitors against Bacillus subtilis Biofilms / E. Yu. Trizna, E.N. Khakimullina, L.Z. Latypova, A.R. Kurbangalieva, I.S. Sharafutdinov, V.G. Evtyugin, E.V. Babynin, M.I. Bogachev, A.R. Kayumov // Acta Naturae. - 2015. - V.7(2). - P. 102-107.
• Trizna E. Yu. Thio Derivatives of 2(5H)-Furanone as Inhibitors against Bacillus subtilis Biofilms / E. Yu. Trizna, E.N. Khakimullina, L.Z. Latypova, A.R. Kurbangalieva, I.S. Sharafutdinov, V.G. Evtyugin, E.V. Babynin, M.I. Bogachev, A.R. Kayumov // Acta Naturae. - 2015. - V.7(2). - P. 102-107.
• Тризна Е. Ю. Ингибиторы образования биопленок бактериями Bacillus subtilis на основе тиопроизводных 2(5H)-фуранона / Е. Ю. Тризна, Э. Н. Хакимуллина, Л. З. Латыпова, А. Р. Курбангалиева, И. С. Шарафутдинов, В. Г. Евтюгин, Э. В. Бабынин, М. И. Богачев, А. Р. Каюмов // Acta Naturae. - 2015. - Т. 7. - № 2 (25). - С. 110–116.
• Шаронова Н.Л. Наноструктурная водно-фосфоритная суспензия - новое перспективное удобрение/ Н.Л. Шаронова, А.Х. Яппаров, Н.Ш. Хисамутдинов, А.М. Ежкова, И.А. Яппаров, В.О. Ежков, И.А. Дегтярева, Э.В. Бабынин // Российские нанотехнологии. -2015.- Т. 10. - № 7-8. – С. 115-122.
  art%3A10.1134%2FS1995078015040187.pdf
  art%3A10.1134%2FS1995078015040187.pdf
• Тризна Е. Ю., Хакимуллина Э. Н., Латыпова Л. З., Курбангалиева А. Р., Шарафутдинов И. С., Евтюгин В. Г., Бабынин Э. В., Богачев М. И., Каюмов А. Р. Ингибиторы образования биопленок бактериями bacillus subtilis на основе тиопроизводных 2(5н)-фуранона // ActaNaturae - 2015 - Т.7. - С.110-116.

• Бабынин Э. В. Селективные процессы, вовлеченные в формирование генома митохондрий // Cборник материалов международной конференции "XXVIII Любищевские чтения. 2014. Современные проблемы эволюции и экологии" (Ульяновск, 7-9 апреля 2014 г.) С. 65-70.
• Гимадеева Р.М., Бабынин Э.В., Маргулис А.Б.Цитотоксичность и генотоксичность новых производных фуранона // Вестник уральской медицинской академической науки. Тематический выпуск по микробиологии, иммунологии и биотехнологии.-2014.-Т.4/1(38).-С.26-27.

• Babynin E.V, Kurbangalieva A.R, An N.T, Antibacterial effects and genotoxicity of new derivatives of furanones//World Applied Sciences Journal. - 2012. - Vol.17, Is.2. - P.145-147.
• Babynin E. V., Kurbangalieva A. R., Nguyen Thuy An, Trushin M. V. Antibacterial Effects and Genotoxicity of New Derivatives of Furanones // World Appl. Sci. J. 2012. V. 17. № 2. P. 145-147.

• Саляма М.А.Ф., Гимадеева Р.М., Бабынин Э.В., Барабанщиков Б.И. РОЛЬ ГЕНА rpoS В АДАПТИВНОМ МУТАГЕНЕЗЕ У Salmonella typhimurium // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки.-2011.-Т.153, кн.2.-С.22-28.
• Babynin E.V., Gimadeeva R.M., Mona Salama and Barabanschikov B.I. Adaptive Mutagenesis Is a Part of the General Response to Stress in Salmonella typhimurium // Advances in Biological Research 5 (5): 233-236, 2011

• Методы изучения мутационной изменчивости микроорганизмов. Барабанщиков Б.И., Бабынин Э.В., Хамидуллина Р.Г. Методы изучения мутационной изменчивости микроорганизмов. Учебно-методическое пособие, Казань: КГУ, 2008.-46с.