• Khilyas, I.V. Genomic insights and anti-phytopathogenic potential of siderophore metabolome of endolithic Nocardia mangyaensis NH1 / I.V. Khilyas, I.V., M.I. Markelova, L.R. Valeeva, T.M. Ivoilova, E. Shagimardanova, A.V. Laikov, A.A. Elistratova, E.S. Berkutova, G. Lochnit, M.R. Sharipova// Sci Rep. - 2024. - 14, 5676.
  Khilyas_et_al.__2024.pdf

• Санникова А. В., Шарипова М. Р., Шакиров Е. В., Валеева Л. Р. Роль консервативных TRFL генов в регуляции длины теломер Physcomitrium patens и Marchantia polymorpha. IV МЕЖДУНАРОДНАЯ НАУЧНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ «ИССЛЕДОВАНИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ В БИОЛОГИИ И ЭКОЛОГИИ» с 17.04.2023 по 20.04.2023. г. Саратов. С.103.
• Danilova, I.V. Characterization of Bacillus pumilus Strains with Targeted Gene Editing for Antimicrobial Peptides and Sporulation Factor / I.V. Danilova, I.A. Vasileva, A.I. Gilmutdinova, I.V. Dyadkina, L.K. Khusnullina, D.I. Khasanov, N.L. Rudakova, M.R. Sharipova // Microorganisms. – 2023. – V.11. - №6. – P.1508. https://doi.org/ 10.3390/microorganisms11061508
  Danilova_2023_microorganisms.pdf
• Sharipova, M.R. Biofilm formation by mutant strains of bacilli under different stress conditions / M.R. Sharipova, N.L. Rudakova, A. M. Mardanova, V. Evtugyn, Y. A. Akosah, I. V. Danilova, A.D. Suleimanova // Microorganisms. – 2023. – V.11. - №6. – P.1486. https://doi.org/10.3390/microorganisms11061486
  F_Sharipova_2023_Microorganisms.pdf
• Minnullina L.F, Misheeva P.S, Mukhtarova G.I, Features of Hemolysin Biosynthesis by Morganella morganii // Bulletin of Experimental Biology and Medicine. - 2023. - Vol. 176, No. 2. - P. 181-186.
• Suleimanova A. Phosphate Solubilization and Plant Growth Promotion by Pantoea brenneri Soil Isolates / A. Suleimanova, D. Bulmakova, L. Sokolnikova, E. Egorova, O. Kuzminova, A. Gizatullina, M. Sharipova // Microorganisms - 2023. - V.11. - P. 1136. DOI: 10.3390/microorganisms11051136
• Suleimanova A. Phosphate Solubilization and Plant Growth Promotion by Pantoea brenneri Soil Isolates / A. Suleimanova, D. Bulmakova, L. Sokolnikova, E. Egorova, D. Itkina, O. Kuzminova, A. Gizatullina, M. Sharipova // Microorganisms. ? 2023. ? V. 11 (5). ? P. 1136 DOI: 10.3390/microorganisms11051136 (WOS, Scopus)
• Abdulkina LR, Agabekian IA, Valeeva LR, Kozlova OS, Sharipova MR, Shakirov EV. Comparative Application of Terminal Restriction Fragment Analysis Tools to Large-Scale Genomic Assays. International Journal of Molecular Sciences. 2023; 24(24):17194. https://doi.org/10.3390/ijms242417194
  F_ijms_24_17194_v2__1_.pdf

• Minnullina L, Kostennikova Z, Evtugin V, Akosah Y, Sharipova M, Mardanova A. Diversity in the swimming motility and flagellar regulon structure of uropathogenic Morganella morganii strains //International Microbiology. - 2022. – V. 25, No. 1. – P. 111-122. https://doi.org/10.1007/s10123-021-00197-7
• Khilyas IV, Markelova MI, Valeeva LR, Gritseva AS, Sorokina AV, Shafigullina LT, Tukhbatova RI, Shagimardanova EI, Berkutova ES, Sharipova MR, Lochnit G, Cohen MF. Genomic and metabolomic profiling of endolithic Rhodococcus fascians strain S11 isolated from an arid serpentine environment. Arch Microbiol. 2022 May 19;204(6):336. doi: 10.1007/s00203-022-02955-1. PMID: 35587838.
  Khilyas_et_al.__2022.pdf
• Санникова А. В. ХАРАКТЕРИСТИКА ДЛИНЫ ТЕЛОМЕР БРИОФИТОВ /Санникова А. В., Шарипова М. Р., Шакиров Е. В., Валеева Л. Р. // ИНТРОДУКЦИЯ, СОХРАНЕНИЕ И ИСПОЛЬЗОВАНИЕ БИОЛОГИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ФЛОРЫ. 28 июня – 1 июля 2022 года, Минск, Беларусь
• Санникова, А. В.РОЛЬ TRFL БЕЛКОВ В РЕГУЛЯЦИИ ДЛИНЫ ТЕЛОМЕР У НАЗЕМНЫХ РАСТЕНИЙ ГРУППЫ BRYOPHYTA / А. В. Санникова, М. Р. Шарипова, Е. В. Шакиров, Л. Р. Валеева // OpenBio-2022. IX МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: ВИРУСОЛОГОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И БИОИНФОРМАТИКОВ, Новосибирск Наукоград Кольцово, 27-30 сентября 2022
• Khasanov, D.I. CRISPR/Cas9-redacted Bacillus subtilis strain as the producer of extracellular metalloproteinase of B. pumilus / D.I. Khasanov, N.L. Rudakova, A.O. Koryagina, M.R. Sharipova // Opera Medica et Physiologica. – 2022. – V.9. - №3. – P. 121-127. doi:10.24412/2500-2295-2022-3-121-127
  F_Khasanov_2022.pdf
• Sannikova A.V. Natural diversity of telomeric DNA sequences in bryophytes /Sannikova A.V., Sharipova M.R., Shakirov E.V., Valeeva L.R.// The 2nd International Electronic Conference on Biomolecules: Biomacromolecules and the Modern World Challenges (IECBM). 1–15 Nov, 2022
• Smolentsev, S.Y. Nutrient digestibility, egg production and embryo development in laying hens fed bacterial enzyme-based additives / S.Y. Smolentsev, N.L. Rudakova, D.S. Bulmakova, A.O. Koryagina, A.D. Suleymanova, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova // Poultry Science Journal. – 2022. – V.10. - №1. – P. 83-90. DOI:10.22069/psj.2022.19618.1742
  F_Smolentsev._2022.pdf
• Danilova, Y.V. Optimization of electroporation conditions for Bacullus pumilus 3-19 strain / I.V. Danilova, N.L. Rudakova, Y.A. Vasilyeva, A.I. Gilmutdinova, I.V. Diadkina, D.I. Khasanov, M.R. Sharipova // BioNanoScience. – 2022. - https://doi.org/10.1007/s12668-022-00982-2
  Danilova_2022_BNS.pdf
• Lutfullin M.T. Identifcation, characterization, and genome sequencing of Brevibacterium sediminis MG‑1 isolate with growth‑promoting properties / M.T. Lutfullin, G.F. Lutfullina, D.S. Pudova, Y. A. Akosah, E.I. Shagimardanova, S.G. Vologin, M.R. Sharipova, A.M. Mardanova // 3Biotech. - 2022. - 12:326. - P. 1-16. DOI 10.1007/s13205-022-03392-z

• Shirshikova TV, Sierra-Bakhshi CG, Kamaletdinova LK, Matrosova LE, Khabipova NN, Evtugyn VG, Khilyas IV, Danilova IV, Mardanova AM, Sharipova MR, Bogomolnaya LM. 2021. The ABC-type efflux pump MacAB is involved in protection of Serratia marcescens against aminoglycoside antibiotics, polymyxins, and oxidative stress. mSphere 6:e00033-21. https://doi.org/10.1128/mSphere.00033-21.
  F_mSphere_2021_Shirshikova_e00033_21.full.pdf

• Khilyas, I. V., Genomic and phenotypic analysis of siderophore-producing Rhodococcus qingshengii strain S10 isolated from an arid weathered serpentine rock environment / Khilyas, I. V., Sorokina, A. V., Markelova, M. I., Belenikin, M., Shafigullina, L., Tukhbatova, R. I., Shagimardanova, E.I., Blom, J., Sharipova, M. R., Cohen, M. F. // Arch Microbiol. - 2020. - https://doi.org/10.1007/s00203-020-02057-w
  Khilyas_et_al.__2020.pdf
• Pudova, D. Effect of Bacillus pumilus 3-19 protease on growth parameters and gut microbiome of broiler chickens / D. Pudova, A. Koryagina, N. Rudakova, A. Mardanova, M. Sharipova // E3S Web of Conference. – 2020. – V. 222. - 02051. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202022202051.
  Pudova_2020__Ekb_.pdf
• Smolentsev, S.Y. The Effect of Bacterial Enzyme-Based Feed Additives on the Productivity, Digestibility and Assimilation of Nutrients in Young Laying Hens / S.Y. Smolentsev, N.L. Rudakova, A.O. Koryagina, D.S. Bilmakova, A.D. Suleymanova, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova / OnLine Journal of Biological Sciences. – 2020. – V.20, №4. – P.176-189. DOI: 10.3844/ojbsci.2020.176.189
  Nesushki_2020.pdf

• Data on the genome analysis of the probiotic strain Bacillus subtilis GM5 / G.F. Hadieva, M.T. Lutfullin, D.S. Pudova, Y.A. Akosah, E.I. Shagimardanova, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova // Data in Brief. 2019. https://doi.org/10.1016/j.dib.2018.12.081.
• A. Giliazeva, E. Shagimardanova, L. Shigapova, D. Pudova, M. Sharipova, A. Mardanova. Draft genome sequence and analysis of Klebsiella oxytoca strain NK-1 isolated from ureteral stent. - Data in Brief. ? 2019. - DOI: 10.1016/j.dib.2019.103853.
• Minnullina Leyla, Pudova Daria, Shagimardanova Elena, Shigapova Leyla, Sharipova Margarita, Mardanova Ayslu. Comparative Genome Analysis of Uropathogenic Morganella morganii Strains//FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY. - 2019. - Vol.9, Is.. - Art. №167.
• Abdulkina, L.R. Arabidopsis thaliana Metabolites Secreted by Roots during Plant Growth in Phosphorus-Limiting Conditions / Abdulkina, L.R., Аgabekian, I.A., Chastukhina, I.B. [etc.] // American Journal of Plant Sciences. - 2019. - N 10. - P. 987-1001. -https://doi.org/10.4236/ajps.2019.106071
  F_Abdulkina__2019.pdf
• Хадиева Г.Ф. Влияние пробиотиков Bacillus subtilis GM2 и GM5 на рост цыплят-бройлеров и усвояемость кормов/ Г.Ф. Хадиева, М.Т. Лутфуллин, А.А. Николаева, Н.К. Мочалова, С.Ю. Смоленцев, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки, 2019. - т.161. - кн.3.
• Abdulkina, L.R., Аgabekian, I.A., Chastukhina, I.B., Valeeva, L.R., Romanova, Y.D., Khilyas, I.V., Sharipova, M.R. and Shakirov, E.V. (2019) Arabidopsis thaliana Metabolites Secreted by Roots during Plant Growth in Phosphorus- Limiting Conditions. American Journal of Plant Sciences , 10, 987-1001. https://doi.org/10.4236/ajps.2019.106071
• Dinh T.L. Influence of divalent metal ions of biofilm formation by Bacillus subtilis / T.L. Dinh, G.R. Akhmetova, D.S. Martykanova, N.L. Rudakova, M.R. Sharipova // BioNanoScience. - 2019. - V.9, №2. - P. 521-527. https://doi.org/10.1007/s12668-019-00621-3.
  F_Dinh2019_Article_InfluenceOfDivalentMetalIonsOn.pdf
• Abdulkina, L.R., Аgabekian, I.A., Chastukhina, I.B., Valeeva, L.R., Romanova, Y.D., Khilyas, I.V., Sharipova, M.R. and Shakirov, E.V. (2019) Arabidopsis thaliana Metabolites Secreted by Roots during Plant Growth in Phosphorus- Limiting Conditions. American Journal of Plant Sciences, 10, 987-1001. https://doi.org/10.4236/ajps.2019.106071
• Khilyas I.V. Microbial diversity and mineral composition of weathered serpentine rock of the Khalilovsky massif / Khilyas I.V., Sorokina A.V., Elistratova A.A., Siniagina M.N., Markelova M.I., Sharipova M.R., Shcherbakova T.A., Megan E. D'Errico, Michael F. Cohen //PLOS One, 2019.-V. 14.-N12.-DOI 10.1371/journal.pone.0225929.
  F_Khilyas_et_al.__2019_Plos.pdf
• Abdulkina L.R. Components of the ribosome biogenesis pathway underlie establishment of telomere length set point in Arabidopsis/ Abdulkina L.R., Kobayashi C., Lovell J.T., Chastukhina I.B., Aklilu B., Agabekyan I.A., Valeeva L.R., Nyamsuren C., Aglyamova G.V., Sharipova M.R., Shippen D.E., Juenger T.J., and Shakirov E.V. // NatCommun 2019 - V.10:5479
  Nat_Comm_2019.pdf
• Lia R. Valeeva. The role of prenyltransferases in the thallus development of Marchantia polymorpha/ Lia R. Valeeva, Yoshihiro Yoshitake, Noriyuki Suetsugu, Ryuichi Nishihama, Takayuki Kohchi, Margarita R. Sharipova. The Conference of IAB, iMOSS and SEB, Abstracts
  Valeeva_iMOSS2019.pdf
• Abdulkina, L.R., Kobayashi, C., Lovell, J.T. et al. Components of the ribosome biogenesis pathway underlie establishment of telomere length set point in Arabidopsis. Nat Commun 10, 5479 (2019). https://doi.org/10.1038/s41467-019-13448-z
• Telomere length regulation in Arabidopsis thaliana/ Итоговая научно-образовательная конференция студентов Казанского федерального университета 2018 года, Казань // Agabekyan I.A., Nigmatullina L.R., Chastukhina I.B., Valeeva L.R., Sharipova M.R./// Апрель 2018г.

• Siderophores produced by Serratia marcescens SM6 / I.V. Khilyas, Y. Dashti, A.V. Sorokina, M.R. Sharipova, G.L. Challis, L.M. Bogomolnaya // The FEBS Journal. - 2017. - Vol. 284. - S.1. - P. 361-362.
  2017_The_FEBS_Journal__peretyanutyj__1.pdf
• Diversity of microbial siderophores excreted by electrogenic bacteria in microbial fuel cells treating swine wastewater // I.V. Khilyas, A. Sorokin, M. Sharipova, M. Cohen, I. Goryanin // The FEBS Journal. - 2017. - Vol. 284. - S.1. - P. 385.
  F_2017_The_FEBS_Journal__peretyanutyj_.pdf
• Санникова, А.В. РОЛЬ ГЕНА NOP2C В РЕГУЛЯЦИИ ДЛИНЫ ТЕЛОМЕР ARABIDOPSIS THALIANA / А.В. Санникова, Л.Р. Валеева, Л.Р. Абдулкина, М.Р. Шарипова, Е.В. Шакиров // Тезисы докладов III Международной школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Материалы и технологии XXI века", Казань, 29 - 31 ноября 2018 г.
• THE INFLUENCE OF PSEUDOMONAS SYRINGAE DC3000 INFECTION ON ARABIDOPSIS THALIANA PLANT TELOMERE LENGTH. A.V.Sannikova ,L.R.Valeeva ,L.Abdulkina ,M.R.Sharipova ,E.V.Shakirov ; Institute of Fundamental Medicine and Biology, Kazan Federal University, Kazan, Russia
• THE INFLUENCE OF PSEUDOMONAS SYRINGAE DC3000 INFECTION ON ARABIDOPSIS THALIANA PLANT TELOMERE LENGTH. A.V.Sannikova ,L.R.Valeeva ,L.Abdulkina ,M.R.Sharipova ,E.V.Shakirov // Abstracts of the Annual Scientific Meeting of the American society for cell biology «ASCB/EMBO-2018 meeting». – San Diego, USA, 2018.
• Low molecular weight metabolites secreted through an ABC-type efflux pump MacAB protect Serratia marcescens against hydrogen peroxide / L. Matrosova, I. Khilyas, T. Shirshikova, L. Kamaletdinova, Y. Danilova, M. Sharipova, L. Bogomolnaya // FEBS Open Bio 8 (Suppl. S1) p. 382-383 (2018) 107–496 DOI: 10.1002/2211-5463.12453
  2018_FEBS_Open_Bio__pdf.io___1_.pdf
• The role of OLI5 gene in telomere length regulation in Arabidopsis thaliana/ International conference "Interventions to extend healthspan and lifespan" , Kazan, Russia // I. A. Agabekian, L.R. Nigmatullina, I.B. Chastukhina, L. R. Valeeva, M.R. Sharipova, E.V. Shakirov/// 23-26 April, 2018.
• Identification of the novel gene involved in telomere length regulation in Arabidopsis thaliana/ ASCB EMBO 2018 Meeting, San Diego, CA, USA// I. Agabekyan, E. Shakirov, L. Abdulkina, L. Valeeva, A. Kurchatova, M. Sharipova/// 8-12 December, 2018
• I.V. Khilyas. Metabolomics and proteomic analysis of serpentinite-associated bacterium / I.V. Khilyas, A.V. Sorokina, L.T. Shafigullina, T. Timm, G. Lochnit, L.M. Bogomolnaya, M.R. Sharipova // FEBS Open Bio 8 (Suppl. S1) p. 180 (2018) 107–496 DOI: 10.1002/2211-5463.12453
  F_2018_FEBS_Open_Bio__pdf.io_.pdf

• Mardanova, А.М. Bacillus subtilis strains with antifungal activity against the phytopathogenic fungi/ A.M. Mardanova, G. F. Hadieva, M. T. Lutfullin, I. V. Khilyas, L. F. Minnullina, A. G. Gilyazeva, L. M. Bogomolnaya, M. R. Sharipova // Agricultural Sciences, - 2017- 8, 1-20. DOI: 10.4236/as.2017.81001
• Danilova, IV; Fakhrullin, RF; Sharipova, MR/ Immobilization of serine subtilisin-like proteinase of bacilli with thrombolytic activity on the surface of the catheter// FEBS JOURNAL, 2017, p. 389.
• The effects of abiotic factors on telomere length/ 42nd FEBS Congress (Ierusalem, Israel)// L. Nigmatullina, I. Chastukhina, L. Valeeva, I. Agabekyan, M. Sharipova, E. Shakirov/// 10-14 сентября 2017г.
• Irina V. Khilyas, Anatoly A. Sorokin, Larisa Kiseleva, et al., “Comparative Metagenomic Analysis of Electrogenic Microbial Communities in Differentially Inoculated Swine Wastewater-Fed Microbial Fuel Cells,” Scientifica, vol. 2017, Article ID 7616359, 10 pages, 2017. doi:10.1155/2017/7616359
  F_Khilyas_et_al.__2017.pdf

• Balaban N.P, Suleimanova A.D, Valeeva L.R., Shakirov E.V., Sharipova M.R.Structural characteristics and catalytic mechanism of Bacillus ?-propeller phytases//Biochemistry (Moscow). - 2016. - Vol.81, Is.8. - P.785-793.
• A. Toymentseva. Genomic characterization of two Bacillus pumilus strains / A. Toymentseva, I. Danilova, D. Baranova, E. Boulygina, M. Markelova, M. Sharipova // FEBS J. - 2016. - V. 283 (S1) – P. 239.
• Khilyas I.V. Genomic comparison of siderophore diversity in clinical and environmental isolates of Serratia marcescens / I.V. Khilyas, T.V. Shirshikova, L.E. Matrosova, Y.V. Danilova, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya // The FEBS Journal. - Vol. 283. - S.1. - P. 370-371.
  2016_The_FEBS_Journal.pdf
• Shirshikova T.V. The role of MacAB efflux pump in protection of Serratia marcescens against antibiotics and oxidative stress / T.V. Shirshikova, L.E. Matrosova, O.V. Morozova, I.V. Khilyas, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya // The FEBS Journal. - 2016. - Vol. 283. - S.1. - P. 190-191.
  2016_The_FEBS_Journal.pdf
• Хиляс И.В. ПОТЕНЦИАЛЬНЫЕ МИШЕНИ ПРИ АНТИБИОТИКОТЕРАПИИ ОППОРТУНИСТИЧЕСКОГО ПАТОГЕНА SERRATIA MARCESCENS SM6 / И.В. Хиляс, Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // ACTA NATURAE. - 2016. - Т.2. - С. 149-150.
  AbstractBook_Vol2.pdf
• Hadieva, G.F. Dry Rot Causing Species of Fusarium Prevalent in Republic of Tatarstan / G.F. Hadieva , N.S. Karamova, Z. Stasevski, E. M. Djabbarova, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova// Research Journal of Pharmaceutica Biological and Chemical Sciences. – 2016. – V.7(6). – P. 2824 – 2827.
• Ширшикова Т.В. ЭФФЛЮКС СИСТЕМА MACAB – ПОТЕНЦИАЛЬНАЯ МИШЕНЬ ПРИ АНТИБИОТИКОТЕРАПИИ SERRATIA MARCESCENS SM6 / Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // ACTA NATURAE. СПЕЦВЫПУСК. - 2016. - Т. 2. - С. 169.
  AbstractBook_Vol2.pdf
• Khilyas I.V. Production of siderophores by Serratia marcescens and the role of MacAB efflux pump in siderophores secretion / I.V. Khilyas, T.V. Shirshikova, L.E. Matrosova, A.V. Sorokina, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya // BioNano Science. - 2016.
  Khilyas__2016.pdf
• Сорокина А.В. Сравнительная характеристика бактерий-продуцентов сидерофоров катехолового типа / А.В. Сорокина, Т.А. Щербакова, А.А. Тойменцева, М.Р. Шарипова, И.В. Хиляс // Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов»: сборник тезисов. - М., 2016. - С. 264.
  Lomonosov_2016.pdf
• Оценка металлоустойчивости сидероофор-продуцирующих бактерий карбонатно-силикатных минералов/ А.В. Сорокина, А. Пугачева, Т.А. Щербакова, М.Р. Шарипова, И.В. Хиляс // II Международная школа-конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Материалы и методы XXI века» (Казань, 20-23 сентября 2016 г.). Сборник тезисов - С. 321.
• Матросова Л.Е. АНТИОКСИДАНТНЫЕ СВОЙСТВА ЭКСТРАКЛЕТОЧНЫХ БЕЛКОВ S. MARCESCENS SM6 / Л.Е. Матросова, Ю.В. Данилова, И.В. Хиляс, Т.В. Ширшикова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // ACTA NATURAE. - 2016. - Т.2. - С. 168.
  AbstractBook_Vol2.pdf

• Замалютдинова Н.М., Шарипова М.Р., Богомольная Л.М., Божокина Е.С., Марданова А.М. Особенности биосинтеза внеклеточной металлопротеиназы Proteus mirabilis. Известия РАН, Серия Биологическая, 2015, 1, 27-33.
• Suleimanova A.D, Toymentseva A.A, Boulygina E.A, High-quality draft genome sequence of a new phytase-producing microorganism Pantoea sp. 3.5.1//Standards in Genomic Sciences. - 2015. - Vol., Is.. - .
• N.M. Zamalyutdinova, M.R. Sharipova, L.M. Bogomol'naya, E.S. Bozhokina, A.M. Mardanova. Peculiarities of Proteus mirabilis Extracellular Metalloproteinase Biosynthesis // Biology Bulletin, 2015, Vol. 42, No. 1, pp. 21-26.
• Toymentseva A. A. et al. Draft genome sequence of Bacillus ginsengihumi strain M2. 11 with phytase activity //Genome announcements. – 2015. – Т. 3. – №. 4. – С. e00851-15.
  Genome_Sequence_of_Bacillus_ginsengihumi_2015.pdf
• Хиляс И.В. Микробные сидерофоры: классификация, применение, детекция и идентификация / И.В.Хиляс, А.В.Лайков, М.Р.Шарипова , Л.М.Богомольная - 2015. - 21 с.
  Siderofory_final.pdf
• Сорокина А.В. Продукция сидерофоров металл-толерантными микроорганизмами / А.В. Сорокина, Т.А. Щербакова, М.Н. Синягина, А.А. Тойменцева, М.Р. Шарипова, И.В. Хиляс // Девятый Всероссийский Форум "Наука и инновации в технических университетах" сборник междунар. науч.-практической конф. - Санкт-Петербург, - 2015. - С.147
  Piter_2015.pdf
• Сорокина А.В. Исследование свойств сидерофор-продуцирующих микроорганизмов с целью разработки методов очистки водных и почвенных территорий, загрязненных тяжелыми металлами / А.В. Сорокина, И.В. Хиляс, М.Р. Шарипова // Конференция молодых ученых "Молодежь и инновации Татарстана" сборник науч.-практической конф. - Казань, 2015. -- С. 73-74.
  Kazan_2015.pdf
• Rudakova N.L. Optimization of cultivation media for heterologous gene expression of adamalysin-like metalloendopeptidase Bacillus pumilus / N.P. Balaban, A.M. Mardanova, I.B. Chastuchina, M.S. Sharipova // Biol Med (Aligarh), 2015, 7:2: BM-077-15, 8 pages.
  BM_077_15_Optimization_of_cultivation_2015__Rudakova.pdf
• Suleimanova A.D. High-quality draft genome sequence of a new phytase-producing microorganism Pantoea sp. / A.A. Toymenceva, Boulygina E.A., Kazakov S.V., F.V. Mardanova, N.P. Balaban, M.R. Sharopova // Standarts in Genomic Sciences, 2015. - 10:95. DOI 10.1186/s40793-015-0093-y
  High_quality_draft_genome_sequence_2015.pdf
• Shirshikova T.V. MacAB efflux system of Serratia marcescens as a potential protective system against oxidative stress / Shirshikova T.V., Matrosova L.Y., Khilyas I. V., Sharipova M. R., Bogomolnaya L. M. //FEBS Journal, V.282, p.201.
• Valeeva, L. R. Expression of Pantoea agglomerans phytase from a strong constitutive promoter in Arabidopsis thaliana plants / L. R Valeeva, Ch. Nyamsuren, D. S Troshagina, M. R Sharipova, E. V. Shakirov // RJPBCS. - 2015. - V. 6(4). - P.99-104.
• Nyamsuren, Ch. An Improved Gene Expression System to Generate Transgenic Arabidopsis Thaliana Plants Harboring a Bacillus Ginsengihumi Phytase Gene / Ch. Nyamsuren, L. R Valeeva, M. R Sharipova, E. V Shakirov // RJPBCS. ? 2015. ? V.6(4). - P.18-24.
• Suleimanova, A. D. Novel glucose-1-phosphatase with high phytase activity and unusual metal ion activation from soil bacterium Pantoea sp. strain 3.5.1 / A. D. Suleimanova, A. Beinhauer, L. R. Valeeva, I. B. Chastukhina, N. P. Balaban, E. V. Shakirov, R. Greiner, M. R. Sharipova/ Applied and Environmental Microbiology. - 2015. V. 81 (19). - P. 6790-6799.
• A. Akhmetova. Heterologous expression of Bacillus ginsengihumi phytase gene / A. Akhmetova, A. Suleimanova, A. Toymentseva, N. Balaban, D. Iljukhina, M. Sharipova // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Science.- 2015.- 6(4).-P. 117-122
• Shirshikova T. V., Matrosova L. Y., Khilyas I. V., MacAB efflux system of Serratia marcescens as a potential protective system against oxidative stress//FEBS JOURNAL. - 2015. - Vol.282, Is.. - P.201-201.
• Elfenbein JR, Knodler LA, Nakayasu ES, Ansong C, Brewer HM, Bogomolnaya L, et al. (2015) Multicopy Single-Stranded DNA Directs Intestinal Colonization of Enteric Pathogens. PLoS Genet 11(9): e1005472. doi:10.1371/journal.pgen.1005472

• Shagimardanova EI, Toymentseva AA, Balaban NP, Mardanova AM, Danilova YV, Gusev OA, Kostryukova E, Karpova I, Manolov A, Alexeev D, Sharipova MR.Draft Genome Sequence of Bacillus pumilus 7P, Isolated from the Soil of the Tatarstan Republic, Russia. Genome Announc. 2014 Jun 12;2(3).
• Danilova YV, Shagimardanova EI, Margulis AB, Toymentseva AA, Balaban NP, Rudakova NL, Rizvanov AA, Sharipova MR, Palotás A. Bacterial enzymes effectively digest Alzheimer's β-amyloid peptide.Brain Res Bull. 2014, 108, P.113-117.
• Danilova Y.V. Bacterial enzymes effectively digest Alzheimer's β-amyloid peptide / Y.V. Danilova, E.I. Shagimardanova, A.B. Margulis, A.A. Toymentseva, N.P. Balaban, N.L. Rudakova, A.A. Rizvanov, M.R. Sharipova, A. Palotás // Brain Res Bull. - 2014. V.108, No.1. - P.113-117.
• А. М. Марданова, Л. М. Богомольная, Ю. Д. Романова, М. Р. Шарипова / Эффлюкс системы Serratia marcescens // МИКРОБИОЛОГИЯ, 2014, том 83, № 1, с. 3–14
• Mardanova AM, Toymentseva AA, Gilyazeva AG, Kazakov SV, Shagimardanova EI, Khaitlina SY, Sharipova MR.Draft Genome Sequence of Serratia grimesii Strain A2.Genome Announc. 2014 Sep 18;2(5).
• Bacterial enzymes effectively digest Alzheimer's В-amyloid peptide
  2014_Bacterial_enzymes_effectively_digest_Alzheimer_s_B_amyloid_peptide.pdf
• А. М. Марданова, Л. М. Богомольная, Ю. Д. Романова, М. Р. Шарипова / ЭФФЛЮКС СИСТЕМЫ SERRATIA ARCESCENS // МИКРОБИОЛОГИЯ, 2014, том 83, № 1, с. 3–14
• Balaban N.P. Inositol Phosphates and their Biological Effects / Balaban N.P., Suleimanova A.D., Valeeva L.R., Chastukhina I.B., Sharopova M.R. // Biomed. Pharmacol. J. - 2014.- Vol. 7. № 2. -P. 433-437.
• N.M. Zamaliutdinova, L.F. Minnullina, M.R. Sharipova, A.M. Mardanova. New Metalloendopeptidase of Morganella morganii ZM // Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2014, Vol. 40, No. 6, pp. 628-633.
• Трошагина Д.С. Фитаза Pantoea agglomerans: экспрессия в Arabidopsis thaliana под контролем вирусного промотора / Трошагина Д.С., Валеева Л.Р., Частухина И.Б., Шакиров Е.В., Шарипова М.Р. // Сборник трудов IV международной научно-практической конференции "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине"(29 октября - 1 ноября 2014 г, Казань). - С 34.
• A. M. Cheremin, Ch. Nyamsuren, A. A. Toimentseva, and M. R. Sharipova Optimization of the Expression of the Subtilisin-like Proteasefrom Bacillus pumilus Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2014, Vol. 40, No. 6, pp. 694–698

• Shagimardanova E.I., Sharipova M.R., T. Kikawada, Gusev O.A. Sleeping hyronomid Polypedilum vanderplanki – a new tool for studying host-microbial interactions. Book of abstracts of the UK-Russia Frontiers of Science Symposium. Kazan, 12-14 March, 2013.
• Shagimardanova E.I., Sharipova M.R., T. Kikawada, Gusev O.A. Sleeping hyronomid Polypedilum vanderplanki – a new tool for studying host-microbial interactions. Book of abstracts of the UK-Russia Frontiers of Science Symposium. Kazan, 12-14 March, 2013.
• Н.П.Балабан,Ю.В.Данилова,Т.Р.Шамсутдинов,А.М.Марданова, А.М.Черемин,Г.Н.Руденская,М.Р.Шарипова/СВОЙСТВА ГЛУТАМИЛЭНДОПЕПТИДАЗЫ Bacillus pumilus НА РАЗНЫХ ФАЗАХ РОСТА РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА//БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2013, том 39, № 1, с. 1–9
• А.Д.Сулейманова, Ю.В.Данилова, Р.Грайнер, М.Р.Шарипова / НОВАЯ БАКТЕРИАЛЬНАЯ ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ ФИТАЗА ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ: ВЫДЕЛЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА // БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2013, том 39, № 4, с. 1–7
• А.Д.Мухаметзянова,И.О.Маренова,М.Р.Шарипова / ПОЛУЧЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА БАЦИЛЛ С ИНАКТИВИРОВАННЫМ ГЕНОМ ФИТАЗЫ // МИКРОБИОЛОГИЯ, 2013, том 82, № 1, с. 1–7
• Toymentseva А.А. Bacillus pumilus Strains with Inactivated Genes of Extracellular Serine Proteinases / А.А. Toymentseva, A.I. Akhmetova, M.R. Karimova, C. Nyamsuren, Yu.O. Ponomareva, E.I. Shagimardanova, A.A. Rizvanov, M.R. Sharipova // Microbiology. – 2013. – Vol.82. No.1. – P.59-68.
• Замалютдинова Н.М. Влияние глюкозы и мочевины на рост Proteus mirabilis и биосинтез внеклеточной протеиназы / Н.М. Замалютдинова, Л.Ф. Миннуллина, А.Г. Гилязева, Е.О. Михайлова, М.Р. Шарипова, Н.Л. Рудакова, А.М. Марданова // Вестник Казанского технологического университета. – 2013. – Т.16, № 20. – С. 184-188.
• Н.П.Балабан,Н.Л.Рудакова,М.Р.Шарипова / СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ И ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ЗНАЧИМОСТЬ МЕТЦИНКИНОВЫХ МЕТАЛЛОЭНДОПЕПТИДАЗ // БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2013, том 39, № 5, с. 552–557
• Н.П.Балабан,Н.Л.Рудакова,М.Р.Шарипова / СТРУКТУРНЫЕ ОСОБЕННОСТИ И ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ЗНАЧИМОСТЬ МЕТЦИНКИНОВЫХ МЕТАЛЛОЭНДОПЕПТИДАЗ // БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2013, том 39, № 5, с. 552–557
• А.И.Ахметова,Ч.Нямсурэн,Н.П.Балабан,М.Р.Шарипова / ВЫДЕЛЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА НОВОЙ ФИТАЗЫ БАЦИЛЛ // БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2013, том 39, № 4, с. 430–436
• А.И.Ахметова,Ч.Нямсурэн,Н.П.Балабан,М.Р.Шарипова / ВЫДЕЛЕНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА НОВОЙ ФИТАЗЫ БАЦИЛЛ // БИООРГАНИЧЕСКАЯ ХИМИЯ, 2013, том 39, № 4, с. 430–436
• Миннуллина Л.Ф. Ген металлопротеиназы Morganella morganii / Л.Ф. Миннуллина, Н.М. Замалютдинова, Е.О. Михайлова, М.Р. Шарипова, А.М. Марданова // Вестник Казанского технологического университета. – 2013. – Т.16, № 23. – С. 143-146.
• А.А.Тойменцева,А.И.Ахметова,М.Р.Каримова,Ч.Нямсурэн,Ю.О.Пономарева,Е.И.Шагимарданова,А.А.Ризванов,М.Р.Шарипова / ШТАММЫ BACILLUS PUMILUS С ИНАКТИВИРОВАННЫМИ ГЕНАМИ ВНЕКЛЕТОЧНЫХ СЕРИНОВЫХ ПРОТЕИНАЗ // МИКРОБИОЛОГИЯ, 2013, том 82, № 1, с. 1–10

• Development of novel LIKE expression system via heterologous signalpeptides screening [Text] / L. Kh. Khabibrakhmanova, C. Nyamsuren, A. A. Toymentseva, M.R. Sharipova // ?State-of-the-art trends of scientific research of artificial and natural nanoobjects?. Book of abstracts. ? Saint Petersburg, 2012. - P. 26.

• Sabirova A.R. A novel secreted metzincin metalloproteinase from Bacillus intermedius / Sabirova A.R., Rudakova N.L., Balaban N.P., Ilyinskaya O.N., Demidyuk I.V., Kostrov S.V., Rudenskaya G.N., Sharipova M.R. // FEBS Lett. – 2010. - 584(21). –P.4419-4425.
  feb2s0014579310007866.pdf

• Ekaterina O. Mikhailova, Nelly P. Balaban, Ayslu M. Mardanova, Nataliya L. Rudakova, Olga N. Ilyinskaya, Galina N. Rudenskaya, Albert A. Rizvanov, Margarita R. Sharipova. Purification of subtilisin-like serine proteinase from recombinant Basillus subtilis during different phases of growth/ Annals of Microbiology, 59 (2)/ 301-307. (2009)

• M. Sharipova, N.Balaban, A.Kayumov, Y.Kirillova, L.Gabdrakhmanova, A.Mardanova, I.Leshchinskaya, G.Rudenskaya, T.Akimkina, D.Safina, I.Demidyuk, S.Kostrov. The expression of the serine proteinase gene of Bacillus intermedius in Bacillus subtilis // Microbiol. Res. - 2008. - 163(1). - Р.39-50.
• A. Kayumov, A. Heinrich, M. Sharipova, O. Iljinskaya, K. Forchhammer. Inactivation of the general transcription factor TnrA in Bacillus subtilis by proteolysis // Microbiology. - 2008. - V.154. - P.2348-2355. DOI 10.1099/mic.0.2008/019802-0.

• Ul'yanova V. V. The effect of Spo0A and AbrB proteins on expression of the genes of guanyl-specific ribonucleases from Bacillus intermedius and Bacillus pumilus in Bacillus subtilis recombinant strains / V. V. Ul'yanova, V. I. Vershinina, M. A. Kharitonova, M. R. Sharipova // Microbiology. - 2007. - V. 76, №5. - P. 563-568. doi:10.1134/S0026261707050086
  2007_The_effect_of_Spo0A_and_AbrB_proteins.pdf

• A.R. Kayumov, J.M. Kirillova, E.O. Mikhailova, N.P. Balaban, M.R. Sharipova. The prediction of regulation of subtilisin-like proteinase gene from Bacillus intermedius through its regulatory sequence analysis // BGRS-2006: Proceedings of the fifth international conference on Bioinformatics of Genome Regulation and Structure, Novosibirsk, Russia, July 16-22, 2006. - P.65

• Ульянова В. В. Роль Spo0A- и AbrB- белков в регуляции экспрессии гена рибонуклеазы Bacillus pumilus в рекомбинантных штаммах Bacillus subtilis / В. В. Ульянова, В. И. Вершинина, М. Р. Шарипова // "Ферменты микроорганизмов: структура, функции, применение": сборник материалов XIII междунар. науч. конф. - Казань, 2005. - С. 86-87.

• Gabdrakhmanova L.A. Biosynthesis and localization of glutamylendopeptidase from Bacillus intermedius strain 3-19 / Gabdrakhmanova L.A, Shakirov E.V, Balaban N.P., Sharipova M.R., Rudenskaya G.N., Leshchinskaya I.B. // Microbios. - 1999. - V.100. -№ 396. - P. 97-108.

• Leshchinskaya I. B. Glutamyl endopeptidase of Bacillus intermedius, strain 3-19 // Leshchinskaya I. B., Shakirov E. V., Itskovitch E. L., Balaban N. P., Mardanova A. M., Sharipova M. .R, Viryasov M. B., Rudenskaya G. N., Stepanov V. M. / FEBS Lett. - 1997. -V. 404. - P. 241-244.
• Itskovich E. L. Enzymatic properties of thiol-dependent serine proteinase of Bacillus intermedius 3-19 / Itskovich E. L., Balaban N. P., Mardanova A. M., Shakirov E.V., Sharipova M.R., Leshchinskaya I.B., Ksenofontov A.L., Rudenskaya G.N. //Biochemistry (Mosc). - 1997. -V. 62. - № 1. - P. 49-53.