Календарная загрузка оборудования
№ п/п | Наименование | Календарная загрузка на 2015 г. |
1 | Масс-спектрометр MALDI TOF/TOF Ultraflextreme | январь – март: проект «Оценка изменений отдельных белков в спинном мозге на фоне применения генно-клеточной терапии» апрель – июль: проект «Идентификация растительных белков в связи с адаптацией к стрессу» июль: проект «Оценка искусственных матриксов, созданных на основе желатины» август – декабрь: разработка методики в рамках х/д «Определение молекулярных масс и изоэлектрических точек отдельных белков в общем пуле растворимых белков растений с последующей идентификацией конкретных белков» |
2 | MALDI Biotyper | январь – декабрь: идентификация изолятов, высеваемых из клинического материала на базе РКБ-2 май – сентябрь: проект с судмедэкспертизой «Разработка методики истинности утопления на основе микробных маркеров» |
3 | Квадруполь-времяпролётный масс-спектрометр сверхвысокого разрешения с ионизацией электроспреем Maxis Impact | январь – апрель: проект «протеом экстраклеточных мембранных везикул Acholeplasma laidlawii PG8» февраль: проект «Белковое профилирование рекомбинантных аденовирусов» апрель – май: проект «Оценка изменений в белковом профиле Lactobacillus plantarum в специфических условиях культивирования» июнь: проект «Исследование изменений в белковом профиле при совместном культивировании A. laidlawii и E. coli» июль – декабрь: х/д НИР ««Разработка методики количественного анализа белков плазмы крови, сорбированных на сетках для герниопластики». |
| 4 | Гибридная система ВЭЖХ и тройной квадруполь-времяпролетный масс-спектрометр сверхвысокого разрешения с ионизацией электроспреем AB SCIEX QTRAP 6500 | январь – май: отработка методики количественной оценки стандартов белковой природы июнь: х/д НИР «Разработка методики масс-спектрометрического анализа аддуктов ДНК» июль – декабрь: х/д «Количественный анализ коэнзима Q10 в крови с помощью масс-спектрометрии» |
| 5 | Высокоэффективный жидкостной хроматограф Ultimate 3000 | январь – март: разделение пептидов в рамках проекта НИЛ «Экстремальная биология» март – май: разделение вторичных метаболитов бактерий сотрудниками НИЛ «Микробные биотехнологии» январь – декабрь: проект «Оценка искусственных матриксов, созданных на основе желатины» |
| 6 | Система фрагментации ДНК Covaris S220, основанная на ультразвуковом воздействии | январь – декабрь: подготовка шотган библиотек для Solid 5500w по проекту ФЦП 14.575.21.0076 |
| 7 | Agilent 2100 Bioanalyzer | январь – декабрь: анализ полученных библиотек для высокопроизводительного секвенирования сентябрь – декабрь: определение индекса целостности выделенной РНК (RNA Integrity Number – RIN) в рамках разработки методики транскриптомного анализа прокариот |
| 8 | Анализатор для проведения ПЦР-анализа в реальном времени Roche LightCycler 480 II | июль: обучение работе с прибором август – декабрь: определение концентрации экзомных библиотек по проекту «Экзом 3000 татар» |
| 9 | Секвенатор GS Junior (Roshe, Switzerland) | январь – май: полногеномное секвенирование штаммов прокариот Bacillus gisengihumi, Bacillus pumilus 7P, Bacillus pumilus 3-19, Agrea bicolorata март – апрель: х/д НИР «Разработка методики анализа микробных сообществ, населяющих кишечник человека, на основе 454-технологии секвенирования» апрель – декабрь: метагеномный анализ состава микробных сообществ в рамках проектов «Биогаз» и «Компосты» |
| 10 | Секвенатор ABI 3730 DNA Analyzer (Life Technologies, USA) | январь – декабрь: секвенирование по методу Сэнгера Август: проведение стажировки для внешних пользователей на тему «Секвенирование по Сэнгеру» сентябрь – декабрь: отработка методики фрагментного анализа |
| 11 | Секвенатор Ion Torrent PGM (Life Technologies, USA) | февраль – март: секвенирование парных библиотек для сборки бактериальных геномов Bacillus ginsengihumi, Bacillus pumilus 7P, Bacillus pumilus 3-19 июнь – июль: освоение методик пробоподготовки с использованием системы One Touch август: таргетное секвенирование ампликоновых библиотек |
| 12 | Секвенатор Ion Proton (Life Technologies, USA) | март – декабрь: секвенирование экзомов в рамках проекта «Экзом 3000 татар» |
| 13 | Секвенатор SOLiD xl 5500 Wildfire (Life Technologies, USA) | январь – декабрь: полногеномное секвенирование по проекту ФЦП 14.575.21.0076 |
| 14 | Секвенатор Illumina NextSeq 500 | сентябрь: обучение работе на приборе октябрь – декабрь: секвенирование транскриптомных библиотек |
| 15 | Высокопроизводительный вычислительный кластер | январь: сборка и аннотация геномов штаммов A. laidlawii, анализ резистома февраль - март: сборка и аннотация бактериальных геномов Bacillus ginsengihumi, Bacillus pumilus 7P, Bacillus pumilus 3-19, анализ данных полнотранскриптомного секвенирования эукариот апрель-май: таксономический и функциональный анализ состава нефтешламов, анализ метагеномных данных по проектам "Биогаз", "Компосты" июнь-сентябрь: анализ данных полногеномного секвенирования по проекту ФЦП 14.575.21.0076, препроцессинг результатов секвенирования первых образцов в рамках проекта "Экзом 3000 татар" октябрь-декабрь: биоинформационный анализ данных проекта «Экзом 3000 татар» |
