Открытие отделения математики и естественных наук, как структурного подразделения Елабужского института Казанского федерального университета было утверждено приказом ректора № 01-06/750 от 20 июля 2016 года на базе имеющихся физико-математического и биологического факультетов.
На отделении осуществляется руководство следующими кафедрами:
При отделении на базе спортивно-оздоровительного лагеря «Буревестник» работает «Летняя физико-математическая школа» для учащихся, окончивших 8, 9 и 10 классы