Научно-образовательный центр фармацевтики (НОЦ фармацевтики), созданный в 2011 году в рамках ФЦП «Развитие фармацевтической и медицинской промышленности Российской Федерации на период до 2020 года и дальнейшую перспективу», является основным структурным подразделением КФУ. В настоящее время в НОЦ фармацевтики работают более 90  сотрудников – специалистов в области  химии, биологии, медицины и ветеринарии. Основная задача центра - разработка инновационных лекарственных средств, включая синтез фармсубстанций, их скрининг на специфическую активность in vitro, выяснение механизмов действия, доклинические исследования на безопасность и эффективность in vivo, а также изготовление готовых лекарственных форм. В 2014 году введены в эксплуатацию чистые помещения для временного содержания мелких лабораторных животных и микробиологическая лаборатория с классами чистоты C и D, позволяющие проводить работы в области фармацевтики по стандартам GLP.

В НОЦ фармацевтики функционируют четыре отдела: медицинской химии, поисковых исследований, доклинических исследований, клинической фармакологии и контроля качества.

В отделе медицинской химии проводится синтез кандидатов в лекарственные средства в лабораторных масштабах, отрабатываются лабораторные регламенты получения фармацевтических субстанций. Лаборатории оснащены современным оборудованием, позволяющим многостадийным синтезом получать кандидаты в лекарственные средства. 

В отделе поисковых исследований проводятся научно-исследовательские работы по поиску новых кандидатов в лекарственные средства и инновационных методов лечения различных заболеваний человека. Осуществляется скрининг кандидатов в лекарственные средства на основании их цитотоксичности, специфической активности и других биологических свойств. Разрабатываются новые модели для скрининга инновационных лекарственных препаратов и исследуются механизмы их действия на молекулярном и клеточном уровне.

Отдел доклинических исследований включает в себя "чистые" помещения для временного содержания мелких лабораторных животных с классами чистоты K и D по стандартам GMP, микробиологическую лабораторию с классами чистоты C и D, что позволяет проводить полный цикл доклинических исследований кандидатов в лекарственные средства по международным стандартам GLP (надлежащей лабораторной практики). Исследования общей токсичности соединений (острой, субхронической, хронической), специфической токсичности (канцерогенности, аллергизирующих свойств, иммунотоксичности), фармакокинетики (LC/MS/MS высокой чувствительности), биодоступности и биораспределения, фармакологической активности с отработкой новых моделей на мышах и крысах SPF-статуса (свободных от патогенной микрофлоры) проводятся в строгом соответствии с руководящими документами в области доклинических исследований лекарственных соединений на территории РФ.

Отдел клинической фармакологии и контроля качества осуществляет проведение клинических исследований по стандартам GCP (надлежащей клинической практики) и методическое сопровождение поисковых и доклинических исследований по стандартам GLP.