SuBioPlatform – новое слово в хранении и анализе омиксных данных

Сегодня, 12 мая, в КФУ состоялся семинар по применению SuBioPlatform для анализа омиксных данных в биологии и медицине. Мероприятие было организовано в рамках программы развития лабораторий  «Open Lab».

На сегодняшний день платформа SuBio является одной из лучших для «неконсольной» оценки и визуализации омиксных данных. Ознакомить представителей Института фундаментальной медицины и биологии с особенностями программы приехал ее разработчик, президент компании SuBio Inc – доктор Акио Танабе (Япония).

«Во время подготовки к экспериментам, ‑ рассказывает господин Танабе, ‑ возникает необходимость проведения крупномасштабного анализа данных. Моей целью было создать программное обеспечение, которое позволило бы ученым в максимально сжатые сроки получать наиболее полную информацию о тысячах генов». По словам японского биолога, в подобных программах, существовавших ранее, он видел как небольшие недочеты, так и значимые погрешности. А, следовательно, стремился к тому, чтобы в процессе разработки собственной программы оставить их в прошлом.

Важной отличительной чертой SuBioPlatform является возможность визуализации данных. Помимо стандартных таблиц с указанием названий генов и их числовых характеристик, в файлах формата SSA, создаваемых при помощи SuBio, можно хранить и их визуальное отображение: графики, функции и т.д. Это позволяет видеть картину в полном объеме и благодаря этому проводить более глубокий анализ.

Много сегодня было сказано и о том, что биоинформатики и биологи должны работать совместно: «Любые статистические данные должны анализироваться и проверяться опытным путем. К примеру, на сегодняшний день в США огромные средства вкладываются в IT-сферу с целью разработки неких сложных алгоритмов, позволяющих генерировать результаты экспериментов. Однако если посмотреть на это с сугубо научной точки зрения, то такого рода данные – это лишь идеи для возможных экспериментов». По мнению доктора Танабе, данные высокого качества можно получить только опытным путем.

Программное обеспечение SuBioPlatform имеет бесплатную версию, позволяющую генерировать файлы формата SSA и передавать их коллегам, на компьютерах которых установлена данная система. Платные версии – Basic SuBio и Advanced SuBio – рассчитаны на проведение полноценного анализа данных.

Помимо этого, клиентам SuBio Inc. доступен ряд иных услуг. Например, если при проведении эксперимента у исследователя не получается произвести расчет данных, их можно отправить на обработку специалистам организации.

В конце встречи Акио Танабе обратился к собравшимся с предложением о сотрудничестве: «Если у вас есть идеи, касающиеся разработки некоего программного обеспечения, мы можем поспособствовать вашему продвижению на рынке. Продавая права на программный продукт, вы получаете доступ к широкой клиентской базе. При этом две трети прибыли остается за вами. Более того, мы не претендуем на приобретение исключительных прав на изобретение. Таким образом, вы сможете продавать его и другим организациям».