Последняя работа Денеки А.Я. включает в себя функциональный анализ сложных сигнальных сетей, целью которого является понимание причин метастазирования немелкоклеточного рака легкого. Так, в сотрудничестве с доктором Бумбером Я.А. из КФУ и Э.А. Големис из онкологического центра Фокс Чейз, коллективом был идентифицирован белок Мусаши 2 (MSI2) в качестве маркера предиктора злокачественности заболевания, а также обнаружена его боилогическая роль с поддержании экспрессии EGFR-мутантного немелкоклеточного рака легкого (НМРЛ). Данные открытия имеют важное научно-практическое значение, так как резистентность к таргетной терапии EGFR-мутантного НМРЛ неуклонно растет, и дальнейшие доклинические и, в перспективе, клинические исследования комбинированной таргетной терапии ингибиторами MSI2 и EGFR несут важное прикладное значение.