Наука\Группа Химической Биологии - Казанский (Приволжский) федеральный университет
Наука

​​



В научных проекта Группы используется широкий спектр современных междисциплинарных подходов и методов, применяемых в разработке биологически активных соединений и лекарственных препаратов. В частности, комбинация методов рационального драг-дизайна, компьютерного моделирования и докинга, органического синтеза и медицинской химии, молекулярной и клеточной биологии.


Методы и подходы, используемые в работе:

- анализ цитотоксичности соединений методом MTS-теста для оценки метаболической  активности клеток (планшетный спектрофотометр Infinite M200, Tecan), а также методом биосенсорного клеточного анализа в режиме реального времени (система xCelligence RTCA, Roche Applied Science);

- оценка влияния синтезированных соединений на изменение уровня белка р53 в обработанных опухолевых клетках методом иммуноблоттинга;

- оценка изменения уровня экспрессии различных генов методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ) по технологии Taqman;

- анализ межмолекулярных взаимодействий “белок-лиганд” по технологии поверхностного
плазмонного резонанса (система Biacore T200, GE Healthcare);

- анализ профиля температурной денатурации белков в присутствии лигандов (эффект
индуцированной термической стабильности) методом дифференциальной сканирующей
флуориметрии (Термоциклер Lightcycler 480, Roche);

- определение значений концентрации полумаксимального ингибирования (IC50) синтезированных соединений методом иммуноферментного анализа (ИФА);

- анализ клеточных субпопуляций и определение уровня апоптоза методом проточной цитофлуориметрии (BD FACSAria III CellSorter);

- хроматографическая очистка рекомбинантных белков с использованием хроматографической системы среднего давления NGC Discover (Bio-Rad);

- компьютерное моделирование белков-мишеней (докинг лигандов, поиск карманов) с использованием программ AutoDock, SwissDock, ICM-Pro.