• Dudkina E.V. Binase deletion mutant with enhanced cytotoxic properties / E.V. Dudkina, A.S. Kosnyrev, O.N. Ilinskaya, V.V. Ulyanova // BIO Web of Conferences. - 2025. - V. 173. - Art.№ 02014.
• Пат. 2835675 Российская Федерация, МПК С 12 N 15/90, C 12 N 15/52, C 12 N 1/12, C 12 N 9/22, C 12 R 1/07. Лабораторный способ биосинтеза бациллярной рибонуклеазы (варианты) / В. В. Ульянова, Е. В. Дудкина, В.И., Вершинина, О.Н. Ильинская. - № 2024104712 ; заявл. 26.02.24 ; опубл. 03.03.25, Бюл. № 7.
• Yarullina D. Microscopic research methods in practical microbiology: educational and methodical manual / D. Yarullina, V. Ulyanova, N. Karamova, W. Kurdy, E. Dudkina, A. Suleimanova. – Kazan: KFU, 2025. – 50 p.
  F_Metodichka_2025_mikroskopiya_Final.pdf
  F_Vypiska_UMK_IFMiB.jpg
  Vypiska_kafedra.pdf
• Дудкина Е.В. Молекулярная вирусология: возбудители инфекций: учебно-методическое пособие / Е.В. Дудкина, Р. Шах Махмуд, В.В. Ульянова, А.И. Надырова. - Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2025. - 29 с.
• Ulyanova V. The antiphage effect of ribonuclease binase in Bacillus subtilis population / V. Ulyanova, V. Shitova, S. Luginskaya, E. Dudkina // BIO Web of Conferences. - 2025. - V. 194. - Art. № 01061. https://doi.org/10.1051/bioconf/202519401061
• Надырова А.И. Рецептор эпидермального фактора роста как мишень противоопухолевого действия мутантных форм биназы / А.И. Надырова, Е.В. Дудкина, Э.М. Хафизова, А.Д. Пестов, А.С. Коснырев, В.В. Ульянова, О.Н. Ильинская // Гены и клетки. - 2025. - Т. 20, № 3. DOI: 10.17816/gc687285 EDN: GPZSMN
• Теория и практика научных исследований в области микробиологии, молекулярной и клеточной биологии: Учебное пособие / В. В. Ульянова, Е. В. Дудкина, А. И. Надырова, В. И. Вершинина, О. Н. Ильинская. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2025. – 170 с.

• Dudkina E.V, Vasilieva E.A, Ulyanova V.V, Surfactants as a Means of Delivering a Reporter Genetic Construct Based on Binase Suicide Gene to Tumor Cells//Russian Journal of Bioorganic Chemistry. - 2024. - Vol.50, Is.1. - P.45-55.
• Дудкина Е.В., Коснырев А.С., Ульянова В.В., Надырова А.И., Морозова П.С., Куприянова Е.А., Ильинская О.Н. Оценка функциональной активности и специфичности промотора гена hSLPI // Российский онкологический журнал. - 2024. - Т. 29. - №1. - C. 13-22. doi: 10.17816/onco629570
• Dudkina E.V, Ulyanova V.V, Ilinskaya O.N., Modern approaches in suicidal gene therapy of malignant neoplasms«;« [Современные подходы к суицидальной генотерапии злокачественных новообразований]//Uspehi Molekularnoj Onkologii. - 2024. - Vol.11, Is.2. - P.63-73.
• Dudkina E, Ulyanova V, Asmandiyarova V, Two Main Cancer Biomarkers as Molecular Targets of Binase Antitumor Activity//BioMed Research International. - 2024. - Vol.2024, Is.. - Art. №8159893.

• Надырова, А. И. ЭФФЕКТИВНОСТЬ ЭКСПРЕССИОННЫХ СИСТЕМ НА ОСНОВЕ Escherichia coli И Bacillus subtilis ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ МУТАНТОВ БИНАЗЫ [Текст] / А. И. Надырова, А. С. Коснырев, В. В. Ульянова, Е. В. Дудкина, В. И. Вершинина, О. Н. Ильинская // Молекулярная биология. - 2023. - Т. 57, № 5. - С. 807-818.
• Надырова А.И. Эффективность экспрессионных систем на основе E.coli и B.subilis для получения мутантов РНКазы биназы /А.И.Надырова, А.С.Коснырев, В.В.Ульянова, Е.В.Дудкина, В.И.Вершинина, О.Н.Ильинская //Молеклярная биология. -2023. - Т.57. -№5. - с.807-818.

• Yarullina D. Microbiology and Virology: Revise Your Competence / D. Yarullina, V. Ulyanova, R. Shah Mahmud, A. Suleimanova, Y., Surchenko, E. Dudkina - Delhi: Red Flower Publication Pvt. Ltd. 2022. - 126 p.
  F_Microbiology_and_Virology_Revise_Your_Competence.pdf
  Book_cover_page.jpg
• Ulyanova V, Nadyrova A, Dudkina E, Structural and Functional Differences between Homologous Bacterial Ribonucleases//International Journal of Molecular Sciences. - 2022. - Vol.23, Is.3. - Art. №1867.

• Ulyanova V, Dudkina E, Nadyrova A, The cytotoxicity of rnase-derived peptides//Biomolecules. - 2021. - Vol.11, Is.1. - P.1-14.
• Ульянова В.В., Дудкина Е.В., Шах Махмуд Р., Вершинина В.И. Теория и практика микробиологических исследований: учебно-методическое пособие / В.В. Ульянова, Е.В. Дудкина, Р. Шах Махмуд, В.И. Вершинина . - Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2021. - 80 с.
• Специфические антитела к биназе: получение и применение.// Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2021. – Т. 163, кн. 4. – С. 557–568. – doi: 10.26907/2542-064X.2021.4.557-568.

• Руководство по выполнению выпускных квалификационных работ в лаборатории микробной энзимологии: учебное пособие / В.В. Ульянова, Е.В. Дудкина, Р. Шах Махмуд, Ю.В. Сурченко, В.И. Вершинина. - Казань: Издательство Казанского Университета, 2020. - 136 с.
• Ulyanova, V.; Shah Mahmud, R.; Laikov, A.; Dudkina, E.; Markelova, M.; Mostafa, A.; Pleschka, S.; Ilinskaya, O. Anti-Influenza Activity of the Ribonuclease Binase: Cellular Targets Detected by Quantitative Proteomics. Int. J. Mol. Sci. 2020, 21, 8294.
• Возбудители бактериальных и вирусных инфекций: учебно-методическое пособие / Е.В. Дудкина, Р. Шах Махмуд. - Казань: Издательство Казанского Университета, 2020. - 87 с.

• Калашников, В.А. Иммунохимическая идентификация биназы и ее комплексов/ В.А. Калашников, Е.В. Дудкина, В.В. Ульянова, В.И. Вершина// Сборник тезисов 23-й Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых «Биология – наука XXI века», Пущино, 15 апреля - 19 апреля 2019 г. – Пущино, 2019 – С. 350.
• Kalashnikov, V. Obtaining of specific antibodies against bacterial ribonuclease // Interaction: from cell to human: abstract book of the Russian-German seminar dedicated to the 30th anniversary of the partnership agreement between the Justus Liebig University (Giessen) and Kazan (Volga region) Federal University (Kazan, 20-24 May, 2019) ? Publishing House of Kazan University, 2019. ? P. 51.
• Bakhtiyarova A. The influence of ribonuclease binase on the bacterial biofilm formation / Bakhtiyarova A., Dudkina E., Beisenova Zh., Ulyanova V. // Interaction: from cell to human: abstract book of the Russian-German seminar dedicated to the 30th anniversary of the partnership agreement between the Justus Liebig University (Giessen) and Kazan (Volga region) Federal University, 20-24 May, 2019 – Kazan: Publishing House of Kazan University, 2019 – P. 21.
• Dudkina Е. Cytotoxic potential of binase-derived peptides / Е. Dudkina, V. Ulyanova, О. Ilinskaya // Interaction: from cell to human: abstract book of the Russian-German seminar dedicated to the 30th anniversary of the partnership agreement between the Justus Liebig University (Giessen) and Kazan (Volga region) Federal University, 20-24 May, 2019 – Kazan: Publishing House of Kazan University, 2019 – P. 9.

• Pudovkin M.S. Cellular uptake and cytotoxicity of unmodified Pr3+:LaF3 nanoparticles / M. S.Pudovkin, E. Dudkina, P. V. Zelenikhin, V. V. Shtyreva, D. A. Koryakovtseva, V. G. Evtugyn, V. V. Salnikov, A. S. Nizamutdinov, V. V. Semashko // Eur J Clin Invest. - 2018. - № 48 (Suppl. 1). - P. 107.
  F_First_page_and_content.pdf
  Statya_Pudovkin.pdf
• Дудкина Елена Владимировна, Ульянова Вера Владимировна, Сурченко Юлия Владимировна, Нгуен Тхи Нга, Колпаков Алексей Иванович, and Ильинская Ольга Николаевна. «КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА БИНАЗЫ НЕ ОТРАЖАЕТ ЕЕ НАТИВНУЮ КОНФОРМАЦИЮ« Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки, vol. 160, no. 4, 2018, pp. 591-600.
• Надырова А.И. Создание генетических конструкций, обеспечивающих экспрессию противоопухолевой бактериальной рибонуклеазы в клетках млекопитающих/ А.И. Надырова, Е.В. Дудкина, А.И. Салимова, В.В. Ульянова, О.Н. Ильинская // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V Международной конференции ?ПОСТГЕНОМ'2018?. ? С. 266-267.
• Ilinskaya O., Ulyanova V., Lisevich I., Dudkina E., Zakharchenko N., Kusova A., Faizullin D., Zyev Yu.The native monomer of Bacillus pumilus ribonuclease does not exist extracellularly. BioMed Research International – 2018. - – V. 2018. – Art. 4837623. https://doi.org/10.1155/2018/4837623
  Dimer_indavi18.pdf

• Шах Махмуд Р. Бактериофаги почвенных бацилл: Новый поливалентный фаг Bacillus altitudinis / Р. Шах Махмуд, К. И. Гарифулина, В. В. Ульянова, В. Г. Евтюгин, Л. Н. Миндубаева, Е. В. Дудкина, В. И. Вершинина, А. И. Колпаков, О. Н. Ильинская // Молекулярная генетика микробиология и вирусология. - 2017. -Т. 35, № 2. - С. 59-64. DOI 10.18821/0208-0613-2017-35-2-59-64
• Dudkina E, Ulyanova V, Ilinskaya O., Balnase, a New Dimer-Forming Ribonuclease from Bacillus altitudinis //BioNanoScience. - 2017. - Vol.7, Is.1. - P.127-129. https://doi.org/10.1007/s12668-016-0305-y
• Сокуренко Ю.В. Олигомерная организация рибонуклеазы Bacillus licheniformis / Ю.В. Сокуренко, А.И. Надырова, Е.В. Дудкина, В.В. Ульянова // Iй Российский Микробиологический конгресс: сборник тезисов /под редакцией д.б.н. Решетиловой Т.А. ? М.: Вода: химия и экология, 2017. ? С. 125-126.
• Shah Mahmud R. Bacteriophages of soil bacilli: A new multivalent phage of Bacillus altitudinis / R. Shah Mahmud, K. I. Garifulina, V. V. Ulyanova, V. G. Evtugyn, L. N. Mindubaeva, L. R. Khazieva, E. V. Dudkina, V. I. Vershinina, A. I. Kolpakov, O. N. Ilinskaya // Mol. Gen. Microbiol. Virol. - 2017. - V. 32, I. 87. - P. 87-93. DOI:10.3103/S0891416817020082
• Сокуренко Ю.В. Олигомерная организация рибонуклеазы Bacillus licheniformis / Ю.В. Сокуренко, А.И. Надырова, Е.В. Дудкина, В.В. Ульянова // Iй Российский Микробиологический конгресс: сборник тезисов /под редакцией д.б.н. Решетиловой Т.А. – М.: Вода: химия и экология, 2017. – С. 125-126.
• Ульянова В.В. Сравнительный анализ геномов группы «Bacillus subtilis«, разделенных по способности секретировать гуанилпредпочитающие рибонуклеазы / В.В. Ульянова, Р. Шах Махмуд , Е.В. Дудкина , В.И. Вершинина, О.Н. Ильинская // 1-й Российский Микробиологический Конгресс. - Пущино, 2017. - C. 130-131.
  Ulyanova_2017.pdf

• Dudkina E. Three-step procedure for preparation of pure Bacillus altitudinis ribonuclease / E. Dudkina, V. Ulyanova, R. Shah Mahmud, V. Khodzhaeva, L. Dao, V. Vershinina, A. Kolpakov, O. Ilinskaya // FEBS Open Bio. - 2016. - V. 6., I. 1. - P. 24-32. doi: 10.1002/feb4.12023
  Three_step_procedure_for_preparation_of_pure_Bacillus_altitudinis_ribonuclease.pdf
• Дудкина Е.В. Природные димеры микробных рибонуклеаз / Е.В. Дудкина, В.В. Ульянова, О.Н. Ильинская. – Казань: Изд-во КФУ, 2016. – 92 с. (5,4 п.л.), ISBN 978-5-00019-745-5, тираж 100 экз.
• Ulyanova V. Phylogenetic distribution of extracellular guanyl-preferring ribonucleases renews taxonomic status of two bacillus strains / V. Ulyanova R. Shah Mahmud, E. Dudkina, V. Vershinina, E. Domann, O. Ilinskaya // Journal of General and Applied Microbiology. - 2016. - V.62(4). - P. 181-188. doi: 10.2323/jgam.2016.02.005
  62_2016.02.005.pdf
• Ilinskaya O. N. Direct inhibition of oncogenic KRAS by Bacillus pumilus ribonuclease (binase) /O. N. Ilinskaya, I. Singh, E. Dudkina, V. Ulyanova, A. Kayumov, G. Barreto // Biochim Biophys Acta. 2016 V. 1863. I. 7. P. 1559-1567. doi: 10.1016/j.bbamcr.2016.04.005.

• Ульянова В. В., Препараты секретируемой РНКазы Bacillus pumilus: один фермент или два? / В. В. Ульянова, В. С. Ходжаева, Е. В. Дудкина, В. И. Вершинина, А. В. Лайков, О. Н. Ильинская // Микробиология. - 2015. - Т. 84, №4. - С. 425-432.
• Ulyanova V.V. Preparations of Bacillus pumilus secreted RNase: One enzyme or two? / V.V. Ulyanova, V.S. Khodzhaeva, E.V. Dudkina, A.V. Laikov, V.I. Vershinina, O.N. Ilinskaya // Microbiology (Russian Federation). - 2015 - V. 84, I. 4. - P. 491-497. doi: 10.1134/S0026261715040177.
  2015_Preparations_of_Bacillus_pumilus_secreted_RNase.pdf
• Сокуренко Ю. В. Разработка универсального метода получения микробных ферментов как потенциальных терапевтических средств нового поколения в борьбе с онкологическими заболеваниями / Ю.В. Сокуренко, Е.В. Дудкина, В.В. Ульянова, О.Н. Ильинская // Молодежь и инновации Татарстана»: сборник материалов конференции молодых ученых. - Казань, 2015. - С. 17-18.
• Shah Mahmud R. Draft whole-genome sequence of Bacillus altitudinis strain B-388, a producer of extracellular RNase / R. Shah Mahmud, V. Ulyanova, S. Malanin, E. Dudkina, V. Vershinina, O. Ilinskaya // Genome Announc. - 2015. - V. 3, I. 1. - P. e01502-14. doi:10.1128/genomeA.01502-14.

• Дудкина Е. В. Bacillus thuringiensis var. subtoxicus B-388 в современной классификации микроорганизмов / Е. В. Дудкина, В. В. Ульянова, Р. Шах Махмуд, В. И. Вершинина, О. Н. Ильинская // "Микробиология в современной медицине": материалы Второй ежегодной заочной научно-практической конференции, приуроченной к 200-летию Казанского государственного медицинского университета. - Казань, 2014. - C. 36.
• Ulyanova V. Draft whole genome sequence of Bacillus pumilus strain 3-19, a chemical mutant overproducing extracellular ribonuclease / V. Ulyanova, R. Shah Mahmud, E. Dudkina, V. Vershinina, O. Ilinskaya // Genome Announc. - 2014. - V. 2, № 4. - P. e00724-14. doi:10.1128/genomeA.00724-14.
• Dudkina E. New insight into secreted ribonuclease structure: binase is a natural dimer / Dudkina E., Kayumov A., Ulyanova V., Ilinskaya O. // PLoS One. - 2014. - V. 9(12). - P. e115818. doi:10.1371/journal.pone.0115818.
  journal.pone.0115818.pdf
• Dudkina E. New insight into secreted ribonuclease structure: binase is a natural dimer / E. Dudkina, A. Kayumov, V. Ulyanova, O. Ilinskaya // PLoS One. - 2014. - V. 9(12). - P. e115818. doi:10.1371/journal.pone.0115818.
  New_Insight_into_Secreted_Ribonuclease.pdf
• Дудкина Е. В. Выделение новой рибонуклеазы B. altitudinis с использванием рекомбинантного штамма-продуцента B. megaterium PV370 / Е. В. Дудкина, А. К. Гальцова, В. В. Ульянова, Р. Шах Махмуд, В. И. Вершинина, О. Н. Ильинская // «Ломоносов-2014»: материалы междунар. науч. конф. студентов, аспирантов и молодых учёных. - М., 2014. - С. 17-18.
• Дудкина Е. В. Трансформированные эпителиальные клетки легких – продуценты микробной РНКазы (биназы) / Е. В. Дудкина, И. Сайн, В. В. Ульянова, Р. Шах Махмуд, Г. Баррето, О. Н. Ильинская // Гены и Клетки. - 2014. - Т. IX, №3. - С. 63-67.
• Шах Махмуд Р. Секвенирование полного генома бактерии Bacillus altitudinis, выделенной из организма южной амбарной огневки / Р. Шах Махмуд, В. В. Ульянова, С. Ю. Маланин, Е. В. Дудкина, О. Н. Ильинская // "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине": сборник трудов IV междунар. науч.-практической конф. - Казань, 2014. - С. 22.

• Дудкина Е. В. Получение новой секретируемой рибонуклеазы Bacillus sp. на основе рекомбинантного штамма Bacillus megaterium / Е. В. Дудкина, В. В. Ульянова, Р. Шах Махмуд, А. К. Гальцова, Е. В. Никитина, В. И. Вершинина, О. Н. Ильинская // Вестник Казанского технологического университета. - 2013. - T. 16, № 10. - С. 186-190.