Учёный совет Елабужского института является выборным коллегиальным органом, осуществляющим общее руководство институтом. Учёный совет института осуществляет свою деятельность, руководствуясь Уставом КФУ, решениями органов управления КФУ, локальными нормативными актами КФУ.
Учёный совет Елабужского института КФУ рассматривает и представляет на утверждение Учёного совета КФУ программы развития института, концепции и представления о создании в институте структурных подразделений, рассматривает планы работы научно-исследовательских подразделений, предварительно рассматривает и рекомендует кандидатуры на должности заведующих кафедрами.
В сфере полномочий Учёного совета института находится рассмотрение итогов работы государственной экзаменационной комиссии и заслушивание информации о выпуске обучающихся по направлениям подготовки бакалавриата, специалитета, магистратуры и аспирантуры, утверждение планов научно-исследовательской деятельности, повышения квалификации работников основных подразделений института.
