Варнек Александр . Результативность работы. Персональная страница сотрудника КФУ. Казанский (Приволжский) федеральный университет.
Институт геологии и нефтегазовых технологий
Институт фундаментальной медицины и биологии
Институт экологии и природопользования
Химический институт им. А.М. Бутлерова
Междисциплинарный центр "Аналитическая микроскопия"
Научно-образовательный центр фармацевтики
Юридический факультет
Институт международных отношений
Институт филологии и межкультурной коммуникации им. Льва Толстого
Институт психологии и образования
Институт социально-философских наук и массовых коммуникаций
Высшая школа журналистики и медиакоммуникаций
Институт управления, экономики и финансов
Высшая школа государственного и муниципального управления
Высшая школа бизнеса
Общеуниверситетская кафедра физического воспитания и спорта
Институт физики
Институт информационных технологий и интеллектуальных систем
Институт вычислительной математики и информационных технологий
Институт математики и механики им. Н.И. Лобачевского
Инженерный институт
Факультет повышения квалификации
Подготовительный факультет для иностранных учащихся
Институт непрерывного образования
IT-лицей-интернат КФУ
Лицей имени Н.И.Лобачевского
Набережночелнинский институт КФУ
Елабужский институт КФУ
Вход
Сайт ректора
Студенту
Абитуриенту
Сотруднику
Выпускнику
Карьера
Музеи
Библиотека
Газета "Казанский университет"
UNIVER TV
Газета "Darelfonyn"
...
English
Español
中文
Институты и факультеты
Об Университете
Миссия университета
Структура КФУ
Документы
Безопасность университета
История Университета
Стратегия развития
Цифры и факты (отчеты КФУ)
Интернет-приемная
Закупки
Достижения КФУ
Карта всех объектов
Телефонный справочник КФУ
Сотрудники КФУ
Обучающиеся КФУ
Корпоративный центр компетенций
Раскрытие информации
Информация от Минюста России о рассмотрении обращений граждан и организаций
Национальные проекты
Образование
Основные подразделения и филиалы КФУ
Нормативно-правовое обеспечение образовательной деятельности
Учебные и методические материалы
Дистанционное обучение
Электронное обучение
Контингент обучающихся
Стипендии
Расписание
Журнал успеваемости
Практика для студентов
Вакансии для студентов
Работодателям
Обучение и стажировки за рубежом
Дополнительное образование
Довузовское образование
Физика для всех
Геология для всех
Международная олимпиада Ассоциации "Глобальные университеты" для абитуриентов магистратуры
Наука
Управление научно-исследовательской деятельности
Инновационная деятельность
Новости
Научная лаборатория
Аспирантура и докторантура
Отдел аттестации научно-педагогических кадров
Патентно-лицензионный отдел
Научные издания КФУ
Научные проекты КФУ
Конференции
Научно-исследовательская работа студентов (НИРС)
Научный центр мирового уровня
Научный центр "Регуляторная геномика"
Полигон "Карбон Поволжье"
Конкурсы и гранты
ЦКП и УНУ
Крупные проекты
Здравоохранение
О мерах по предупреждению коронавируса
Научные исследования
Университетская клиника
Высшая школа медицины
Высшая школа биологии
Ординатура
Дополнительное образование
Аспирантура
Научно-клинический центр прецизионной и регенеративной медицины
Научно-клинический центр профилактической медицины
Симуляционный центр
Аккредитационный центр
Центр экспериментальной медицины
Стоматологический фантомный класс
Инжиниринговый центр медицинских симуляторов "Центр медицинской науки"
Документы
Международная деятельность
Департамент внешних связей
Развитие сотрудничества
Обучение и стажировки за рубежом
Приглашение иностранного учёного
Миграционное сопровождение иностранных граждан
Признание иностранного образования
Обучение иностранных граждан
Адаптация иностранных граждан
Студенческий научный кружок "Полимирие"
Летний университет 2024
Нормативные документы и шаблоны
Университет и общество
Дистанционное обучение в КФУ
Музеи
Научная библиотека им.Н.И.Лобачевского
Общественные организации
Выпускникам
Представителям СМИ
Социальная инфраструктура
Здравоохранение
Вакансии
КФУ в проекте "Культурное наследие России"
Дирекция социально-спортивных объектов КФУ
Программа оздоровления работников
Полезные ссылки
Локальный этический комитет
Национальный проект "Наука и университеты"
Десятилетие науки и технологий
Приоритет 2030
Варнек Александр (архив)
2022
Fatykhova A. Planning of chemical synthesis based on Monte-Carlo Tree Search. A. Fatykhova, T. Madzhidov, R. Nugmanov, A. Varnek // 5-я Российская конференция по медицинской химии с международным участием МедХим-Россия 2021 : материалы конференции, Волгоград, 16-19 мая, 2022 / Европейская Федерация Медицинской Химии ; Министерство науки и высшего образования Российской Федерации ; Российская академия наук [и др.]. Волгоград : Издательство ВолгГМУ, 2021. - С. 174.
Timur Gimadiev, Ramil Nugmanov, Aigul Khakimova, Adeliya Fatykhova, Timur Madzhidov, Pavel Sidorov, Alexandre Varnek (2021). CGRdb2.0: A Python Database Management System for Molecules, Reactions, and Chemical Data. Journal of Chemical Information and Modeling. https://doi.org/10.1021/acs.jcim.1c01105
2021
Rakhimbekova, A. Cross-validation strategies in QSPR modelling of chemical reactions / A. Rakhimbekova, T.N. Akhmetshin, G.I. Minibaeva, R.I. Nugmanov, T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, I.I. Baskin, A. Varnek // SAR and QSAR in Environmental Research -2021.-32(3)-pp.207-219. doi: 10.1080/1062936X.2021.1883107.
Rakhimbekova А. CONJUGATED QUANTITATIVE STRUCTURE-PROPERTY RELATIONSHIP MODELS / A. Rakhimbekova, D.V. Zankov, R.I. Nugmanov, T.I Madzhidov, I.I Baskin, A.A Varnek // XII International Conference on Chemistry for Young Scientists (Mendeleev 2021) September 6-10, 2021, Saint-Petersburg, Russia P. 157.
Фатыхова А.А., Нугманов Р.И., Мухаметгалеев Р.Н., Маджидов Т.И., Варнек А. Предсказание пути синтеза химического соединения и его аналогов / А.А. Фатыхова, Р.И. Нугманов, Р.Н. Мухаметгалеев, Т.И. Маджидов, А. Варнек // Материалы Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных "Ломоносов2021" (12 - 23 Апреля 2021), секция "Химия". - М.: Издательство "Перо", 2021. - 80 МБ. [Электронное издание] - С. 744.
Фатыхова А.А. Платформа для дизайна синтеза молекул с заданными характеристиками. / А.А. Фатыхова, Д. Хорват, Д.В. Занков, Р.И. Нугманов, Т.И. Маджидов, А. Варнек // СБОРНИК НАУЧНЫХ ТРУДОВ XXVII СИМПОЗИУМА "БИОИНФОРМАТИКА И КОМПЬЮТЕРНОЕ КОНСТРУИРОВАНИЕ ЛЕКАРСТВ" (5-8 апреля 2021). Москва: Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, 2021. - С. 69.
2020
Фатыхова А.А. Предсказание пути синтеза целевого соединения и его аналогов на основе алгоритма обучения с подкреплением / А.А. Фатыхова, Т.И. Маджидов, В.А. Малых, И.С. Кузнецов, Б.И. Пякилля, Р.И. Нугманов, А. Варнек // Сборник тезисов докладов Шестой Междисциплинарной конференции "Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии" / под редакцией К.В. Кудрявцева и Е.М. Паниной. - М.: "Перо", 2020. - С. 108
ПРОГНОЗИРОВАНИЕ КИНЕТИЧЕСКИХ И ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИХ ХАРАКТЕРИСТИК ХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ МЕТОДОВ МАШИННОГО ОБУЧЕНИЯ: КАКИЕ ДЕСКРИПТОРЫ ЛУЧШЕ ВСЕГО ИСПОЛЬЗОВАТЬ? / А. Рахимбекова, Г. И. Минибаева, Д. Мазитов, А. Кокорин, А. Семенова, Р. И. Нугманов, П. Г. Полищук, Т. И. Маджидов, А. Варнек // Современные синтетические методологии для создания лекарственных препаратов и функциональных материалов (MOSM 2020) : IV Международная научно-практическая конференция : сборник тезисов (Екатеринбург, 16?20 ноября 2020 г.). ? Екатеринбург : Индивидуальный предприниматель Шестакова Екатерина Вячеславовна, 2020. ? ISBN 978-5-6044427-1-5. ? PR-63.
Фатыхова А.А. Предсказание пути синтеза целевого соединения и его аналогов на основе алгоритма обучения с подкреплением / А.А. Фатыхова, Т.И. Маджидов, В.А. Малых, И.С. Кузнецов, Б.И. Пякилля, Р.И. Нугманов, А. Варнек // Сборник тезисов докладов Шестой Междисциплинарной конференции «Молекулярные и Биологические аспекты Химии, Фармацевтики и Фармакологии« / под редакцией К.В. Кудрявцева и Е.М. Паниной. - М.: «Перо«, 2020. - С. 108
Madzhidov T.I. Deep conditional variational autoencoder for reaction conditions prediction / T.I.Madzhidov, D.A. Mazitov, V.A. Afonina, T.N. Akhmetshin, J.D. Skibina, A.I. Lin, R.I. Nugmanov, A. Varnek // 3rd RSC-BMCS/RSC-CICAG Artificial Intelligence in Chemistry. - London, 2020. - P. 55.
thesis.pdf
СОПРЯЖЕННЫЕ МОДЕЛИ ДЛЯ ОДНОВРЕМЕННОГО ПРЕДСКАЗАНИЯ КОНСТАНТЫ ТАУТОМЕРНОГО РАВНОВЕСИЯ И КОНСТАНТЫ КИСЛОТНОСТИ / А. Рахимбекова, Д. В. Занков, Т. Р. Гимадиев, Р. И. Нугманов, Т. И. Маджидов, М. А. Казымова, И. И. Баскин, А. Варнек // Современные синтетические методологии для создания лекарственных препаратов и функциональных материалов (MOSM 2020) : IV Международная научно-практическая конференция : сборник тезисов (Екатеринбург, 16?20 ноября 2020 г.). ? Екатеринбург : Индивидуальный предприниматель Шестакова Екатерина Вячеславовна, 2020. ? ISBN 978-5-6044427-1-5. ? PR-62.
2019
Афонина, В.А. Предсказание оптимальных условий проведения реакций каталитического гидрирования с использованием искусственных нейронных сетей / Д.А. Мухаметзянова, А.С. Делова, Р.И. Нугманов, Т.И. Маджидов, А.А. Варнек // Сборник материалов XXVI Российского национального конгресса “Человек и лекарство 2019.” Тезисы докладов. – Москва, 2019. – С. 98.
G.I. Minibaeva Сomparison of different ways to description methods for chemical reactions in the modeling ?structure - reactivity? // G.I. Minibaeva, A. Rakhimbekova, T.I. Madzhidov, A. Varnek // Markovnikov Congress on Organic Chemistry.-2019.- P. 153.
Рахимбекова, А. Сравнение методов оценки области применимости моделей для предсказания связи "структура - реакционная способность"/ А.Рахимбекова, Р.И. Нугманов, Т.Р. Гимадиев, Т.И. Маджидов, А. Варнек // Сборник материалов XXVI Российского национального конгресса "Человек и лекарство". Тезисы докладов М.: Видокс, 2019.- C. 132-133.
Мухаметгалеев Р.Н. Предсказание биоизостерных замен с использованием подхода Конденсированного графа реакции/Р.Н.Мухаметгалеев,Т.Р.Гимадиев,Р.И. Нугманов, Г.Р.Миндубаева,П.Г.Полищук,Т.И.Маджидов,И.С.Антипин,А.А.Варнек//Сборник материалов XXVI Российского национального конгресса "Человек и лекарство 2019" Тезисы докладов 2019.-С.126.
Fatykhova A. Computational Reactor: generation of possible products of reactions involving given chemical compound / A. Fatykhova, R. Nugmanov, R. Mukhametgaleev, T. Madzhidov, A. Varnek // Markovnikov Congress on Organic Chemistry (June 201-28): book of abstracts, 2019. - P 56.
Fatykhova A. Computational Reactor for chemical synthesis planning: generation of possible reactions involving given chemical compound / A. Fatykhova, R. Nugmanov, R. Mukhametgaleev, T. Madzhidov, A. Varnek // XXI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry. Book 1: Abstracts. – Saint Petersburg, 2019 - P. 137
Zankov D.V, Madzhidov T.I, Rakhimbekova A, Conjugated Quantitative Structure-Property Relationship Models: Application to Simultaneous Prediction of Tautomeric Equilibrium Constants and Acidity of Molecules//Journal of Chemical Information and Modeling. - 2019. - Vol. 59, Is. 11. - 4569-4576
Gimadiev T.R, Klimchuk O, Nugmanov R.I, Sydnone-alkyne cycloaddition: Which factors are responsible for reaction rate ?//Journal of Molecular Structure. - 2019. - Vol.1198 - Art. № 126897.
Введение в хемоинформатику: учеб. пособие. Ч. 6. Химическое пространство и виртуальный скрининг / Т.И. Маджидов, И.И. Баскин, А.А. Варнек. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2019. – 240 с.
Fatykhova A. Computational Reactor for chemical synthesis planning: generation of possible reactions involving given chemical compound / A. Fatykhova, R. Nugmanov, R. Mukhametgaleev, T. Madzhidov, A. Varnek // XXI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry. Book 1: Abstracts. ? Saint Petersburg, 2019 - P. 137
Fatykhova A. Computational Reactor: generation of possible products of reactions involving given chemical compound / A. Fatykhova, R. Nugmanov, R. Mukhametgaleev, T. Madzhidov, A. Varnek // Markovnikov Congress on Organic Chemistry (June 201-28): book of abstracts, 2019. - P 56.
Fatykhova A. CGR-DB cartridge in chemical synthesis planning / A. Fatykhova, R. Nugmanov, T. Madzhidov, A. Varnek // Markovnikov Congress on Organic Chemistry (June 201-28): book of abstracts, 2019. - P 147.
Fatykhova A. CGR-DB cartridge in chemical synthesis planning / A. Fatykhova, R. Nugmanov, T. Madzhidov, A. Varnek // Markovnikov Congress on Organic Chemistry (June 201-28): book of abstracts, 2019. - P 147.
F_mc150cgrdb.pdf
Rakhimbekova A. BENCHMARKING ANALYSIS OF APPLICABILITY DOMAIN DEFINITION: CHEMICAL REACTIONS CASE. A. Rakhimbekova, R.I. Nugmanov, T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, A. Varnek // Mendeleev 2019, the XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. 2019. P. 425.
Gimadiev T.R. REACTIONS MODELING WORKFLOW USING CONDENSED GRAPH OF REACTION / Gimadiev T.R., Akhmetshin T.N., Rahimbekova A., Nugmanov R.I., Polishchuk P.G., Madzhidov T.I., Antipin I.S., Varnek A. // ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry.- 2019.- P 81
Nugmanov, R.I. TOOLCHAIN FOR REACTIONS PROCESSING, MODELING AND STORAGE / Nugmanov R.I., Fatykhova A.A., Mukhametgaleev R.N., Rakhimbekova A., Akhmetshin T.N., Gimadiev T.R., Batyrshyn D.S., Afonina V.A., Madzhidov T.I., Varnek A. // ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry.- 2019.- P 71.
Gimadiev, T.R. REACTIONS MODELING WORKFLOW USING CONDENSED GRAPH OF REACTION / T.R. Gimadiev, T.N. Akhmetshin, A. Rahimbekova, R.I. Nugmanov, P.G. Polishchuk, T.I. Madzhidov, I.S. Antipin, A. Varnek. Mendeleev 2019, the XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. - 2019. - P 398
Афонина, В.А. Предсказание оптимальных условий проведения реакций каталитического гидрирования с использованием искусственных нейронных сетей / В.А. Афонина, Д.А. Мухаметзянова, А.С. Делова, Р.И. Нугманов, Т.И. Маджидов, А.А. Варнек // Сборник материалов XXVI Российского национального конгресса Человек и лекарство. Тезисы докладов. - Москва, 2019. - С. 98.
2018
Assessment of tautomer distribution using the condensed reaction graph approach / T. Gimadiev, T. Madzhidov, R. Nugmanov, I.I. Baskin, I.S. Antipin, A. Varnek // Journal of Computer-Aided Molecular Design.? 2018.? P.1-14
Rakhimbekova, A. Comparison of the applicability domain for chemical reactions / A. Rakhimbekova, T. Madzhidov, T. Gimadiev, R. Nugmanov, M. Glavatskikh, A. Varnek // Book of abstracts of Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive Chemistry". - 2018. - P.58.
Gimadiev T.R, Madzhidov T.I, Nugmanov R.I, Assessment of tautomer distribution using the condensed reaction graph approach//Journal of Computer-Aided Molecular Design. - 2018. - Vol.32, Is.3. - P.401-414.
Afonina, V.A. Reaction conditions prediction by artificial neural networks / V.A. Afonina, A. Delova, R.I. Nugmanov, T.I. Madzhidov, O. Klimchuk, A. Varnek // Third International School-Seminar «From Empirical to Predictive Chemistry« (Kazan, 5-7 April 2018): book of abstracts. - Kazan: Kazan Federal University, 2018. - P. 31.
Lin A, Horvath D, Afonina V, Mapping of the Available Chemical Space versus the Chemical Universe of Lead-Like Compounds//ChemMedChem. - 2018. - Vol. 13, Is. 6. - P. 540-554.
Afonina, V.A. Reaction conditions prediction by artificial neural networks / V.A. Afonina, A. Delova, R.I. Nugmanov, T.I. Madzhidov, O. Klimchuk, A. Varnek // Third International School-Seminar From Empirical to Predictive Chemistry (Kazan, 5-7 April 2018): book of abstracts. - Kazan: Kazan Federal University, 2018. - P. 31.
Lin A, Horvath D, Afonina V, Mapping of the Available Chemical Space versus the Chemical Universe of Lead-Like Compounds//ChemMedChem. - 2018. - Vol. 13, Is. 6. - P. 540-554.
Muhametgaleev R.N.Automatic analysis of reactivity of functional groups under conditions of catalytic hydrogenatio/ R.N.Muhametgaleev,S.I.Musaeva,T.I.Madzhidov,R.I.Nugmanov,A.A.Varnek//First Russian-Chinese Workshop on Organic and Supramolecular Chemistry(Kazan,27-29 August 2018):book of abstracts.Kazan: Kazan Federal University, 2018.
Afonina V.A. Ranking of Reaction Condition Applicability Based of Artificial Networks / V.A. Afonina, A. Delova, R. Nugmanov, T. Madzhidov, O. Klimchuk, A. Varnek // 6th Strasbourg Summer School in Chemoinformatics: Strasbourg, 25 June - 29 June 2018. - Strasbourg, 2018. - P. 40.
Fatykhova A. On-line reaction database cartridge with built-in condensed graph of reaction-based search engine / A. Fatykhova, R. Nugmanov, T. Madzhidov, A. Varnek // Third International School-Seminar «From Empirical to Predictive Chemistry« (April 5–7, 2018, Kazan, Russia): book of abstracts / ed.: T.I. Madzhidov, V.A. Afonina; I.S. Antipin. Kazan: Kazan University Press, 2018. – 96 p.
ONLINE_REACTION_DATABASE_CARTRIDGE.pdf
Фатыхова А. А. CGR-db — интегрированный картридж для системы управления базой данных химических реакций / А. А. Фатыхова, Р. И. Нугманов, Т. И. Маджидов, А. Варнек // III Международная школа-конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Материалы и технологии XXI века«: 29 - 31 октября 2018. - КФУ, 2018.
Хайруллина, А.И. Подход для создания атом-атомного отображения с использованием наивного Байесовского классификатора / А. И. Хайруллина, Т.И. Маджидов, Р.И. Нугманов, В.А. Афонина, И.И. Баскин, А.А. Варнек // Ученые записки Казанского университета. Серия: Естественные науки. - 2018. - Т. 160, кн. 2. - С. 200–213.
Маджидов Т.И. Хемоинформатика в анализе и предсказании характеристик химических реакций / Маджидов Т.И., Нугманов Р.И., Гимадиев Т.Р., Афонина В.А., Фатыхова А.А., Мухаметгалеев Р.Н., Рахимбекова А.Б., Мусаева С.И., Боначера Ф, Баскин И.И., Антипин И.С., Варнек А.А. // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V международной конференции ПОСТГЕНОМ 2018. 29 октября - 2 ноября 2018. - Казань: Изд. Казан. ун-та. 2018. - С. 342.
Фатыхова А. А. CGR-db - интегрированный картридж для системы управления базой данных химических реакций / А. А. Фатыхова, Р. И. Нугманов, Т. И. Маджидов, А. Варнек // Сборник научных тезисов III Международной школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых Материалы и технологии XXI века: 29 - 31 октября 2018. - КФУ, 2018.
Фатыхова А.А. Автоматизированная система для поиска реакций, реакционных центров и анализа защитных групп с использованием картриджа данных CGR-DB / Фатыхова А.А., Нугманов Р.И., Мухаметгалеев Р.Н., Мусаева С.И., Афонина В.А., Маджидов Т.И., Варнек, А.А. // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V международной конференции ПОСТГЕНОМ 2018. 29 октября - 2 ноября 2018. - Казань: Изд. Казан. ун-та. 2018. - С. 319.
Хайруллина, А.И. Подход для создания атом-атомного отображения с использованием наивного Байесовского классификатора / А. И. Хайруллина, Т.И. Маджидов, Р.И. Нугманов, В.А. Афонина, И.И. Баскин, А.А. Варнек // Ученые записки Казанского университета. Серия: Естественные науки. - 2018. - Т. 160, кн. 2. - С. 200?213.
Artificial neural networks model for assessment of optimal conditions of hydrogenation reactions / T. Madzhidov, V. Afonina, A. Delova, D. Mukhametzyanova, R. Nugmanov, R. Mukhametgaliev, O. Klimchuk, A. Varnek // 22nd EuroQSAR symposium: Thessaloniki, Greece, 16 September - 20 September 2018: abstract book. - Greece, 2018. - P. 186.
Fatykhova A. Automated system for searching reactions, reaction centers and analysis of protective groups using CGR-DB cartridge / A. Fatykhova, R. Nugmanov, R. Mukhametgaleev, S. Musaeva, V. Afonina, T. Madzhidov, A. Varnek //In search of models for personalized medicine. Abstracts volume of V International conference “POSTGENOME'2018” (October 29 - November 2, 2018) - Kazan: KFU publishing office. 2018. - P. 319. (poster presentation)
abstract.pdf
Афонина, В.А. Интерактивные таблицы оценки реакционной способности защитных групп/ В.А. Афонина, С.И. Мусаева, Р.И. Нугманов, А.И. Лин, Т.И. Маджидов, О. Климчук, И.С. Антипин, А. Варнек // Сборник тезисов научной конференции Марковниковские чтения. Органическая химия: от Марковникова до наших дней.Пансионат МГУ Красновидово, 19-23 января 2018 г. - М., 2018. - С. 66.
2017
T.I. Madzhidov, T.R. Gimadiev, D.A. Malakhova, R.I. Nugmanov, I.I. Baskin, I.S. Antipin, and .A. Varnek. Structure-Reactivity modeling for Dielas-alder reactions based on the condensed REACTION graph approach.Journal of Structural Chemistry,2017, Vol.58, No 4,p. 685-691
Structure?reactivity modeling using mixture-based representation of chemical reactions / P. Polishchuk, T. Madzhidov, T. Gimadiev, A. Bodrov, R. Nugmanov, A. Varnek // Journal of Computer-Aided Molecular Design.? 2017.? P.1-11
Afonina, V.A. Automatic system for prediction of optimal condition for hydrogenation reactions / V. Afonina, A. Lin, T. Madzhidov, R. Nugmanov, I. Antipin, O. Klimchuk, A. Varnek // 3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics (5–7 July 2017, Kazan). – Kazan: Kazan Federal University, 2017. - P. 38.
Madzhidov T. I., Gimadiev T. R., Malakhova D. A., STRUCTURE-REACTIVITY RELATIONSHIP IN DIELS-ALDER REACTIONS OBTAINED USING THE CONDENSED REACTION GRAPH APPROACH//JOURNAL OF STRUCTURAL CHEMISTRY. - 2017. - Vol.58, Is.4. - P.650-656.
Afonina, V. Automatic system for prediction of optimal condition for hydrogenation reactions / V. Afonina, A. Lin, T. Madzhidov, R. Nugmanov, I. Antipin, O. Klimchuk, A. Varnek // 3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics (5-7 July 2017, Kazan). - Kazan: Kazan Federal University, 2017. - P. 38.
Baskin Igor I., Madzhidov Timur I., Antipin Igor S., Artificial intelligence in synthetic chemistry: achievements and prospects//RUSSIAN CHEMICAL REVIEWS. - 2017. - Vol.86, Is.11. - P.1127-1156.
Введение в хемоинформатику: учеб. пособие. Ч. 5. Информатика химических реакций / И.И. Баскин, Т.И. Маджидов, А.А. Варнек. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2017. – 244 с.
Madzhidov, T. Handling of Markush Structures / T.I. Madzhidov, R.I. Nugmanov, A. Varnek //Tutorials in Chemoinformatics. - Hoboken: John Wiley & Sons, 2017 - p. 67-73
Nugmanov R. CGR-DB. INTERACTIVE REACTION DATABASE AND CGR-BASED SEARCH ENGINE / R. Nugmanov, B. Sattarov, A. Fatykhova, A. Kutlushina, F. Bekmuratova, Z. Khayrullina, E. Moiseeva, R. Gimatev, T. Madzhidov, A. Varnek // 3rd Kazan Summer School on Chemoinformatics. (5–7 July 2017, Kazan). Books of abstracts. – Kazan: Kazan Federal University, 2017. – 92.
F_tuzis.pdf
Polishchuk P, Madzhidov T, Gimadiev T, Structure?reactivity modeling using mixture-based representation of chemical reactions//Journal of Computer-Aided Molecular Design. - 2017. - Vol.31, Is.9. - P.829-839.
2016
Madzhidov, T.I. Prediction of tautomeric equilibria: QSAR vs quantum chemistry / T.I. Madzhidov, T.R. Gimadiev, R.I. Nugmanov, I.I. Baskin, I.S. Antipin, A.Varnek // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design: May 18-20, 2016, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - P. 30.
Sidorov, P. Visualization and analysis of large dataset of chemical reactions using GTM / P. Sidorov, A. Lin, T. Madzhidov, A. Varnek // 5th Chemoinformatics Strasbourg Summer School: book of abstracts, June 27 - July 1, 2016, Strasbourg, France.
Afonina V.A. Mapping of the Chemical Uni-verse versus Available Chemical Space of Lead-Like Compounds / V.A. Afonina, D. Horvath, A. Varnek // 5th Chemoinformatics Strasbourg Summer School: Strasbourg, 27 June - 1 July 2016. – P. 77.
Glavatskikh M. Predictive Models for Halogen-bond Basicity of Binding Sites of Polyfunctional Molecules / M. Glavatskikh, T. Madzhidov, V. Solov'ev, G. Marcou, D. Horvath, J. Graton, J.-Y. Le Questel, A. Varnek // Molecular Informatics. - 2016. - V. 35, Is. 2. - Pp. 70-80.
Madzhidov, T.I. Asessment of optimal reaction conditions: deprotection in catalytic hydrogenation conditions / T.I. Madzhidov, A.I. Lin, R.I. Nugmanov, O. Klimchuk, I. Antipin, A. Varnek // 5th Chemoinformatics Strasbourg Summer School: book of abstracts, June 27 - July 1, 2016, Strasbourg, France. - P. 52.
Введение в хемоинформатику: учеб. пособие. Ч. 4. Методы машинного обучения / И.И. Баскин, Т.И. Маджидов, А.А. Варнек. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2016. – 330 с.
Klimchuk, O. Assessment of optimal conditions in reactions of catalytic hydrogenation / O. Klimchuk, A.I. Lin, T.I. Madzhidov, R.I. Nugmanov, I. Antipin, A. Varnek // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design: May 18-20, 2016, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - P. 9.
Glavatskikh, M. Predictive models for diiodine basicity scale of halogen bond / M. Glavatskikh, T. Madzhidov, V. Solov`ev, D. Horvath, G. Marcou, A. Varnek // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design: May 18-20, 2016, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - P. 14
Gimadiev, T.R. Predicting of reactivity for biorthogonal reactions of sydnones heterocycles with alkynes / T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, R.I. Nugmanov, A. Varnek // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design: May 18-20, 2016, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - P. 19.
Nugmanov R.I. Automatic reaction processing and standardization workflow / R.I. Nugmanov, T.I. Madzhidov, A. Varnek // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design: May 18-20, 2016, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - P. 37.
Afonina, V.A. Mapping of the Chemical Universe vs Available Chemical Space of Lead-Like Compounds / V.A. Afonina, D. Horvath, A. Varnek // XX Mendeleev Congress on general and applied chemistry. Five-volumes book. Vol.5: abstracts. - Ekaterinburg: Ural Branch of the Russian Academy of Sciences, 2016. - P.126.
Nugmanov, R.I. Workflow for reaction database cleaning and data standartization / R.I. Nugmanov, T.I. Madzhidov, A. Varnek // 5th Chemoinformatics Strasbourg Summer School: book of abstracts, June 27 - July 1, 2016, Strasbourg, France. - P. 54
2015
Gimadiev T.R. Prediction of Tautomer Equilibrium Constants Using Condensed Graphs of Reaction / T.R. Gimadiev, R. I. Nugmanov, T. I. Madzhidov, I. I. Baskin, I. S. Antipin, A. A. Varnek // Second Kazan Summer School in Chemoinformatics: July 6-9, 2015, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - Kazan, 2015. - P. 34.
Madzhidov T.I. Structure-reactivity relationship in bimolecular elimination reactions based on the condensed graph of a reaction / T. I. Madzhidov, A. V. Bodrov, T. R. Gimadiev, R. I. Nugmanov, I. S. Antipin, A. A. Varnek // Journal of Structural Chemistry. - 2015. -V. 56. - Is. 7. - Pp. 1227-1234.
Madzhidov, T.I. Condensed graph of reaction approach for protective group reactivity / T.I. Madzhidov, A.I. Lin, I. Antipin, O. Klimchuk, A. Varnek // Second Kazan Summer School in Chemoinformatics: July 6-9, 2015, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - Kazan, 2015. - P. 22.
Баскин, И.И. Введение в хемоинформатику: учеб. пособие. Ч. 3. Моделирование "структура-свойство" / И.И. Баскин, Т.И. Маджидов, А.А. Варнек. - Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2015. - 304 с.
Маджидов, Т.И. Введение в хемоинформатику: учеб. пособие. Ч. 2. Химические базы данных / Т.И. Маджидов, И.И. Баскин, А.А. Варнек. - Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2015. - 188 с.
2014
Нугманов, Р.И. Разработка моделей «структура-свойство» в реакциях нуклеофильного замещения с участием азидов / Р.И. Нугманов, Т.И. Маджидов, Г.Р. Халиуллина, И.И. Баскин, И.С. Антипин, А.А. Варнек - Журнал структурной химии. – 2014. – Т. 55, Вып. 6. – C. 1080–1087
T. I. Madzhidov, P. G. Polishchuk, R. I. Nugmanov, A. V. Bodrov, A. I. Lin, I. I. Baskin, A. A. Varnek, I. S. Antipin. Structure–Reactivity Relationships in Terms of the Condensed Graphs of Reactions // Russian Journal of Organic Chemistry – 2014. - V.50, No. 4 - p. 459–463.
Nugmanov R.I. Development of "structure-property" models in nucleophilic substitution reactions involving azides / Nugmanov, R.I., Madzhidov, T.I. , Khaliullina, G.R., Baskin, I.I., Antipin, I.S., Varnek, A.A. // Journal of Structural Chemistry. - 2014. - V. 55. - Is. 6. - Pp. 1026-1033.
Моделирование органических и метаболических реакций методами хемоинформатики: от эмпирической к предсказательной химии (РНФ-14-7)
2013
Polishchuk P.G. Estimation of the size of drug-like chemical space based on GDB-17 data / P.G. Polishchuk, T.I. Madzhidov, A. Varnek // Journal of Computer-Aided Molecular Design - 2013. - V. 27, Is. 8. - p. 675-679
Маджидов Т.И. Введение в хемоинформатику: Компьютерное представление химических структур: учеб. пособие / Т.И. Маджидов, И.И. Баскин, И.С. Антипин, А.А. Варнек. – Казань: Казан. ун-т, 2013. – 174 с.
Google scholar:
https://scholar.google.com/citations?user=hcMM9qYAAAAJ&hl=ru
Общие сведения
Направления научной работы
Показатели продуктивности
Мероприятия
Результативность работы
Статьи
Учебники и учебные пособия
Тезисы и материалы конференций
Руководство НИР
Публикации в СМИ
Вход в личный кабинет
Ваш логин
Ваш пароль
запомнить меня
Забыли пароль?
Регистрация