2023
2020
2019
- Фролова Л.Л. МЕТАГЕНОМ ГИДРОБИОНТОВ ОЗЕР КАБАН ГОРОДА КАЗАНИ: Анализ видового разнообразия гидробионтов по маркерным генам /Л.Л. Фролова, А.Э. Свердруп, С.Ю. Маланин, О.Ю. Деревенская, А.М. Хусаинов, А.М. Харченко. - Казань, Изд-во Казанск. ун.-та, 2019. - 216 с.
- Метагеном гидробионтов озер Кабан города Казани: анализ видового разнообразия гидробионтов по маркерным генам / под общ. ред. Л.Л.Фроловой. - Казань: Издательство Казанского университета, 2019. - 216 с.
-
Filippova J. A. Are snoRNAs “CRISPRable”? A report on box C/D snoRNA editing in human cells / J. A. Filippova, A. M. Matveeva, E. S. Zhuravlev et al. // Frontiers in pharmacology. - 2019. - V. 10. - Article: 1246. DOI: 10.3389/fphar.2019.01246
F_fphar_10_01246.pdf
2018
2017
-
Ulyanova V. Improving Bacillus altitudinis B-388 genome scaffolding using mate-pair next-generation sequencing / V. Ulyanova, R. Shah Mahmud, S. Malanin, V. Vershinina, O. Ilinskaya // BioNanoScience. - 2017. - V. 7, I. 1. - P. 85-87. DOI: 10.1007/s12668-016-0304-z
-
Martykanova D. S. et al. Characterization of Dysbiotic Changes of Skin Microbiota in Contact Sports Athletes / Dilyara S. Martykanova, Nailja Ch. Davletova, Ilya A. Zemlenuhin, Salavat M. Mugallimov, Azat M. Ahatov, Nazira S. Karamova, Sergey Yu. Malanin, Alexander V. Laikov, Maria I. Markelova, Maria N. Siniagina, Eugenia A. Boulygina, Tatyana V. Grigoryeva // BioNanoScience – 2016. - Vol.7,Is.1. - P. 1-3
Characterization_of_Dysbiotic_Changes_of_Skin_Microbiota_in_Contact_Sport_Athletes.pdf -
Safina D. The Influence of Helicobacter Pylori Eradication Therapy on Intestinal Microbiota / Safina D., Abdulkhakov S., Grigoryeva T., Khusnutdinova D., Kovarsky B., Tyakht A., Markelova M., Boulygina A., Siniagina M., Malanin S., Abdulkhakov R., Chernov V. // Gastroenterology. - 2017. - Т. 152. - №. 5. - С. S633.
Safina_D._The_Influence_of_Helicobacter_Pylori_Eradication_Therapy_on_Intestinal_Microbiota_AGA_Abstracts.pdf -
Data on gut metagenomes of the patients with alcoholic dependence syndrome and alcoholic liver cirrhosis / A.V. Tyakht [et al.] // Data in Brief. – 2017. – V. 11. – P. 98-102.
1_s2.0_S2352340917300082_main.pdf -
RAKITINA D.V.Genome analysis of E. coli isolated from
Crohn's disease patients/ RAKITINA D.V., MANOLOV A.I., KANYGINA A.V., GARUSHYANTS S.K., BAIKOVA JU.P., ALEXEEV D.G., LADYGINA V.G., KOSTRYUKOVA E.S., LARIN A.K., SEMASHKO T.A., KARPOVA I.Y., BABENKO V.V., ISMAGILOVA R.K., MALANIN S.Y., GELFAND M.S., ILINA E.N., GORODNICHEV R.B., LISITSYNA E.S., ALESHKIN G.I., SCHERBAKOV P.L., KHALIF I.L., SHAPINA M.V., MAEV I.V., ANDREEV D.N., GOVORUN V.M. //BMC Genomics. - 2017.
s12864_017_3917_x.pdf - Хуснутдинова Д.Р., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Синягина М.Н., Маланин С.Ю., Григорьева Т.В., Исмагилова Р.К., Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Абдулхаков Р.А., Чернов В.М., Чернова О.А. Влияние эрадикационной терапии Helicobacter pylori на микробиоту человека: метагеномный анализ микробиома кишечника // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. ? 2017. ? Т. 159, кн. 2. ? С. 217?231.
- Ученые записки Казанского государственного университе-та. Серия: Естественные науки. 2017. Т. 159, № 2. С. 217-231.
- D. Safina. Prevalence of key members of human gut microbiota after Helicobacter pylori eradication therapy / D. Safina, D. Khusnutdinova, T. Grigoryeva, S. Abdulkhakov, M. Markelova, E. Boulygina, M. Siniagina, S. Malanin, R. Ismagilova, R. Abdulkhakov, V. Chernov, O. Chernova // Helicobacter, Special Issue: XXXth International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer, 7-9 September 2017, Bordeaux.- Vol. 22, Is. S1. - P. 127-128
- S. Malanin. Effects of Helicobacter pylori eradication therapy on gut resistome // S. Malanin, D. Safina, S. Abdulkhakov, D. Khusnutdinova, I. Vasilyev, T. Grigoryeva, M. Siniagina, M. Markelova, E. Boulygina, R. Abdulkhakov, V. Chernov // Helicobacter, Special Issue: XXXth International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer, 7-9 September 2017, Bordeaux.- Vol. 22, Is. S1. - P. 128
-
Shah Mahmud R. RNA-seq analysis of Bacillus altitudinis with an emphasis on ribonucleases/ R. Shah Mahmud, M. Markelova, S. Malanin, V. Ulyanova// FEBS J. - 2017. - V. 284 (S1) - P. 381. DOI: 10.1111/febs.14174
F_Shah_Mahmud.pdf - Medvedeva E.S. Genome Sequences of Acholeplasma laidlawii Strains Differing in Sensitivity to Ciprofloxacin / Medvedeva E.S., Siniagina M.N., Malanin S.Y., Boulygina E.A., Malygina T.Y., Baranova N.B., Mouzykantov A.A., Davydova M.N., Chernova O.A., Chernov V.M. // Genome Announc. 2017 5(44). pii: e01189-17. doi: 10.1128/genomeA.01189-17.
-
Medvedeva E.S. Genome Sequences of Acholeplasma laidlawii Strains Differing in Sensitivity to Ciprofloxacin / Medvedeva E.S., Siniagina M.N., Malanin S.Y., Boulygina E.A., Malygina T.Y., Baranova N.B., Mouzykantov A.A., Davydova M.N., Chernova O.A., Chernov V.M. // Genome Announc. 2017 5(44). pii: e01189-17. doi: 10.1128/genomeA.01189-17.
- Eugenia A. Boulygina, Maria M. Markelova, Dilyara R. Khusnutdinova, Maria N. Siniagina, Sergey Yu. Malanin, Rustam A. Abdulkhakov, Sayar R. Abdulkhakov, Vladislav M. Chernov, Tatiana V. Grigoryeva. Shotgun metagenomic data on the human stool samples to characterize shifts of the gut microbial profile after the Helicobacter pylori eradication therapy // Data in Brief. ? 2017. ? Vol. 14. ? pp. 458-461
2016
- Гены & клетки Том X, № 4, 2015
- Харченко А.М., Метагеномный анализ в диагностике нарушений микробиоты рубца высокопродуктивных коров [Текст] / Харченко А.М., Григорьева Т.В., Синягина М.Н., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Хуснутдинова Д.Р., Маланин С.Ю., Хамидуллин И.Р., Шакиров Ш.К. // Актуальные проблемы современной генетики. Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 40-летию кафедры генетики Института Фундаментальной Медицины и Биологии Казанского Федерального Университета. - 2016. - С. 95-97.
-
Shah Mahmud R. RNA-seq analysis of A549 cells treated with bacterial ribonuclease binase demonstrating biological activities / R. Shah Mahmud, M. Markelova, S. Malanin, V. Ulyanova, O. Ilinskaya // FEBS J. - 2016. - V. 283 (S1) - P. 226-227. DOI: 10.1111/febs.13808
2016_The_FEBS_Journal.pdf -
Eugenia A. Boulygina. Lessons from the whole-exome sequencing effort in populations of Russia and Tajikistan / Eugenia A. Boulygina, Elena Lukianova, Tatyana V. Grigoryeva, Maria N. Siniagina, Sergey Yu. Malanin, Elena V. Balanovska, Oleg P. Balanovsky, Vladislav M. Chernov // BioNanoScience. - 2016. - Vol.6,Is.4. - P. 540-542
actual_paper.pdf -
Хуснутдинова Д.Р. Интегральные показатели изменений метагеномного профиля кишечной микрофлоры на фоне эрадикации Helicobacter pylori / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, С.Ю. Маланин, Т.В. Григорьева // Сборник тезисов участников форума: Наука будущего - наука молодых : Казань, 2016. - Т.2. - С.88-90
sbornik_tezisov_Nauka_buduschego_nauka__542_544.pdf -
Kenyon J. J. et al. The K19 capsular polysaccharide of Acinetobacter baumannii is produced via a Wzy polymerase encoded in a small genomic island rather than the KL19 capsule gene cluster /J.J. Kenyon , M.M. Shneider, S.N. Senchenkova, A.S. Shashkov, M.N. Siniagina, S.Y. Malanin, A.V. Popova, K.A. Miroshnikov, R.M. Hall, Y.A. Knirel // Microbiology. – 2016. - P. 1479-1489
microbiology2016.pdf -
Ю.Д. Романова. Изменение профиля цитокинов после трансплантации почки / Ю.Д. Романова, А.В. Лайков, М.И. Маркелова, Е. А. Куприянова, С.Ю. Ефремова, А.Р. Максеев, Л.И. Фахрутдинова, С.Ю. Маланин, И.И. Салафутдинов // Спецвыпуск Acta Naturae. - 2016. - Т. 2. - С. 184.
Acta_Naturae_Izmenenie_profilya_citokinov_posle_transplantacii_pochki.pdf -
Ulyanova V. Improving Bacillus altitudinis B-388 genome scaffolding using mate-pair next-generation sequencing / V. Ulyanova, R. Shah Mahmud, S. Malanin, V. Vershinina, O. Ilinskaya // BioNanoScience. - 2016. DOI: 10.1007/s12668-016-0304-z
-
Khusnutdinova D. Gut microbiome shotgun sequencing in assessment of microbial community changes associated with H.pylori eradication therapy / Khusnutdinova D., Grigoryeva T., Abdulkhakov S., Safina D., Siniagina M., Markelova M., Boulygina E., Malanin S., Tyakht A., Kovarsky B., Ismagilova R., Abdulkhakov R., Chernov V. // BioNanoScience. - 2016. - Vol.6,Is.4. - P. 585-587. DOI: doi:10.1007/s12668-016-0285-y
statya_Bionanoscience.pdf - Хуснутдинова Д. Оценка риска критических изменений микробиоты кишечника человека в результате антимикробной терапии / Д. Хуснутдинова, Т. Григрьева, С. Абдулхаков, Д. Сафина, М. Синягина, М. Маркелова, Е. Булыгина, С. Маланин, А. Тяхт, Б. Коварский, Р. Абдулхаков, В. Чернов // Актуальные проблемы современной генетики: тезисы докладов. - Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2016. - С.98-100.
-
Shah Mahmud R. RNA-seq analysis of A549 cells treated with bacterial ribonuclease binase demonstrating biological activities / R. Shah Mahmud, M. Markelova, S. Malanin, V. Ulyanova, O. Ilinskaya // FEBS J. - 2016. - V. 283 (S1) - P. 226-227. DOI: 10.1111/febs.13808
- Харченко А.М. Метагеномный анализ в диагностике нарушений микробиоты рубца высокопродуктивных коров [Текст] / А.М. Харченко, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Е.А. Булыгина, Д.Р. Хуснутдинова, С.Ю. Маланин, И.Р. Хамидуллин, Ш.К. Шакиров, Т.В. Григорьева // Актуальные проблемы современной генетики. Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 40-летию кафедры генетики Института Фундаментальной Медицины и Биологии Казанского Федерального Университета. - 2016. - С. 95-97. - ISBN 978-5-00019-708-0.
- BioNanoScience.2016. Vol. 6, № 4. P. 585-587.
- В сборнике тезисов: Программа и научные труды Научной кон-ференции молодых ученых по медицинской биологии ФГБУ ФНКЦ физико-химической ме-дицины ФМБА. Москва, 2016. С. 150-151.
-
Хуснутдинова Д.Р. Метагеномный анализ и интегральные показатели изменений кишечной микрофлоры на фоне эрадикации Helicobacter pylori. Д.Р. Хуснутдинова, Т.В. Григорьева, С.Р. Абдулхаков, Д.Д. Сафина, Е.А. Булыгина, С.Ю. Маланин, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Р.А. Абдулхаков, В.М. Чернов // Программа и научные труды Научной конференции молодых ученых по медицинской биологии ФГБУ ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА. - 2016. - С. 150-151
2016_FRCPC_YNG_Program_Proceedings_152_153.pdf - Исследование полиморфизмов генов SLCO1B1 и PSRC1 у лиц с заболеваниями сердечно-сосудистой системы (Кардио-16)
2015
-
Shah Mahmud R. Draft whole-genome sequence of Bacillus altitudinis strain B-388, a producer of extracellular RNase / R. Shah Mahmud, V. Ulyanova, S. Malanin, E. Dudkina, V. Vershinina, O. Ilinskaya // Genome Announc. - 2015. - V. 3, I. 1. - P. e01502-14. doi:10.1128/genomeA.01502-14.
- Сборник тезисов I Международной школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых Биомедицина, материалы и технологии XXI века [Электронный ресурс] / отв. ред. А.В. Герасимов. Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2015. 219 с.
-
Vasilyev I, Siniagina M, Malanin S, Boulygina E, Grygoryeva T, Yarullina D, et al. Draft Genome Sequence of Agreia bicolorata Strain AC-1804 , a Producer of Large Amounts of Carotenoid Pigments, Isolated from Narrow Reed Grass Infected by the Phytoparasitic Nematode. 2015;3(6):95449.
- Тезисы I Международной шко-лы-конференции студентов, ас-пирантов и молодых ученых ?Биомедицина, материалы и технологии XXI века?. Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2015. С. 219.
-
Safina D.D Pharmacotherapy effect on genetic diversity of intestinal biocenosis / D.D. Safina, S.R. Abdulkhakov, T.V. Grigoryeva, M.I. Markelova, R.K. Ismagilova, D.R. Khusnutdinova, S.Yu. Malanin, A.V. Laikov, M.N. Siniagina, R.A. Abdulkhakov, V.M. Chernov // Genes and Cells. - 2015. - Vol.10, Is.4. - P.80-85.
- Гены и клетки. 2015. Т. X, №4. C. 1-6.
-
Хуснутдинова Д.Р. ВЛИЯНИЕ ЭРАДИКАЦИОННОЙ ТЕРАПИИ H.PYLORI НА МИКРОФЛОРУ КИШЕЧНИКА / Д.Р. Хуснутдинова, Т.В. Григорьева, С.Р. Абдулхаков, Д.Д. Сафина, Е.А. Булыгина, С.Ю. Маланин, Р.К. Исмагилова, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Р.А. Абдулхаков, В.М. Чернов // Сборник тезисов I Международной школы-конференции
студентов, аспирантов и молодых ученых «Биомедицина, материалы и технологии XXI века». - Казань, 2015. - С. 219
Tezisy_Vliyanie_eradikacii.pdf - Разработка методики анализа состава кишечной микрофлоры человека на платформе MySeq (Illumina) (Кномикс-15)
2014
- Синягина М.Н. Загадки генома экстремотолерантного штамма P. stutzeri KOS6: нетипичное поведение типичных систем / М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, А.В. Лайков, С.Ю. Маланин, А.И. Манолов , Д.Г. Алексеев, Т.В. Григорьева // Геномика и системная биология: сборник междунар. школы молодых ученых по молекулярной генетике. - М.: ИМГ РАН, 2014. - С.41
-
Шах Махмуд Р. Секвенирование полного генома бактерии Bacillus altitudinis, выделенной из организма южной амбарной огневки / Р. Шах Махмуд, В. В. Ульянова, С. Ю. Маланин, Е. В. Дудкина, О. Н. Ильинская // "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине": сборник трудов IV междунар. науч.-практической конф. - Казань, 2014. - С. 22.
| Рабочий адрес: | Казань, ул. Парижской Коммуны, д. 9, Здание |
| Номер кабинета: | 106 |
| Телефон: | (843) 233-78-65 |
| E-mail: | SJMalanin@ksu.ru |
| Google scholar: | https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=XBcBo0wAAAAJ |
