2024
-
Маркелова М. И. Анализ данных секвенирования ампликонов гена 16S рРНК с помощью web-платформы MicrobiomeAnalyst: учебное пособие / М.И. Маркелова, Е.А. Булыгина, М.Н. Синягина, А.М. Сенина, Т.В. Григорьева. - Казань: Казанский федеральный университет, 2024. – 94 с.
vypiska_UMK06112024.pdf
F_Uch_posobie_METAGENOMIKA.pdf -
Abdulkhakov S. et al. Butyric Acid Supplementation Reduces Changes in the Taxonomic and Functional Composition of Gut Microbiota Caused by H. pylori Eradication Therapy //Microorganisms. – 2024. – Т. 12. – №. 2. – С. 319.
2023
-
Markelova M, Senina A, Khusnutdinova D, Association between Taxonomic Composition of Gut Microbiota and Host Single Nucleotide Polymorphisms in Crohn?s Disease Patients from Russia//International Journal of Molecular Sciences. - 2023. - Vol.24, Is.9. - Art. №7998.
-
Karaseva O, Ozhegov G, Khusnutdinova D, Whole Genome Sequencing of the Novel Probiotic Strain Lactiplantibacillus plantarum FCa3L//Microorganisms. - 2023. - Vol.11, Is.5. - Art. №1234.
-
Хуснутдинова Д.Р. Потенциал продукции токсических метаболитов штаммами Ligilactobacillus salivarius, выделенными от пациентов с болезнью Крона / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, А.М. Сенина, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Генетические технологии в исследованиях природных соединений. Всероссийская научная школа-конференция молодых ученых и студентов, Владивосток, 3–7 октября 2023 г. : тезисы докладов конференции / ТИБОХ ДВО РАН. – Владивосток : Издательство Дальневосточного федерального университета, 2023. – С.61.
F_Genetic_technologies_in_the_study_of_natural_compounds__1_.pdf -
Хуснутдинова Д.Р. Характеристика геномов Ligilactobacillus salivarius, выделенных от пациентов с болезнью Крона / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, А.М. Сенина, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Сборник тезисов II Всероссийской школы-конференции «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (Санкт-Петербург, 26-27 июня 2023 г). – Москва: Издательство Перо, 2023. – С.91-92.
Sbornik_tezisov_2023_Khusnutdinova_Piter.pdf -
Siniagina, M.N. Hydrogen sulfide-producing Escherichia coli strains in a patient with Crohn's colitis: a clinical case / M.N. Siniagina, A.V. Laikov, M.I. Markelova, E.A. Boulygina, N.A. Danilova, E.A. Sultanbekova, S.R. Abdulkhakov, T.V. Grigoryeva // FEBS Open Bio. - 2023. - V. 13 (Suppl. S2). - P. 159.
abstract_FEBS2023.pdf
2022
-
Romanova V, Markelova M, Boulygina E, Significance of both alkB and P450 alkane-degrading systems in Tsukamurella tyrosinosolvens: proteomic evidence // Applied Microbiology and Biotechnology. - 2022. - 106 (8). - pp. 3153-3171.
- Харитонова М.А., Фролова Л.А., Нигаматзянова Г.Р., Нигматуллин Н.М., Синягина М.Н., Нургалиев Д.К. Метаногены и метанотрофы в структуре сообществ микроорганизмов донных отложений озера Кандрыкуль (Южный Урал) // GREG 2022: Международная научно-исследовательская конференция Эмиссия парниковых газов сегодня и в геологическом прошлом: источники, влияние на климат и окружающую среду. – 2022. – Стр. 53.
- Харитонова М.А., Нургалиев Д.К., Нигаматзянова Г.Р., Нигматуллин Н.М., Синягина М.Н., Фролова Л.А. Метанокисляющие бактерии в структуре бактериальных сообществ донных отложений озера Кандрыкуль // Динамика экосистем в голоцене. – 2022. – С. 183-187.
-
Siniagina M.N, Laikov A.V, Markelova M.I, Competitive ability of Escherichia coli strains in the intestinal microbiota of patients with Crohn's disease and healthy volunteers: physiological, biochemical and genetic characteristics//Zhurnal Mikrobiologii Epidemiologii i Immunobiologii. - 2022. - Vol.99, Is.6. - P.669-681.
- 2. Yakubova A. Genomic Screening of Chronic Migraine Patients Identified Genes Linked to Drug and Endogenous Substances Metabolism / A. Yakubova, E. Shagimardanova, T. Grigoryeva, E. Boulygina, L. Shigapova, M. Siniagina, N. Blatt, R. Giniatullin, A. Rizvanov // BioNanoScience. – 2022. – Vol.12 (1). – P. 154–159.
-
Хуснуллина Л.Х. Особенности видового состава и конкурентных свойств лактобацилл при воспалительных заболеваниях кишечника / Л.Х. Хуснуллина, Д.Р. Хуснутдинова, А.М. Харченко, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // IX Международная конференция молодых ученых: вирусологов, биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и биоинформатиков – 2022 (Новосибирск, 27-30 сентября 2022 г.): сборник тезисов. – Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2022. – С.283-284.
openbio_tezis_2022.pdf -
Хуснутдинова Д.Р. Особенности видового состава и генов вирулентности Lactobacillus при воспалительных заболеваниях кишечника / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, А.М. Сенина, М.Н. Синягина, И.Ю. Васильев, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. – 2022. – №3-4. – С.14-15
F_gsp_3_4_2022_e_zhurnal.pdf -
Хуснутдинова Д.Р. Разнообразие Lactobacillus в микробиоте кишечника при ВЗК / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Цитология. – 2022. – Т.64. №7 – С.638-639.
Materialy_VIII_Molodezhnoi__774__shkoly_konferencii_INC_RAN.pdf - С. 2022623651, Российская Федерация. База данных факторов вирулентности комменсальных Escherichia coli / Синягина М.Н., Маркелова М.И., Лайков А.В., Булыгина Е.А., Григорьева Т.В.; № 2022623511; опубл. 23.12.2022.
2021
-
Lo Sasso G, Khachatryan L, Kondylis A, Inflammatory Bowel Disease-Associated Changes in the Gut: Focus on Kazan Patients//Inflammatory bowel diseases. - 2021. - Vol.27, Is.3. - P.418-433.
-
Gaponov A.M, Volkova N.I, Ganenko L.A, Characteristics of the colonic microbiome in patients with different obesity phenotypes (The original article)//Zhurnal Mikrobiologii Epidemiologii i Immunobiologii. - 2021. - Vol.98, Is.2. - P.144-155.
-
Siniagina M.N, Markelova M.I, Boulygina E.A, Diversity and adaptations of escherichia coli strains: Exploring the intestinal community in crohn?s disease patients and healthy individuals//Microorganisms. - 2021. - Vol.9, Is.6. - Art. № 1299.
-
Siniagina, Maria N., et al. Diversity and Adaptations of Escherichia coli Strains: Exploring the Intestinal Community in Crohn's Disease Patients and Healthy Individuals // Microorganisms. - 2021. - V.9. - N.6. - P.1299.
-
Гапонов А.М. Особенности микробиома толстой кишки у пациентов с ожирением при его различных фенотипах / А.М. Гапонов, Н.И. Волкова, Л.А. Ганенко, Ю.Л. Набока, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, А.М. Харченко, Д.Р. Хуснутдинова, С.А. Румянцев, А.В. Тутельян, В.В.Макаров, С.М. Юдин, А.В. Шестопалов // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии / Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. – 2021. – Т.98. №2. – С.144-155.
osobennosti_mikrobioma_tolstoy_kishki_u_patsientov_s_ozhireniem_pri_ego_razlichnyh_fenotipah_originalnaya_statya.pdf - Siniagina M., Markelova M., Boulygina E., Antibiotic resistome profiles of fecal Escherichia coli isolates in association with Crohn's disease//JOURNAL OF CROHNS & COLITIS. - 2021. - Vol.15, Is.. - P.S601-S602.
- Khusnutdinova D., Markelova M., Siniagina M., Overabundance of Lactobacillus species in gut microbiota of IBD patients//JOURNAL OF CROHNS & COLITIS. - 2021. - Vol.15, Is.. - P.S160-S161.
-
Григорьева Т. В. и др. БАЗА ДАННЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ЧЕЛОВЕКА ДЛЯ ПЕРСОНИФИЦИРОВАННОГО ПОДБОРА ОЗДОРОВИТЕЛЬНО-ПРОФИЛАКТИЧЕСКИХ ПРОЦЕДУР.
F_elibrary_44758516_12126901.PDF -
Байчурина И.А. Изменения транскрипционного профиля Escherichia coli K-12 substr. MG1655 в ответ на взаимодествие с иммуноглобулином А IN VITRO / И.А. Байчурина, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, А.В. Лайков, Е.А. Булыгина, Я.К. Семин, А.А. Круглов, Д.С. Матюшкина, В.А. Мусарова, Т.В. Григорьева// Сборник тезисов докладов III Объединенного научного форума физиологов, биохимиков и молекулярных биологов, Сочи - Дагомыс, 3-8 октября 2021 года.-С.30.
F_Tekst_tezisa_Dagomys.pdf
2020
-
Siniagina M, Markelova M, Laikov A, Cultivated Escherichia coli diversity in intestinal microbiota of Crohn's disease patients and healthy individuals: Whole genome data//Data in Brief. - 2020. - Vol.28, Is.. - Art. № 104948.
-
Siniagina M. Cultivated Escherichia coli diversity in intestinal microbiota of Crohn's disease patients and healthy individuals: Whole genome data / M. Siniagina, M. Markelova, A. Laikov, E. Boulygina, D. Khusnutdinova, A. Kharchenko, A. Misbakhova, T. Grigoryeva // Data in brief. - 2020. - V. 28. - 104948
- Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Маркелова М.И., Григорьева Т.В., Булыгина Е.А., Маланин С.Ю., Васильев И.Ю., Синягина М.Н., Абдулхаков Р.А. Влияние эрадикационной терапии H.Pylori на состав микробиоты кишечника / Материалы к 46-й научной сессии ЦНИИ гастроэнтерологии «Генетика в гастроэнтерологии: возможности и перспективы»// Доказательная гастроэнтерология. – 2020. – Т.1, № 2. – С.12-13.
- Эрадикационная терапия Helicobacter pylori и микробиота кишечника у пациентов с заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта / Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Маркелова М.И., Григорьева Т.В., Булыгина Е.А., Маланин С.Ю., Васильев И.Ю., Синягина М.Н., Абдулхаков Р.А. // Вестник современной клинической медицины. – 2020. – Т. 13, № 1. – С. 46-53.
- Khusnutdinova D. SHIFTS IN RESISTANCE OF LACTOBACILLUS IN HUMAN GUT MICROBIOTA AFTER HELICOBACTER PYLORI ERADICATION THERAPY / Khusnutdinova D., Markelova M., Siniagina M., Boulygina E., Malanin S., Grigoryeva T.V., Abdulkhakov S., Abdulkhakov R.A., Chernov V., Chernova O. // United European Gastroenterology Journal - October 2020. - Vol.8 (8) - P. 502.
2019
- Romanova Valeriya A., Boulygina Eugenia A., Siniagina Maria N., Draft Genome Sequence of a Medium- and Long-Chain n-Alkane-Degrading Bacterium, Tsukamurella tyrosinosolvens Strain PS2, with Two Genetic Systems for Alkane Degradation//MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS. - 2019. - Vol.8, Is.17. - Art. №e00218-19.
-
Khusnutdinova D. The development of resistance to clarithromycin and amoxicillin in Lactobacillus plantarum is accompanied by mutations not only in target genes / Khusnutdinova D., Markelova M., Boulygina E., Kupriyanova E., Siniagina M., Baranova N., Grigoryeva T., Chernov V., Chernova O. // United European Gastroenterology Journal - October 2019. - Vol.7 (8S) - P. 926.
-
Siniagina M. Cultivated Escherichia coli diversity in intestinal microbiota of Crohn's disease patients and healthy individuals: whole genome data / Siniagina M., Markelova M., Laikov A., Boulygina E., Khusnutdinova D., Kharchenko A., Misbakhova A., Grigoryeva T. //Data in Brief. – 2019. – V. 28. - P. 104948.
F_DatainBrief2019.pdf -
Khilyas I.V. Microbial diversity and mineral composition of weathered serpentine rock of the Khalilovsky massif / Khilyas I.V., Sorokina A.V., Elistratova A.A., Siniagina M.N., Markelova M.I., Sharipova M.R., Shcherbakova T.A., Megan E. D'Errico, Michael F. Cohen //PLOS One, 2019.-V. 14.-N12.-DOI 10.1371/journal.pone.0225929.
F_Khilyas_et_al.__2019_Plos.pdf - Khilyas I.V. Microbial diversity and mineral composition of weathered serpentine rock of the Khalilovsky massif / Khilyas I.V., Sorokina A.V., Elistratova A.A., Siniagina M.N., Markelova M.I., Sharipova M.R., Shcherbakova T.A., Megan E. D'Errico, Michael F. Cohen //PLOS One, 2019.-V. 14.-N12.-DOI 10.1371/journal.pone.0225929. F_Khilyas_et_al.__2019_Plos.pdf
-
Siniagina M. No difference in the distribution of pathogenic factors found in Escherichia coli isolates from patients with Crohn's disease and healthy individuals / Siniagina M., Markelova M., Laikov A., Boulygina E., Khusnutdinova D., Kharchenko A., Fedorova M., Romanova V., Grigoryeva T. // United European Gastroenterology Journal - October 2019. - Vol.7 (8S) - P. 870.
F_UEG2019_Siniagina.pdf
2018
-
Baranova N.B, Malygina T.Y, Medvedeva E.S, Genome sequences of Acholeplasma laidlawii strains with increased resistance to tetracycline and melittin//Genome Announcements. - 2018. - Vol.6, Is.2. - Art. № e01446-17.
- Харченко А.М. Сравнительный анализ микробиоты рубца высокопродуктивных коров на фоне применения пробиотиков [Электронный ресурс] / А.М. Харченко, Ф.Р. Вафин, Д.Р. Хуснутдинова, Ш.К. Шакиров, Е.А. Булыгина, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, Т.В. Григорьева // Материалы Международного молодежного форума "ЛОМОНОСОВ-2018" // М.: МАКС Пресс, 2018. - ISBN 978-5-317-05800-5.
- Safina D., Markelova M., Abdulkhakov S., Taxonomic diversity changes in human gut microbiota due to Helicobacter pylori eradication therapy//HELICOBACTER. - 2018. - Vol.23, Is.. - .
-
Tyakht A.V, Manolov A.I, Kanygina A.V, Genetic diversity of Escherichia coli in gut microbiota of patients with Crohn's disease discovered using metagenomic and genomic analyses//BMC Genomics. - 2018. - Vol.19, Is.1. - Art. № 968.
- Baranova N. B. et al. Genome Sequences of Acholeplasma laidlawii Strains with Increased Resistance to Tetracycline and Melittin / N. B. Baranova, T. Malygina, E. S. Medvedeva, E. A. Boulygina, M. N. Siniagina, M. A. Dramchini, R. A. Prottoy, A. A. Mouzykantov, M. N. Davydova, O. A. Chernova, V. M. Chernov //Genome announcements. – 2018. – V. 6. – N. 2. – P. e01446-17.
- Siniagina M.N. Crohn's disease-associated Escherichia coli serotyping through the whole-genome sequencing of cultivated intestinal community / M.N. Siniagina, M.I. Markelova, A.V. Laikov, E.A. Boulygina, T.V. Grigoryeva // 5th European Congress of Immunology ECI2018: abstract book. - P. 432
- Экспериментальная и клиниче-ская гастроэнтерология. 2018. Т. 159, № 11. С. 48-61.
- Medvedeva E.S. Molecular bases of Acholeplasma laidlawii adaptation to environmental conditions / E.S. Medvedeva, N.B. Baranova, A.A. Mouzykantov, M.N. Siniagina, E.A. Boulygina, M.N. Davydova, O.A. Chernova, V.M. Chernov // The 14th Biennial Congress of the Anaerobe Society of the Americas. Anaerobe 2018. Abstract book. –July 9-12, 2018. – Las Vegas, Nevada, USA. – P. 159.
- Елистратова А.А. Характеристика микробного сообщества серпентинита / А.А. Елистратова, А.В. Сорокина, М.И. Синягина, М.И. Маркелова, Т.А. Щербакова, И.В. Хиляс // Сборник тезисов III международной школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых Материалы и технологии XXI века, Казань, 29-31 октября 2018 г. - С. 124.
- Экспериментальная и клиниче-ская гастроэнтерология. 2018. Т. 159, № 11. С. 48?61.
- Харченко А.М., Сравнительный анализ микробиоты рубца высокопродуктивных коров на фоне применения пробиотиков [Электронный ресурс] / А.М. Харченко, Ф.Р. Вафин, Д.Р. Хуснутдинова, Ш.К. Шакиров, Е.А. Булыгина, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, Т.В. Григорьева // Материалы Международного молодежного форума "ЛОМОНОСОВ-2018" // М.: МАКС Пресс, 2018. - ISBN 978-5-317-05800-5.
- Харченко А.М., Изменение микробиоты рубца у молочных коров на фоне применения пробиотиков / Харченко А.М., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Синягина М.Н., Маланин С.Ю., Хуснутдинова Д.Р., Крупин Е.О., Шакиров Ш.К., Григорьева Т.В. // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V Международной конференции ?ПОСТГЕНОМ?2018?. ? Казань ?: Издательство Казан. ун-та., 2018. ? 223с.
- Харченко А.М. Изменение микробиоты рубца у молочных коров на фоне применения пробиотиков / Харченко А.М., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Синягина М.Н., Маланин С.Ю., Хуснутдинова Д.Р., Крупин Е.О., Шакиров Ш.К., Григорьева Т.В. // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V Международной конференции "ПОСТГЕНОМ 2018". - Казань: Издательство Казан. ун-та., 2018. - 223с.
2017
-
Mouzykantov A. A. Plasticity of Mycoplasmas: Changes in the Genomic Profile, as well as in the Cellular and Vesicular Proteomes of the Acholeplasma laidlawii in Adapting the Bacterium to Different Environmental Conditions / A. A. Mouzykantov, E. S. Medvedeva, T. Y. Malygina, N. B. Baranova, M. N. Davydova, M. N. Siniagina, E. A. Boulygina, R. Shah Mahmud, R. A. Prottoy, M. V. Trushin, O. A. Chernova, V. M. Chernov // BioNanoScience. - 2017. - Vol. 7,. Issue. 2, - P. 323–325. DOI: 10.1007/s12668-016-0362-2
- Ученые записки Казанского государственного университе-та. Серия: Естественные науки. 2017. Т. 159, № 2. С. 217-231.
-
Safina D. The Influence of Helicobacter Pylori Eradication Therapy on Intestinal Microbiota / Safina D., Abdulkhakov S., Grigoryeva T., Khusnutdinova D., Kovarsky B., Tyakht A., Markelova M., Boulygina A., Siniagina M., Malanin S., Abdulkhakov R., Chernov V. // Gastroenterology. - 2017. - Т. 152. - №. 5. - С. S633.
Safina_D._The_Influence_of_Helicobacter_Pylori_Eradication_Therapy_on_Intestinal_Microbiota_AGA_Abstracts.pdf -
Mouzykantov A.A, Medvedeva E.S, Malygina T.Y, Plasticity of Mycoplasmas: Changes in the Genomic Profile, as well as in the Cellular and Vesicular Proteomes of the Acholeplasma laidlawii in Adapting the Bacterium to Different Environmental Conditions//BioNanoScience. - 2017. - Vol.7, Is.2. - P.323-325.
-
Martykanova D.S, Davletova N.C, Zemlenuhin I.A, Characterization of Dysbiotic Changes of Skin Microbiota in Contact Sports Athletes//BioNanoScience. - 2017. - Vol.7, Is.1. - pp 1-3.
Martykanova.pdf - Medvedeva E.S., Malygina T.Y., Baranova N.B., Mouzykantov А.А., Davydova M.N. , Siniagina M.N., Boulygina E.A., Chernova O.A., Chernov V.M. Molecular bases of antimicrobial resistance of Acholeplasma laidlawii. IC2AR 2017. Proceedings Book. 2nd International Caparica Conference in Antibiotic Resistance. Caparica, Portugal. – 2017. – P. 215.
- Хуснутдинова Д.Р., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Синягина М.Н., Маланин С.Ю., Григорьева Т.В., Исмагилова Р.К., Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Абдулхаков Р.А., Чернов В.М., Чернова О.А. Влияние эрадикационной терапии Helicobacter pylori на микробиоту человека: метагеномный анализ микробиома кишечника // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. ? 2017. ? Т. 159, кн. 2. ? С. 217?231.
- Eugenia A. Boulygina, Maria M. Markelova, Dilyara R. Khusnutdinova, Maria N. Siniagina, Sergey Yu. Malanin, Rustam A. Abdulkhakov, Sayar R. Abdulkhakov, Vladislav M. Chernov, Tatiana V. Grigoryeva. Shotgun metagenomic data on the human stool samples to characterize shifts of the gut microbial profile after the Helicobacter pylori eradication therapy // Data in Brief. ? 2017. ? Vol. 14. ? pp. 458-461
- D. Safina. Prevalence of key members of human gut microbiota after Helicobacter pylori eradication therapy / D. Safina, D. Khusnutdinova, T. Grigoryeva, S. Abdulkhakov, M. Markelova, E. Boulygina, M. Siniagina, S. Malanin, R. Ismagilova, R. Abdulkhakov, V. Chernov, O. Chernova // Helicobacter, Special Issue: XXXth International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer, 7-9 September 2017, Bordeaux.- Vol. 22, Is. S1. - P. 127-128
- S. Malanin. Effects of Helicobacter pylori eradication therapy on gut resistome // S. Malanin, D. Safina, S. Abdulkhakov, D. Khusnutdinova, I. Vasilyev, T. Grigoryeva, M. Siniagina, M. Markelova, E. Boulygina, R. Abdulkhakov, V. Chernov // Helicobacter, Special Issue: XXXth International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer, 7-9 September 2017, Bordeaux.- Vol. 22, Is. S1. - P. 128
- Markelova M., Siniagina M., Boulygina E., Gastrointestinal microbiota of the Japanese quail: sex-based differences//FEBS JOURNAL. - 2017. - Vol.284, Is.. - P.380-380.
- Siniagina M., Markelova M., Evtugyn V., Genomic profile of Bacillus pumilus 3-19 strain extracellular membrane vesicles//FEBS JOURNAL. - 2017. - Vol.284, Is.. - P.380-380.
-
Medvedeva E.S, Siniagina M.N, Malanin S.Y, Genome sequences of Acholeplasma laidlawii strains differing in sensitivity to ciprofloxacin//Genome Announcements. - 2017. - Vol.5, Is.44. - Art. № e01189-17.
-
Boulygina E.A, Markelova M.I, Khusnutdinova D.R, Shotgun metagenomic data on the human stool samples to characterize shifts of the gut microbial profile after the Helicobacter pylori eradication therapy//Data in Brief. - 2017. - Vol.14, Is.. - P.458-461.
- Medvedeva E.S. Genome Sequences of Acholeplasma laidlawii Strains Differing in Sensitivity to Ciprofloxacin / Medvedeva E.S., Siniagina M.N., Malanin S.Y., Boulygina E.A., Malygina T.Y., Baranova N.B., Mouzykantov A.A., Davydova M.N., Chernova O.A., Chernov V.M. // Genome Announc. 2017 5(44). pii: e01189-17. doi: 10.1128/genomeA.01189-17.
- Баранова Н.Б. Адаптация микоплазм к антимикробным пептидам: особенности геномного профиля у штамма Acholeplasma laidlawii, проявляющего повышенную устойчивость к мелиттину /Баранова Н.Б., Медведева Е.С., Музыкантов А.А., Малыгина Т.Ю., Синягина М.Н., Давыдова М.Н., Драмшини М.А., Чернова О.А., Чернов В.М. // Научно-техническая конференция по итогам совместного конкурса фундаментальных исследований РФФИ – РТ. Тезисы докладов. – Казань: Изд-во «Фэн» АН РТ, 2017. – Казань, Россия. 22-25 ноября 2017 г. – с.14.
-
Siniagina M. Genomic profile of Bacillus pumilus 3–19 strain extracellular membrane vesicles / Siniagina M., Markelova M., Evtugyn V., Chernov V. // FEBS J. - 2017. - V. 284. - P. 380. DOI: 10.1111/febs.14174
-
Martykanova D. S. et al. Characterization of Dysbiotic Changes of Skin Microbiota in Contact Sports Athletes / Dilyara S. Martykanova, Nailja Ch. Davletova, Ilya A. Zemlenuhin, Salavat M. Mugallimov, Azat M. Ahatov, Nazira S. Karamova, Sergey Yu. Malanin, Alexander V. Laikov, Maria I. Markelova, Maria N. Siniagina, Eugenia A. Boulygina, Tatyana V. Grigoryeva // BioNanoScience – 2016. - Vol.7,Is.1. - P. 1-3
Characterization_of_Dysbiotic_Changes_of_Skin_Microbiota_in_Contact_Sport_Athletes.pdf
2016
- Медведева Е. С. Геномный и протеомный профили штаммов Acholeplasma laidlawii, различающихся по чувствительности к ципрофлоксацину / Е.С. Медведева, М.Н. Давыдова, А.А. Музыкантов, Н.Б. Баранова, Т.Ю. Григорьева, М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, О.А. Чернова, В.М. Чернов // Докл. АН. - 2016. - Т. 466, № 2. - С. 228-232.
- Харченко А.М., Метагеномный анализ в диагностике нарушений микробиоты рубца высокопродуктивных коров [Текст] / Харченко А.М., Григорьева Т.В., Синягина М.Н., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Хуснутдинова Д.Р., Маланин С.Ю., Хамидуллин И.Р., Шакиров Ш.К. // Актуальные проблемы современной генетики. Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 40-летию кафедры генетики Института Фундаментальной Медицины и Биологии Казанского Федерального Университета. - 2016. - С. 95-97.
-
Нгуен, Н.Т. Молекулярно-генетический анализ микроорганизмов с внутриэпителиальной инвазией, выделенных от больных колоректальным раком/Н.Т.Нгуен, Р.Р. Вафин, И.В.Ржанова, А.И.Колпаков, И.Г.Гатауллин, С.В. Тюлькин, М.Н.Синягина, Т.В.Григорьева, О.Н.Ильинская // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. -2016. №1. –C.13-18.
MGMV16_Colorec.pdf -
Хуснутдинова Д.Р. Метагеномный анализ и интегральные показатели изменений кишечной микрофлоры на фоне эрадикации Helicobacter pylori. Д.Р. Хуснутдинова, Т.В. Григорьева, С.Р. Абдулхаков, Д.Д. Сафина, Е.А. Булыгина, С.Ю. Маланин, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Р.А. Абдулхаков, В.М. Чернов // Программа и научные труды Научной конференции молодых ученых по медицинской биологии ФГБУ ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА. - 2016. - С. 150-151
2016_FRCPC_YNG_Program_Proceedings_152_153.pdf -
Nguyen N.T, Vafin R.R, Rzhanova I.V, Molecular genetic analysis of microorganisms with intraepithelial invasion isolated from patients with colorectal cancer//Molecular Genetics, Microbiology and Virology. - 2016. - Vol.31, Is.1. - P.15-20.
-
Eugenia A. Boulygina. Lessons from the whole-exome sequencing effort in populations of Russia and Tajikistan / Eugenia A. Boulygina, Elena Lukianova, Tatyana V. Grigoryeva, Maria N. Siniagina, Sergey Yu. Malanin, Elena V. Balanovska, Oleg P. Balanovsky, Vladislav M. Chernov // BioNanoScience. - 2016. - Vol.6,Is.4. - P. 540-542
actual_paper.pdf -
A. Laikov. Proteogenomic profile of the new alkane-oxidizing strain Tsukamurella tyrosinosolvens PS2 in relation to the emulsification activity / A. Laikov, V. Romanova, E. Boulygina, M. Siniagina, J. Romanova, T. Grigorieva // FEBS J. - 2016. - V. 283 (S1) – P. 373.
2016_The_FEBS_Journal_247_247.pdf -
Medvedeva E.S, Davydova M.N, Mouzykantov A.A, Genomic and proteomic profiles of Acholeplasma laidlawii strains differing in sensitivity to ciprofloxacin//Doklady Biochemistry and Biophysics. - 2016. - Vol.466, Is.1. - P.23-27.
-
Kenyon J. J. et al. The K19 capsular polysaccharide of Acinetobacter baumannii is produced via a Wzy polymerase encoded in a small genomic island rather than the KL19 capsule gene cluster /J.J. Kenyon , M.M. Shneider, S.N. Senchenkova, A.S. Shashkov, M.N. Siniagina, S.Y. Malanin, A.V. Popova, K.A. Miroshnikov, R.M. Hall, Y.A. Knirel // Microbiology. – 2016. - P. 1479-1489
microbiology2016.pdf - Siniagina M. N. Comparative analysis of gastrointestinal microbiome in wild and domestic quails /M. N. Siniagina, M. I. Markelova, E. A. Boulygina, E. R. Kirillova, A. V. Lichoman, V. V. Radchenko // Abstracts of The X International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. - 2016. - P. 281.
-
Khusnutdinova D. Gut microbiome shotgun sequencing in assessment of microbial community changes associated with H.pylori eradication therapy / Khusnutdinova D., Grigoryeva T., Abdulkhakov S., Safina D., Siniagina M., Markelova M., Boulygina E., Malanin S., Tyakht A., Kovarsky B., Ismagilova R., Abdulkhakov R., Chernov V. // BioNanoScience. - 2016. - Vol.6,Is.4. - P. 585-587. DOI: doi:10.1007/s12668-016-0285-y
statya_Bionanoscience.pdf - Хуснутдинова Д. Оценка риска критических изменений микробиоты кишечника человека в результате антимикробной терапии / Д. Хуснутдинова, Т. Григрьева, С. Абдулхаков, Д. Сафина, М. Синягина, М. Маркелова, Е. Булыгина, С. Маланин, А. Тяхт, Б. Коварский, Р. Абдулхаков, В. Чернов // Актуальные проблемы современной генетики: тезисы докладов. - Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2016. - С.98-100.
-
Boulygina E.A, Lukianova E, Grigoryeva T.V, Lessons from the Whole Exome Sequencing Effort in Populations of Russia and Tajikistan//BioNanoScience. - 2016. - Vol.6, Is.4. - P.540-542.
BioNanoScience_Boulygina.pdf -
Khusnutdinova D, Grigoryeva T, Abdulkhakov S, Gut Microbiome Shotgun Sequencing in Assessment of Microbial Community Changes Associated with H. pylori Eradication Therapy//BioNanoScience. - 2016. - Vol.6, Is.4. - P.585-587.
-
Mouzykantov A. A. Plasticity of Mycoplasmas: Changes in the Genomic Profile, as well as in the Cellular and Vesicular Proteomes of the Acholeplasma laidlawii in Adapting the Bacterium to Different Environmental Conditions / A. A. Mouzykantov, E. S. Medvedeva, T. Y. Malygina, N. B. Baranova, M. N. Davydova, M. N. Siniagina, E. A. Boulygina, R. Shah Mahmud, R. A. Prottoy, M. V. Trushin, O. A. Chernova, V. M. Chernov // BioNanoScience. - 2016. - P. 323-325. DOI: 10.1007/s12668-016-0362-2
- Медведева Е.С. Геномный профиль штаммов Acholeplasma laidlawii, различающихся по чувствительности к антибактериальным препаратам / Медведева Е.С., Давыдова М.Н., Музыкантов А.А., Баранова Н.Б., Григорьева Т.Ю., Синягина М.Н., Булыгина Е.А., Чернова О.А., Чернов В М. // Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков России и конференции ADFLIM. – Сочи – Дагомыс, Россия. – ActaNaturae, спецвыпуск. – 2016. – Т. 2. – С.242.
- Малыгина Т.Ю. Молекулярные основы устойчивости Acholeplasma laidlawii к антимикробным препаратам / Малыгина Т.Ю., Медведева Е.С., Музыкантов А.А., Баранова Н.Б., Давыдова М.Н., Синягина М.Н., Булыгина Е.А., Шах Махмуд Р., Проттой Р.А., Чернова О.А., Чернов В.М. // IV Российский симпозиум с международным участием «Фитоиммунитет и клеточная сигнализация у растений«. Тез. докл. - Казань: Изд-во: «ФизтехПресс« КФТИ КазНЦ РАН. - Казань, Россия. - 2016 г. - С. 95-96
- Харченко А.М. Метагеномный анализ в диагностике нарушений микробиоты рубца высокопродуктивных коров [Текст] / А.М. Харченко, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Е.А. Булыгина, Д.Р. Хуснутдинова, С.Ю. Маланин, И.Р. Хамидуллин, Ш.К. Шакиров, Т.В. Григорьева // Актуальные проблемы современной генетики. Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 40-летию кафедры генетики Института Фундаментальной Медицины и Биологии Казанского Федерального Университета. - 2016. - С. 95-97. - ISBN 978-5-00019-708-0.
- BioNanoScience.2016. Vol. 6, № 4. P. 585-587.
- В сборнике тезисов: Программа и научные труды Научной кон-ференции молодых ученых по медицинской биологии ФГБУ ФНКЦ физико-химической ме-дицины ФМБА. Москва, 2016. С. 150-151.
- Гены & клетки Том X, № 4, 2015
2015
-
Belostotskiy D.E., E.E. Ziganshina, M. Siniagina, E.A. Boulygina, V.A. Miluykov, A.M. Ziganshin. Impact of the substrate loading regime and phosphoric acid supplementation on performance of biogas reactors and microbial community dynamics during anaerobic digestion of chicken wastes // Bioresour. Technol. – 2015. – V. 193. – P. 42–52.
Belostotskiy_et_al_2015_BT.pdf -
Сорокина А.В. Продукция сидерофоров металл-толерантными микроорганизмами / А.В. Сорокина, Т.А. Щербакова, М.Н. Синягина, А.А. Тойменцева, М.Р. Шарипова, И.В. Хиляс // Девятый Всероссийский Форум "Наука и инновации в технических университетах" сборник междунар. науч.-практической конф. - Санкт-Петербург, - 2015. - С.147
Piter_2015.pdf - Medvedeva E.S. Extracellular vesicles and resistance of mycoplasmas to fluoroquinolones: resistome of Acholeplasma laidlawii / E.S. Medvedeva, N.B. Baranova, T.Y. Grigoreva, A.A. Mouzykantov, E.A. Boulyguina, M.N. Siniagina, M.N. Davydova, O.A. Chernova, V.M. Chernov // The 6th Congress of European Microbiologists (FEMS 2015). Program book. – Maastricht, The Netherlands. – 2015. – P. 120.
- Григорьева Т.Ю. Молекулярные основы устойчивости микоплазм к фторхинолонам: резистом Acholeplasma laidlawii / Т.Ю. Григорьева, Е.С. Медведева, А.А. Музыкантов, Н.Б. Баранова, М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, М.Н. Давыдова, Г.Ф. Шаймарданова, О.А. Чернова, В.М. Чернов // Биология – наука ХХI века: 19-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых. Сборник тезисов. – Пущино, Россия. – 2015 г. – С. 172-173.
- Сборник тезисов I Международной школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых Биомедицина, материалы и технологии XXI века [Электронный ресурс] / отв. ред. А.В. Герасимов. Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2015. 219 с.
- Тезисы I Международной шко-лы-конференции студентов, ас-пирантов и молодых ученых ?Биомедицина, материалы и технологии XXI века?. Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2015. С. 219.
-
Belostotskiy D.E., Ziganshina E.E., Siniagina M., Boulygina E.A., Miluykov V.A., Ziganshin A.M. Impact of the substrate loading regime and phosphoric acid supplementation on performance of biogas reactors and microbial community dynamics during anaerobic digestion of chicken wastes // Bioresource Technology. - 2015. - Vol. 193. - P. 42-52.
-
Хуснутдинова Д.Р. ВЛИЯНИЕ ЭРАДИКАЦИОННОЙ ТЕРАПИИ H.PYLORI НА МИКРОФЛОРУ КИШЕЧНИКА / Д.Р. Хуснутдинова, Т.В. Григорьева, С.Р. Абдулхаков, Д.Д. Сафина, Е.А. Булыгина, С.Ю. Маланин, Р.К. Исмагилова, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Р.А. Абдулхаков, В.М. Чернов // Сборник тезисов I Международной школы-конференции
студентов, аспирантов и молодых ученых «Биомедицина, материалы и технологии XXI века». - Казань, 2015. - С. 219
Tezisy_Vliyanie_eradikacii.pdf -
Safina D.D Pharmacotherapy effect on genetic diversity of intestinal biocenosis / D.D. Safina, S.R. Abdulkhakov, T.V. Grigoryeva, M.I. Markelova, R.K. Ismagilova, D.R. Khusnutdinova, S.Yu. Malanin, A.V. Laikov, M.N. Siniagina, R.A. Abdulkhakov, V.M. Chernov // Genes and Cells. - 2015. - Vol.10, Is.4. - P.80-85.
-
Vasilyev I, Siniagina M, Malanin S, Draft genome sequence of Agreia bicolorata strain AC-1804, a producer of large amounts of carotenoid pigments, isolated from narrow reed grass infected by the phytoparasitic nematode//Genome Announcements. - 2015. - Vol.3, Is.6. - Art. № e0138315.
- Гены и клетки. 2015. Т. X, №4. C. 1-6.
-
Vasilyev I, Siniagina M, Malanin S, Boulygina E, Grygoryeva T, Yarullina D, et al. Draft Genome Sequence of Agreia bicolorata Strain AC-1804 , a Producer of Large Amounts of Carotenoid Pigments, Isolated from Narrow Reed Grass Infected by the Phytoparasitic Nematode. 2015;3(6):95449.
2014
| Рабочий адрес: | Казань, ул. Парижской Коммуны, д. 9, Здание |
| E-mail: | MaNSinyagina@kpfu.ru |
| Google scholar: | https://scholar.google.ru/citations?user=-XgyELkAAAAJ&hl=ru&oi=ao |
| Научно-педагогический стаж: |
| Общий стаж: |
| Непрерывный в КФУ: |
