2011, Ширшикова Т. В. Выявление Helicobacter pylori и энтерогепатических хеликобактеров в желчи с помощью метода ПЦР [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. И. Шагимарданова,Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов // Тезисы Материалов 8-й Северо-Западной научной гастроэнтерологической сессии (Санкт-Петербург, 24-25 ноября 2011 года). - 2011. - С. М43.
2012, Ширшикова Т. В. Оценка эффективности различных методов обнаружения Helicobacter pylori у больных хронической HCV-инфекцией [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. Н. Белоусова, А. И. Фазульзянова, Г. Ш. Исаева // Тезисы XVII Всероссийской научно-практической конференции "Молодые ученые в медицине". 86-я Всероссийская научная студенческая конференция памяти член-корреспондента академии наук РТ, профессора И.Г. Салихова.15-я всероссийская медико-историческая конференция, посвященная 200-летию клинического медицинского образования в Казани (23-24 апреля 2012 г.). - 2012. - С. 183.
2012, Исаева Г.Ш. Молекулярная детекция бактерий рода Helicobacter при заболеваниях желудочно-кишечного тракта [Текст] / Г. Ш. Исаева, Е. И. Шагимарданова, Т. В. Ширшикова, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов, Е. П. Селькова // Современные проблемы науки и образования. Электронный научный журнал: www.science-education.ru; ISSN 1817-6321. - 2012. - №1. - 0421200037\0041 - Идентификационный номер статьи, присвоенный НТЦ "Информрегистр" (Импакт-фактор РИНЦ (двухлетний) = 0,379 (по данным на 16.01.2015)
2012, Ширшикова Т. В. Молекулярная детекция бактерий рода Helicobacter в желчи больных с патологиями желудочно-кишечного тракта при помощи ПЦР [Текст] / Т. В. Ширшикова, М. Р. Шарипова,Е. И. Шагимарданова, Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов // Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине. III международная научно-практическая конференция (22-24 ноября 2012г. (г. Казань)). - 2012. - С. 324-325.
2012, Ширшикова Т. В. Биоинформационный анализ в геномах энтеробактерий генов эффлюкс-системы [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Р. Валеева, А. Г. Гилязева, Л. М. Богомольная, М.Р. Шарипова, А.М. Марданова, Ю.Д. Романова // Материалы V Всероссийского с международным участием медико-биологического конгресса молодых ученых "Симбиоз-Россия 2012" (3-8 декабря 2012г. (г. Тверь)). - 2012. - С.278-279.
2012, Ширшикова Т. В. Выявление бактерий рода Helicobacter в желчи больных с различной патологией ЖКТ [Текст] / Т. В. Ширшикова, М. Р. Шарипова, Е. И. Шагимарданова, Г. Ш. Исаева // Итоговая научно-образовательная конференция студентов Казанского Федерального университета 2012 года. Сборник тезисов. - 2012. - Т. 1 - С. 39.
2012, Ширшикова Т. В. Идентификация бактерий рода Helicobacter в желчи больных с патологиями ЖКТ [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. И. Шагимарданова, М. Р. Шарипова,Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова// Тезисы Международной научной конференции студентов и молодых ученых, посвященной 155-летию со дня рождения В. В. Подвысоцкого. Современные теоретические и практические аспекты клинической медицины (для молодых ученых и студентов). - 2012. - С. 49.
2012, Ширшикова Т. В. Идентификация бактерий рода Helicobacter в желчи больных с патологиями желудочно-кишечного тракта [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. И. Шагимарданова, М. Р. Шарипова, Г. Ш. Исаева // Материалы V Всероссийского с международным участием медико-биологического конгресса молодых ученых "Симбиоз-Россия 2012" (3-8 декабря 2012г. (г. Тверь)). - 2012. - С.358-359.
2012, Ширшикова Т. В. Обнаружение бактерий рода Helicobacter в желчи больных с различной патологией желудочно-кишечного тракта [Текст] / Т. В. Ширшикова, М. Р. Шарипова,Е. И. Шагимарданова, Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов // Тезисы Международной научно-практической конференции www.sworld.com.ua (20-31 марта 2012 года (г. Одесса)).Современные направления теоретических и прикладных исследований. - 2012. - Т. 31. - С. 29-30.
2013, Маликова А.З. Выделение и идентификация микробных симбионтов личинки хирономиды Polypedilum vanderplankti [Текст] / А.З. Маликова, М.Р. Шарипова, О.А. Гусев, А.Д. Сулейманова, А.А. Тойменцева, Т.В. Ширшикова, Е.О. Михайлова, А.М. Марданова, Е.И. Шагимарданова // Вестник Казанского технологического университета. - 2013. - Т. 16. - №20. - С. 181-183. ISSN: 1998-7072
2013, Ширшикова Т. В. Чувствительность штаммов бактерий рода Serratia к бактериофагу ФОТ8 [Текст] / Т. В. Ширшикова, А.М. Марданова, Л. М. Богомольная // Биология - наука ХХI века: 17-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых (21-26 апреля 2013 г., (г. Пущино)). Сборник тезисов. - 2013. - С. 54-55.
2013, Марданова А.М. Чувствительность штаммов Serratia marcescens к перекиси водорода [Текст] / А.М. Марданова, Э. Х. Низамутдинова, Т.В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, Е.О. Михайлова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Вестник Казанского технологического университета. - 2013. ‒ Т. 16. ‒ № 19. ‒ С. 215-218. ISSN: 1998-7072 (IF=0.384)
2013, Ширшикова Т. В. Разработка метода переноса мутаций в генах macAB Serratia marcescens в новый штамм при помощи трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, А. М. Марданова, Л. М. Богомольная // Итоговая научно-образовательная конференция студентов Казанского Федерального университета 2013 года. Сборник статей. - Т.2 - С.43-45.
2013, Ширшикова Т. В. Разработка метода переноса мутаций в генах macAB Serratia marcescens в новый штамм при помощи трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, А. М. Марданова, Л. М. Богомольная // Итоговая научно-образовательная конференция студентов Казанского Федерального университета 2013 года. Сборник статей. - Т.2 - С.43-45.
2013, Ширшикова Т. В. Молекулярная идентификация бактерий рода Helicobacter в желчи больных с различной патологией гепатобилиарной системы [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е.Н. Белоусова, А.И. Фазульзянова // 87-ая Всероссийская научно-практическая конференция студентов и молодых ученых, посвященная 155-летию со дня рождения Л. О. Даркшевича. V-я Российская научно-практическая конференция "Здоровье человека в XXI веке". (5 апреля 2013 г., (г. Казань)). - 2013. - С. 148.
2013, Ширшикова Т. В. Инактивация генов эффлюкс-системы в Serratia marcescens при помощи гомологичной рекомбинации и трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // V Международная научно-практическая конференция "Актуальные проблемы биологии, нанотехнологий и медицины" (3-5 октября 2013г. (г. Ростов-на-Дону)). Сборник тезисов. - 2013. ‒ С. 142-143.
2014, Камалетдинова Л.Х. Определение чувствительности дикого штамма Serratia marcescens и его мутанта по генам эффлюкс системы к активным формам кислорода [Текст]/ Л.Х. Камалетдинова, Т.В. Ширшикова, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова, Л.М.Богомольная // IV Международная научно-практическая конференция "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине" (Казань, Россия, 29 Октября - 1 Ноября, 2014г.). Сборник трудов. - С. 26.
2014, Ширшикова Т. В. Инактивация генов macAB Serratia marcescens при помощи системы рекомбинации фага λ-ред и трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // Материалы VI Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням (24-26 марта 2014г., (г. Москва)). - С. 351.
2014, Камалетдинова Л.Х. Роль эффлюкс системы в подвижности Serratia marcescens [Текст] /Л.Х. Камалетдинова, Т.В. Ширшикова, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // IV Международная научно-практическая конференция "Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине" (Казань, Россия, 29 Октября - 1 Ноября, 2014г.). Сборник трудов. - С. 18
2014, Камалетдинова Л.Х. Чувствительность разных штаммов Serratia marcescens к перекиси водорода [Текст] / Л.Х. Камалетдинова, Т.В. Ширшикова, Л.М. Богомольная, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова // Биология - наука ХХI века: 18-я Международная Пущинская школа- конференция молодых ученых (Пущино, 21 - 25 апреля 2014 г.). Сборник тезисов. - С. 208.
2014, Ширшикова Т. В. Нокаутирование генов эффлюкс-системы Serratia marcescens при помощи системы рекомбинации фага λ-ред и трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // XXVI Зимняя молодежная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии" (10-14 февраля 2014г., (г. Москва)). Сборник тезисов. - С. 85.
2015, Ширшикова Т.В. Вклад эффлюкс системы МасАВ Serratia marcescens в устойчивость к антибиотикам [Текст] / Т.В. Ширшикова, Л.Х. Камалетдинова, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Площадка открытых коммуникаций "Openbio-2015". Международная конференция молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов (1-2 октября 2015г., наукоград Кольцово). Сборник тезисов. - С. 145-150.
2015, Shirshikova, T. V. Characteristics of Serratia marcescens strains [Text] / T.V. Shirshikova, E. K. Nizamutdinova, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya // Research Journal of Applied Sciences. − 2015. − V. 10. − N.12. − P. 911-916.
2015, Shirshikova T.V., Matrosova L.Y., Khilyas I. V., Sharipova M. R., Bogomolnaya L. M. (2015) MacAB efflux system of Serratia marcescens as a potential protective system against oxidative stress. FEBS Journal, V.282, p.201. (July 4-9, Berlin, Germany. IF=4.001)
2015, Ширшикова Т.В. Роль эффлюкс системы MacAB Serratia marcescens SM6 в развитии антибиотикоустойчивости [Текст] / Т.В. Ширшикова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // I Международная школа-конференция студентов, аспирантов и молодых ученых "Биомедицина, материалы и технологии XXI века" (25-28 ноября 2015 года, Казань). Сборник тезисов. - С. 229.
2016, Низамутдинова Э.Х. Характеристика нативных и мутантных штаммов Serratia marcencens [Текст] /Э. Х. Низамутдинова, Т. В. Ширшикова, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // Микробиология. МАИК НАУКА/ИНТЕРПЕРИОДИКА - 2016 - Т.85 - N 1. - С. 36-41.
2016, Ширшикова, Т.В. Генерализованная трансдукция в штаммах Serratia marcescens [Текст] / Т.В. Ширшикова, О.В. Морозова, Л.Х. Камалетдинова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Международная конференция "Трансляционная медицина - 2016" (Россия, Казань,13-14 октября 2016 г.). Сборник тезисов. − 2016. − С.116.
2016, Ширшикова Т.В. Роль MacAB эффлюкс-системы в защите Serratia marcescens от антибиотиков и оксидативного стресса [Текст] / Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых "Биология - наука XXI века" (Пущино, 18 - 22 апреля 2016 г.). Сборник тезисов. - С. 61.
2016, Матросова, Л.Е. Роль эффлюкс системы MacAB в защите бактерий от оксидативного стресса [Текст] / Л.Е. Матросова, Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Ю.В. Данилова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Российско-китайская научно-практическая конференция по медицинской микробиологии и клинической микологии (XIX Кашкинские чтения) (14-16 июня 2016 г., Санкт-Петербург). Журнал "Проблемы медицинской микологии" − 2016. - Т.18. - №2. - С. 94.
2016, Shirshikova, T. V. Generalized Bacteriophage Transduction in Serratia marcescens [Text] / T. V. Shirshikova, O.V. Morozova, L. Kh. Kamaletdinova, M. R. Sharipova, L. M. Bogomolnaya // BioNanoSci. DOI 10.1007/s12668-016-0268-z
2016, Matrosova, L. E. Virulence of Pigmented Serratia marcescens Strain SM6 and its Nalidixic Acid-Resistant Derivative in White Outbred Mice [Text] / L. E. Matrosova, I. V. Khilyas, T. V. Shirshikova, L. M. Bogomolnaya // BioNanoSci. DOI 10.1007/s12668-016-0257-2
2016, Kamaletdinova, L. Kh. Inactivation of Chromosomal Genes in Serratia marcescens [Text] / L. Kh. Kamaletdinova, E. Kh. Nizamutdinova, T. V. Shirshikova, I. M. Skipina, L. M. Bogomolnaya // BioNanoSci. DOI 10.1007/s12668-016-0249-2
2016, Khilyas, I. V. Production of Siderophores by Serratia marcescens and the Role of MacAB Efflux Pump in Siderophores Secretion [Text] / I. V. Khilyas, T. V. Shirshikova, L. E. Matrosova, A. V. Sorokina, M. R. Sharipova, L. M. Bogomolnaya // BioNanoSci. DOI 10.1007/s12668-016-0264-3
2016, The role of MacAB efflux pump in protection of Serratia marcescens against antibiotics and oxidative stress / T. V. Shirshikova, L. E. Matrosova, O. V. Morozova, I. V. Khilyas, M. R. Sharipova, L. M. Bogomolnaya / FEBS Journal. − V. 283 (Suppl. 1). − 2016. − P.190
2016, Genomic comparison of siderophore diversity in clinical and environmental isolates of Serratia marcescens / I. V. Khilyas, T. V. Shirshikova, L. E. Matrosova, Y. V. Danilova, M. R. Sharipova, L. M. Bogomolnaya /FEBS Journal. − V.283 (Suppl. 1). − 2016. − P.370
2016, Ширшикова, Т.В. Роль эффлюкс системы MacAB Serratia marcescens в секреции гемолизинов и протеаз [Текст] / Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Площадка открытых коммуникаций OpenBio-2016. III Международная конференция молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов (5-6 октября 2016 г., Новосибирск, Наукоград Кольцово). Сборник тезисов. − 2016. − С.309-312
2016, Хиляс, И.В. Потенциальные мишени при антибиотикотерапии оппортунистического патогена Serratia marcescens SM6 [Текст] /И.В. Хиляс, Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков России, Конференции ADFLIM (Россия, Сочи, Дагомыс, 4?8 октября 2016г.). ACTA NATURAE. Спецвыпуск. − 2016. − Т.2 − С. 149-150.
2016, Ширшикова, Т.В. Эффлюкс система MacAB - потенциальная мишень при антибиотикотерапии Serratia marcescens SM6 [Текст] / Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков России, Конференции ADFLIM (Россия, Сочи, Дагомыс, 4-8 октября 2016г.). ACTA NATURAE. Спецвыпуск. − 2016. − Т.2 − С. 169.
2016, Ширшикова, Т.В. Роль эффлюкс системы MacAB Serratia marcescens в секреции гемолизинов и протеаз [Текст] / Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Площадка открытых коммуникаций OpenBio-2016. III Международная конференция молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов (5-6 октября 2016 г., Новосибирск, Наукоград Кольцово). Сборник тезисов. − 2016. − С.309-312.
2016, Ширшикова, Т.В. Роль и клиническое значение эффлюкс системы МacАВ Serratia marcescens SM6 [Текст] / Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, О.В. Морозова, И.В. Хиляс, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Международная научная конференция "Трансляционная медицина, настоящее и будущее" (г. Казань, 24-25 мая 2016 г.)
2016, Ширшикова, Т.В. Генерализованная трансдукция в штаммах Serratia marcescens [Текст] / Т.В. Ширшикова, О.В. Морозова, Л.Х. Камалетдинова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Международная конференция "Трансляционная медицина - 2016" (Россия, Казань,13-14 октября 2016 г.). Сборник тезисов. − 2016. − С.116.
2016, Матросова, Л.Е. Антиоксидантные свойства экстраклеточных белков Serratia marcescens SM6 [Текст] /Л.Е. Матросова, Ю.В. Данилова, И.В. Хиляс, Т.В. Ширшикова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков России, Конференции ADFLIM (Россия, Сочи, Дагомыс, 4-8 октября 2016г.). ACTA NATURAE. Спецвыпуск. − 2016. − Т.2 − С. 168.
2017, L. Matrosova, I. Khilyas, T. Shirshikova, L. Kamaletdinova, Y. Danilova, L. Bogomolnaya (2017) Bacterial drug efflux pump MacAB as a new target for grug development. FEMS Journal. (July 9-13, Valencia, Spain) - in press
2017, Ширшикова Т.В. Эффлюкс система МасАВ Serratia marcescens SM6 - мишень для получения новых антимикробных препаратов[Текст] /Т.В.Ширшикова, Л.Х.Камалетдинова, Л.Е. Матросова, И.В. Хиляс, М.Р. Шарипова , Богомольная Л.М.// Российско-Китайский конгресс по медицинской микробиологии, эпидемиологии и клинической микологии (ХХ Кашкинские чтения).(Санкт-Петербург, 14-16 июня 2017г.) ТЕЗИСЫ ДОКЛАДОВ. - С. 162