2011, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Докинг производных пиридоксина в активном центре холинэстераз // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки - 2011.- Т. 153, кн. 3. - С. 107-118.
2011, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Изучение взаимодействия производных пиридоксина и каталитической триады ацетилхолинэтеразы // 15 Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых ?Биология: наука XXI века? - 2011 - с.11-12
2012, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Взаимодействие производного пиридоксина с активным центром ацетилхолинэстеразы // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки - 2012.- Т. 154, кн. 2. - С. 234-246
2012, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Динамика ?ворот? ведущий в канал активного центра ацетилхолинэстеразы // Биоинформатика и молекулярное моделирование - 2012 - с. 8-9
2012, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Динамика фермент-лигандного комплекса // Всероссийская молодежная конференция ?Актуальные проблемы химии и биологии? - 2012 - с. 48-49
2012, Ayupov R., Akberova N., Tarasov D. The acetylcholinesterase sites effects on the interaction of Ser203 with pyridoxine derivatives // 11-th International Meeting on Cholinesterases - 2012. - c.143
2013, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Общий механизм взаимодействия производного пиридоксина с активным центром ацетилхолинэстеразы // IV Международная конференция. Актуальные проблемы биохимии и бионанотехнологии - 2013 - с. 17-18
2013, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Моделирование взаимодействия фермент-лигандного комплекса // Международный симпозиум ?Биохимия ? основа наук о жизни? - 2013. - c. 43-47
2013, Ayupov R., Akberova N., Tarasov D. Computer simulation of Acetylcholinesterase enzyme interaction with novel inhibitor // Kazan Summer School on Chemoinformatics - 2013. - c. 14
2013, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И., Тарасов Д.С. Структура ацетилхолинэстеразы как модельный объект при поиске специфичных ингибиторов биоинформационными методами // Всероссийская конференция "На стыке наук. Физико-химическая серия" - 2013 - с. 15-17
2013, Аюпов Р.Х. Молекулярная динамика фермент-лигандного комплекса // XX Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных ?Ломоносов-2013? - 2013
2014, IV МЕЖДУНАРОДНОЙ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ
Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине // Применение компьютерного молекулярного скрининга для изучения взаимодействия ацетилхолинэстераз с различными лигандами. - с. 271
ISBN 987-5-00019-293-1
2014, Предсказание пространственной модели CFR Staphylococcus aureus // V Международная научно-практическая виртуальная конференция "Актуальные проблемы биохимии и бионанотехнологии". 2014 - стр 25-26
2014, Анализ динамики взаимодействия лиганда с поверхностью фермента ацетилхолинэстеразы // На стыке наук. Физико-химическая серия. I том - 2014 - стр. 35-39
2014, Аюпов Р. Х. К проблеме липидного кодирования геномной ДНК: особенности молекулярной динамики комплексов ДНК с фосфолипидом / Р.И. Жданов, Р.Х. Аюпов, Г.В. Андрианов, Н.И. Акберова, М.Я. Ибрагимова // Гены & Клетки, Том IX, №3 часть Б, 2014, стр.: 185-190
2015, Rustam K Ayupov Comparative Analysis of Mice Acetylcholinesterases by Functional Amino Acid Residues and Molecular Screening / Ayupov R.K., Andrianov G.V., Akberova N.I. // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences (RJPBCS) - 2015. - №6 (6) - 1781-1786
2015, Rustam K Ayupov The Ligand Behavior on the Surface of Acetylcholinesterase / Ayupov R.K., Akberova N.I. // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences (RJPBCS) - 2015. - №6 (4) - 2202-2206.
2015, Rustam K Ayupov Molecular Dynamics of the Pyridoxine Derivative in the Acetylcholinesterase Active Cavity / Ayupov R.K., Akberova N.I. // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences (RJPBCS) - 2015. - №6 (6) - 1717-1722
2015, Rustam K Ayupov Comparative Analysis of Mice Acetylcholinesterases by Functional Amino Acid Residues and Molecular Screening / Ayupov R.K., Andrianov G.V., Akberova N.I. // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences (RJPBCS) - 2015. - №6 (6) - 1781-1786
2016, Usachev, K. S. Structural studies of Staphylococcus aureus hibernation promoting factor homolog SaHPF by high-resolution NMR spectroscopy / K.S. Usachev, R.Kh. Ayupov, V.V. Klochkov, M.M. Yusupov // BIOMEMBRANES. - 2016. - P. 164.
2016, Аюпов Р.Х., Акберова Н.И. СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ПРЕДСКАЗАННЫХ СТРУКТУР БЕЛКА SAHPF / II Международная школа-конференция студентов, аспирантов и молодых ученых ?Материалы и технологии XXI века? - 2016 - С. 14
2016, И.Хусаинов СТРУКТУРА 70S И 100S РИБОСОМ ПАТОГЕННОЙ БАКТЕРИИ STAPHYLOCOCCUS AUREUS / И. Хусаинов, Р. Аюпов, К. Висанс, А. Бошлер, Ф. Гросс, А. Мясников, С. Марзи, П. Ромби, Г. Юсупова, Я. Хашем, М. Юсупов // Acta Naturae, 2016, спецвыпуск, том 2, с. 15
2016, Ayupov R.K, Akberova N.I., Prediction of the three-dimensional structure of the protein SaHPF and analysis of its molecular dynamics//International Journal of Pharmacy and Technology. - 2016. - Vol.8, Is.2. - P.14548-14557.
2016, Анализ структуры белка SaHPF Staphylococcus aureus / Аюпов Р.Х., Акберова Н.И. // Ученые записки Казанского университета. Серия: Естественные науки. - 2016. - Т. 158, кн. 3. - с. 327-337.
2016, Ayupov R., Akberova N., Yusupov M.. Analysis of molecular dynamics of SAPHF protein // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design - 2016, p. 22
2016, Ayupov R.K, Khusainov I.S, Validov S.Z, Yusupova, G.Z, Yusupov, M.M. Isolation and purification of staphylococcus aureus hibernation promoting factor inactivating of the ribosome//International Journal of Pharmacy and Technology. - 2016. - Vol.8, Is.2. - P.14392-14398.
2016, Аюпов Р.Х. Предсказание структуры белка SaHPF методами компьютерного моделирования // Материалы Международного молодежного научного форума ?ЛОМОНОСОВ-2016? / Отв. ред. И.А. Алешковский, А.В. Андриянов, Е.А. Антипов. [Электронный ресурс] ? М.: МАКС Пресс, 2016. ? 1 электрон. опт. диск (DVD-ROM); 12 см. - Систем. требования: ПК с процессором 486+; Windows 95; дисковод DVD-ROM; Adobe Acrobat Reader. (http://lomonosov-msu.ru/archive/Lomonosov_2016/index.htm)
2016, Аюпов Р.Х., Хусаинов И.Ш., Усачев К.С., Юсупов М.М. Димеризация рибосомы Staphylococcus aureus при помощи фактора инактивации SaHPF // Сборник тезисов международной конференции ?Трансляционная медицина 2016?. - 2016 - С. 14