• Поиск биологически активных молекул в химическом пространстве, сгенерированном при помощи реакций Сузуки и Бухвальда-Хартвига / Гимазова А.Р., Хакимова А.А., Афонина В.А., Гимадиев Т.Р. // Международный форум KAZAN DIGITAL WEEK – 2024: сборник материалов / Сост.: Р.Ш. Ахмадиева, Р.Н. Минниханов; Под общей ред. президента Академии наук Республики Татарстан, д-ра техн. наук, проф. Р.Н. Минниханова. – Казань: ОСП «НЦБЖД АН РТ», 2024. – Ч. 1. -С. 213-221

• Давлетшина Н.В. Мембранный транспорт полифункциональных субстратов алкил (N-алкил-N,N-диоктиламмониометил)-фосфонатами // Н.В. Давлетшина, Е.А. Ермакова, А.Р. Хабибуллина, Д.Р. Долгова, Т.Р. Гимадиев, Р.Р. Давлетшин, И.И. Стойков, Р.А. Черкасов // Журнал общей химии. ? 2023. ? Т.93 ? №12. ? С.1927-1936

• Rakhimbekova, A. Cross-validation strategies in QSPR modelling of chemical reactions / A. Rakhimbekova, T.N. Akhmetshin, G.I. Minibaeva, R.I. Nugmanov, T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, I.I. Baskin, A. Varnek // SAR and QSAR in Environmental Research -2021.-32(3)-pp.207-219. doi: 10.1080/1062936X.2021.1883107
• Rakhimbekova, A. Cross-validation strategies in QSPR modelling of chemical reactions / A. Rakhimbekova, T.N. Akhmetshin, G.I. Minibaeva, R.I. Nugmanov, T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, I.I. Baskin, A. Varnek // SAR and QSAR in Environmental Research -2021.-32(3)-pp.207-219. doi: 10.1080/1062936X.2021.1883107.

• СОПРЯЖЕННЫЕ МОДЕЛИ ДЛЯ ОДНОВРЕМЕННОГО ПРЕДСКАЗАНИЯ КОНСТАНТЫ ТАУТОМЕРНОГО РАВНОВЕСИЯ И КОНСТАНТЫ КИСЛОТНОСТИ / А. Рахимбекова, Д. В. Занков, Т. Р. Гимадиев, Р. И. Нугманов, Т. И. Маджидов, М. А. Казымова, И. И. Баскин, А. Варнек // Современные синтетические методологии для создания лекарственных препаратов и функциональных материалов (MOSM 2020) : IV Международная научно-практическая конференция : сборник тезисов (Екатеринбург, 16?20 ноября 2020 г.). ? Екатеринбург : Индивидуальный предприниматель Шестакова Екатерина Вячеславовна, 2020. ? ISBN 978-5-6044427-1-5. ? PR-62.
• Rakhimbekova A, Madzhidov T.I, Nugmanov R.I, Comprehensive analysis of applicability domains of QSPR models for chemical reactions//International Journal of Molecular Sciences. - 2020. - Vol.21, Is.15. - P.1-20.

• CGRtools: Python Library for Molecule, Reaction, and Condensed Graph of Reaction Processing / R.I. Nugmanov, R.N. Mukhametgaleev, T. Akhmetshin, T.R. Gimadiev, V.A. Afonina, T.I. Madzhidov, A. Varnek // Journal of Chemical Information and Modeling. - 2019. - Vol. 59, Is. 6. - P. 2516-2521
• Рахимбекова, А. Сравнение методов оценки области применимости моделей для предсказания связи "структура - реакционная способность"/ А.Рахимбекова, Р.И. Нугманов, Т.Р. Гимадиев, Т.И. Маджидов, А. Варнек // Сборник материалов XXVI Российского национального конгресса "Человек и лекарство". Тезисы докладов М.: Видокс, 2019.- C. 132-133.
• Мухаметгалеев Р.Н. Предсказание биоизостерных замен с использованием подхода Конденсированного графа реакции/Р.Н.Мухаметгалеев,Т.Р.Гимадиев,Р.И. Нугманов, Г.Р.Миндубаева,П.Г.Полищук,Т.И.Маджидов,И.С.Антипин,А.А.Варнек//Сборник материалов XXVI Российского национального конгресса "Человек и лекарство 2019" Тезисы докладов 2019.-С.126.
• Nugmanov R.I, Mukhametgaleev R.N, Akhmetshin T, CGRtools: Python Library for Molecule, Reaction, and Condensed Graph of Reaction Processing//Journal of Chemical Information and Modeling. - 2019. - Vol. 59, Is. 6. - 2516-2521.
• Zankov D.V, Madzhidov T.I, Rakhimbekova A, Conjugated Quantitative Structure-Property Relationship Models: Application to Simultaneous Prediction of Tautomeric Equilibrium Constants and Acidity of Molecules//Journal of Chemical Information and Modeling. - 2019. - Vol. 59, Is. 11. - 4569-4576
• Gimadiev, T.R. REACTIONS MODELING WORKFLOW USING CONDENSED GRAPH OF REACTION / T.R. Gimadiev, T.N. Akhmetshin, A. Rahimbekova, R.I. Nugmanov, P.G. Polishchuk, T.I. Madzhidov, I.S. Antipin, A. Varnek. Mendeleev 2019, the XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. - 2019. - P 398
• Хемоинформатика
• Rakhimbekova A. BENCHMARKING ANALYSIS OF APPLICABILITY DOMAIN DEFINITION: CHEMICAL REACTIONS CASE. A. Rakhimbekova, R.I. Nugmanov, T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, A. Varnek // Mendeleev 2019, the XI International Conference on Chemistry for Young Scientists. 2019. P. 425.
• Rakhimbekova A. BENCHMARKING ANALYSIS OF APPLICABILITY DOMAIN DEFINITION: CHEMICAL REACTIONS CASE // A. Rakhimbekova, R.I. Nugmanov, T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, A. Varnek // ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry.- 2019.- P 90.
• Gimadiev T.R. REACTIONS MODELING WORKFLOW USING CONDENSED GRAPH OF REACTION / Gimadiev T.R., Akhmetshin T.N., Rahimbekova A., Nugmanov R.I., Polishchuk P.G., Madzhidov T.I., Antipin I.S., Varnek A. // ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry.- 2019.- P 81
• Nugmanov, R.I. TOOLCHAIN FOR REACTIONS PROCESSING, MODELING AND STORAGE / Nugmanov R.I., Fatykhova A.A., Mukhametgaleev R.N., Rakhimbekova A., Akhmetshin T.N., Gimadiev T.R., Batyrshyn D.S., Afonina V.A., Madzhidov T.I., Varnek A. // ХХI Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry.- 2019.- P 71.
• Gimadiev T.R, Klimchuk O, Nugmanov R.I, Sydnone-alkyne cycloaddition: Which factors are responsible for reaction rate ?//Journal of Molecular Structure. - 2019. - Vol.1198 - Art. № 126897.

• Assessment of tautomer distribution using the condensed reaction graph approach / T. Gimadiev, T. Madzhidov, R. Nugmanov, I.I. Baskin, I.S. Antipin, A. Varnek // Journal of Computer-Aided Molecular Design.? 2018.? P.1-14
• Rakhimbekova, A. Comparison of the applicability domain for chemical reactions / A. Rakhimbekova, T. Madzhidov, T. Gimadiev, R. Nugmanov, M. Glavatskikh, A. Varnek // Book of abstracts of Third International School-Seminar "From Empirical to Predictive Chemistry". - 2018. - P.58.
• Маджидов Т.И. Хемоинформатика в анализе и предсказании характеристик химических реакций / Маджидов Т.И., Нугманов Р.И., Гимадиев Т.Р., Афонина В.А., Фатыхова А.А., Мухаметгалеев Р.Н., Рахимбекова А.Б., Мусаева С.И., Боначера Ф, Баскин И.И., Антипин И.С., Варнек А.А. // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V международной конференции ПОСТГЕНОМ 2018. 29 октября - 2 ноября 2018. - Казань: Изд. Казан. ун-та. 2018. - С. 342.
• Gimadiev T.R, Madzhidov T.I, Nugmanov R.I, Assessment of tautomer distribution using the condensed reaction graph approach//Journal of Computer-Aided Molecular Design. - 2018. - Vol.32, Is.3. - P.401-414.

• Structure?reactivity modeling using mixture-based representation of chemical reactions / P. Polishchuk, T. Madzhidov, T. Gimadiev, A. Bodrov, R. Nugmanov, A. Varnek // Journal of Computer-Aided Molecular Design.? 2017.? P.1-11
• T.I. Madzhidov, T.R. Gimadiev, D.A. Malakhova, R.I. Nugmanov, I.I. Baskin, I.S. Antipin, and .A. Varnek. Structure-Reactivity modeling for Dielas-alder reactions based on the condensed REACTION graph approach.Journal of Structural Chemistry,2017, Vol.58, No 4,p. 685-691

• Gimadiev, T.R. Predicting of reactivity for biorthogonal reactions of sydnones heterocycles with alkynes / T.R. Gimadiev, T.I. Madzhidov, R.I. Nugmanov, A. Varnek // International School-Seminar on Computer-Aided Molecular Design: May 18-20, 2016, Kazan, Russia: Book of Abstracts and Scientific Program. - P. 19.

• Madzhidov, T.I., Bodrov, A.V., Gimadiev, T.R. et al. J Struct Chem (2015) 56: 1227. doi:10.1134/S002247661507001X

• F. D. Sokolov, T. R. Gimadiev, L. N. Yamalieva, D. R. Chubukaeva, R. A. Cherkasov, New polynuclear complex of copper(I) with N-diethylthiophosphoryl-N'-isopropylthiourea, New polynuclear complex of copper(I) with N-diethylthiophosphoryl-N'-isopropylthiourea, 2014, 6, 1253-1254

• Gataulina A.R, Safin D.A, Gimadiev T.R, Complexes of podand-containing bis(dithiophosphonate) ligands with cobalt(II), nickel(II) and cadmium(II): Recognition of CH2Cl 2//Transition Metal Chemistry. - 2008. - Vol.33, Is.7. - P.921-924.