• Шакиров Р.Р., Панкратова Ю.С., Сенина А.М., Булыгина Е.А., Карасева О.С., Григорьева Т.В., Яруллина Д.Р., Карпухин О.Ю. Пристеночная микробиота дивертикулов при воспалительных осложнениях дивертикулярной болезни (пилотное исследование). Колопроктология. 2024; т. 23, № 1, с. 108–116. https://doi.org/10.33878/2073-7556-2024-23-1-108-116
  Offprint_1849_3497_1_PB.pdf
• Маркелова М. И. Анализ данных секвенирования ампликонов гена 16S рРНК с помощью web-платформы MicrobiomeAnalyst: учебное пособие / М.И. Маркелова, Е.А. Булыгина, М.Н. Синягина, А.М. Сенина, Т.В. Григорьева. - Казань: Казанский федеральный университет, 2024. – 94 с.
  vypiska_UMK06112024.pdf
  F_Uch_posobie_METAGENOMIKA.pdf
• Задорина И. И. Депонирование черновых сборок геномов в NCBI. Учебно-методическое пособие / И. И. Задорина, М. И. Маркелова, И. Г. Старостина, З. И. Исхакова, Е. А. Булыгина // Казань, Казанский федеральный университет, 2024. – 40 с.
  F_Metodichka_po_deponirovaniyu.pdf
  F_photo_2024_09_12_07_49_48.jpg

• Siniagina, M.N. Hydrogen sulfide-producing Escherichia coli strains in a patient with Crohn's colitis: a clinical case / M.N. Siniagina, A.V. Laikov, M.I. Markelova, E.A. Boulygina, N.A. Danilova, E.A. Sultanbekova, S.R. Abdulkhakov, T.V. Grigoryeva // FEBS Open Bio. - 2023. - V. 13 (Suppl. S2). - P. 159.
  abstract_FEBS2023.pdf
• Романова В.А. Изменения в составе микробного сообщества очистных сооружений предприятия органического синтеза при формировании углеводородных шламов / Романова В.А., Булыгина Е.А., Маркелова М.И., Григорьева Т.В., Лайков А.В. // СОХРАНЕНИЕ И ПРЕУМНОЖЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ РЕСУРСОВ МИКРООРГАНИЗМОВ: сборник тезисов II Всероссийской школы-конференции. - Санкт-Петербург, 2023. - С. 76.
• Хуснутдинова Д.Р. Потенциал продукции токсических метаболитов штаммами Ligilactobacillus salivarius, выделенными от пациентов с болезнью Крона / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, А.М. Сенина, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Генетические технологии в исследованиях природных соединений. Всероссийская научная школа-конференция молодых ученых и студентов, Владивосток, 3–7 октября 2023 г. : тезисы докладов конференции / ТИБОХ ДВО РАН. – Владивосток : Издательство Дальневосточного федерального университета, 2023. – С.61.
  F_Genetic_technologies_in_the_study_of_natural_compounds__1_.pdf
• Свидетельство № 2023680776 Российская Федерация. Программа анализа метагеномных данных кишечника / Р.Р. Мифтахова. - № 2023668751; заявл. 11.09.2023 ; опубл. 04.10.2023.
  2023680776_Miftakhova_R.R._i_dr._Pr._analiza_metagenomnykh_dannykh_kishechnika.pdf
• Хуснутдинова Д.Р. Характеристика геномов Ligilactobacillus salivarius, выделенных от пациентов с болезнью Крона / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, А.М. Сенина, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Сборник тезисов II Всероссийской школы-конференции «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (Санкт-Петербург, 26-27 июня 2023 г). – Москва: Издательство Перо, 2023. – С.91-92.
  Sbornik_tezisov_2023_Khusnutdinova_Piter.pdf
• Романова В.А. Мультиомиксные исследования аборигенных микроорганизмов техногенных экосистем / В.А. Романова, Е.А. Булыгина, М.И. Маркелова, Т.В. Григорьева, А.В. Лайков // Всероссийская научная школа-конференция молодых ученых и студентов «Генетические технологии в исследованиях природных соединений». - Владивосток, 2023. - С. 86.

• Romanova V, Markelova M, Boulygina E, Significance of both alkB and P450 alkane-degrading systems in Tsukamurella tyrosinosolvens: proteomic evidence // Applied Microbiology and Biotechnology. - 2022. - 106 (8). - pp. 3153-3171.
• Zolotykh M. et al. Single-nucleotide polymorphisms of POLQ rs3218634 and rs532411 may be associated with the risk of luminal breast cancer/ M. Zolotykh, A. Nesterova, A. Bilyalov, A. Zhdanova, A. Martyanova, A. Akhunzianov, R. Farzaleev, E. Boulygina, J. Filina, A. Rizvanov, R. Miftakhova //EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION. – 111 RIVER ST, HOBOKEN 07030-5774, NJ USA : WILEY, 2022. – Т. 52
• Kostenko V.V, Mouzykantov A.A, Baranova N.B, Development of Resistance to Clarithromycin and Amoxicillin-Clavulanic Acid in Lactiplantibacillus plantarum In Vitro Is Followed by Genomic Rearrangements and Evolution of Virulence//Microbiology Spectrum. - 2022. - Vol.10, Is.3. - .
• Filina J. et al. OGG1 ­rs1052133 ­is ­a ­potential predictor ­of ­cisplatin ­resistance­ in ­ovarian­ cancer patients / J. Filina, A. Sagdeeva, Y. Shamsutdinova, R. Galimova, A. Sabirov, A. Halilova, L. Sharafetdinova, E. Boulygina, A. Rizvanov, R. Miftakhova // EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION - 2022 -Т. 52 - C.153
• Filina J, Sagdeeva A, Shamsutdinova Y, OGG1 rs1052133 is a potential predictor of cisplatin resistance in ovarian cancer patients//EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION. - 2022. - Vol.52, Is.. - .
• Zolotykh M, Nesterova A, Bilyalov A, Single-nucleotide polymorphisms of POLQ rs3218634 and rs532411 may be associated with the risk of luminal breast cancer//EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION. - 2022. - Vol.52, Is.. - .
• Хуснутдинова Д.Р. Разнообразие Lactobacillus в микробиоте кишечника при ВЗК / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Цитология. – 2022. – Т.64. №7 – С.638-639.
  Materialy_VIII_Molodezhnoi__774__shkoly_konferencii_INC_RAN.pdf
• M. Zolotykh, Germline genetic variants of ERBB3 in triple-negative breast cancer / M. Zolotykh , A. Nesterova, A. Bilyalov, A. Gimranov , J. Filina , E. Boulygina, A. Rizvanov, R. Miftakhova // Cell Death Discovery. - 2022. - Т. Suppl 1. - №486. - С. 10
• M. Zolotykh, Single­nucleotide polymorphisms of POLQ rs3218634 and rs532411 may be associated with the risk of luminal breast cancer / M. Zolotykh, A. Nesterova, A. Bilyalov, A. Zhdanova, A. Martyanova, A. Akhunzianov, R. Farzaleev, E. Boulygina, J. Filina, A. Rizvanov, R. Miftakhova // / EUROPEAN JOURNAL OF CLINICAL INVESTIGATION ? 2022 - T.52 - C.100
• Siniagina M.N, Laikov A.V, Markelova M.I, Competitive ability of Escherichia coli strains in the intestinal microbiota of patients with Crohn's disease and healthy volunteers: physiological, biochemical and genetic characteristics//Zhurnal Mikrobiologii Epidemiologii i Immunobiologii. - 2022. - Vol.99, Is.6. - P.669-681.
• Zolotykh Maria, Nesterova Alfya, Bilyalov Airat, Germline genetic variants of ERBB3 in triple-negative breast cancer//CELL DEATH DISCOVERY. - 2022. - Vol.8, Is.1. - P.10-10.
• С. 2022623651, Российская Федерация. База данных факторов вирулентности комменсальных Escherichia coli / Синягина М.Н., Маркелова М.И., Лайков А.В., Булыгина Е.А., Григорьева Т.В.; № 2022623511; опубл. 23.12.2022.
• Хуснутдинова Д.Р. Особенности видового состава и генов вирулентности Lactobacillus при воспалительных заболеваниях кишечника / Д.Р. Хуснутдинова, М.И. Маркелова, А.М. Сенина, М.Н. Синягина, И.Ю. Васильев, Е.А. Булыгина, С.Р. Абдулхаков, Т.В. Григорьева // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. – 2022. – №3-4. – С.14-15
  F_gsp_3_4_2022_e_zhurnal.pdf
• Boulygina E. A. et al. Loss-of-function mutations in athletes //Bioinformatics of Genome Regulation and Structure/Systems Biology (BGRS/SB-2022). – 2022. – С. 392-392.
  F_Loss_of_function_mutations_in_athletes.pdf

• Lo Sasso G, Khachatryan L, Kondylis A, Inflammatory Bowel Disease-Associated Changes in the Gut: Focus on Kazan Patients//Inflammatory bowel diseases. - 2021. - Vol.27, Is.3. - P.418-433.
• Siniagina M.N, Markelova M.I, Boulygina E.A, Diversity and adaptations of escherichia coli strains: Exploring the intestinal community in crohn?s disease patients and healthy individuals//Microorganisms. - 2021. - Vol.9, Is.6. - Art. № 1299.
• Siniagina, Maria N., et al. Diversity and Adaptations of Escherichia coli Strains: Exploring the Intestinal Community in Crohn's Disease Patients and Healthy Individuals // Microorganisms. - 2021. - V.9. - N.6. - P.1299.
• Булыгина Е.А. Полногеномное секвенирование спортсменов: влияние нонсенс-мутаций на функциональные показатели / Булыгина Е.А., Борисов О.В., Валеева Е.В., Семенова Е.А., Ларин А.К., Набиуллина Р.М., Мавлиев Ф.А., Ахатов А.М., Генерозов Э.В., Ахметов И.И. // Медицинская генетика. - 2021. - № 20. - Вып. 4. - С. 19-29.
  F_Mg_2021_04_19_29_Boulygina.pdf
• Khusnutdinova D Dynamic changes in Lactobacillus and Bifidobacterium abundance in the intestinal microbiota of patients with moderate COVID-19 and healthy individuals / D. Khusnutdinova, A. Senina, M. Markelova, V. Romanova, E. Boulygina, E. Ziyatdinova, E. Muhametshina, I. Grigoreva, A. Sharkhemullina, S.Abdulkhakov, T. Grigoryeva // International conference on beneficial microbes (ICOBM-2021, June 1-6, 2021): Book of Abstracts. – Rostov-on-Don, 2021. – С.64
  Abstracts_of_ICOBM_2021__1_.pdf
• Байчурина И.А. Изменения транскрипционного профиля Escherichia coli K-12 substr. MG1655 в ответ на взаимодествие с иммуноглобулином А IN VITRO / И.А. Байчурина, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, А.В. Лайков, Е.А. Булыгина, Я.К. Семин, А.А. Круглов, Д.С. Матюшкина, В.А. Мусарова, Т.В. Григорьева// Сборник тезисов докладов III Объединенного научного форума физиологов, биохимиков и молекулярных биологов, Сочи - Дагомыс, 3-8 октября 2021 года.-С.30.
  F_Tekst_tezisa_Dagomys.pdf
• Siniagina M., Markelova M., Boulygina E., Antibiotic resistome profiles of fecal Escherichia coli isolates in association with Crohn's disease//JOURNAL OF CROHNS & COLITIS. - 2021. - Vol.15, Is.. - P.S601-S602.
• Khusnutdinova D., Markelova M., Siniagina M., Overabundance of Lactobacillus species in gut microbiota of IBD patients//JOURNAL OF CROHNS & COLITIS. - 2021. - Vol.15, Is.. - P.S160-S161.
• Григорьева Т. В. и др. БАЗА ДАННЫХ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ЧЕЛОВЕКА ДЛЯ ПЕРСОНИФИЦИРОВАННОГО ПОДБОРА ОЗДОРОВИТЕЛЬНО-ПРОФИЛАКТИЧЕСКИХ ПРОЦЕДУР.
  F_elibrary_44758516_12126901.PDF
• Сираева З.Ю., Булыгина Е.А., Исмагилова Р.К., Кравцова О.А. Метагеномный анализ структуры прокариотных сообществ горизонтов почв при No-Till технологии / З.Ю. Сираева, Е.А. Булыгина, Р.К. Исмагилова, О.А. Кравцова / Современные проблемы биохимии, генетики и биотехнологии: мат. III Всеросс. науч. конф. с междунар. участием, Уфа, 21-23 сент. 2021. - Уфа: РИЦ БашГУ, 2021. - С. 207-214.
  sbornik2021.pdf

• Siniagina M, Markelova M, Laikov A, Cultivated Escherichia coli diversity in intestinal microbiota of Crohn's disease patients and healthy individuals: Whole genome data//Data in Brief. - 2020. - Vol.28, Is.. - Art. № 104948.
• Semenova E.A, Miyamoto-Mikami E, Akimov E.B, The association of HFE gene H63D polymorphism with endurance athlete status and aerobic capacity: novel findings and a meta-analysis//European Journal of Applied Physiology. - 2020. - Vol., Is.. - .
• Boulygina EA, Borisov OV, Valeeva EV, Semenova EA, Kostryukova ES, Kulemin NA, Larin AK, Nabiullina RM, Mavliev FA, Akhatov AM, Andryushchenko ON, Andryushchenko LB, Zmijewski P, Generozov EV, Ahmetov II. Whole-genome sequencing of elite athletes. Biol Sport. 2020;37(3):295-304.
• Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Маркелова М.И., Григорьева Т.В., Булыгина Е.А., Маланин С.Ю., Васильев И.Ю., Синягина М.Н., Абдулхаков Р.А. Влияние эрадикационной терапии H.Pylori на состав микробиоты кишечника / Материалы к 46-й научной сессии ЦНИИ гастроэнтерологии «Генетика в гастроэнтерологии: возможности и перспективы»// Доказательная гастроэнтерология. – 2020. – Т.1, № 2. – С.12-13.
• Boulygina E.A, Borisov O.V, Valeeva E.V, Whole genome sequencing of elite athletes//Biology of Sport. - 2020. - Vol.37, Is.3. - P.295-304.
• Эрадикационная терапия Helicobacter pylori и микробиота кишечника у пациентов с заболеваниями верхних отделов желудочно-кишечного тракта / Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Маркелова М.И., Григорьева Т.В., Булыгина Е.А., Маланин С.Ю., Васильев И.Ю., Синягина М.Н., Абдулхаков Р.А. // Вестник современной клинической медицины. – 2020. – Т. 13, № 1. – С. 46-53.
• Khusnutdinova D. SHIFTS IN RESISTANCE OF LACTOBACILLUS IN HUMAN GUT MICROBIOTA AFTER HELICOBACTER PYLORI ERADICATION THERAPY / Khusnutdinova D., Markelova M., Siniagina M., Boulygina E., Malanin S., Grigoryeva T.V., Abdulkhakov S., Abdulkhakov R.A., Chernov V., Chernova O. // United European Gastroenterology Journal - October 2020. - Vol.8 (8) - P. 502.

• Martykanova D.S, Davletova N.C, Zemlenuhin I.A, Skin Microbiota in Contact Sports Athletes and Selection of Antiseptics for Professional Hygiene//BioMed Research International. - 2019. - Vol.2019, Is.. - Art. № 9843781.
• Romanova Valeriya A., Boulygina Eugenia A., Siniagina Maria N., Draft Genome Sequence of a Medium- and Long-Chain n-Alkane-Degrading Bacterium, Tsukamurella tyrosinosolvens Strain PS2, with Two Genetic Systems for Alkane Degradation//MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS. - 2019. - Vol.8, Is.17. - Art. №e00218-19.
• Arleevskaya M., Larionova R., Kravtsova O., Shagimardanova E., Validov S., Valeeva A., Valieva D., Boulygina E., Takha E., Shuralev E., Mukminov M., Kazarian G., Renaudineau Y. Infections, microbiota and immune response at early stage of rheumatoid arthritis: results from the Tatarstan cohort // Proceeding of the VII International Meeting: New concepts on the mechanisms of inflammation, autoimmunity and tumorogenesis (6-8 June 2019, Kazan, Russia). – Kazan: MeDDok, 2019. – P. 76.
• Danilova N. A., Abdulkhakov S. R., Grigoryeva T. V., Markers of dysbiosis in patients with ulcerative colitis and Crohn's disease//TERAPEVTICHESKII ARKHIV. - 2019. - Vol.91, Is.4. - P.13-20.
• Siniagina M. Cultivated Escherichia coli diversity in intestinal microbiota of Crohn's disease patients and healthy individuals: whole genome data / Siniagina M., Markelova M., Laikov A., Boulygina E., Khusnutdinova D., Kharchenko A., Misbakhova A., Grigoryeva T. //Data in Brief. – 2019. – V. 28. - P. 104948.
  F_DatainBrief2019.pdf
• Olekhnovich E.I, Manolov A.I, Samoilov A.E, Shifts in the human gut microbiota structure caused by quadruple helicobacter pylori eradication therapy//Frontiers in Microbiology. - 2019. - Vol.10, Is.AUG. - Art. № 1902.
• Khusnutdinova D. The development of resistance to clarithromycin and amoxicillin in Lactobacillus plantarum is accompanied by mutations not only in target genes / Khusnutdinova D., Markelova M., Boulygina E., Kupriyanova E., Siniagina M., Baranova N., Grigoryeva T., Chernov V., Chernova O. // United European Gastroenterology Journal - October 2019. - Vol.7 (8S) - P. 926.
• Pickering C, Suraci B, Semenova E.A, A Genome-Wide Association Study of Sprint Performance in Elite Youth Football Players//Journal of strength and conditioning research. - 2019. - Vol.33, Is.9. - P.2344-2351.
• Siniagina M. No difference in the distribution of pathogenic factors found in Escherichia coli isolates from patients with Crohn's disease and healthy individuals / Siniagina M., Markelova M., Laikov A., Boulygina E., Khusnutdinova D., Kharchenko A., Fedorova M., Romanova V., Grigoryeva T. // United European Gastroenterology Journal - October 2019. - Vol.7 (8S) - P. 870.
  F_UEG2019_Siniagina.pdf
• Semenova Ekaterina A., Boulygina Eugenia A., Valeeva Elena V., A Genome-wide Association Study For Muscle Fiber Composition//MEDICINE AND SCIENCE IN SPORTS AND EXERCISE. - 2019. - Vol.51, Is.6. - P.575-575.

• Baranova N.B, Malygina T.Y, Medvedeva E.S, Genome sequences of Acholeplasma laidlawii strains with increased resistance to tetracycline and melittin//Genome Announcements. - 2018. - Vol.6, Is.2. - Art. № e01446-17.
• Экспериментальная и клиниче-ская гастроэнтерология. 2018. Т. 159, № 11. С. 48-61.
• Валеева Е.В., Семенова Е.А., Кашеваров Г.С., Ахметов И.И., Кравцова О.А. Ассоциация полиморфизма rs6265 BDNF и rs6313 HTR2A со стрессоустойчивостью хоккеистов // Сборник материалов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы в области физической культуры и спорта«, посвященной 85-летию ФГБУ СПбНИИФК. – Санкт-Петербург. – 27-28 сентября 2018 г. – С.191-193.
• Семенова Е.А., Миямото-Миками Э., Акимов Е.Б., Аль-Хелаифи Ф., Мураками Х., Земпо Х., Кострюкова Е.С., Кулемин Н.А., Ларин А.К., Мияти М., Оспанова Е.А., Павленко А.В., Любаева Е.В., Попов Д.В., Виноградова О.Л., Булыгина Е.А., Кумагаи Х., Какиги Р., Кобаяши Х., Леонска-Дуниек А., Жастребски З., Ядзевска А., Моска В., Лулинска-Куклик Э., Савчук М., Чешчик П., Мазчик А., Франки П.В., Линдгрен К., Осколков Н., Ханссон О., Наито Х., Пикеринг К., Грималди К.А., Элейс М.А., Генерозов Э.В., Говорун В.М., Фуку Н., Ахметов И.И. Идентификация маркеров выносливости с помощью полногеномных технологий // Сборник материалов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные проблемы в области физической культуры и спорта«, посвященной 85-летию ФГБУ СПбНИИФК. – Санкт-Петербург. – 27-28 сентября 2018 г. – С.234-236.
• Safina D., Markelova M., Abdulkhakov S., Taxonomic diversity changes in human gut microbiota due to Helicobacter pylori eradication therapy//HELICOBACTER. - 2018. - Vol.23, Is.. - .
• Borisov O., Semenova E., Miyamoto-Mikami E., A genome-wide association study of muscle fibers composition revealed 5 SNPs associated with slow-twitch fibers//FEBS OPEN BIO. - 2018. - Vol.8, Is.. - P.463-463.
• Булыгина Е.А., Бочкарев В.В., Соловьев В.Д. Сопоставление генетических и лингвистических данных как подход к изучению миграций народов // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2018. – Т. 160, кн. 2. – С. 227–239.
• Baranova N. B. et al. Genome Sequences of Acholeplasma laidlawii Strains with Increased Resistance to Tetracycline and Melittin / N. B. Baranova, T. Malygina, E. S. Medvedeva, E. A. Boulygina, M. N. Siniagina, M. A. Dramchini, R. A. Prottoy, A. A. Mouzykantov, M. N. Davydova, O. A. Chernova, V. M. Chernov //Genome announcements. – 2018. – V. 6. – N. 2. – P. e01446-17.
• Siniagina M.N. Crohn's disease-associated Escherichia coli serotyping through the whole-genome sequencing of cultivated intestinal community / M.N. Siniagina, M.I. Markelova, A.V. Laikov, E.A. Boulygina, T.V. Grigoryeva // 5th European Congress of Immunology ECI2018: abstract book. - P. 432
• Харченко А.М. Изменение микробиоты рубца у молочных коров на фоне применения пробиотиков / Харченко А.М., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Синягина М.Н., Маланин С.Ю., Хуснутдинова Д.Р., Крупин Е.О., Шакиров Ш.К., Григорьева Т.В. // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V Международной конференции "ПОСТГЕНОМ 2018". - Казань: Издательство Казан. ун-та., 2018. - 223с.
• Medvedeva E.S. Molecular bases of Acholeplasma laidlawii adaptation to environmental conditions / E.S. Medvedeva, N.B. Baranova, A.A. Mouzykantov, M.N. Siniagina, E.A. Boulygina, M.N. Davydova, O.A. Chernova, V.M. Chernov // The 14th Biennial Congress of the Anaerobe Society of the Americas. Anaerobe 2018. Abstract book. –July 9-12, 2018. – Las Vegas, Nevada, USA. – P. 159.
• D. Khusnutdinova, S. Malanin, T. Grigoryeva, S. Abdulkhakov, I. Vasilyev, M. Markelova, E. Boulygina, M. Siniagina, R. Abdulkhakov, V. Chernov, O. Chernova. Fate of beneficial gut microbiote after H. Pylori eradication therapy: metagenomic landscape of resistance mechanisms. United European Gastroenterology Journal - October 2018: Vol.6 (8S): Suppl. 1 - P. A731, P 1828.
• Экспериментальная и клиниче-ская гастроэнтерология. 2018. Т. 159, № 11. С. 48?61.
• Харченко А.М., Сравнительный анализ микробиоты рубца высокопродуктивных коров на фоне применения пробиотиков [Электронный ресурс] / А.М. Харченко, Ф.Р. Вафин, Д.Р. Хуснутдинова, Ш.К. Шакиров, Е.А. Булыгина, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, Т.В. Григорьева // Материалы Международного молодежного форума "ЛОМОНОСОВ-2018" // М.: МАКС Пресс, 2018. - ISBN 978-5-317-05800-5.
• Харченко А.М., Изменение микробиоты рубца у молочных коров на фоне применения пробиотиков / Харченко А.М., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Синягина М.Н., Маланин С.Ю., Хуснутдинова Д.Р., Крупин Е.О., Шакиров Ш.К., Григорьева Т.В. // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V Международной конференции ?ПОСТГЕНОМ?2018?. ? Казань ?: Издательство Казан. ун-та., 2018. ? 223с.
• Харченко А.М. Сравнительный анализ микробиоты рубца высокопродуктивных коров на фоне применения пробиотиков [Электронный ресурс] / А.М. Харченко, Ф.Р. Вафин, Д.Р. Хуснутдинова, Ш.К. Шакиров, Е.А. Булыгина, М.И. Маркелова, М.Н. Синягина, Т.В. Григорьева // Материалы Международного молодежного форума "ЛОМОНОСОВ-2018" // М.: МАКС Пресс, 2018. - ISBN 978-5-317-05800-5.

• Safina D. The Influence of Helicobacter Pylori Eradication Therapy on Intestinal Microbiota / Safina D., Abdulkhakov S., Grigoryeva T., Khusnutdinova D., Kovarsky B., Tyakht A., Markelova M., Boulygina A., Siniagina M., Malanin S., Abdulkhakov R., Chernov V. // Gastroenterology. - 2017. - Т. 152. - №. 5. - С. S633.
  Safina_D._The_Influence_of_Helicobacter_Pylori_Eradication_Therapy_on_Intestinal_Microbiota_AGA_Abstracts.pdf
• Ученые записки Казанского государственного университе-та. Серия: Естественные науки. 2017. Т. 159, № 2. С. 217-231.
• Mouzykantov A.A, Medvedeva E.S, Malygina T.Y, Plasticity of Mycoplasmas: Changes in the Genomic Profile, as well as in the Cellular and Vesicular Proteomes of the Acholeplasma laidlawii in Adapting the Bacterium to Different Environmental Conditions//BioNanoScience. - 2017. - Vol.7, Is.2. - P.323-325.
• Martykanova D.S, Davletova N.C, Zemlenuhin I.A, Characterization of Dysbiotic Changes of Skin Microbiota in Contact Sports Athletes//BioNanoScience. - 2017. - Vol.7, Is.1. - pp 1-3.
  Martykanova.pdf
• Medvedeva E.S., Malygina T.Y., Baranova N.B., Mouzykantov А.А., Davydova M.N. , Siniagina M.N., Boulygina E.A., Chernova O.A., Chernov V.M. Molecular bases of antimicrobial resistance of Acholeplasma laidlawii. IC2AR 2017. Proceedings Book. 2nd International Caparica Conference in Antibiotic Resistance. Caparica, Portugal. – 2017. – P. 215.
• Хуснутдинова Д.Р., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Синягина М.Н., Маланин С.Ю., Григорьева Т.В., Исмагилова Р.К., Сафина Д.Д., Абдулхаков С.Р., Абдулхаков Р.А., Чернов В.М., Чернова О.А. Влияние эрадикационной терапии Helicobacter pylori на микробиоту человека: метагеномный анализ микробиома кишечника // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. ? 2017. ? Т. 159, кн. 2. ? С. 217?231.
• Семенова Е.А., Валеева Е.В., Булыгина Е.А., Губайдуллина С.И., Ахметов И.И. Применение омиксных технологий в системе спортивной подготовки // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2017. – Т. 159, кн. 2. – С. 232–247
  Primenenie_omiksnyh_tehnologij_v_sisteme_sportivnoj_podgotovki.pdf
• N. A. Danilova. Abundance of key intestinal dysbiosis markers in gut metagenomes of patients with ulcerative colitis and Crohn's disease / N. A. Danilova, M. Markelova, E. Boulygina, I. Vasilyev, S. Abdulkhakov, T. Grigoryeva, V. Dubinkina, A. Tyakht, A. Pavlenko, A. Odintsova, R. Abdulkhakov // Helicobacter, Special Issue: XXXth International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer, 7-9 September 2017, Bordeaux.- Vol. 22, Is. S1. - P. 124
• D. Safina. Prevalence of key members of human gut microbiota after Helicobacter pylori eradication therapy / D. Safina, D. Khusnutdinova, T. Grigoryeva, S. Abdulkhakov, M. Markelova, E. Boulygina, M. Siniagina, S. Malanin, R. Ismagilova, R. Abdulkhakov, V. Chernov, O. Chernova // Helicobacter, Special Issue: XXXth International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer, 7-9 September 2017, Bordeaux.- Vol. 22, Is. S1. - P. 127-128
• S. Malanin. Effects of Helicobacter pylori eradication therapy on gut resistome // S. Malanin, D. Safina, S. Abdulkhakov, D. Khusnutdinova, I. Vasilyev, T. Grigoryeva, M. Siniagina, M. Markelova, E. Boulygina, R. Abdulkhakov, V. Chernov // Helicobacter, Special Issue: XXXth International Workshop on Helicobacter & Microbiota in Inflammation & Cancer, 7-9 September 2017, Bordeaux.- Vol. 22, Is. S1. - P. 128
• Markelova M., Siniagina M., Boulygina E., Gastrointestinal microbiota of the Japanese quail: sex-based differences//FEBS JOURNAL. - 2017. - Vol.284, Is.. - P.380-380.
• Medvedeva E.S, Siniagina M.N, Malanin S.Y, Genome sequences of Acholeplasma laidlawii strains differing in sensitivity to ciprofloxacin//Genome Announcements. - 2017. - Vol.5, Is.44. - Art. № e01189-17.
• Boulygina E.A, Markelova M.I, Khusnutdinova D.R, Shotgun metagenomic data on the human stool samples to characterize shifts of the gut microbial profile after the Helicobacter pylori eradication therapy//Data in Brief. - 2017. - Vol.14, Is.. - P.458-461.
• Galitskaya P, Biktasheva L, Saveliev A, Fungal and bacterial successions in the process of co-composting of organic wastes as revealed by 454 pyrosequencing//PLoS ONE. - 2017. - Vol.12, Is.10. - Art. № e0186051.
• Семенова Е.А., Валеева Е.В., Булыгина Е.А., Губайдуллина С.И., Ахметов И. И. Применение омиксных технологий в системе спортивной подготовки // Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки. ? 2017. ? T.159. ? №2. ? С.232?247.
• Medvedeva E.S. Genome Sequences of Acholeplasma laidlawii Strains Differing in Sensitivity to Ciprofloxacin / Medvedeva E.S., Siniagina M.N., Malanin S.Y., Boulygina E.A., Malygina T.Y., Baranova N.B., Mouzykantov A.A., Davydova M.N., Chernova O.A., Chernov V.M. // Genome Announc. 2017 5(44). pii: e01189-17. doi: 10.1128/genomeA.01189-17.
• Medvedeva E.S., Malygina T.Y., Baranova N.B., Mouzykantov А.А., Davydova M.N. , Siniagina M.N., Boulygina E.A., Chernova O.A., Chernov V.M. Molecular bases of antimicrobial resistance of Acholeplasma laidlawii. IC2AR 2017. Proceedings Book. 2nd International Caparica Conference in Antibiotic Resistance. Caparica, Portugal. - 2017. - P. 215.
• Romanova V. A., Boulygina E. A., Grigoryeva T. V., Comparison of virulence factors in clinical and environmental strains of actinobacterium Tsukamurella tyrosinosolvens based on whole-genome sequencing.//MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL. - 2017. - Vol.28, Is.. - .
• Ilya Vasilyev. First identification of C50 carotenoids biosynthesis gene cluster in nematode-associated bacterium Agreia Bicolorata strain VKM AC-1804 and its abundance in coryneform actinobacteria group / Ilya Vasilyev, Eugenia Boulygina, Dina Yarullina, Olga Ilinskaya // Abstracts of 16th Fat Soluble Vitamins Congress, p. 105.
  FSV_2017___PARIS___ABSTRACT_BOOK_108_108.pdf

• Медведева Е. С. Геномный и протеомный профили штаммов Acholeplasma laidlawii, различающихся по чувствительности к ципрофлоксацину / Е.С. Медведева, М.Н. Давыдова, А.А. Музыкантов, Н.Б. Баранова, Т.Ю. Григорьева, М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, О.А. Чернова, В.М. Чернов // Докл. АН. - 2016. - Т. 466, № 2. - С. 228-232.
• Харченко А.М., Метагеномный анализ в диагностике нарушений микробиоты рубца высокопродуктивных коров [Текст] / Харченко А.М., Григорьева Т.В., Синягина М.Н., Маркелова М.И., Булыгина Е.А., Хуснутдинова Д.Р., Маланин С.Ю., Хамидуллин И.Р., Шакиров Ш.К. // Актуальные проблемы современной генетики. Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 40-летию кафедры генетики Института Фундаментальной Медицины и Биологии Казанского Федерального Университета. - 2016. - С. 95-97.
• А.А. Тойменцева. Сравнительная характеристика двух геномов Bacillus pumilus / А.А. Тойменцева, Д.С. Баранова, Е.А. Булыгина, М.И. Маркелова, М.Р. Шарипова // Спецвыпуск Acta Naturae. - 2016. - Т. 2. - С. 203.
  AbstractBook_Vol2_203.pdf
• A. Laikov. Proteogenomic profile of the new alkane-oxidizing strain Tsukamurella tyrosinosolvens PS2 in relation to the emulsification activity / A. Laikov, V. Romanova, E. Boulygina, M. Siniagina, J. Romanova, T. Grigorieva // FEBS J. - 2016. - V. 283 (S1) – P. 373.
  2016_The_FEBS_Journal_247_247.pdf
• Medvedeva E.S, Davydova M.N, Mouzykantov A.A, Genomic and proteomic profiles of Acholeplasma laidlawii strains differing in sensitivity to ciprofloxacin//Doklady Biochemistry and Biophysics. - 2016. - Vol.466, Is.1. - P.23-27.
• Siniagina M. N. Comparative analysis of gastrointestinal microbiome in wild and domestic quails /M. N. Siniagina, M. I. Markelova, E. A. Boulygina, E. R. Kirillova, A. V. Lichoman, V. V. Radchenko // Abstracts of The X International Conference of Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. - 2016. - P. 281.
• A. Toymentseva. Genomic characterization of two Bacillus pumilus strains / A. Toymentseva, I. Danilova, D. Baranova, E. Boulygina, M. Markelova, M. Sharipova // FEBS J. - 2016. - V. 283 (S1) – P. 239.
• Хуснутдинова Д. Оценка риска критических изменений микробиоты кишечника человека в результате антимикробной терапии / Д. Хуснутдинова, Т. Григрьева, С. Абдулхаков, Д. Сафина, М. Синягина, М. Маркелова, Е. Булыгина, С. Маланин, А. Тяхт, Б. Коварский, Р. Абдулхаков, В. Чернов // Актуальные проблемы современной генетики: тезисы докладов. - Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2016. - С.98-100.
• Boulygina E.A, Lukianova E, Grigoryeva T.V, Lessons from the Whole Exome Sequencing Effort in Populations of Russia and Tajikistan//BioNanoScience. - 2016. - Vol.6, Is.4. - P.540-542.
  BioNanoScience_Boulygina.pdf
• Khusnutdinova D, Grigoryeva T, Abdulkhakov S, Gut Microbiome Shotgun Sequencing in Assessment of Microbial Community Changes Associated with H. pylori Eradication Therapy//BioNanoScience. - 2016. - Vol.6, Is.4. - P.585-587.
• Медведева Е.С. Геномный профиль штаммов Acholeplasma laidlawii, различающихся по чувствительности к антибактериальным препаратам / Медведева Е.С., Давыдова М.Н., Музыкантов А.А., Баранова Н.Б., Григорьева Т.Ю., Синягина М.Н., Булыгина Е.А., Чернова О.А., Чернов В М. // Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков России и конференции ADFLIM. – Сочи – Дагомыс, Россия. – ActaNaturae, спецвыпуск. – 2016. – Т. 2. – С.242.
• Малыгина Т.Ю. Молекулярные основы устойчивости Acholeplasma laidlawii к антимикробным препаратам / Малыгина Т.Ю., Медведева Е.С., Музыкантов А.А., Баранова Н.Б., Давыдова М.Н., Синягина М.Н., Булыгина Е.А., Шах Махмуд Р., Проттой Р.А., Чернова О.А., Чернов В.М. // IV Российский симпозиум с международным участием «Фитоиммунитет и клеточная сигнализация у растений«. Тез. докл. - Казань: Изд-во: «ФизтехПресс« КФТИ КазНЦ РАН. - Казань, Россия. - 2016 г. - С. 95-96
• Toymentseva A., Danilova I., Baranova D., Genomic characterization of two Bacillus pumilus strains//FEBS JOURNAL. - 2016. - Vol.283, Is.. - P.239-239.
• Харченко А.М. Метагеномный анализ в диагностике нарушений микробиоты рубца высокопродуктивных коров [Текст] / А.М. Харченко, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Е.А. Булыгина, Д.Р. Хуснутдинова, С.Ю. Маланин, И.Р. Хамидуллин, Ш.К. Шакиров, Т.В. Григорьева // Актуальные проблемы современной генетики. Всероссийская конференция с международным участием, посвященная 40-летию кафедры генетики Института Фундаментальной Медицины и Биологии Казанского Федерального Университета. - 2016. - С. 95-97. - ISBN 978-5-00019-708-0.
• BioNanoScience.2016. Vol. 6, № 4. P. 585-587.
• В сборнике тезисов: Программа и научные труды Научной кон-ференции молодых ученых по медицинской биологии ФГБУ ФНКЦ физико-химической ме-дицины ФМБА. Москва, 2016. С. 150-151.
• Хуснутдинова Д.Р. Метагеномный анализ и интегральные показатели изменений кишечной микрофлоры на фоне эрадикации Helicobacter pylori. Д.Р. Хуснутдинова, Т.В. Григорьева, С.Р. Абдулхаков, Д.Д. Сафина, Е.А. Булыгина, С.Ю. Маланин, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Р.А. Абдулхаков, В.М. Чернов // Программа и научные труды Научной конференции молодых ученых по медицинской биологии ФГБУ ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА. - 2016. - С. 150-151
  2016_FRCPC_YNG_Program_Proceedings_152_153.pdf

• Medvedeva E.S. Extracellular vesicles and resistance of mycoplasmas to fluoroquinolones: resistome of Acholeplasma laidlawii / E.S. Medvedeva, N.B. Baranova, T.Y. Grigoreva, A.A. Mouzykantov, E.A. Boulyguina, M.N. Siniagina, M.N. Davydova, O.A. Chernova, V.M. Chernov // The 6th Congress of European Microbiologists (FEMS 2015). Program book. – Maastricht, The Netherlands. – 2015. – P. 120.
• Григорьева Т.Ю. Молекулярные основы устойчивости микоплазм к фторхинолонам: резистом Acholeplasma laidlawii / Т.Ю. Григорьева, Е.С. Медведева, А.А. Музыкантов, Н.Б. Баранова, М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, М.Н. Давыдова, Г.Ф. Шаймарданова, О.А. Чернова, В.М. Чернов // Биология – наука ХХI века: 19-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых. Сборник тезисов. – Пущино, Россия. – 2015 г. – С. 172-173.
• Suleimanova A.D, Toymentseva A.A, Boulygina E.A, High-quality draft genome sequence of a new phytase-producing microorganism Pantoea sp. 3.5.1//Standards in Genomic Sciences. - 2015. - Vol., Is.. - .
• Ziganshina E.E., Belostotskiy D.E., Ilinskaya O.N, Boulygina E.A., Grigoryeva T.V., Ziganshin A.M. Effect of the Organic Loading Rate Increase and the Presence of Zeolite on Microbial Community Composition and Process Stability During Anaerobic Digestion of Chicken Wastes // Microbial Ecology. - 2015. - Vol. 70. - P. 948-960.
• Тезисы I Международной шко-лы-конференции студентов, ас-пирантов и молодых ученых ?Биомедицина, материалы и технологии XXI века?. Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2015. С. 219.
• Хуснутдинова Д.Р. ВЛИЯНИЕ ЭРАДИКАЦИОННОЙ ТЕРАПИИ H.PYLORI НА МИКРОФЛОРУ КИШЕЧНИКА / Д.Р. Хуснутдинова, Т.В. Григорьева, С.Р. Абдулхаков, Д.Д. Сафина, Е.А. Булыгина, С.Ю. Маланин, Р.К. Исмагилова, М.Н. Синягина, М.И. Маркелова, Р.А. Абдулхаков, В.М. Чернов // Сборник тезисов I Международной школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Биомедицина, материалы и технологии XXI века». - Казань, 2015. - С. 219
  Tezisy_Vliyanie_eradikacii.pdf
• Toymentseva A.A, Suleimanova A.D, Boulygina E.A, Draft genome sequence of Bacillus ginsengihumi strain M2.11 with phytase activity//Genome Announcements. - 2015. - Vol.3, Is.4. - Art. № e00851-15.
• Vasilyev I, Siniagina M, Malanin S, Draft genome sequence of Agreia bicolorata strain AC-1804, a producer of large amounts of carotenoid pigments, isolated from narrow reed grass infected by the phytoparasitic nematode//Genome Announcements. - 2015. - Vol.3, Is.6. - Art. № e0138315.
• Grigoreva T.Yu. Molecular basis for the development of mycoplasmas resistance to fluoroquinolones: genomic profiles of A.laidlawii strains, differing in sensitivity to ciprofloxacin / Grigoreva T.Yu., Medvedeva E.S., Mouzykantov A.A., Baranova N.B., Sinigina M.N., Boulygina E.A., Davydova M.N., Chernov V.M. // 18th Symposium for Biology Students in Europe, Alexandroupoli, 23-31 Juli, 2015. P. 22.
• Belostotskiy D.E., Ziganshina E.E., Siniagina M., Boulygina E.A., Miluykov V.A., Ziganshin A.M. Impact of the substrate loading regime and phosphoric acid supplementation on performance of biogas reactors and microbial community dynamics during anaerobic digestion of chicken wastes // Bioresource Technology. - 2015. - Vol. 193. - P. 42-52.

• Синягина М.Н. Загадки генома экстремотолерантного штамма P. stutzeri KOS6: нетипичное поведение типичных систем / М.Н. Синягина, Е.А. Булыгина, А.В. Лайков, С.Ю. Маланин, А.И. Манолов , Д.Г. Алексеев, Т.В. Григорьева // Геномика и системная биология: сборник междунар. школы молодых ученых по молекулярной генетике. - М.: ИМГ РАН, 2014. - С.41

• Булыгина Е.А., Соловьев В.Д. ДНК-филогения и лингвистическое разнообразие тюркских народов // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. - 2014. - Т. 155, 4. - С. 69-81
• Е. А. Булыгина. Транскриптомный анализ ответа мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток человека на воздействие неионных блоксополимеров / Е.А. Булыгина, Н.Л. Блатт, А.К. Шафигуллина, А.А. Ризванов // Клеточная трансплантология и тканевая инженерия. – 2013. – Т. 8, №3. – С. 11-12.
• Akhatova F.S, Boulygina E.A, Litvinov S.S, Analysis of polymorphism in Alu-incertional loci in the population of Tatar in Russia//World Applied Sciences Journal. - 2013. - Vol.26, Is.4. - P.461-463.
  Analysis_of_Polymorphism_in_Alu_Incertional_Loci_in_the_Population_of_Tatar_in_Russia_.pdf
• Bulygina E., Solovyev V., Bayrasheva V. North-Caucasian languages: measures of similarities//Proceedings of The XVIII-th Intern. Conf. “Cognitive Modeling in Linguistics”. Kazan: KFU, 2013
  V._Solovyev__E._Bulygina__V._Bayrasheva._North_Caucasian_languages__measures_of_similarity_.pdf

• Булыгина Е. А., Соловьев В. Д. Генетическое и лингвистическое разнообразие четырнадцать популяций Евразии // Ученые записки Казанского университета. Серия: Естественные науки. – 2012. – Т. 154. – №. 4. – С. 175-187.
  Bulygina_E.A.__Solovev_V.D._Geneticheskoe_i_lingvisticheskoe_raznoobrazie_14_populyacij_Evrazii_.pdf