KFU. Card publication. Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации

- RUS
- 中文
- ES

ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА В УРАЛЬСКОМ РЕГИОНЕ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Form of presentation

Articles in Russian journals and collections

Year of publication

2024

Язык

русский

Authors, employees of KFU

Tkachev Sergey Evgenevich, author

Shagimardanova Elena Ilyasovna, author

Shaykhutdinov Nurislam Maratovich, author

Shigapova Leylya Khuzzatovna, author

Other authors

Dzhioev Yuriy Pavlovich, author

Doroshhenko Elena Konstantinovna, author

Zlobin Vladimir Igorevich, author

Kozlova Irina Valerevna, author

Lisak Oksana Vasilevna, author

Suncova Olga Vladimirovna, author

Yakimenko Valeriy Viktorovich, author

Bibliographic description in the original language

Shigapova L.Kh. Ispolzovanie vysokoproizvoditelnogo sekvenirovaniya dlya izucheniya geneticheskogo raznoobraziya virusa kleshhevogo encefalita v Uralskom regione Rossiyskoy Federacii / L.Kh. Shigapova, N.M. Shaykhutdinov, E.I. Shagimardanova, I.V. Kozlova, V.V. Yakimenko, O.V. Lisak, E.K. Doroshhenko, O.V. Suncova, Yu.P. Dzhioev, V.I. Zlobin, S.E. Tkachyov // Nacionalnye prioritety Rossii. - 2024. - № 4 (55). – S. 84-89.

Annotation

Вирус клещевого энцефалита (ВКЭ) является возбудителем тяжёлого заболевания центральной нервной системы человека — клещевого энцефалита. Высокопроизводительное полногеномное секвенирование вирусов является мощным инструментом для генетического анализа коллекций образцов штаммов ВКЭ. В настоящее время в базе данных GenBank содержится около 250 полногеномных последовательностей штаммов и изолятов ВКЭ из различных регионов Евразии, но для ряда регионов, включая Уральский регион, полногеномные после-довательности ВКЭ отсутствуют. Поэтому целью данного исследования являлось изучение генетического разно-образия ВКЭ в ряде районов Урала с использованием полногеномных последовательностей, полученных с помо-щью методов высокопроизводительного секвенирования. Молекулярно-генетический анализ 16 полногеномных последовательностей штаммов ВКЭ показал, что преобладающим субтипом среди исследуемых образцов ВКЭ оказались штаммы сибирского субтипа генетической линии Заусаев. Также в данном регионе были выявлены два штамма дальневосточного субтипа и впервые четыре штамма европейского субтипа. Полученные результаты позволят заполнить пробел

Keywords

вирус клещевого энцефалита, субтип, генетическая линия, Уральский регион, высоко-производительное секвенирование

The name of the journal

Национальные приоритеты России

Please use this ID to quote from or refer to the card

https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=306532&p_lang=2

Resource files

File name	Size (MB)	Format
F_Shigapova_i_dr.___2024___VKE_Ural.pdf	0,47	pdf	show / download

Full metadata record

Field DC	Value	Language
dc.contributor.author	Tkachev Sergey Evgenevich	ru_RU
dc.contributor.author	Shagimardanova Elena Ilyasovna	ru_RU
dc.contributor.author	Shaykhutdinov Nurislam Maratovich	ru_RU
dc.contributor.author	Shigapova Leylya Khuzzatovna	ru_RU
dc.contributor.author	Dzhioev Yuriy Pavlovich	ru_RU
dc.contributor.author	Doroshhenko Elena Konstantinovna	ru_RU
dc.contributor.author	Zlobin Vladimir Igorevich	ru_RU
dc.contributor.author	Kozlova Irina Valerevna	ru_RU
dc.contributor.author	Lisak Oksana Vasilevna	ru_RU
dc.contributor.author	Suncova Olga Vladimirovna	ru_RU
dc.contributor.author	Yakimenko Valeriy Viktorovich	ru_RU
dc.date.accessioned	2024-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2024-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2024	ru_RU
dc.identifier.citation	Шигапова Л.Х. Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации / Л.Х. Шигапова, Н.М. Шайхутдинов, Е.И. Шагимарданова, И.В. Козлова, В.В. Якименко, О.В. Лисак, Е.К. Дорощенко, О.В. Сунцова, Ю.П. Джиоев, В.И. Злобин, С.Е. Ткачёв // Национальные приоритеты России. - 2024. - № 4 (55). – С. 84-89.	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=306532&p_lang=2	ru_RU
dc.description.abstract	Национальные приоритеты России	ru_RU
dc.description.abstract	Вирус клещевого энцефалита (ВКЭ) является возбудителем тяжёлого заболевания центральной нервной системы человека — клещевого энцефалита. Высокопроизводительное полногеномное секвенирование вирусов является мощным инструментом для генетического анализа коллекций образцов штаммов ВКЭ. В настоящее время в базе данных GenBank содержится около 250 полногеномных последовательностей штаммов и изолятов ВКЭ из различных регионов Евразии, но для ряда регионов, включая Уральский регион, полногеномные после-довательности ВКЭ отсутствуют. Поэтому целью данного исследования являлось изучение генетического разно-образия ВКЭ в ряде районов Урала с использованием полногеномных последовательностей, полученных с помо-щью методов высокопроизводительного секвенирования. Молекулярно-генетический анализ 16 полногеномных последовательностей штаммов ВКЭ показал, что преобладающим субтипом среди исследуемых образцов ВКЭ оказались штаммы сибирского субтипа генетической линии Заусаев. Также в данном регионе были выявлены два штамма дальневосточного субтипа и впервые четыре штамма европейского субтипа. Полученные результаты позволят заполнить пробел	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	вирус клещевого энцефалита	ru_RU
dc.subject	субтип	ru_RU
dc.subject	генетическая линия	ru_RU
dc.subject	Уральский регион	ru_RU
dc.subject	высоко-производительное секвенирование	ru_RU
dc.title	Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации	ru_RU
dc.type	Articles in Russian journals and collections	ru_RU