KFU. Card publication. Предсказание структуры транспортера NaPi2b

KAZAN
FEDERAL UNIVERSITY

- RUS
- 中文
- ES

ПРЕДСКАЗАНИЕ СТРУКТУРЫ ТРАНСПОРТЕРА NAPI2B

Form of presentation

Conference proceedings in Russian journals and collections

Year of publication

2018

Язык

русский

Authors, employees of KFU

Akberova Natalya Ivanovna, author

Kozlova Anastasiya Sergeevna, author

Authors, postgraduates KFU

Kozlova Anastasiya Sergeevna, postgraduate kfu

Authors, students KFU

Kozlova Anastasiya Sergeevna, author

Bibliographic description in the original language

Kozlova A. S., Akberova N. I. Predskazanie struktury transportera NaPi2b. Kompyuternoe modelirovanie struktury i dinamiki biomolekul, Tezisy vystupleniy uchastnikov Vtoroy Shkoly molodykh uchenykh MolMod2018 (Hovosibirsk, 28-30 aprelya 2018 g.) / Novosib. gos. Un-t. -Novosibirsk: IPC NGU, 2018. - 52s

Annotation

Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.)

Keywords

фосфатный транспортер, de novo предсказание пространственной структуры белка

The name of the journal

Please use this ID to quote from or refer to the card

https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=186314&p_lang=2

Full metadata record

Field DC	Value	Language
dc.contributor.author	Akberova Natalya Ivanovna	ru_RU
dc.contributor.author	Kozlova Anastasiya Sergeevna	ru_RU
dc.contributor.author	Kozlova Anastasiya Sergeevna	ru_RU
dc.contributor.author	Kozlova Anastasiya Sergeevna	ru_RU
dc.date.accessioned	2018-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2018-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2018	ru_RU
dc.identifier.citation	Козлова А. С., Акберова Н. И. Предсказание структуры транспортера NaPi2b. Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.) / Новосиб. гос. Ун-т. -Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2018. - 52с	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=186314&p_lang=2	ru_RU
dc.description.abstract	Компьютерное моделирование структуры и динамики биомолекул, Тезисы выступлений участников Второй Школы молодых ученых MolMod2018 (Hовосибирск, 28-30 апреля 2018 г.)	ru_RU
dc.description.abstract	Целью работы было предсказание пространственной структуры транспортера NaPi2b по его аминокислотной последовательности с использованием биоин-форматических подходов. Для построения топологии NaPi2b использовали базу данных Uniprot и про-грамму CCTOP. Для предсказания трехмерной структуры использовали подход de novo с помощью программ QUARKи Robetta. Качество полученных моделей оценивали с помощью программы Qmean. Было показано, что NaPi2b имеет 8 трансмембранных участков, четыре внекле-точных домена, С- и N-концы, расположенные в цитоплазме. Для предсказания трехмерной структуры, белковая последовательность транспортера была поде-лена на 17 участков c учетом топологии NaPi2b. Для дальнейшего построения модели были выбраны структуры участков с наибольшим значением Qmean для увеличения точности предсказания структуры. В участках 1-100, 234-362, 574-690, были совершены повороты между следующими аминокислотами 40-41, 58-59, 320-321, 340-341, 579-580 для приведения в соответствие с предсказ	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	фосфатный транспортер	ru_RU
dc.subject	de novo предсказание пространственной структуры белка	ru_RU
dc.title	Предсказание структуры транспортера NaPi2b	ru_RU
dc.type	Conference proceedings in Russian journals and collections	ru_RU