KFU. Card publication. GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ

KAZAN
FEDERAL UNIVERSITY

- RUS
- 中文
- ES

GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ

Form of presentation

Articles in Russian journals and collections

Year of publication

2009

Язык

русский

Authors, employees of KFU

Izotova Ekaterina Dmitrievna, author

Bibliographic description in the original language

Tarasov D.C. GPAMM − PROGRAMMNYY PAKET DLYa RASChETOV MOLEKULYaRNOY DINAMIKI NA GRAFIChESKIKh PROCESSORAKh/ E.D. Izotova, D.A. Alisheva, N.I. Akberova//MATEMATIChESKOE MODELIROVANIE 2009 god, tom 21, nomer 3, c. 31-40

Annotation

Представлен программный пакет и рассмотрены соответствующие алгоритмы для расчетов молеку- лярной динамики на графических процессорах (GPU) NVIDIA G80,G84,G92 с использованием тех- нологии NVIDIA CUDA. Реализованы потенциалы MM2 и AMBER с возможностью комбинации функций для создания других потенциалов. Поддерживается расчет молекулярной динамики в ус- ловиях NVT (канонический ансамбль) и NVE (микроканонический ансамбль). Сравнивается произ- водительность кода для различных графических процессоров с производительностью МД-алгорит- мов для процессоров Intel Celeron, Intel Pentium 4 и Intel Core2 Duo. Показано, что прирост произво- дительности составляет до 30 раз. Программный пакет доступен по адресу www.gpamm.mntech.ru

Keywords

молекулярная динамика, графический процессор

The name of the journal

Математическое моделирование

Please use this ID to quote from or refer to the card

https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=124877&p_lang=2

Resource files

File name	Size (MB)	Format
mm2745_2009_gpamp_mat_model.pdf	0,38	pdf	show / download

Full metadata record

Field DC	Value	Language
dc.contributor.author	Izotova Ekaterina Dmitrievna	ru_RU
dc.date.accessioned	2009-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.available	2009-01-01T00:00:00Z	ru_RU
dc.date.issued	2009	ru_RU
dc.identifier.citation	Тарасов Д.C. GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ/ Е.Д. Изотова, Д.А. Алишева, Н.И. Акберова//МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ 2009 год, том 21, номер 3, c. 31-40	ru_RU
dc.identifier.uri	https://repository.kpfu.ru/eng/?p_id=124877&p_lang=2	ru_RU
dc.description.abstract	Математическое моделирование	ru_RU
dc.description.abstract	Представлен программный пакет и рассмотрены соответствующие алгоритмы для расчетов молеку- лярной динамики на графических процессорах (GPU) NVIDIA G80,G84,G92 с использованием тех- нологии NVIDIA CUDA. Реализованы потенциалы MM2 и AMBER с возможностью комбинации функций для создания других потенциалов. Поддерживается расчет молекулярной динамики в ус- ловиях NVT (канонический ансамбль) и NVE (микроканонический ансамбль). Сравнивается произ- водительность кода для различных графических процессоров с производительностью МД-алгорит- мов для процессоров Intel Celeron, Intel Pentium 4 и Intel Core2 Duo. Показано, что прирост произво- дительности составляет до 30 раз. Программный пакет доступен по адресу www.gpamm.mntech.ru	ru_RU
dc.language.iso	ru	ru_RU
dc.subject	молекулярная динамика	ru_RU
dc.subject	графический процессор	ru_RU
dc.title	GPAMM − ПРОГРАММНЫЙ ПАКЕТ ДЛЯ РАСЧЕТОВ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ НА ГРАФИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОРАХ	ru_RU
dc.type	Articles in Russian journals and collections	ru_RU