Казанский федеральный университет в рамках реализации партнерских соглашений и участия в совместных научно-образовательных проектах сотрудничает со следующими вузами и организациями Японии:

• Исследовательский институт RIKEN (стратегическое партнерство)
• Национальная организация агробиологических наук (состояния живых организмов)
• Университет Джунтендо (фармакогеномика)
• Университет Джикей (медицина и биология)
• Университет Кумамото (биология старения) 
• Национальная астрономическая обсерватория Японии (изучение Луны)
• Университет Цукубы (студенческая мобильность)
• Университет Канадзавы (студенческая мобильность, физика, медицина)

• Университет Сайтамы (студенческая мобильность)
• Университет Киндаи (студенческая мобильность)
• Японский фонд в Москве    

Подробная информация о сотрудничестве с университетами.