1. Традиционно, молекулярные шапероны были классом белков, которые временно связываются с субстратными белками, способствуя их правильному сворачиванию, взаимодействуя нековалентно с ненативными промежуточнo свернутыми интермедиатаи, а не с нативным или полностью развёрнутым белком. Используя Eastern-Western блоттинг, я продемонстрировал, что один из наиболее распространенных бактериальных липидов, фосфатидилэтаноламин (РЕ), необходим либо во время рефолдинга частично денатурированного белка in vitro, либо во время фолдинга in vivo, но не требуется, как только «нативная структура» была достигнута. Поэтому отдельные липиды действуют как небелковые молекулярные шапероны во время фолдинга мембранных белков путём программирования «конформационной памяти» во время сборки. Открытие первого молекулярного шаперона небелкового происхождения привело к внедрению концепции опосредованного липидами фолдинга мембранных белков и «конформационной памяти» что привело к открытию новых липошаперонов многими лабораториями с 1996 года.
*Bogdanov, M., Sun, J., Kaback, H.R. and Dowhan, W.: A phospholipid acts as a chaperone in assembly of membrane transport protein. J. Biol. Chem. 1996. 271: 11615-11618. (considered as JBC Classics);
*Bogdanov, M. and Dowhan, W.: Lipid-assisted protein folding (mini-review). J. Biol. Chem. 1999. 274: 36827-36830.
2.Pазработана новая методика SCAMTM для экспериментальной верификации предсказательной трансмембранной топологии политопных мембранных белков. SCAMTM получил дальнейшее развитие для картирования двойной, смешанной или необычной топологии мембранных белков в интактных клетках, изолированных мембранных везикулах или в липосомах. Cтратегия может быть адаптирована к любой мембранной системе.
*Bogdanov, M. Mapping of Membrane Protein Topology by Substituted Cysteine Accessibility Method (SCAMTM) Methods in Molecular Biology, 2017;1615:105-128.
3.SCAMTM позволил установить физиологическую основу правила фолдинга политопных мембранных белков «Positive-Inside Rule», согласно которому позитивно заряженные аминокислотные остатки несимметрично распределены и чаще всего обнаруживаются в цитоплазматических доменах. Согласно новому сформулированному и экспериментально проверенному «динамическому» Правилу Баланса Зарядов (Charge Balance Rule) , липид-белковые взаимодействия определяют способность экстраклеточных доменов содержащих заряженные аминокислотные остатки как топологические сигналы транслоцироваться или не транслоцироваться (to flip or not to flip) через мембрану.
Bogdanov, M., Jun Xie, J., Heacock, P., Dowhan, W. To flip or not to flip: protein–lipid charge interactions are a determinant of final membrane protein topology J.Cell Biology. 2008. 182: 925-935;
Dowhan, W, and *Bogdanov, M.: Lipid-dependent topogenesis. Annu. Rev. Biochem. 2009. 78:515-540;
Vitrac, H., Dowhan, W., *Bogdanov, M. Effects of mixed proximal and distal topogenic signals on the topological sensitivity of a membrane protein to the lipid environment. Biochim. Biophys. Acta. 2017. 1859 (7):1291-1300;
*Corresponding or co-corresponding author
Рабочий адрес: | Казань, ул. Кремлевская, д. 18, Учебное здание №02 (Восточное крыло главного корпуса университета) |
Телефон: | 1(713) 500-6125 |
E-mail: | Mikhail.V.Bogdanov@uth.tmc.edu |
Google scholar: | https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=EtFQAMH9URcC&view_op=list_works |
Научно-педагогический стаж: |
Общий: |
Непрерывный в КФУ: |