• Софинская О.А. ИЗМЕНЕНИЯ МИКРОБИОМА КАРБОНАТНОЙ ГЛИНЫ: ОПЫТ ПРИМЕНЕНИЯ АЛГОРИТМОВ АНАЛИЗА БОЛЬШИХ ДАННЫХ / О.А. Софинская, Е.Ю. Полякова, Н.Е. Гоголева // Проблемы геохимической экологии в условиях техногенеза биосферы : материалы XIV Международной Биогеохимической школы - конференции, г. Томск, 15–20 сентября 2025 г. под ред. Н.В. Барановской, Н.С. Безаевой, Б.Р. Соктоева, В.А. Сафонова. – Томск : STT, 2025. – C. 682-684.
  F_tezis_2025.pdf

• Oxana A. Sofinskaya, Oleg Y. Andrushkevich, Bulat M. Galiullin, Nataliya E. Gogoleva, Nurislam M. Shaikhutdinov, Eduard A. Korolev, Fedor A. Mouraviev, and Rustem M. Usmanov. Surface Properties of Carbonate Speleothems in Karst Caves Changing Under Biofilms // O. V. Frank-Kamenetskaya et al. (eds.), Biogenic—Abiogenic Interactions in Natural and Anthropogenic Systems 2022, Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences. 2023. - PP. 495-511
  F_536750_1_En_29_Chapter_Author.pdf

• Гоголева Н. Е. Подготовка образцов и нанопоровое секвенирование / Учебно-методическое пособие / Н.Е. Гоголева, Е.И Шагимарданова / - Казань: Казан. ун-т, 2022. – 28 с.

• Supplementation of Bacillus subtilis GM5 enhances broiler body weight gain and modulates cecal microbiota / G. Hadieva, M. Lutfullin, D. Pudova, Y. Akosah, E. Shagimardanova, N. Gogoleva, M. Sharipova, A. Mardanova // 3 Biotech - 2021 - V. 11. – N.126 - https://doi.org/10.1007/s13205-020-02634-2
• The potato rhizoplane actively recruits Fusarium taxa during flowering / Y. Akosah, M. Lutfullin, G. Lutfullina, D. Pudova, E. Shagimardanova, S. Vologin, N. Gogoleva, Z. Stasevski, M. Sharipova, A. Mardanova // Rhizosphere – 2021 – V. 20; 100449: DOI:10.1016/j.rhisph.2021.100449.
• Gorshkov, V. Y., Toporkova, Y. Y., Tsers, I. D., Smirnova, E. O., Ogorodnikova, A. V., Gogoleva, N. E., ... & Gogolev, Y. V. (2021). Differential modulation of the lipoxygenase cascade during typical and latent Pectobacterium atrosepticum infections. Annals of Botany.

• на английском
• Zhuravleva D.E. Complete Genome Sequence of Lactobacillus hilgardii LMG 7934, Carrying the Gene Encoding for the Novel PII-Like Protein PotN/ D.E. Zhuravleva, Z.I. Iskhakova, G.D. Ozhegov, N.E. Gogoleva, D.R. Khusnutdinova, E.I. Shagimardanova, K. Forchhammer, A.R. Kayumov//Current Microbiology. - 2020. - Vol.77, Is.11. - P.3538-3545.
• Lutfullina G. Influence of the total fraction of Bacillus subtilis GM5 lipopeptides on the growth parameters and formation of bacterial microbiota of broiler chickens/ G. Lutfullina, D. Pudova, N.Gogoleva, Е. Shagimardanova, А.Mardanova// «E3S Web of Conferences» V. 222, 02053 (2020) DOI: https://doi.org/10.1051/e3sconf/202022202053
• Zhuravleva D.E. Complete Genome Sequence of Lactobacillus hilgardii LMG 7934, Carrying the Gene Encoding for the Novel PII-Like Protein PotN/ D.E. Zhuravleva, Z.I. Iskhakova, G.D. Ozhegov, N.E. Gogoleva, D.R. Khusnutdinova, E.I. Shagimardanova, K. Forchhammer, A.R. Kayumov // Current Microbiology. - 2020. - Vol.77, Is.11. – P.3538-3545.

• Hadieva, G. F., Lutfullin, M. T., Pudova, D. S., Akosah, Y. A., Gogoleva, N. E., Shagimardanova, E. I., A. M. Mardanova & Sharipova, M. R. (2019). Data on the genome analysis of the probiotic strain Bacillus subtilis GM5. Data in Brief, 23, 103643. https://doi.org/10.1016/j.dib.2018.12.081
• тезисы конференции ВИЗР (еще не издано)
• Тендюк, Н. В. Экстраклеточный белок Svx - потенциальный участник "диалога" пектобактерий и растений [Текст] / Н. В. Тендюк, Н. Е. Гоголева, С. С. Дмитриева, В. Ю. Горшков, Ю. В. Гоголев // IX Съезд общества физиологов растений России ?Физиология растений ? основа создания растений будущего?: тезисы докладов, Казань, 18?24 сентября 2019 г. ? С. 427.
• Горшков В.Ю., Петрова О.Е., Парфирова О.И., Исламов Б.Р., Церс И.Д., Гоголева Н.Е., Агеева М.В., Даминова А.Г., Губаев Р.Ф., Микшина П.В., Воробьев В.Н., Гоголев, Ю.В. Гнить или не гнить: война и мир между растениями и фитопатогенными пектобактериями // Стратегия взаимодействия микроорганизмов и растений с окружающей средой: Материалы конференции. Саратов: ООО «Издательский Центр Наука«. ISBN 978-5-9999-3239-6 – Саратов, 14-18 октября 2019. – С.53.
• Mardanova A. Structure and variation of root‑associated microbiomes of potato grown in alfisol / M. Lutfullin, G. Hadieva, Y. Akosah, D. Pudova, D. Kabanov, E. Shagimardanova, P. Vankov, S. Vologin, N. Gogoleva, Z. Stasevski, M. Sharipova // World Journal of Microbiology and Biotechnology - (2019) 35:181
• Olga Petrova, Vladimir Gorshkov, Amina Daminova, Iuliia Sergeeva, Natalia Gogoleva, Yuri Gogolev (2019) A multiplicity of adaptive strategies in phytopathogenic bacterium Pectobacterium atrosepticum // 8th Congress of European Microbiologists (FEMS2019). – Glasgow, Scotland. July 7-11, 2019. – P.997.

• Ziganshina E.E., Mohammed W.S., Doijad S.P., Shagimardanova E.I., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Draft genome sequence of Brevibacterium epidermidis EZ-K02 isolated from nitrocellulose-contaminated wastewater environments // Data in Brief. - 2018. - Vol. 17. - P. 119-123.
• Mohammed W.S., Ziganshina E.E., Shagimardanova E.I., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Comparison of intestinal bacterial and fungal communities across various xylophagous beetle larvae (Coleoptera: Cerambycidae) // Scientific Reports. - 2018. - Vol. 8. - Art. №10073.
• Ziganshina E.E., Mohammed W.S., Shagimardanova E.I., Vankov P.Y., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Fungal, bacterial, and archaeal diversity in the digestive tract of several beetle larvae (Coleoptera) // Biomed Research International. - 2018. - Vol. 2018. - Art. № 6765438.

• Kovtunov E. Phenol oxidases from Pectobacterium atrosepticum: identification and cloning of genes, characteristics of the enzymes and assessment of the transcript levels / E. Kovtunov, N. Tarasova, N. Gogoleva, V. Gorshkov, О. Petrova, E. Osi-pova, Y. Gogolev // 42 FEBS Congress: Abstract book. – Jerusalem, Israel, 10-14 September, 2017. – P. 354.
• Gorshkov V. Polyphenol oxidase from Pectobacterium atrosepticum: identification and cloning of gene and characteristics of the enzyme / V. Gorshkov, N. Tarasova, N. Gogoleva, E. Osipova, O. Pe-trova, E. Kovtunov, Y. Gogolev // J Basic Microbiol. – 2017. – Р. 1–12.
• Petrova, O. Bacterial proliferation as an adaptive strategy under starvation / O. Petrova, V. Gorshkov, A. Daminova, M. Ageeva, I. Sergeeva, E. Kovtunov, N. Gogoleva, Y. Gogolev // 7th FEMS Congress: Abstract book. – Valencia, Spain, 9-13 July, 2017. − P. 1143
• Mohammed W.S., Ziganshina E.E., Shagimardanova E.I., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Draft genome sequence of Paenibacillus sp. EZ-K15 isolated from wastewater systems // BMC Research Notes. - 2017. - Vol. 10. - Art. № 734.
• Горшков В.Ю. Восприимчивые ответы растений как фундаментальная основа развития растительно - микробных патосистем [Text] / В.Ю. Горшков, Р.Ф. Губаев, А.Г. Даминова, О.Е. Петрова, Н.Е. Гоголева, Ю.В. Гоголев // Материалы конференции «Экспериментальная биология растений: фундаментальные и прикладные аспекты«. – Крым, Судак, 18-24 сентября, 2017. – С.34.
  F_Dokument1.pdf

• Горшков В.Ю. «Мягкие гнили» растений: структурно-функциональное преобразование элементов растительно-микробных патосистем [Text] / В.Ю. Горшков, А.Г. Даминова, О.Е. Петрова, М.В. Агеева, Р.Ф. Губаев, Б.Р. Исламов, П.В. Микшина, Н.Е. Гоголева, Н.Б. Тарасова, Ю.В. Гоголев // Всероссийская научная конференция с международным участием «Растения в условиях глобальных и локальных природно-климатических и антропогенных воздействий». Петрозаводск, Россия, 21–26 сентября 2015. − С. 144.