• Shirshikova T.V. Isolation and characterization of endolithic strain Pseudomonas chlororaphis S15: a study on heavy metal resistance and siderophore production / Shirshikova T.V., Ivoilova T.M., Elistratova A.A., Khilyas I.V. // Bioinformatics of Genome Regulation and Structure / Systems Biology (BGRS/SB-2024) : The Fourteenth International Multiconference (August 5–10, 2024, Novosibirsk, Russia): Abstracts / Inst. of Cytol. and Genetics, Sib. Branch of the Russ. Acad. of Sci.; Novosib. State Univ. – Novosibirsk: ICG SB RAS, 2024 – С. 1439-1441. doi 10.18699/bgrs2024-8.2-15
  BGRSSB_2024_Abstracts.pdf
• Ивойлова Т.А. Биотехнологические свойства эндолитного штамма Nocardia mangyaensis NH1 и его сидерофоров // Т.М. Ивойлова, А. А. Елистратова, А. В. Лайков, Т. В. Ширшикова, И. В. Хиляс // Биосистемы: организация, поведение, управление: Тезисы докладов 77-й Международной школы-конференции молодых ученых - Н. Новгород, Университет Лобачевского. - 2024. - С.425.
  F_Ivojlova_NN_sbornik.pdf
• Елистратова А.А. Биосинтетические генные кластеры биосинтеза сидерофоров эндолитного штамма Bacillus velezensis S18 / А.А. Елистратова, Т.М. Ивойлова, Т.В. Ширшикова, М.И. Маркелова, М.Р. Шарипова, И.В. Хиляс // Сборник тезисов XIV молодежной школы-конференции с международным участием «Актуальные аспекты современной микробиологии«. - М.: ВАШ ФОРМАТ. - 2024. - С. 78-80.
  F_Shkola_konferenciya_2024_v_pechat__1__78_80.pdf
• A.A. Elistratova. Effect of heavy metals on the production of siderophores by an endolithic strain of Bacillus velezensis S18 / Elistratova A.A., Shirshikova T.V., Ivoilova T.M., Sharipova M.R., Khilyas I.V. // Limnology and Freshwater Biology. - 2024. - V.4. - P. 877-880. - doi: https://doi.org/10.31951/2658-3518-2024-A-4-877
• Ивойлова Т.М. Агробиотехнологический потенциал эндолитного штамма Nocardia mangyaensis NH1 / Т. М. Ивойлова, Е. Н. Деханова, А. А. Елистратова, Т. В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, И. В. Хиляс // PLAMIC2024: материалы IV Международной научной конференции «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» и III Всероссийской конференции с международным участием «Механизмы адаптации микроорганизмов к различным условиям среды обитания» - Иркутск., 2024. - С.231-232.
  PLAMIC_2024_tezisy_sbornik_Ivojlova_T.M..pdf

• Ширшикова Т.В. Транскриптомный анализ дифференциально экспрессирующихся генов Serratia marcescens SM6 с инактивированной эффлюкс системой МасАВ-2 / Т.В. Ширшикова, Шарипова М.Р., Богомольная Л.М. // Проблемы медицинской микологии. Материалы VII Всероссийского конгресса по медицинской микробиологии, клинической микологии и иммунологии (XXVI Кашкинские чтения) - 2023. - №2. - С.206.
  KCh_2023.pdf

• Elistratova A. A. Serratia marcescens DUF1471-Containing Protein SrfN Is Needed for Adaptation to Acid and Oxidative Stresses / A. A. Elistratova, L. E. Matrosova, I. V. Khilyas, T. V. Shirshikova, I. V. Danilova, A. V. Laikov, Y. D. Romanova, C. G. Sierra-Bakhshi, M. R. Sharipova, L. M. Bogomolnaya // mSphere. - 2022. - DOI: https://doi.org/10.1128/msphere.00212-22
  msphere.00212_22.pdf
• Елистратова А.А. Белок SrfN с доменом DUF1471 необходим для биопленкообразования и подвижности Serratia marcescens SM6 / А.А. Елистратова, Т.В. Ширшикова, Н.Н. Хабипова, Л.М. Богомольная // Сборник статей международной научно-практической конференции, посвященной 135-й годовщине со дня рождения академика Н.И. Вавилова. – Саратов: Амирит. - 2022 г. - С. 87-90.
  F_elibrary_50239872_11547372.pdf
• Ширшикова Т.В. Вклад эффлюкс системы MacAB-2 в подвижость клеток Serratia marcescens SM6 / Т. В. Ширшикова, Л. М. Богомольная // IX Международная конференция молодых ученых: вирусологов, биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и биоинформатиков — 2022: Cб. тез. - С. 717.

• Shirshikova TV, Sierra-Bakhshi CG, Kamaletdinova LK, Matrosova LE, Khabipova NN, Evtugyn VG, Khilyas IV, Danilova IV, Mardanova AM, Sharipova MR, Bogomolnaya LM. 2021. The ABC-type efflux pump MacAB is involved in protection of Serratia marcescens against aminoglycoside antibiotics, polymyxins, and oxidative stress. mSphere 6:e00033-21. https://doi.org/10.1128/mSphere.00033-21.
  F_mSphere_2021_Shirshikova_e00033_21.full.pdf
• Shirshikova T., Sharipova M., Bogomolnaya L. The role of MacAB-2 efflux pump in antibiotic resistance of Serratia marcescens SM6. Molecular Biology of the Cell, ASCB Annual Meeting abstracts. 2021. V. 32, N. 32, p. 629.
• Ширшикова Т.В., Романова Ю.Д., Лайков А.В., Шарипова М.Р., Богомольная Л.М. Анализ поверхностных структур клеток Serratia marcescens SM6. III Объединенный Научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов, VII Съезд биохимиков России, X Российский Симпозиум «Белки и пептиды», VII Съезд физиологов СНГ (Сочи, 3–7 октября 2022). Научные труды. Издательство «Перо».2021 г. - Т. 2, С. 85-86.
• Elistratova A.A. The role of DUF1471-containing protein SrfN in the physiology of Serratia marcescens SM6 / A.A. Elistratova, T.V. Shirshikova, L.M. Bogomolnaya // International conference devoted to the 100th anniversary of Microbiology Departament at Kazan University: Microbiology: yesterday, today, tomorrow. - Kazan.- 2021.- p.106

• Serratia marcescens DUF1471-containing protein srfN is needed for oxidative stress survival and biofilm formation / A.A. Elistratova, L.M Bogomolnaya, L.E. Matrosova, T.V. Shirshikova // FEMS online Conference on Microbiology, 28-31. October 2020. p. 349 (ISBN 978-86-914897-6-2) (PDF)
  FEMS_2020_ONLINE_Conference___Abstract_Book_349.pdf

• Khilyas, I.V. Genome sequence of pigmented siderophore-producing strain Serratia marcescens SM6 / I. Khilyas, K. Tursunov, T. Shirshikova, L. Kamaletdinova, L. Matrosova, P. Desai, M. McClelland, L. Bogomolnaya // Microbiology Resource Announcements, 2019. DOI: 10.1128/MRA.00247-19
  F_Khilyas_et_al.__2019.pdf
• Elistratova A.A. Contribution of the DUF1471-containing protein SM6_4611 in Serratia marcescens SM6 resistance to hydrogen peroxide / A.A. Elistratova, T.V. Shirshikova, L.E. Matrosova, L.M. Bogomolnaya // Interaction: from cell to human: abstract book of the Russian-German Seminar dedicated to the 30th anniversary of the partnership agreement between the Justus Liebeg University (Giessen) and Kazan (Volga region) Federal University, May 20-24, 2019. - Kazan:Publishing House of Kazan University, 2019. - 90 pp.
• Елистратова А.А. Роль DUF1471-содержащего белка SM6_4611 в устойчивости Serratia marcescens SM6 к перекиси водорода / А.А.Елистратова, Т.В. Ширшикова // Материалы Международного молодежного научного форума ЛОМОНОСОВ-2019, Москва, 8-12 апреля 2019 / Москва: МАКС Пресс, 2019.
  F_Lomonosov_2019__Elistratova.pdf
• Ширшикова, Т.В. Регуляция экспрессии эффлюкс системы MacAB-2 Serratia marcescens SM6 /Т.В. Ширшикова, М.Н. Аммар, Л.М. Богомольная //II Объединенный научный форум. IX Российский симпозиум «Белки и пептиды» (Сочи, Дагомыс, 1–6 октября 2019). Спецвыпуск ActaNaturae. Научные труды. М.: Издательство «Перо» – 2019. – Т.2 – С. 215.
  Shirshikova_BelkiPeptidy2019.pdf

• Ширшикова, Т.В. Роль эффлюкс системы MасAB Serratia marcescens SM6 в защите клеток от антибактериальных препаратов [Текст] /Т.В. Ширшикова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Всероссийский Конгресс по медицинской микробиологии, клинической микологии и иммунологии (XXI Кашкинские чтения); (6-8 июня 2018 г., Санкт-Петербург). Проблемы медицинской микологии. - Т.20. - №2. - С.130
• D.S. Pudova, T.V. Shirshikova, D.A. Kabanov, A.O. Tikhonova, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya (2018) THE ABC-TYPE MULTIDRUG EFFLUX PUMP MACAB GENES IN THE GENOME OF SERRATIA MARCESCENS SM6. Life of Genomes 2018 - P.16-18.
• Low molecular weight metabolites secreted through an ABC-type efflux pump MacAB protect Serratia marcescens against hydrogen peroxide / L. Matrosova, I. Khilyas, T. Shirshikova, L. Kamaletdinova, Y. Danilova, M. Sharipova, L. Bogomolnaya // FEBS Open Bio 8 (Suppl. S1) p. 382-383 (2018) 107–496 DOI: 10.1002/2211-5463.12453
  2018_FEBS_Open_Bio__pdf.io___1_.pdf
• Кабанов Д.А.РОЛЬ ГОМОЛОГА MACAB ЭФФЛЮКС СИСТЕМЫ SERRATIA MARCESCENS SM6 В ЗАЩИТЕ КЛЕТОК ОТ ОКСИДАТИВНОГО СТРЕССА [Текст] /Д.А. Кабанов, Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, Л.М. Богомольная, Шарипова М.Р. // III Международная школа-конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Материалы и технологии XXI века«. Сборник тезисов. - С.40.
  Shirshikova_MT21_2018.pdf
• T.V. Shirshikova, D.A. Kabanov, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya (2018) The ABC-type efflux pump MacAB is required for motility of Serratia marcescens SM6. 43rd FEBS Congress. FEBS Open Bio. Volume 8, Issue S1. P.09-152-Tue

• Ширшикова Т.В. Эффлюкс система МасАВ Serratia marcescens SM6 - мишень для получения новых антимикробных препаратов[Текст] /Т.В.Ширшикова, Л.Х.Камалетдинова, Л.Е. Матросова, И.В. Хиляс, М.Р. Шарипова , Богомольная Л.М.// Российско-Китайский конгресс по медицинской микробиологии, эпидемиологии и клинической микологии (ХХ Кашкинские чтения).(Санкт-Петербург, 14-16 июня 2017г.) Проблемы медицинской микологии. - 2017. - Т.19. - №2. - С. 162

• Ширшикова Т.В. Роль MacAB эффлюкс-системы в защите Serratia marcescens от антибиотиков и оксидативного стресса [Текст] / Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // 20-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых «Биология – наука XXI века» (Пущино, 18 - 22 апреля 2016 г.). Сборник тезисов. – С. 61.
• Kamaletdinova L.K, Nizamutdinova E.K, Shirshikova T.V, Inactivation of Chromosomal Genes in Serratia marcescens//BioNanoScience. - 2016. - Vol.6, Is.4. - P.376-378.
• Матросова, Л.Е. Роль эффлюкс системы MacAB в защите бактерий от оксидативного стресса [Текст] / Л.Е. Матросова, Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Ю.В. Данилова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Российско-китайская научно-практическая конференция по медицинской микробиологии и клинической микологии (XIX Кашкинские чтения) (14-16 июня 2016 г., Санкт-Петербург). Журнал "Проблемы медицинской микологии" − 2016. – Т.18. – №2. – С. 94.
• Shirshikova, T. V. Generalized Bacteriophage Transduction in Serratia marcescens [Text] / T. V. Shirshikova, O.V. Morozova, L. Kh. Kamaletdinova, M. R. Sharipova, L. M. Bogomolnaya // BioNanoSci. DOI 10.1007/s12668-016-0268-z
• Kamaletdinova, L. Kh. Inactivation of Chromosomal Genes in Serratia marcescens [Text] / L. Kh. Kamaletdinova, E. Kh. Nizamutdinova, T. V. Shirshikova, I. M. Skipina, L. M. Bogomolnaya // BioNanoSci. DOI 10.1007/s12668-016-0249-2
• Genomic comparison of siderophore diversity in clinical and environmental isolates of Serratia marcescens. / I. V. Khilyas, T. V. Shirshikova, L. E. Matrosova, Y. V. Danilova, M. R. Sharipova, L. M. Bogomolnaya. /FEBS Journal 283 (Suppl. 1) 2016. P.370
• Shirshikova T.V. The role of MacAB efflux pump in protection of Serratia marcescens against antibiotics and oxidative stress / T.V. Shirshikova, L.E. Matrosova, O.V. Morozova, I.V. Khilyas, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya // The FEBS Journal. - 2016. - Vol. 283. - S.1. - P. 190-191.
  2016_The_FEBS_Journal.pdf
• Хиляс И.В. ПОТЕНЦИАЛЬНЫЕ МИШЕНИ ПРИ АНТИБИОТИКОТЕРАПИИ ОППОРТУНИСТИЧЕСКОГО ПАТОГЕНА SERRATIA MARCESCENS SM6 / И.В. Хиляс, Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // ACTA NATURAE. - 2016. - Т.2. - С. 149-150.
  AbstractBook_Vol2.pdf
• Матросова Л.Е. АНТИОКСИДАНТНЫЕ СВОЙСТВА ЭКСТРАКЛЕТОЧНЫХ БЕЛКОВ S. MARCESCENS SM6 / Л.Е. Матросова, Ю.В. Данилова, И.В. Хиляс, Т.В. Ширшикова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // ACTA NATURAE. - 2016. - Т.2. - С. 168.
  AbstractBook_Vol2.pdf
• Ширшикова Т.В. ЭФФЛЮКС СИСТЕМА MACAB – ПОТЕНЦИАЛЬНАЯ МИШЕНЬ ПРИ АНТИБИОТИКОТЕРАПИИ SERRATIA MARCESCENS SM6 / Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // ACTA NATURAE. СПЕЦВЫПУСК. - 2016. - Т. 2. - С. 169.
  AbstractBook_Vol2.pdf
• Khilyas I.V. Production of siderophores by Serratia marcescens and the role of MacAB efflux pump in siderophores secretion / I.V. Khilyas, T.V. Shirshikova, L.E. Matrosova, A.V. Sorokina, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya // BioNano Science. - 2016.
  Khilyas__2016.pdf
• Matrosova L.E. Virulence of pigmented Serratia marcescens strain SM6 and its nalidixic acid-resistant derivative in white outbred mice / L.E. Matrosova, I.V. Khilyas, T.V. Shirshikova, L.M. Bogomolnaya // BioNano Science. - 2016.
  Matrosova__2016.pdf
• Ширшикова, Т.В. Эффлюкс система MacAB – потенциальная мишень при антибиотикотерапии Serratia marcescens SM6 [Текст] / Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Научные труды V Съезда физиологов СНГ, V Съезда биохимиков России, Конференции ADFLIM (Россия, Сочи, Дагомыс, 4–8 октября 2016г.). ACTA NATURAE. Спецвыпуск. − 2016. − Т.2 − С. 169.
• Ширшикова, Т.В. Роль эффлюкс системы MacAB Serratia marcescens в секреции гемолизинов и протеаз [Текст] / Т.В. Ширшикова, И.В. Хиляс, Л.Е. Матросова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Площадка открытых коммуникаций OpenBio-2016. III Международная конференция молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов (5-6 октября 2016 г., Новосибирск, Наукоград Кольцово). Сборник тезисов. − 2016. − С.309-312
• Ширшикова, Т.В. Генерализованная трансдукция в штаммах Serratia marcescens [Текст] / Т.В. Ширшикова, О.В. Морозова, Л.Х. Камалетдинова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Международная конференция «Трансляционная медицина – 2016» (Россия, Казань,13-14 октября 2016 г.). Сборник тезисов. − 2016. − С.116
• Низамутдинова Э.Х. Влияние мутаций по внеклеточной нуклеазе на свойства пигментообразующего и беспигментного штаммов Serratia marcescens / Э. Х. Низамутдинова, Т.В. Ширшикова, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // Микробиология - 2016. - т. 85. № 1. - С. 36-41.
• Shirshikova T.V, Morozova O.V, Kamaletdinova L.K, Generalized Bacteriophage Transduction in Serratia marcescens//BioNanoScience. - 2016. - Vol.6, Is.4. - P.487-489.
• Ширшикова, Т.В. Роль и клиническое значение эффлюкс системы МacАВ Serratia marcescens SM6 [Текст] / Т.В. Ширшикова, Л.Е. Матросова, О.В. Морозова, И.В. Хиляс, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Международная научная конференция «Трансляционная медицина, настоящее и будущее» (г. Казань, 24-25 мая 2016 г.)

• Ширшикова Т.В. Вклад эффлюкс системы МасАВ Serratia marcescens в устойчивость к антибиотикам [Текст] /Т.В. Ширшикова, Л.Х. Камалетдинова, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Площадка открытых коммуникаций «Openbio-2015». Международная конференция молодых ученых: биотехнологов, молекулярных биологов и вирусологов (1-2 октября 2015г., наукоград Кольцово). Сборник тезисов. – С. 145-150.
• Ширшикова Т.В. Роль эффлюкс системы MacAB Serratia marcescens SM6 в развитии антибиотикоустойчивости [Текст] / Т.В. Ширшикова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // I Международная школа-конференция студентов, аспирантов и молодых ученых «Биомедицина, материалы и технологии XXI века» (25-28 ноября 2015 года, Казань). Сборник тезисов. – С. 229.
• Shirshikova T. V., Matrosova L. Y., Khilyas I. V., MacAB efflux system of Serratia marcescens as a potential protective system against oxidative stress//FEBS JOURNAL. - 2015. - Vol.282, Is.. - P.201-201.
• Shirshikova, T. V. Characteristics of Serratia marcescens strains [Text] / T.V. Shirshikova, E. K. Nizamutdinova, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova, L.M. Bogomolnaya // Research Journal of Applied Sciences. − 2015. − V. 10. − N.12. − P. 911-916.
• Shirshikova T.V., Matrosova L.Y., Khilyas I. V., Sharipova M. R., Bogomolnaya L. M. (2015) MacAB efflux system of Serratia marcescens as a potential protective system against oxidative stress. FEBS Journal, V.282, p.201.

• Ширшикова Т. В. Нокаутирование генов эффлюкс-системы Serratia marcescens при помощи системы рекомбинации фага λ-ред и трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // XXVI Зимняя молодежная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии» (10-14 февраля 2014г., (г. Москва)). Сборник тезисов. – С. 85.
• Ширшикова Т. В. Инактивация генов macAB Serratia marcescens при помощи системы рекомбинации фага λ-ред и трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // Материалы VI Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням (24-26 марта 2014г., (г. Москва)).– С. 351.
• Камалетдинова Л.Х. Определение чувствительности дикого штамма Serratia marcescens и его мутанта по генам эффлюкс системы к активным формам кислорода [Текст]/ Л.Х. Камалетдинова, Т.В. Ширшикова, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова, Л.М.Богомольная // IV Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Казань, Россия, 29 Октября – 1 Ноября, 2014г.). Сборник трудов. – С. 26.
• Камалетдинова Л.Х. Роль эффлюкс системы в подвижности Serratia marcescens [Текст] / Л.Х. Камалетдинова, Т.В. Ширшикова, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // IV Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине» (Казань, Россия, 29 Октября – 1 Ноября, 2014г.). Сборник трудов. – С. 18.
• Камалетдинова Л.Х. Чувствительность разных штаммов Serratia marcescens к перекиси водорода [Текст] / Л.Х. Камалетдинова, Т.В. Ширшикова, Л.М. Богомольная, А.М. Марданова, М.Р. Шарипова// Биология – наука ХХI века: 18-я Международная Пущинская школа- конференция молодых ученых (Пущино, 21 - 25 апреля 2014 г.). Сборник тезисов. – С. 208.

• Ширшикова Т. В. Молекулярная идентификация бактерий рода Helicobacter в желчи больных с различной патологией гепатобилиарной системы [Текст] / Т.В. Ширшикова, Е.Н. Белоусова, А.И. Фазульзянова // 87-ая Всероссийская научно-практическая конференция студентов и молодых ученых, посвященная 155-летию со дня рождения Л.О. Даркшевича. V-я Российская научно-практическая конференция «Здоровье человека в XXI веке». (5 апреля 2013 г., (г. Казань)). – 2013. – С. 148.
• Ширшикова Т. В. Разработка метода переноса мутаций в генах macAB Serratia marcescens в новый штамм при помощи трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, А. М. Марданова, Л. М. Богомольная // Итоговая научно-образовательная конференция студентов Казанского Федерального университета 2013 года. Сборник статей. – Т.2 – С.43-45.
• Маликова А.З. Выделение и идентификация микробных симбионтов личинки хирономиды Polypedilum vanderplankti [Текст] / А.З. Маликова, М.Р. Шарипова, О.А. Гусев, А.Д. Сулейманова, А.А. Тойменцева, Т.В. Ширшикова, Е.О. Михайлова, А.М. Марданова, Е.И. Шагимарданова // Вестник Казанского технологического университета. – 2013. – Т. 16. – №20. – С.181-183. ISSN: 1998-7072
• Ширшикова Т. В. Инактивация генов эффлюкс-системы в Serratia marcescens при помощи гомологичной рекомбинации и трансдукции [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, А. М. Марданова, М. Р. Шарипова, Л. М. Богомольная // V Международная научно-практическая конференция "Актуальные проблемы биологии, нанотехнологий и медицины" (3-5 октября 2013г., (г. Ростов-на-Дону)). Сборник тезисов. – 2013. ‒ С. 142-143.
• Марданова А.М. Чувствительность штаммов Serratia marcescens к перекиси водорода [Текст] / А.М. Марданова, Э. Х. Низамутдинова, Т.В. Ширшикова, Л. Х. Камалетдинова, Е.О. Михайлова, М.Р. Шарипова, Л.М. Богомольная // Вестник Казанского технологического университета. – 2013. ‒ Т. 16. ‒ № 19. ‒ С. 215-218. ISSN: 1998-7072
• Ширшикова Т. В. Чувствительность штаммов бактерий рода Serratia к бактериофагу ФОТ8 [Текст] / Т. В. Ширшикова, А.М. Марданова, Л. М. Богомольная // Биология – наукаХХI века: 17-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых (21 – 26 апреля 2013 г., (г. Пущино)). Сборник тезисов. – 2013. – С. 54-55.

• Ширшикова Т. В. Идентификация бактерий рода Helicobacter в желчи больных с патологиями ЖКТ [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. И. Шагимарданова, М. Р. Шарипова, Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова // Тезисы Международной научной конференции студентов и молодых ученых, посвященной 155-летию со дня рождения В. В. Подвысоцкого. Современные теоретические и практические аспекты клинической медицины (для молодых ученых и студентов). – 2012. - С. 49.
• Ширшикова Т. В. Обнаружение бактерий рода Helicobacter в желчи больных с различной патологией желудочно-кишечного тракта [Текст] / Т. В. Ширшикова, М. Р. Шарипова, Е. И. Шагимарданова, Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов // Тезисы Международной научно-практической конференции www.sworld.com.ua (20-31 марта 2012 года (г. Одесса)). Современные направления теоретических и прикладных исследований. Сборник трудов. – 2012. – Т. 31. - С. 29-30.
• Ширшикова Т. В. Оценка эффективности различных методов обнаружения Helicobacter pylori у больных хронической HCV-инфекцией [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. Н. Белоусова, А. И. Фазульзянова, Г. Ш. Исаева // Тезисы XVII Всероссийской научно-практической конференции «Молодые ученые в медицине». 86-я Всероссийская научная студенческая конференция памяти член-корреспондента академии наук РТ, профессора И.Г. Салихова.15-я всероссийская медико-историческая конференция, посвященная 200-летию клинического медицинского образования в Казани (23-24 апреля 2012 г.). – 2012. – С. 183.
• Ширшикова Т. В. Молекулярная детекция бактерий рода Helicobacter в желчи больных с патологиями желудочно-кишечного тракта при помощи ПЦР [Текст] / Т. В. Ширшикова, М. Р. Шарипова, Е. И. Шагимарданова, Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов // Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине. III международная научно-практическая конференция (22-24 ноября 2012г. (г. Казань)). – 2012. – С. 324-325.
• Ширшикова Т. В. Выявление бактерий рода Helicobacter в желчи больных с различной патологией ЖКТ [Текст] / Т. В. Ширшикова, М. Р. Шарипова, Е. И. Шагимарданова, Г. Ш. Исаева // Итоговая научно-образовательная конференция студентов Казанского Федерального университета 2012 года. Сборник тезисов. – 2012. – Т. 1 – С. 39.
• Ширшикова Т. В. Биоинформационный анализ в геномах энтеробактерий генов эффлюкс-системы [Текст] / Т. В. Ширшикова, Л. Р. Валеева, А. Г. Гилязева, Л. М. Богомольная, М.Р. Шарипова, А.М. Марданова, Ю.Д. Романова // Материалы V Всероссийского с международным участием медико-биологического конгресса молодых ученых «Симбиоз-Россия 2012» (3-8 декабря 2012г. (г. Тверь)). – 2012. – С.278-279.
• Ширшикова Т. В. Идентификация бактерий рода Helicobacter в желчи больных с патологиями желудочно-кишечного тракта [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. И. Шагимарданова, М. Р. Шарипова,Г. Ш. Исаева // Материалы V Всероссийского с международным участием медико-биологического конгресса молодых ученых «Симбиоз-Россия 2012» (3-8 декабря 2012г. (г. Тверь)). – 2012. – С.358-359.
• Исаева Г.Ш. Молекулярная детекция бактерий рода Helicobacter при заболеваниях желудочно-кишечного тракта [Текст] / Г. Ш. Исаева, Е. И. Шагимарданова, Т. В. Ширшикова, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов, Е. П. Селькова // Современные проблемы науки и образования. Электронный научный журнал: www.science-education.ru; ISSN 1817-6321. –2012. – №1. –0421200037\0041 - Идентификационный номер статьи, присвоенный НТЦ "Информрегистр"

• Ширшикова Т. В. Выявление Helicobacter pylori и энтерогепатических хеликобактеров в желчи с помощью метода ПЦР [Текст] / Т. В. Ширшикова, Е. И. Шагимарданова,Г. Ш. Исаева, А. И. Фазульзянова, А. А. Ризванов // Тезисы Материалов 8-й Северо-Западной научной гастроэнтерологической сессии (Санкт-Петербург, 24-25 ноября 2011 года). – 2011. – С. М43.