• Lutfullina G, Pudova D, Lutfullin M, Nikolaeva A, Abubakirova A, Akosah Y, Shagimardanova E, Sharipova M, Mardanova A. Genome sequence data of Bacillus spizizenii GM2: a lipopeptide producer. Microbiol Resour Announc. 2025 Feb 11;14(2):e0106724. doi: 10.1128/mra.01067-24.
  F_mra.01067_24.pdf
• Danishevich A, Fedorova D, Bodunova N, Makarova M, Byakhova M, Semenova A, Galkin V, Litvinova M, Nikolaev S, Efimova I, Osinin P, Lisitsa T, Khakhina A, Shipulin G, Nasedkina T, Shumilova S, Gusev O, Bilyalov A, Shagimardanova E, Shigapova L, Nemtsova M, Sagaydak O, Woroncow M, Gadzhieva S, Khatkov I. Assessing germline TP53 mutations in cancer patients: insights into Li-Fraumeni syndrome and genetic testing guidelines. Hered Cancer Clin Pract. 2025 Feb 17;23(1):5. doi: 10.1186/s13053-025-00307-w. PMID: 39962599; PMCID: PMC11834258.

• Airat Bilyalov, Sergey Nikolaev , Anastasiia Danishevich , Igor Khatkov , Komron Makhmudov , Zhainagul Isakova , Nurbek Bakirov , Ernis Omurbaev , Anastasia Osipova, Ramaldan Ramaldanov , Elena Shagimardanova , Andrey Kiassov , Oleg Gusev, Natalia Bodunova. The spectrum of pathogenic germline nucleotide variants in gastric cancer patients of Kyrgyz origin. Abstracts from the 56th European Society of Human Genetics (ESHG) Conference: e-Posters. European Journal of Human Genetics. 2024. 32:91. P. 256-257
  2_5287343090586109779.pdf
• Khilyas, I.V. Genomic insights and anti-phytopathogenic potential of siderophore metabolome of endolithic Nocardia mangyaensis NH1 / I.V. Khilyas, I.V., M.I. Markelova, L.R. Valeeva, T.M. Ivoilova, E. Shagimardanova, A.V. Laikov, A.A. Elistratova, E.S. Berkutova, G. Lochnit, M.R. Sharipova// Sci Rep. - 2024. - 14, 5676.
  Khilyas_et_al.__2024.pdf
• Usenko T, Bezrukova A, Basharova K, Altered Sphingolipid Hydrolase Activities and Alpha-Synuclein Level in Late-Onset Schizophrenia//Metabolites. - 2024. - Vol.14, Is.1. - Art. №30.
• Ananeva A, Kadirov A, Andryushkina A.V, The novel HLA-C*12:392 allele was identified in four unrelated bone marrow donors//HLA. - 2024. - Vol.103, Is.1. - Art. №e15328.
• Bilyalov A, Nikolaev S, Danishevich A, The spectrum of pathogenic germline nucleotide variants in gastric cancer patients of Kyrgyz origin//EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. - 2024. - Vol.32, Is.. - P.256-257.
• Titova A, Nikolaev S, Bilyalov A, Extreme Tolerance of Extraocular Muscles to Diseases and Aging: Why and How?//International Journal of Molecular Sciences. - 2024. - Vol.25, Is.9. - Art. №4985.
• Filatov, N. S., Khismatullin, R. R., Bilyalov, A. I., Khabirova, A. I., Salyakhutdinova, S. M., Ursan, R. V., Kasimova, R. N., Peshkova, A. D., Gazizov, I. I., Shagimardanova, E. I., Woroncow, M. V., Kiyasov, A. P., Litvinov, R. I., & Gusev, O. A. (2024). Distinct Hemostasis and Blood Composition in Spiny Mouse Acomys cahirinus. International Journal of Molecular Sciences, 25(23), 12867
• Низамов Ш.Р., Газизова Г.Р., Шагимарданова Е.И., Гусев О.А., Девятияров Р.М. Гетерогенность профилей экспрессии генов в скелетных мышцах человека / Материалы XI Всероссийской с международным участием школы-конференции по физиологии мышц и мышечной деятельности, посвященной 70-летию открытия механизма мышечного сокращения. Москва, 22?25 апреля 2024 г. М.: ГНЦ РФ ? ИМБП РАН, с. 188.
• Bilyalova A, Bilyalov A, Filatov N, Shagimardanova E, Kiyasov A, Vorontsova M, Gusev O. Non-classical animal models for studying adrenal diseases: advantages, limitations, and implications for research//Laboratory Animal Research. - 2024. - Vol.40, Is.1. - Art. №25.
• N.S. Filatov, A.I. Bilyalov, G.R. Gazizova, A.A. Bilyalova, E.I. Shagimardanova, M.V. Vorontsova, A.P. Kiyasov, O.A. Gusev, O.S. Kozlova. Combination of Histological and Transcriptomic Approaches for Annotation of Cell Types in Non-Model Organisms by Example of Spiny Mice Acomys cahirinus//Russian Journal of Genetics. - 2024. - Vol.60, Is.9. - P.1153-1160.
• Bilyalova, A., Shagimardanova, E., Bilyalov, A., Zaripova, M., Shigapova, L., Gazizova, G., Mazin, P., Tatiana, B., & Gusev, O. (2024). Novel HexA splice site mutations in a patient with late atypical onset Tay-Sachs disease: importance of combined NGS and biochemical analysis. Frontiers in neurology, 15, 1400989.
• Шигапова Л.Х. Использование высокопроизводительного секвенирования для изучения генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в Уральском регионе Российской Федерации / Л.Х. Шигапова, Н.М. Шайхутдинов, Е.И. Шагимарданова, И.В. Козлова, В.В. Якименко, О.В. Лисак, Е.К. Дорощенко, О.В. Сунцова, Ю.П. Джиоев, В.И. Злобин, С.Е. Ткачёв // Национальные приоритеты России. - 2024. - № 4 (55). – С. 84-89.
  Shigapova_i_dr_2024.pdf
• Билялова А.А. Особенности строения надпочечника мышей рода Acomys / А.А. Билялова, О.С. Козлова, Д.Д. Филимошина, А.И. Билялов, Т.А. Воронина, Г.Р. Газизова, Н.С. Филатов, А.А. Титова, К.Н. Султанова, Е.И. Шагимарданова, М.В. Воронцова, О.А. Гусев, А.П. Киясов // Технологии живых систем. 2024. T. 21. № 2. С. 65−75.

• Sergeeva I, Ananeva A, Andryushkina A.V, A novel HLA-C*01 allele, HLA-C*01:230, identified by next generation sequencing in a Russian individual//HLA. - 2023. - Vol., Is.. - .
• Исследование генетического разнообразия вируса клещевого энцефалита в эндемичных регионах Российской Федерации и странах ближнего зарубежья / Л.Х. Шигапова, Н.М. Шайхутдинов, Е.И. Шагимарданова, И.В. Козлова, Г.С. Чичерина, В.В. Якименко, О.В. Лисак, Е.К. Дорощенко, С.Е. Ткачёв // Сборник трудов конференции «11-АЯ МОСКОВСКАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ ПО ВЫЧИСЛИТЕЛЬНОЙ МОЛЕКУЛЯРНОЙ БИОЛОГИИ MCCMB'23«. — Москва, 2023. — С. 114.
  elibrary_59299719_69891641.pdf
• Ananeva A, Plaksina E, Gritsenko O, Characterization of four novel HLA-B alleles: HLA-B07:02:92, -B40:02:36,-B18:220, -B18:221//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.3. - P.274-276.
• Ananeva A, Gulnaz A, Ryzhkova T, Identification and characterization of the novel HLA-A23:122 allele by next-generation sequencing//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.5. - P.522-524.
• Ananeva A, Vizerov T, Zabudskaya K, Identification of the novel HLA-B07:458 allele, detected in two unrelated bone marrow donors//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.3. - P.276-278.
• Ananeva A, Shcherbakova A, Kuznetsova A, Identification of the novel HLA-C02:212 allele detected in a potential hematopoietic stem cell donor//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.5. - P.543-544.
• Ananeva A, Vetchinkina E, Guselnikova A, Identification of the novel HLA-C05:269 allele by next-generation sequencing//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.5. - P.548-549.
• Ananeva A, Matrosova A, Podshivalova E, Recognition of the novel HLA-C07:1002 allele identified in a potential hematopoietic stem cell donor//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.5. - P.549-551.
• Ananeva A, Gulnaz A, Sergeeva I, The detection of four novel HLA-A alleles: HLA-A31:01:48, -A31:210, -A31:211 and -A33:03:54//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.2. - P.159-161.
• Ananeva A, Gulnaz A, Shagimardanova E, Two novel HLA-A alleles detected in a potential hematopoietic stem cell donors: HLA-A03:418 and -A26:220//HLA. - 2023. - Vol.101, Is.2. - P.151-153.
• Bilyalov A, Nikolaev S, Danishevich A, Khatkov I, Makhmudov K, Isakova Z, Bakirov N, Omurbaev E, Osipova A, Ramaldanov R, et al. The Spectrum of Germline Nucleotide Variants in Gastric Cancer Patients in the Kyrgyz Republic. Current Issues in Molecular Biology. 2023; 45(8):6383-6394. https://doi.org/10.3390/cimb45080403
• Билялов А.И., Филатов Н.С., Козлова О.С., Воронина Т.А., Несмелов А.А., Филимошина Д.Д., Билялова А.А., Титова А.А., Титова М.А., Шагимарданова Е.И., Гусев О.А., Киясов А.П. Металлотионеин – универсальный клеточный ответ на повреждение ушной раковины у Acomys cahirinus // Технологии живых систем. 2023. T. 20. № 4. С. 101−111.
  F_Tgs_04_2023__1_.pdf
• Низамов Ш. Р. MuscleFANTOM - атлас экспрессии генов в скелетных мышцах человека / Ш. Р. Низамов, Г. Р. Газизова, Е. И. Шагимарданова, О. А. Гусев, Р. М. Девятияров, Й. Хаяшизаки // Сборник тезисов XXIV съезда физиологического общества им. И. П. Павлова, Санкт-Петербург, 11-15 сентября 2023 года. ? Санкт-Петербург: ООО ?Издательство ВВМ?, 2023. ? 612 с. ? ISBN 978-5-9651-1500-6. ? EDN TCOQBI.
• Низамов Ш. Р. MuscleFANTOM - атлас экспрессии генов в скелетных мышцах человека / Ш. Р. Низамов, Г. Р. Газизова, Е. И. Шагимарданова, О. А. Гусев, Р. М. Девятияров, Й. Хаяшизаки // Сборник тезисов XXIV съезда физиологического общества им. И. П. Павлова, Санкт-Петербург, 11–15 сентября 2023 года. – Санкт-Петербург: ООО «Издательство ВВМ«, 2023. – 612 с. – ISBN 978-5-9651-1500-6. – EDN TCOQBI.
  Tezis_Nizamov_Sh._R.pdf
• Ткачев С.Е. Использование высокопроизводительного секвенирования при изучении генетического разнообразия ви- руса клещевого энцефалита в эндемичных регионах Российской Федерации и странах ближнего зарубежья / С.Е. Ткачев, Л.Х. Шигапова, Н.М. Шайхутдинов, Е.И. Шагимарданова, И.В. Козлова, Г.С. Чичерина, В.В. Якименко, О.В. Лисак, Е.К. Дорощенко, Ю.П. Джиоев, В.И. Злобин // Актуальные природно-очаговые инфекции: материалы Международной научно-практической конференции, Иркутск, 14– 18 сентября 2023 г. – Иркутск: ИНЦХТ, 2023. С. 56-59.
  POI_2023_TkachevSE.pdf
• Golikov A.V., Gudmundsson G., Blicher M.E., Jørgensen L.L., Korneeva E.I., Olafsdot-tir S.H., Shagimardanova E.I., Shigapova L.H., Zakharov D.V., Zimina O.L. & Sabirov R.M. A review of the genus Muusoctopus (Cephalopoda: Octopoda) from Arctic waters // Zoological Letters - V. 9, Article number: 21 (2023)
• Филатов Н.С. Особенности свертывающей системы мышей Acomys cahirinus / Н.С. Филатов, А.И. Билялов, И.И. Газизов, Р.Р. Хисматуллин, Р.И. Литвинов, Е.И. Шагимарданова, А.П. Киясов, О.А. Гусев // Материалы и технологии XXI века: сборник тезисов Всероссийской с международным участием школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых - Казань, 30 ноября – 2 декабря 2023 года. - С. 69
• Ananeva A., Sergeeva I., Shagimardanova E. / The novel HLA-A*02:1009 allele was identified in four unrelated bone marrow donors / A. Ananeva, I. Sergeeva, E. Shagimardanova // HLA. - 2023. - V. 101(1). - P. 44-45.
• Ananeva A., Akhmetshina G., Sergeeva I. Shagimardanova E. / The detection of four novel HLA-A alleles: HLA-A*31:01:48, -A*31:210, -A*31:211 and -A*33:03:54 / A. Ananeva, G. Akhmetshina, I. Sergeeva, E. Shagimardanova // HLA. - 2023. - V. 101(2). - P. 159-161.
• Ananeva A., Sergeeva I., Shagimardanova E. / The detection of the novel HLA-C*04:469 allele identified in a potential hematopoietic stem cell donor / A. Ananeva, I. Sergeeva, Shagimardanova // HLA. - 2023. - V. 101(1). - P. 67-69.
• Ananeva A., Sergeeva I., Ryzhkova T., Shagimardanova E. / TIdentification of the novel HLA alleles: HLA-A*30:201, HLA-B*51:364 and HLA-C*08:241 / A. Ananeva, I. Sergeeva, T. Ryzhkova , E. Shagimardanova // HLA. - 2023. - V. 101(5). - P. 530-531.
• Ananeva A, Kadirov A, Andryushkina AV, Shagimardanova EI. Detection of the novel HLA-A*29:183 allele in a Russian individual. HLA. 2024 Jan;103(1):e15304. doi: 10.1111/tan.15304. Epub 2023 Nov 22. PMID: 37990789.
• Ananeva A, Kadirov A, Andryushkina AV, Shagimardanova EI. Detection of the novel HLA-A*29:183 allele in a Russian individual. HLA. 2024 Jan;103(1):e15304. doi: 10.1111/tan.15304. Epub 2023 Nov 22. PMID: 37990789.
• Arleevskaya M.I, Larionova R.V, Shagimardanova E.I, Predictive risk factors before the onset of familial rheumatoid arthritis: the Tatarstan cohort study//Frontiers in Medicine. - 2023. - Vol.10, Is.. - Art. №1227786.
• Boichuk S, Dunaev P, Skripova V, Unraveling the Mechanisms of Sensitivity to Anti-FGF Therapies in Imatinib-Resistant Gastrointestinal Stromal Tumors (GIST) Lacking Secondary KIT Mutations//Cancers. - 2023. - Vol.15, Is.22. - Art. №5354.
• Задорина И.И. Удаление зубного камня с помощью томата / И. И. Задорина, Е. И. Шагимарданова, А. К. Галиуллин, Д. Р. Байдамшина, Е. Ю. Тризна, А. Р. Каюмов // Сборник тезисов 76-ой Всероссийской школы-конференции молодых ученых «Биосистемы: организация, поведение, управление«. Нижний Новгород, 11–14 апреля 2023 г. - С. 123.

• Shagimardanova E, Ananeva A. The novel HLA-A*01:390 allele was identified in a Russian individual. HLA. 2022 Jan;99(1):34-36. doi: 10.1111/tan.14463. Epub 2021 Oct 27. PMID: 34676698.
• Ananeva A., Sergeeva I., Gaifullina R., Shagimardanova E. / Three novel HLA-C alleles identified in Russian individuals: HLA-C*12:346, -C*05:01:66, and -C*07:955 / A. Ananeva, I. Sergeeva, R. Gaifullina, E. Shagimardanova // HLA. - 2022. - V. 100(5). - P. 539-541.
• Miyata Y, Tokumoto S, Arai T, Identification of Genomic Safe Harbors in the Anhydrobiotic Cell Line, Pv11//Genes. - 2022. - Vol.13, Is.3. - Art. №406.
• Kondratyeva S.A, Voronina T.A, Nesmelov A.A, Intracellular Localization and Gene Expression Analysis Provides New Insights on LEA Proteins? Diversity in Anhydrobiotic Cell Line//Biology. - 2022. - Vol.11, Is.4. - Art. №487.
• Гоголева Н. Е. Подготовка образцов и нанопоровое секвенирование / Учебно-методическое пособие / Н.Е. Гоголева, Е.И Шагимарданова / - Казань: Казан. ун-т, 2022. – 28 с.
• Ананьева А. В. Регистрация новых HLA аллелей. Учебно-методическое пособие / А.В Ананьева, Е.И Шагимарданова / - Казань: Казан. ун-т, 2022. – 33 с.
• Khilyas IV, Markelova MI, Valeeva LR, Gritseva AS, Sorokina AV, Shafigullina LT, Tukhbatova RI, Shagimardanova EI, Berkutova ES, Sharipova MR, Lochnit G, Cohen MF. Genomic and metabolomic profiling of endolithic Rhodococcus fascians strain S11 isolated from an arid serpentine environment. Arch Microbiol. 2022 May 19;204(6):336. doi: 10.1007/s00203-022-02955-1. PMID: 35587838.
  Khilyas_et_al.__2022.pdf
• Патент 2766887 от 16.03.2022. Российская федерация. Генетическая конструкция c геном белка-ингибитора апоптоза, предназначенная для экспрессии чужеродных генов в клетках насекомого Polypedilum vanderplanki в условиях повышенного радиационного фона /А.В. Ананьева, А.Г. Кадиров Е.И. Шагимарданова, О.А. Гусев // Заявка: 2021108 416, 29.03.2021.
  patent_2766887.pdf
• База данных. Свидетельство о государственной регистрации № 2020620980 от 16.06.2020. Штаммы микроорганизмов, устойчивых к высоким дозам ионизирующего излучения. Заявка № 2020620817 от 27.05.2020.
  BD_20206200980.pdf
• База данных. Свидетельство о государственной регистрации № 2020621449 от 17.08.2020. Молекулярно -генетические детерминанты устойчивости к ионизирующему излучению. Заявка № 2020621291 от 30.07.2020.
  BD_2020621449.pdf
• Молекулярно-генетический анализ в систематике и филогении животных
• Shagimardanova E, Ananeva A, Klyuchnikov D, Gaifullina R, Andryushkina A. Rare and very rare HLA alleles among bone marrow donors recruited by the national bone marrow donors registry named after Vasya Perevoshchikov, Russia. HLA. 2022 May;99(5), p520: P155. doi:10.1111/tan.14606
• Ananeva A, Nizamov S, Shagimardanova E. The novel HLA-DQB1*03:445 allele was identified in two unrelated bone marrow donors from Russia. HLA. 2022 Jan;99(1):69-70. doi: 10.1111/tan.14444. Epub 2021 Oct 12. PMID: 34617418.
• Ткачев С.Е., Шайхутдинов Н.М., Шигапова Л.Х., Чичерина Г.С., Зинкина А.С., Якименко В.В., Шагимарданова Е.И. Высокопроизводительное секвенирование как инструмент для генетической характеристики больших коллекций вирусов на примере штаммов вируса клещевого энцефалита из Западной Сибири // Новые концепции механизмов воспаления, аутоиммунитета инфекций: Сборник трудов VIII международной науч.-практ. конф. (Казань, 31 мая 2022 г.). – Казань: Редакционно-издательский отдел, 2022. – С. 92-94.
  Materialy_VIII_Mezhdunarodnoj_konferencii_2022.pdf
• Lutfullin M.T. Identifcation, characterization, and genome sequencing of Brevibacterium sediminis MG‑1 isolate with growth‑promoting properties / M.T. Lutfullin, G.F. Lutfullina, D.S. Pudova, Y. A. Akosah, E.I. Shagimardanova, S.G. Vologin, M.R. Sharipova, A.M. Mardanova // 3Biotech. - 2022. - 12:326. - P. 1-16. DOI 10.1007/s13205-022-03392-z
• Ткачев С. Е. Генетическое разнообразие вируса клещевого энцефалита в природных очагах на южной границе его обитания / С. Е. Ткачев, Н. М. Шайхутдинов, Л. Х. Шигапова, Е. И. Шагимарданова, И. В. Козлова, Т. В. Демина, Е. К. Дорощенко, О. В. Лисак, М. М. Верхозина, Ю. П. Джиоев, А. И. Парамонов, О. В. Сунцова, Ю. С. Савинова, В. И. Злобин // Материалы Региональной научно-практической конференции с международным участием «АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ОБЕСПЕЧЕНИЯ САНИТАРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО БЛАГОПОЛУЧИЯ НАСЕЛЕНИЯ СИБИРИ И ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА«, 15 ноября 2022 г., Иркутск: Издательство ИГУ, 2022. - С. 118-119.
  F_Tkachev_et_al__2022.pdf
• Bilyalov A, Nikolaev S, Shigapova L, Application of Multigene Panels Testing for Hereditary Cancer Syndromes//Biology. - 2022. - Vol.11, Is.10. - Art. №1461.
  biology_11_01461.pdf
• Bilyalov A.I, Filimoshina D.D, Filatov N.S, ELASTIC EAR CARTILAGE OF ACOMYS MICE IS RECOVERING AFTER INJURY//Genes and Cells. - 2022. - Vol.17, Is.1. - P.42-47.
• Билялов А.И. ОЦЕНКА РЕПАРАТИВНОГО ХОНДРОГЕНЕЗА ЭЛАСТИЧЕСКОГО ХРЯЩА ИГЛИСТЫХ МЫШЕЙ / А.И. Билялов, Д.Д. Филимошина, Н.С. Филатов, А.А. Билялова, А.А. Титова, Л.Р. Гатауллина, А.С. Плюшкина, Е.И. Шагимарданова, Р.В. Деев, О.С. Козлова, А.А. Несмелов, О.А. Гусев, А.П. Киясов//Гены и клетки. Материалы V Национального конгресса по регенеративной медицине, Москва, 2022 - Том XVII, №3. С.29
• Билялова А.А. ОЦЕНКА ОСОБЕННОСТИ СТРОЕНИЯ НАДПОЧЕЧНИКОВ ИГЛИСТЫХ МЫШЕЙ / А.И. Билялов, Д.Д. Филимошина, Н.С. Филатов, А.А. Билялова, А.А. Титова, Л.Р. Гатауллина, А.С. Плюшкина, Е.И. Шагимарданова, Р.В. Деев, О.С. Козлова, А.А. Несмелов, О.А. Гусев, А.П. Киясов//Гены и клетки. Материалы V Национального конгресса по регенеративной медицине, Москва, 2022 - Том XVII, №3. С.29-30
• Ananeva Anastasiia, Sergeeva Iuliia, Ryzhkova T, The novel HLA-C*04:441:01:02 allele was identified in three unrelated bone marrow donors//HLA. - 2022. - Vol., Is.. - .
• Bulmakova D. S. Effect of Pantoea sp. 3.5.1 phytase on the broilers' caecum microbiota / D. S Bulmakova, D. S. Pudova, A. D. Suleimanova, E. I. Shagimardanova, S. Y. Smolentsev, G. F. Lutfullina, M. T. Lutfullin, A.M. Mardanova, M.R. Sharipova // BioNanoScience. – 2022. – V. 12. – P. 824-832
• Билялов А.И. ACOMYS — НЕКАНОНИЧЕСКАЯ МОДЕЛЬ РЕГЕНЕРАЦИИ/ Билялов А. И., Филимошина Д.Д., Билялова A. A., Филатов Н. С., Гатауллина Л. Р., Титова А. А., Козлова О. С., Несмелов А. А., Шагимарданова Е.И., Пресняков Е.В., Деев Р. В., Киясов А. П., Гусев О. А.// Вопросы морфологии XXI века. Сборник научных трудов Всероссийской научной конференции. Инновационные технологии в исследованиях, диагностике и преподавании. - СПб, 2022. - Вып.7. - C.123-125
• 2. Yakubova A. Genomic Screening of Chronic Migraine Patients Identified Genes Linked to Drug and Endogenous Substances Metabolism / A. Yakubova, E. Shagimardanova, T. Grigoryeva, E. Boulygina, L. Shigapova, M. Siniagina, N. Blatt, R. Giniatullin, A. Rizvanov // BioNanoScience. – 2022. – Vol.12 (1). – P. 154–159.
• S.A. Kondratyeva, T.A. Voronina, A.A. Nesmelov (equal contribution), Y. Miyata, et al. Intracellular Localization and Gene Expression Analysis Provides New Insights on LEA Proteins? Diversity in Anhydrobiotic Cell Line. Biology (Basel), 2022, V.11 (4), P.487.
• Ananeva A., Sergeeva I., Shagimardanova E. / The four novel HLA-B alleles in unrelated Russian individuals: HLA-B*38:01:18, -B*39:01:28, -B*40:484, -B*44:498 / A. Ananeva, I. Sergeeva, E. Shagimardanova // HLA. - 2022. - V. 99(1). - P. 42-44.
• Yoshida Y, Shaikhutdinov N, Kozlova O, High quality genome assembly of the anhydrobiotic midge provides insights on a single chromosome-based emergence of extreme desiccation tolerance//NAR GENOMICS AND BIOINFORMATICS. - 2022. - Vol.4, Is.2. - Art. №lqac029.

• Ananeva A, Leksina Y, Andryushkina A, The novel HLA-A*02:941 allele was identified during high-resolution HLA typing//HLA. - 2020. - Vol., Is.. - .
• Supplementation of Bacillus subtilis GM5 enhances broiler body weight gain and modulates cecal microbiota / G. Hadieva, M. Lutfullin, D. Pudova, Y. Akosah, E. Shagimardanova, N. Gogoleva, M. Sharipova, A. Mardanova // 3 Biotech - 2021 - V. 11. – N.126 - https://doi.org/10.1007/s13205-020-02634-2
• Anastasiia Ananeva, Iuliia Sergeeva, Oleg Gusev, Elena Shagimardanova. Three novel HLA-C alleles identified in Russian individuals: C*04:01:124, C*12:02:38, and C*12:03:64. HLA. 2021 Mar;97(3):237-239. doi: 10.1111/tan.14178. Epub 2021 Jan 4.
• Tokumoto S, Miyata Y, Deviatiiarov R, Genome-wide role of hsf1 in transcriptional regulation of desiccation tolerance in the anhydrobiotic cell line, pv11//International Journal of Molecular Sciences. - 2021. - Vol.22, Is.11. - Art. № 5798.
• Pintus S.S, Akberdin I.R, Yevshin I, Genome-wide atlas of promoter expression reveals contribution of transcribed regulatory elements to genetic control of disuse-mediated atrophy of skeletal muscle//Biology. - 2021. - Vol.10, Is.6. - Art. № 557.
• Subbot A, Kondratieva S, Novikov I, Life-on-hold: Lanthanoids rapidly induce a reversible ametabolic state in mammalian cells//Biology. - 2021. - Vol.10, Is.7. - Art. № 607.
• Ananeva A, Osipova N, Shaihutdinova A, Identification of three new HLA-DQB1 alleles: HLA-DQB1*03:02:33,-DQB1*04:79 and-DQB1*05:249//HLA. - 2021. - Vol.97, Is.4. - P.378-+.
• Adameyko K. I., Finoshin A. D., Lyupina Y. V., Regulation of ferritin and globin genes in cold-water sea sponges Halisarca dujardini and Halichondria panicea and its role during reaggregation//FEBS OPEN BIO. - 2021. - Vol.11, Is.. - P.120-120.
• Miyata Y, Fuse H, Tokumoto S, Cas9-mediated genome editing reveals a significant contribution of calcium signaling pathways to anhydrobiosis in Pv11 cells//Scientific Reports. - 2021. - Vol.11, Is.1. - Art. №19698.
• The potato rhizoplane actively recruits Fusarium taxa during flowering / Y. Akosah, M. Lutfullin, G. Lutfullina, D. Pudova, E. Shagimardanova, S. Vologin, N. Gogoleva, Z. Stasevski, M. Sharipova, A. Mardanova // Rhizosphere – 2021 – V. 20; 100449: DOI:10.1016/j.rhisph.2021.100449.
• Ivanova O., Komarova M. Y., Ignatieva E. V., Multilevel metabolic impairments in skeletal muscle of heart failure patients//EUROPEAN JOURNAL OF HEART FAILURE. - 2021. - Vol.23, Is.. - P.317-317.
• Патент 2763049 от 27.12.2021. Российская федерация. Генетическая конструкция для повышения радиационной устойчивости культуры клеток насекомого P. vanderplanki / А.А. Несмелов, А.В. Ананьева, О.А. Гусев, А.Г. Кадиров Е.И. Шагимарданова // Заявка: 2021107502, 22.03.2021.
  F_patent_2763049.pdf
• Adameyko K.I, Burakov A.V, Finoshin A.D, Conservative and atypical ferritins of sponges//International Journal of Molecular Sciences. - 2021. - Vol.22, Is.16. - Art. № 8635.

• Finoshin A.D, Adameyko K.I, Mikhailov K.V, Iron metabolic pathways in the processes of sponge plasticity//PLoS ONE. - 2020. - Vol.15, Is.2. - Art. № e0228722.
• Ananeva A., Sergeeva I., Gaifullina R., Shagimardanova E. / A novel HLA-B allele, HLA-B*44:493, detected in a potential hematopoietic stem cell donor / A. Ananeva, I. Sergeeva, R. Gaifullina, E. Shagimardanova // HLA. - 2020. - V. 96(6). - P. 730-732.
• Yamada T.G, Hiki Y, Hiroi N.F, Identification of a master transcription factor and a regulatory mechanism for desiccation tolerance in the anhydrobiotic cell line Pv11//PLoS ONE. - 2020. - Vol.15, Is.3. - Art. № e0230218.
• Ziganshina E.E., Sagitov I.I., Akhmetova R.F.,... Ziganshin A.M. Comparison of the microbiota and inorganic anion content in the saliva of patients with gastroesophageal reflux disease and gastroesophageal reflux disease-free individuals // BioMed Research International. - 2020. - Vol. 2020 - Art. № 2681791.
• Nikitin A.G, Chudakova D.A, Enikeev R.F, Lynch Syndrome Germline Mutations in Breast Cancer: Next Generation Sequencing Case-Control Study of 1,263 Participants//Frontiers in Oncology. - 2020. - Vol.10, Is.. - Art. № 666.
• Avetisov S.E, Abramova N.D, Gogoleva N.E, Rational strategy for studying microbiome of the ocular surface of people using hard contact lenses by method of 16S rRNA gene metabarcoding [Ratsional'naya strategiya izucheniya mikrobioma glaznoi poverkhnosti pol'zovatelei zhestkikh kontaktnykh linz metodom metabarkodinga po genu 16S rRNK]//Vestnik oftalmologii. - 2020. - Vol.136, Is.3. - P.3-9.
• Adameyko K.I, Kravchuk O.I, Finoshin A.D, Structure of Neuroglobin from Cold-Water Sponge Halisarca dujardinii//Molecular Biology. - 2020. - Vol.54, Is.3. - P.416-420.
• Adameyko K.I, Kravchuk O.I, Finoshin A.D, Structure of Neuroglobin from Cold-Water Sponge Halisarca dujardinii//Molekuliarnaia biologiia. - 2020. - Vol.54, Is.3. - P.474-479.
• Адамейко К.И. Структура нейроглобина холодноводной губки Halisarca dujardinii / К.И. Адамейко, О.И. Кравчук, А.Д. Финошин, А.Н. Бончук, А.А. Георгиев, В.С. Михайлов, Н.Г. Горностаев, К.В. Михайлов, А.В. Бачева, М.И. Индейкина, А.Е. Бугрова, Г.Р. Газизова, О.С. Козлова, О.А. Гусев, Е.И. Шагимарданова, Ю.В. Люпина // Молекулярная биология. - 2020. - № 3. - С. 474-479.
• Voronina T.A, Nesmelov A.A, Kondratyeva S.A, New group of transmembrane proteins associated with desiccation tolerance in the anhydrobiotic midge Polypedilum vanderplanki//Scientific Reports. - 2020. - Vol.10, Is.1. - Art. № 11633.
• Zhuravleva D.E. Complete Genome Sequence of Lactobacillus hilgardii LMG 7934, Carrying the Gene Encoding for the Novel PII-Like Protein PotN/ D.E. Zhuravleva, Z.I. Iskhakova, G.D. Ozhegov, N.E. Gogoleva, D.R. Khusnutdinova, E.I. Shagimardanova, K. Forchhammer, A.R. Kayumov // Current Microbiology. - 2020. - Vol.77, Is.11. – P.3538-3545.
• Ozhegov G. D. Whole genome sequence data of Lactobacillus fermentum HFD1, the producer of antibacterial peptides / G. D. Ozhegov, A. S. Pavlova, D. E. Zhuravleva, N. E. Gogoleva, E. I. Shagimardanova, M. I. Markelova, D. R. Yarullina, A. R. Kayumov // Data in brief. – 2020. – V. 32. – P. 106105.
• Ryabova A, Cornette R, Cherkasov A, Combined metabolome and transcriptome analysis reveals key components of complete desiccation tolerance in an anhydrobiotic insect//Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2020. - Vol.117, Is.32. - P.19209-19220.
• Deviatiiarov R, Ayupov R, Laikov A, Diversity and regulation of S-adenosylmethionine dependent methyltransferases in the anhydrobiotic midge//Insects. - 2020. - Vol.11, Is.9. - P.1-11.
• Anastasiia Ananeva, Iuliia Sergeeva, Raushania Gaifullina, Elena Shagimardanova. The novel allele HLA‐A*11:362 identified in two unrelated bone marrow donors from Russia. HLA. 2021 Mar;97(3):218-219. doi: 10.1111/tan.14082. Epub 2020 Oct 8.
• Anastasiia Ananeva, Iuliia Sergeeva, Raushania Gaifullina, Elena Shagimardanova. A novel HLA‐B allele, HLA‐B*44:493, detected in a potential hematopoietic stem cell donor. HLA. 2020 Dec;96(6):730-732. doi: 10.1111/tan.14084. Epub 2020 Oct 8.
• Khilyas I.V, Sorokina A.V, Markelova M.I, Genomic and phenotypic analysis of siderophore-producing Rhodococcus qingshengii strain S10 isolated from an arid weathered serpentine rock environment//Archives of Microbiology. - 2020. - Vol., Is.. - .
• Tokumoto S, Miyata Y, Usui K, Development of a tet-on inducible expression system for the anhydrobiotic cell line, PV11//Insects. - 2020. - Vol.11, Is.11. - P.1-14.
• Khilyas, I. V., Genomic and phenotypic analysis of siderophore-producing Rhodococcus qingshengii strain S10 isolated from an arid weathered serpentine rock environment / Khilyas, I. V., Sorokina, A. V., Markelova, M. I., Belenikin, M., Shafigullina, L., Tukhbatova, R. I., Shagimardanova, E.I., Blom, J., Sharipova, M. R., Cohen, M. F. // Arch Microbiol. - 2020. - https://doi.org/10.1007/s00203-020-02057-w
  Khilyas_et_al.__2020.pdf
• Zlotina A, Melnik O, Fomicheva Y, A 300-kb microduplication of 7q36.3 in a patient with triphalangeal thumb-polysyndactyly syndrome combined with congenital heart disease and optic disc coloboma: a case report//BMC Medical Genomics. - 2020. - Vol.13, Is.1. - Art. № 175.
• Ryabova A, Kozlova O, Kadirov A, Detr db: A database of ionizing radiation resistance determinants//Genes. - 2020. - Vol.11, Is.12. - P.1-9.
• Lutfullina G. Influence of the total fraction of Bacillus subtilis GM5 lipopeptides on the growth parameters and formation of bacterial microbiota of broiler chickens/ G. Lutfullina, D. Pudova, N.Gogoleva, Е. Shagimardanova, А.Mardanova// «E3S Web of Conferences» V. 222, 02053 (2020) DOI: https://doi.org/10.1051/e3sconf/202022202053
• Lisitsa T., Danishevich A., Litvinova M., Investigating of genetic variants, associated with breast cancer in Russian women//EUROPEAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS. - 2020. - Vol.28, Is.SUPPL 1. - P.496-497.
• Anastasiia Ananeva, Iuliia Sergeeva, Raushania Gaifullina, Elena Shagimardanova.Characterization of the new HLA-B*35:482, detected in a potential hematopoietic stem cell donor. HLA. 2021 Mar;97(3):233-235. doi: 10.1111/tan.14150. Epub 2020 Dec 8.
• Anastasiia Ananeva, Yana Leksina, Iuliia Sergeeva, Raushania Gaifullina, Elena Shagimardanova. Characterization of three new HLA-A*11 alleles in Russian individuals by next-generation sequencing. HLA. 2021 Apr;97(4):351-353. doi: 10.1111/tan.14153. Epub 2020 Dec 2.
• Zhuravleva D.E. Complete Genome Sequence of Lactobacillus hilgardii LMG 7934, Carrying the Gene Encoding for the Novel PII-Like Protein PotN/ D.E. Zhuravleva, Z.I. Iskhakova, G.D. Ozhegov, N.E. Gogoleva, D.R. Khusnutdinova, E.I. Shagimardanova, K. Forchhammer, A.R. Kayumov//Current Microbiology. - 2020. - Vol.77, Is.11. - P.3538-3545.
• Ananeva A., Sergeeva I., Gaifullina R., Shagimardanova E. / A the novel allele HLA-A*11:362 identified in two unrelated bone marrow donors from Russia / A. Ananeva., I. Sergeeva., E. Shagimardanova // HLA. - 2020. - V. 97(3). - P. 218-219.
• Makhnovskii P.A, Zgoda V.G, Bokov R.O, Regulation of Proteins in Human Skeletal Muscle: The Role of Transcription//Scientific Reports. - 2020. - Vol.10, Is.1. - Art. № 3514.

• Миннуллина Л.Ф., Пудова Д.С., Шагимарданова Е.И., Марданова А.М. Полногеномное секвенирование для сравнительного анализа клинических изолятов Morganella morganii // Материалы VI Международной конференции «Современные биотехнологии для науки и практики». – Санкт-Петербург, 2019. - С. 32-33.
• Mardanova A. Structure and variation of root‑associated microbiomes of potato grown in alfisol / M. Lutfullin, G. Hadieva, Y. Akosah, D. Pudova, D. Kabanov, E. Shagimardanova, P. Vankov, S. Vologin, N. Gogoleva, Z. Stasevski, M. Sharipova // World Journal of Microbiology and Biotechnology - (2019) 35:181
• Shagimardanova Elena I., Leksina Yana A., Gabidullina Regina I., NOVEL HLA ALLELES BASED ON POLYMORPHISM OUTSIDE THE KEY EXONS AS A RESULT OF FULL LENGTH NGS: WHAT NOW?//HLA. - 2019. - Vol.93, Is.5. - P.390-390.
• Klyuchnikov Dmitry Y., Vavilov Mikhail N., Trusova Larisa M., THE MOST FREQUENT HLA-A, -B AND-DRB1 ALLELES IN TATARS FROM CHELYABINSK REGION, SAMARA REGION AND TATARSTAN//HLA. - 2019. - Vol.93, Is.5. - P.349-349.
• Miyata Y, Tokumoto S, Sogame Y, Identification of a novel strong promoter from the anhydrobiotic midge, Polypedilum vanderplanki, with conserved function in various insect cell lines//Scientific Reports. - 2019. - Vol.9, Is.1. - Art. № 7004.
• Popov D.V, Makhnovskii P.A, Shagimardanova E.I, Contractile activity-specific transcriptome response to acute endurance exercise and training in human skeletal muscle//American journal of physiology. Endocrinology and metabolism. - 2019. - Vol.316, Is.4. - P.E605-E614.
• Arleevskaya M., Larionova R., Kravtsova O., Shagimardanova E., Validov S., Valeeva A., Valieva D., Boulygina E., Takha E., Shuralev E., Mukminov M., Kazarian G., Renaudineau Y. Infections, microbiota and immune response at early stage of rheumatoid arthritis: results from the Tatarstan cohort // Proceeding of the VII International Meeting: New concepts on the mechanisms of inflammation, autoimmunity and tumorogenesis (6-8 June 2019, Kazan, Russia). – Kazan: MeDDok, 2019. – P. 76.
• Hadieva, G. F., Lutfullin, M. T., Pudova, D. S., Akosah, Y. A., Gogoleva, N. E., Shagimardanova, E. I., A. M. Mardanova & Sharipova, M. R. (2019). Data on the genome analysis of the probiotic strain Bacillus subtilis GM5. Data in Brief, 23, 103643. https://doi.org/10.1016/j.dib.2018.12.081
• Minnullina Leyla, Pudova Daria, Shagimardanova Elena, Shigapova Leyla, Sharipova Margarita, Mardanova Ayslu. Comparative Genome Analysis of Uropathogenic Morganella morganii Strains//FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY. - 2019. - Vol.9, Is.. - Art. №167.
• Minkina E., The role of the enhancers in the intraspecific variability / E. Minkina, N. Akberova, E. Shagimardanova, I. Adameyko, O. Gusev // SMBE 2019 abstract book (21-25 July 2019, Manchester, England). - Manchester, 2019. - URL: http://smbe2019.org/media/1058/smbe-2019-abstract-book.pdf
• Minkina E., The highly-variable enhancers in the intra-specific morphological diversity [Online] / E. Minkina, N. Akberova, E. Shagimardanova, I. Adameyko, O. Gusev // Proceedings of 9-th Moscow Conference on Computational Molecular Biology (27-30 July 2019, Moscow, Russia). - Moscow, 2019. - URL: http://mccmb.belozersky.msu.ru/2019/thesis/MCCMB2019/abstracts/160.pdf
• Shagimardanova E., Shigapova L. H., Nikitin A., Evaluation of germ line mutational status among women with triple-negative breast cancer in Russia//ANNALS OF ONCOLOGY. - 2019. - Vol.30, Is.. - .
• Popov, DV, Makhnovskii, PA, Shagimardanova, EL, Gazizova, GR, Lysenko, EA, Gusev, OA, Vinogradova, OL Contractile activity-specific transcriptome response to acute endurance exercise and training in human skeletal muscle // American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism. – 2019. Vol. 316. №. 4. P. E605-E614. https://doi.org/10.1152/ajpendo.00449.2018
• Gazizova G., Deviatiiarov R., Tyapkina O., Cherkasov A., Nurullin L., Shagimardanova E., Gusev O. Regulation of hibernation: promoter expression landscape in skeletal muscle of edible dormouse // Proceedings of 33rd International Mammalian Genome Conference (IMGC-2019). 25-28 September, 2019. Stras-bourg, France. – 2019. – p. 41
• Gazizova G., Tyapkina O., Deviatiiarov R., Kozlova O., Shagimardanova E., Gusev O. Promoter-level expression atlas of skeletal muscle in hibernating edible dormouse // Proceedings of 9th Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'19). 27-30 July 2019, Moscow, Russia. – 2019.
• Kuzmich Elena V., Makarenko Olga A., Vavilov Michail N., MOST COMMON HLA ALLELES AND FIVE-LOCUS HAPLOTYPES IN NATIONAL BONE MARROW DONORS REGISTRY NAMED AFTER VASYA PEREVOSHCHIKOV, RUSSIA//HLA. - 2019. - Vol.93, Is.5. - P.356-357.

• Ziganshina E.E., Mohammed W.S., Doijad S.P., Shagimardanova E.I., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Draft genome sequence of Brevibacterium epidermidis EZ-K02 isolated from nitrocellulose-contaminated wastewater environments // Data in Brief. - 2018. - Vol. 17. - P. 119-123.
• Pudova D.S. Draft genome sequence data of Lysinibacillus fusiformis strain GM, isolated from potato phyllosphere as a potential probiotic / D.S. Pudova, M.T. Lutfullin, E.I. Shagimardanova, G.F. Hadieva, L. Shigapova, A.A. Toymentseva, D.A. Kabanov,A.M. Mardanova,S.G. Vologin, M.R. Sharipova // Data in Brief. 2018. V. 21. P. 2504-2509. https://doi.org/10.1016/j.dib.2018.11.107.
• Gazizova, G., Deviatiiarov R., Nigmetzyanov, I., Forrest A., Deev R., Hayashizaki Y., Shagimardanova E., Gusev O. Promoter-level atlas of diversity of gene expression in the mammalian skeletal muscles: scope and milestones of the project // Human Genomics 2018, 12 (Suppl 1):9 P.28
  F_HGM.pdf
• Nesmelov Alexander, Shagimardanova Elena, Kikawada Takahiro G.O. Involvement of Heat Shock Proteins in Invertebrate Anhydrobiosis // Heat Shock Proteins and Stress / A.A. Asea, P. Kaur., eds. Singapore: Springer international PU, 2018. С. 232–243.
• Localization of LEA proteins in the cells of anhydrobiotic insect / A. Nesmelov, T. Voronina, S. Kondratyeva, E. Shagimardanova // Abstracts of 43st FEBS Congress «Biochemistry forever« Prague, Czech Republic, 07.07.2018 - 12.07.2018.
• Ziganshina E.E., Mohammed W.S., Shagimardanova E.I., Vankov P.Y., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Fungal, bacterial, and archaeal diversity in the digestive tract of several beetle larvae (Coleoptera) // Biomed Research International. - 2018. - Vol. 2018. - Art. № 6765438.
• Garanina, E.E. Activation of FGFR-signaling mediates resistance of gastrointestinal stromal tumors (GISTs) to imatinib (IM) / E.E. Garanina, S. Boichuk; P. Dunaev; A. Galembikova;E. Shagimardanova; O. Gusev; S. Khaiboullina // European journal of clinical investigation. - 2018. - Vol.48, supp.1. - P.159
  F_2018_European_Journal_of_Clinical_Investigation__ABSTRACT_.pdf
• Л.Х. Шигапова. Таргетное секвенирование нового поколения генов BRCA1 и BRCA2 для выявления редких мутаций при наследственном раке молочной железы и раке яичников/Л.Х. Шигапова, О.И.Бровкина, М.Г. Гордиев, М.О. Дружков, Е.И. Шагимарданова,Р.Ф. Еникеев, Г.К. Мухамедьярова, Д.С.Ходырев, А.Г. Никитин,В.В. Питкау,Д.Д. Сакаева, Р.Р. Фаисханова, А.Ф. Насретдинов, Ю.К. Моляка, Е.Г. Овчинникова, И.С. Шумская, О.А. Гусев// Третья международная научно-практическая конференция: NGS в медицинской генетике. Тезисы конференции. г. Суздаль, 25-27 апреля 2018г.-Стр. 54-57
• Ananeva, A. Genetic testing to guide warfarin dosage in Russian Federation / A.Ananeva, L.Shigapova, A.Nikitin, M.Gordiev, E.Shagimardanova // Abstracts of the 52nd Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation "Precision medicine for healthy ageing". - 2018. - V.48. - I.1. - P.135.
• Shigapova L. Genetic predisposition to cancer due to germline mutations in DNA reparation-associated genes among Russian woman/ Shigapova L, Gordiev M, Druzkov M, Enikeev R, Nikitin A,Leksina Y, Gusev O, Shagimardanova E.// Human Genome Meeting 2018, Yokohama, Japan, 12-15 March 2018.- Human Genomics-2018.- Vol.-12(Suppl 1)
• Mohammed W.S., Ziganshina E.E., Shagimardanova E.I., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Comparison of intestinal bacterial and fungal communities across various xylophagous beetle larvae (Coleoptera: Cerambycidae) // Scientific Reports. - 2018. - Vol. 8. - Art. №10073.
• Ziganshina E.E., Mohammed W.S., Shagimardanova E.I., Shigapova L.H., Ziganshin A.M. Draft genome sequence of Bacillus pumilus strain EZ-C07 isolated from digested agricultural wastes // BMC Research Notes. - 2018. - Vol. 11. - Art. № 606.
• Nesmelov A., Voronina T., Kondratyeva S., Localization of LEA proteins in the cells of anhydrobiotic insect//FEBS OPEN BIO. - 2018. - Vol.8, Is.. - P.292-292.
• Brovkina OI, Shigapova L, Chudakova DA, Gordiev MG, Enikeev RF, Druzhkov MO, Khodyrev DS, Shagimardanova EI, Nikitin AG and Gusev OA (2018) The Ethnic-Specific Spectrum of Germline Nucleotide Variants in DNA Damage Response and Repair Genes in Hereditary Breast and Ovarian Cancer Patients of Tatar Descent. Front. Oncol. 8:421. doi: 10.3389/fonc.2018.00421
• M. Gordiev, L.H. Shigapova, O. Brovkina, R.F. Enikeev, M. Druzhkov, A. Nikitin,E. Shagimardanova, O. Gusev. Lynch syndrome-associated hereditary mutations cause breast and ovarian cancer: Results from Russian Heredetary Oncogenomics project/Annals of Oncology.- 2018.-V.29. DOI: 10.1093/annonc/mdy270.236
• Ziganshina E.E., Mohammed W.S., Shagimardanova E.I., Shigapova L.H., Ziganshin A.M. Draft genome sequence of Staphylococcus sp. EZ-P03 isolated from a mesophilic anaerobic digester // BMC Research Notes. - 2018. - Vol.11 - Art. № 694.
• Анализ геномных локусов антимикробных метаболитов штамма Bacillus subtilis GM5. Хадиева Г.Ф., Лутфуллин М.Т., Пудова Д.С., Шагимарданова Е.И., Марданова А.М., Шарипова М.Р. Сборник научных трудов V Международной конференции ПОСТГЕНОМ 2018. В поисках моделей персонализированной медицины (Казань, 29 октября 2 ноября 2018). Казань: Издательство Казан. ун-та. 2018. С. 228.
• О. Гусев, Е. Шагимарданова, Р. Девятияров, Г. Газизова, Й. Хаяшизаки Muscle FANTOM: атлас экспрессии промоторов в скелетных мышцах человека и приматов // В поисках моделей персонализированной медицины. Сборник научных трудов V Международной конференции «ПОСТГЕНОМ'2018», Казань, 29 октября – 2 ноября 2018. - 2018. - С. 15.
• Ziganshina E.E., Mohammed W.S., Shagimardanova E.I., Ziganshin A.M. Draft genome sequence data and analysis of Brachybacterium sp. strain EE-P12 isolated from a laboratory-scale anaerobic reactor // Data in Brief. - 2018. - Vol. 21. - P. 2576-2580.
• Ананьева, А.В. Анализ частоты полиморфных вариантов генов, связанных с метаболизмом варфарина у жителей Татарстана / А.В. Ананьева, Л.Х. Шигапова, А.Г. Никитин, О.А. Гусев, Е.И.Шагимарданова // Сборник тезисов III Международной школы-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Материалы и технологии XXI века". -2018. -с.12.
• Лексина Я.А., Габидуллина Р.И., Ананьева А.В., Шагимарданова Е.И. Опыт внедрения секвенирования нового поколения (NGS) для HLA-типирования потенциальных доноров костного мозга в РФ // Вестник гематологии, том XIV, № 2, 2018. - Санкт-Петербург: РосНИИГТ, 2018. - С. 35-36.
• E. Shagimardanova, L. H. Shigapova, R. F. Enikeev, M. Druzhkov, A. Nikitin, O. Gusev, M. Gordiev. Landscape of germline mutations in hereditary breast and ovarian cancer (HBOC) patients in Russia revealed by target panel sequencing/ E. Shagimardanova, L. H. Shigapova, R. F. Enikeev, M. Druzhkov, A. Nikitin, O. Gusev, M. Gordiev// Annals of Oncology, Volume 29, Issue suppl_8, 1 October 2018, mdy270.235,https://doi.org/10.1093/annonc/mdy270.235
• Mazin P.V, Shagimardanova E, Kozlova O, Cooption of heat shock regulatory system for anhydrobiosis in the sleeping chironomid Polypedilum vanderplanki//Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2018. - Vol.115, Is.10. - P.E2477-E2486.

• Gazizova G., Kozlova O., Tyapkina O., Nurullin L., Shagimardanova E. Semaphorins Are likely to Be Involved in the Control of Hibernation // BioNanoSci. (2017). doi:10.1007/s12668-016-0292-z
• Особенности распределения мутаций в генах BRCA1/BRCA2 у пациенток татарского происхождения с наследственным РМЖ и РЯ, выявляемые методом NGS. О.И. Бровкина, М.Г. Гордиев, Р.Ф. Еникеев, М.О. Дружков, Л.Х. Шигапова, Е.И. Шагимарданова, О.А. Гусев, Д.С. Ходырев, А.Г. Никитин.- Сборник тезисов Второй международной научно-практической конференции NGS в медицинской генетике, Суздаль 26-28 апреля 2017г., С. 25-26
• Deviatiiarov R., Shagimardanova E., Kikawada T. BioNanoSci. (2017) 7: 212. doi:10.1007/s12668-016-0312-z
• Бровкина О.И. Гены BRCA1 И BRCA2: популяционные особенности развития рака молочной железы у татарских женщин /Бровкина О.И., Гордиев М.Г., Шигапова Л.Х., Дружков М.О., Шагимарданова Е.И., Еникеев Р.Ф., Ходырев Д.С., Гусев О.А., Никитин А.Г.// Журнал: «Медицинская генетика«.- М., 2016.- №10(172).- С. 50-52
• О.И. Бровкина, М.Г. Гордиев, Р.Ф. Еникеев, М.О. Дружков, Л.Х. Шигапова, Е.И. Шагимарданова, О.А. Гусев, В.В. Косый, Д.С. Ходырев, А.Г. Кедрова, Р.Ш.Хасанов, А.Г. Никитин /Гены системы репарации: популяционные различия наследственных типов рака яичников и молочной железы, выявляемые методом секвенирования нового поколения// «Опухоли женской репродуктивной системы. Оригинальные статьи.«- Т.2.- 2017.- С.61-66.
• Gusev O., Nesmelov A., Gazizova G., Analysis of LEA proteins evolution in closely related anhydrobiotic species of chironomid midges//FEBS JOURNAL. - 2017. - Vol.284, Is.. - P.322-322.
• Mohammed W.S., Ziganshina E.E., Shagimardanova E.I., Gogoleva N.E., Ziganshin A.M. Draft genome sequence of Paenibacillus sp. EZ-K15 isolated from wastewater systems // BMC Research Notes. - 2017. - Vol. 10. - Art. № 734.
• CDK12: New breast and ovarian cancer predisposition gene in Tatar population? / Shagimardanova E., O Brovkina, M Gordiev, R Enikeev, L Shigapova, D Khodyrev, O. Gusev, A Kedrova, V Kosiy, A Nikitin.// Oxford Journals:Annals of Oncology. - 2017 - V.28. - doi:10.1093/annonc/mdx362.61
• Khaiboullina Svetlana F., Mendelevich Elena G., Shigapova Leyla H., Cerebellar Arophy and changes in Cytokines Associated with the CACNA1A R583Q Mutation in a Russian Familial Hemiplegic Migraine Type 1 Family//FRONTIERS IN CELLULAR NEUROSCIENCE. - 2017. - Vol.11, Is.. - Art. №263.

• L. Shigapova, E. Shagimardanova, O.Gusev, A. Nikitin, M.Gordiev. Frequency of germline mutations genes CHEK, FANCL and FANCI patients with Breast Cancer in the Republic of Tatarstan// Materials of the conference "Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology". Novosibirsk, 29 August- 2 September 2016
• New Antioxidant Genes from an Anhydrobiotic Insect: Unique Structural Features in Functional Motifs of Thioredoxins. A.A. Nesmelov, R.M. Devatiyarov, T.A. Voronina, S.A. Kondratyeva, A. V. Cherkasov, R. Cornette, et al., Bionanoscience. (2016) 6: 568. doi:10.1007/s12668-016-0278-x
• Kozlova O., Cherkasov A., Przhiboro A., Shagimardanova E. Complexity of Expression Control of HSP70 Genes in Extremophilic Midges // BioNanoSci. (2016). doi:10.1007/s12668-016-0256-3
• A.A. Nesmelov, E.I. Shagimardanova, M.D. Logacheva, R. Cornette, T. Kikawada, O.A. Gusev Regulation of thioredoxin genes expression in desiccation-tolerant insect Polypedilum vanderplanki / Abstracts of 10th anniversary International Multiconference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure and Systems Biology. - Novosibirsk, Russia, 29.08-02.09.2016 p. 202.
• Shagimardanova E., Shigapova L., Gusev O., Nikitin A., Druzhkov N.,Enikeev R., Gordiev M. Germline BRCA screening in breast cancer patients in Tatar women population/Shagimardanova E., Shigapova L., Gusev O., Nikitin A., Druzhkov N.,Enikeev R., Gordiev M. //ANNALS OF ONCOLOGY. - 2016. - Vol.27(suppl_6)
• Газизова, Г.Р. Зимнеспящие сони (Gliridae) - новая перспективная модель в космических экспериментах / О.В. Тяпкина, И.М. Вихлянцев, А.А. Пенин, О.С. Козлова, Л.Ф. Нуруллин, Е.И. Шагимарданова, О.А. Гусев // Сборник тезисов XVI Конференции по космической биологии и медицине с международным участием, школа молодых ученых, 5-8 декабря 2016, Москва. - 2016. - с. 47-48
• E. Shagimardanova, L. Shigapova. Germline BRCA screening in breast cancer patients in Tatar women population/E. Shagimardanova, L. Shigapova, O. Gusev, A. Nikitin, M. Druzhkov, R. Enikeev and M. Gordiev// Oxford Journals:Annals of Oncology. - 2016 - V.27. - doi:10.1093/annonc/mdw364.26
• Шигапова Л.Х., Шагимарданова Е.И., Никитин А.Г., Гордеев М.Г., Гусев О.А. Выявление фаундер-мутаций в генах BRCA1 и BRCA2 в популяции женщин с татарским этносом/ Cборник тезисов международной конференции "Трансляционная Медицина-2016",13-14 откября 2016, Казань - 2016. - C. 115
• Бровкина О.И. Гены BRCA1 И BRCA2: популяционные особенности развития рака молочной железы у татарских женщин /Бровкина О.И., Гордиев М.Г., Шигапова Л.Х., Дружков М.О., Шагимарданова Е.И., Еникеев Р.Ф., Ходырев Д.С., Гусев О.А., Никитин А.Г.// Журнал: «Медицинская генетика«.- М., 2016.- №10(172).- С. 50-52
• Газизова, Г.Р. Анализ экспрессии семафоринов – белков, вовлеченных в регуляцию зимней спячки сонь-полчков / Г.Р. Газизова, О.С. Козлова, О.В. Тяпкина, Л.Ф. Нуруллин, Е.И. Шагимарданова // Сборник тезисов международной конференции «Трансляционная медицина -2016», 13-14 октября 2016, Казань. - 2016. - С. 22

• Gusev O.A. Single cell molecular toolkit for inducible resistance to complete desiccation / O.Gusev, A.Nesmelov, R.Deviatiarov, E.Shagimardanova, J.Okada, R.Cornette, M. Logacheva, A. Penin, A. Forrest, T.Kikawada // Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology (16-19 July 2015, Moscow, Russia). - Moscow, 2015. - p.146-147
  61.pdf
• A.Nesmelov, E.Shagimardanova, M.Logacheva, R.Cornette, T. Kikawada, O. Gusev Antioxidant system of desiccation-tolerant insect Polypedilum vanderplanki / Proceedings of the International Moscow Conference on Computational Molecular Biology. - Moskow, Russia, 16.07-19.07.2015 p. 174-176
  174.pdf

• Vladimir Evtugyn Morphological changes associated with induced complete desiccation resistance in the cell line derived from an anhydrobiotic insect Vladimir Evtugyn, Jun Okada, Elena Shagimardanova, Takashi Okuda, Takahiro Kikawada, Oleg Gusev 23-27 March, Pornichet France
• Патент 2510821 Российская федерация, ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS PUMILUS МК-10 С НИЗКОЙ ПРОТЕОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ / М.Р. Шарипова, Н.П. Балабан, А.А. Ризванов, А.М. Марданова, М.Р. Каримова, Е.И. Шагимарданова, А.А. Тойменцева, Ч. Нямсурэн // Заявка: 2012145332/10, 24.10.2012. Опубликовано: 10.04.2014
• Bacterial enzymes effectively digest Alzheimer's В-amyloid peptide
  2014_Bacterial_enzymes_effectively_digest_Alzheimer_s_B_amyloid_peptide.pdf
• Gusev O., Suetsugu Y., Cornette R.,Kawashima T., Logacheva M., Kondrashov A.,Penin A., Hatanaka R., Kikuta Sh., Shimura S., Katayose Y.,Matsumoto T., Shagimardanova E., Alexeev D.,Govorun V., Wisecaver J., Mikheyev A., Koyanagi R., Nishiyama T., Shigenobu Sh., Shibata T., Galygina V., Hasebe M., Okuda T., Satoh N. and Kikawada T. Comparative genome sequencing reveals genomic signature of extreme desiccation tolerance in the anhydrobiotic midge. Nature Communications, 5, 4784; doi:10.1038/ncomms5784

• Шагимарданова Е.И., Маликова А.З., Захаров И.С. Гусев О.А., Окуда Т, Шарипова М.Р. Выделение и идентификация микробных симбионтов хирономиды Polipedilum vanderplanki.. Материалы Международной конференции Биология –наука XXI века. Москва – Россия - 24. Мая 2012. С. 1042-1043.
• Toymentseva А.А. Bacillus pumilus Strains with Inactivated Genes of Extracellular Serine Proteinases / А.А. Toymentseva, A.I. Akhmetova, M.R. Karimova, C. Nyamsuren, Yu.O. Ponomareva, E.I. Shagimardanova, A.A. Rizvanov, M.R. Sharipova // Microbiology. – 2013. – Vol.82. No.1. – P.59-68.
• Toymentseva A.A, Akhmetova A.I, Karimova M.R, Bacillus pumilus strains with inactivated genes of extracellular serine proteinases//Microbiology (Russian Federation). - 2013. - Vol.82, Is.1. - P.59-67.
• Патент № 2511416. ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS PUMILUS 2А-5 С НИЗКОЙ ПРОТЕОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТЬЮ, ПОВЫШЕННОЙ АКТИВНОСТЬЮ ФОСФАТАЗЫ, СПОСОБ ЕГО ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Авторы: М. Р. Шарипова, Н. П. Балабан, А. М. Марданова, А. И. Ахметова, А. Д. Мухаметзянова, Е. И. Шагимарданова, А. А. Тойменцева, Ч. Нямсурэн. Заявка № 2012145331/10(072895) от 16.12.2013.
• А.А.Тойменцева,А.И.Ахметова,М.Р.Каримова,Ч.Нямсурэн,Ю.О.Пономарева,Е.И.Шагимарданова,А.А.Ризванов,М.Р.Шарипова / ШТАММЫ BACILLUS PUMILUS С ИНАКТИВИРОВАННЫМИ ГЕНАМИ ВНЕКЛЕТОЧНЫХ СЕРИНОВЫХ ПРОТЕИНАЗ // МИКРОБИОЛОГИЯ, 2013, том 82, № 1, с. 1–10

• Е.И. Шагимарданова, М.Р. Шарипова, А.А. Ризванов, И.С. Захаров, О.А. Гусев. Жизнь без воды: криптобиоз беспозвоночных как модель для разработки технологии консервации биоматериала нового поколения. Клеточная трансплантология и тканевая инженерия. 2012. Т.3. №7. С. 185-189.
• Shagimardanova E.I, Sharipova M.R, Rizvanov A.A, Life without water: Cryptobiosis of invertebrates as a model for next generation techmology of biomaterials preservation//Cellular Transplantation and Tissue Engineering. - 2012. - Vol.7, Is.3. - P.185-189.
• Шагимарданова Е.И., Захаров И.С.Гусев О.А., Окуда Т, Шарипова М.Р. Идентификация видового состава микробиоты, населяющей африканскую хирономиду Polypedilumvanderplanki. IX Научная конференция молодых ученых, аспирантов и студентов научно-образовательного центра Казанского государственного университета "Материалы и технологии XXI века". Сбоник тезисов. – Казань. – Россия. – 2012. – С. 94.

• Сабирова А.Р. Мембраносвязанные металлопротеиназы бактерий / Сабирова А.Р., Рудакова Н.Л., Шагимарданова Е.И., Балабан Н.П., Шарипова М.Р. // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2011. – Т.153, кн. 2. – С. 89-95.
  F_92567422.pdf

• Тойменцева А.А., Шагимарданова Е.И., Каюмов А.Р., Шарипова М.Р. Влияние делеций в промоторе на экспрессию гена глутамилэндопептидазы Bacillus intermedius // Ученые Записки Казанского университета. Серия Естественные науки. - 2010. - Т.152, кн.3. - С.149-159.