• Probiotics on a Mineral Zeolite-containing Carrier / O. N. Ilinskaya, A. G. Galeeva, M. A. Kharitonova, A. I. Kolpakov, M. S. Glukhov and O. N. Lopatin // Microbiology, 2023, Vol. 92, Suppl. 1, pp. S37–S40

• Ильинская О.Н. Микробиом лечебных грязей, применяемых в Татарстане / Ильинская О.Н., Гафарова Л.Ф., Курди У., Колпаков А.И., Яковлева Г.Ю. // Вопросы курортологии, физиотерапии и лечебной физической культуры. -2023; -Т.100, №5: -С.27‑35 .
• Ильинская О.Н., Гафарова Л.Ф., Курди У., Колпаков А.И., Яковлева Г.Ю. Микробиом лечебных грязей, применяемых в Татарстане. Вопросы курортологии, физиотерапии и лечебной физической культуры. 2023;100(5):27‑35. Ilinskaya ON, Gafarova LF, Kurdy W, Kolpakov AI, Yakovleva GYu. Microbiome of therapeutic muds used in Tatarstan. Voprosy kurortologii, fizioterapii, i lechebnoi fizicheskoi kultury. 2023;100(5):27‑35. (In Russ.) https://doi.org/10.17116/kurort202310005127
• Гафарова Л. Ф. Характеристика бактериального сообщества сакскойлечебной грязи, применяемой в санаториях Татарстана/ Л.Ф Гафарова., А.И.Колпаков, О.Н.Ильинская // Ученые записки Крымского федерального университета имени В. И. Вернадского. Биология. Химия. -2023, Т. 9(75), № 4. -С. 3–13.
• Ильинская О.Н. Пробиотики на минеральном цеолитсодержащем носителе / О.Н. Ильинская, А.Г. Галеева, М.А. Харитонова, А.И. Колпаков, М.С. Глухова, О.Н. Лопатин // Микробиология. – 2023. – Т.92 (спецвыпуск). – С. 37-40. DOI: 10.1134/S002626172360372X

• Харитонова М.А. Посев, культивирование и микроскопия микроорганизмов: учебно-методическое пособие / М.А. Харитонова, Ф.Г. Куприянова-Ашина, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2022. – 36 с.
• Харитонова М.А., Куприянова-Ашина Ф.Г., Кузнецова О.Ю., Колпаков А.И., Ильинская О.Н. Микробиологический анализ эффективности антисептиков и дезинфектантов / М.А.Харитонова, Ф.Г.Куприянова-Ашина ,О.Ю.Кузнецова, А.И.Колппаков, О.Н.Ильинская - Казань: Издательство Казанского университета, 2022 - 33 с.

• Gataullin B.I, Gataullin I.G, Nga N.T, Analysis of the intestinal microbiome in colorectal cancer [Рэрышч ъшјхїэюую ьшъ№юсшюьр я№ш ъюыю№хъђрыќэюь №ръх]//Kazan Medical Journal. - 2021. - Vol.102, Is.2. - P.185-191.
• Гатауллин Б.И. Анализ кишечного микробиома при колоректальном раке / Б.И.Гатауллин, И.Г.Гатауллин, Н.Т.Нга, А.И.Колпаков, О.Н.Ильинская // Казанский медицинский журнал. -2021. -Т.102, №2. -с.185-191.

• Makhnovskii P.A, Zgoda V.G, Bokov R.O, Regulation of Proteins in Human Skeletal Muscle: The Role of Transcription//Scientific Reports. - 2020. - Vol.10, Is.1. - Art. № 3514.
• Куприянова-Ашина, Ф.Г. Кальциевые сигналы микромицетов и их детекция с помощью рекомбинантного экворина: учебно-методическое пособие / Ф.Г. Куприянова-Ашина, М.А. Харитонова, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2020. – 55 с.
• Секретируемые щелочные рибонуклеазы микромицетов // Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки. - 2020. - Т.162, кн.3. - С.335-349.
• Shah Mahmud R. Bacillus pumilus ribonuclease rescues mice infected by double-stranded RNA-containing reovirus serotype 1 / R. Shah Mahmud, M.A Efimova, V. Ulyanova, R. Ravilov, E. Shuralev, A. Kolpakov, O. Ilinskaya // Virus Research. - 2020. - V.286. - Art. № 198086. DOI: 10.1016/j.virusres.2020.198086
• Workbook for practical microbiology: study guide/ E.A. Sokolova, P.V. Zelenikhin, A.I. Kolpakov, O.N. Il'inskaya - Kazan: Publishing House of Kazan University, 2020. - 56p.

• Vankov P. Secreted alkaline ribonucleases of micromycetes / Vankov. P., Ulyanova V., Zelenikhin P., Shah Mahmud R., Kolpakov A., Ilinskaya O. // Interaction: from cell to human: abstract book of the Russian-German seminar dedicated to the 30th anniversary of the partnership agreement between the Justus Liebig University (Giessen) and Kazan (Volga region) Federal University, 20-24 May, 2019 – Kazan: Publishing House of Kazan University, 2019 – P. 75.
• Харитонова М.А. Методы культивирования и анализ результатов посевов микроорганизмов: учебно-методическое пособие / М.А. Харитонова. – Казань: Изд-во Казан. ун-та, 2019. – 35с.
• Рабочая тетрадь для лабораторных занятий по микробиологии : учебно-методическое пособие. Рабочая тетрадь подготовлена в соответствии с учебной программой «Микро-биология, вирусология» по специальностям 31.05.01 «Лечебное дело», 30.05.01 «Медицинская биохимия», 30.05.02 «Медицинская биофизика», 30.05.03 «Медицинская кибернетика», 31.05.03 «Стоматология», 33.05.01 «Фармация». Содержит планы занятий и задания для выполнения лабораторных работ по изучаемым темам.

• Ефимова М.А. Рибонуклеаза Bacillus pumilus препятствует проникновению в клетки и репродукции вируса HSV 1/ М.А. Ефимова, Р. Шах Махмуд, А.И. Никитин, А.Н. Чернов, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2018. - Т. 36, №. 2. - С. 109-112. www.doi.org/10.18821/0208-0613-2018-36-2-109-112
• Зеленихин П.В. Антипролиферативное и апоптозиндуцирующее действие олигохитозанов, полученных деполимеризацией в присутствии азотистой кислоты / П.В. Зеленихин , Е.В. Субакаева , С.Н. Куликов, Е.А. Соколова, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Известия Уфимского научного центра РАН. - 2018. - №3(2). - С.13-17.
• Efimova М.А. Ribonuclease from Bacillus pumilus Prevents HSV-1 Entrance into the Cell and Reproduction / M. A. Efimova, R. Shah Mahmud, A. I. Nikitin, A. N. Chernov, A. I. Kolpakov, O. N. Ilinskaya // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. - 2018. - Т. 33, №. 2. - С. 147-150. www.doi.org/10.3103/S0891416818020076
• Зеленихин П.В. Оценка взаимодействия хитозанов с бактериальной рибонуклеазой биназой [Текст] / Зеленихин П.В., Сабирова М.И., Надырова А.И., Колпаков А.И., Ильинская О.Н. // Известия Уфимского научного центра Российской академии наук.- 2018.- №3(3).- С.14-17.
  Zelenikhinkhitozan_2018.pdf
• Дудкина Елена Владимировна, Ульянова Вера Владимировна, Сурченко Юлия Владимировна, Нгуен Тхи Нга, Колпаков Алексей Иванович, and Ильинская Ольга Николаевна. «КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА БИНАЗЫ НЕ ОТРАЖАЕТ ЕЕ НАТИВНУЮ КОНФОРМАЦИЮ« Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки, vol. 160, no. 4, 2018, pp. 591-600.
• Зеленихин П.В. Оценка взаимодействия хитозанов с бактериальной рибонуклеазой биназой [Текст] / Зеленихин П.В., Сабирова М.И., Надырова А.И., Колпаков А.И., Ильинская О.Н. // Известия Уфимского научного центра Российской академии наук.- 2018.- №3(3).- С.14-17.
• Зеленихин П.В. Оценка взаимодействия хитозанов с бактериальной рибонуклеазой биназой [Текст] / Зеленихин П.В., Сабирова М.И., Надырова А.И., Колпаков А.И., Ильинская О.Н. // Известия Уфимского научного центра Российской академии наук.- 2018.- №3(3).- С.14-17.
• Зеленихин П.В. Оценка взаимодействия хитозанов с бактериальной рибонуклеазой биназой [Текст] / Зеленихин П.В., Сабирова М.И., Надырова А.И., Колпаков А.И., Ильинская О.Н. // Известия Уфимского научного центра Российской академии наук.- 2018.- №3(3).- С.14-17.
• Bajazitova, A.A. Application of Image Processing in Adaptation of Yeast to Environmental Conditions, Optimized by Autogegulatory Molecules and PSO / A.A. Bajazitova, F.G. Kupriyanova-Ashina, A.I. Kolpakov, M.A. Kharitonova, O.N. Ilinskaya // International Journal of Engineering & Technology – 2018 – V.7, № 4.7. – P. 1-4
  F_Flera_Yeast.pdf

• Шах Махмуд Р. Бактериофаги почвенных бацилл: Новый поливалентный фаг Bacillus altitudinis / Р. Шах Махмуд, К. И. Гарифулина, В. В. Ульянова, В. Г. Евтюгин, Л. Н. Миндубаева, Е. В. Дудкина, В. И. Вершинина, А. И. Колпаков, О. Н. Ильинская // Молекулярная генетика микробиология и вирусология. - 2017. -Т. 35, № 2. - С. 59-64. DOI 10.18821/0208-0613-2017-35-2-59-64
• Ефимова М.А. ЭКЗОГЕННАЯ РНКАЗА BACILLUS PUMILUS (БИНАЗА) ПОДАВЛЯЕТ РЕПРОДУКЦИЮ РЕОВИРУСА СЕРОТИПА 1 / М.А. Ефимова, Р. Шах Махмуд, П.В. Зеленихин, М.И. Сабирова, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Молекулярная биология. - 2017. - Т. 51. - № 1. - P. 111-117.
• Efimova M. A. Exogenous Bacillus pumilus RNase (binase) suppresses the reproduction of reovirus serotype 1 / M. A. Efimova, R. Shah Mahmud, P. V. Zelenikhin, M. I. Sabirova, A. I. Kolpakov, O. N. Ilinskaya // Molecular Biology. - 2017. - V. 51, I. 1. - P. 96–101.
• Sokurenko Y. Mg2+ enhances the formation of 2',3'-cGMP, an intermediate of RNA cleavage by binase / Y. Sokurenko, A. Kolpakov, O. Ilinskaya // BioNanoScience. - 2017. - V. 7. - № 1. - P. 167-169.
• Kharitonova M.A. Pleiotropic ef-fect of salt stress on motility and synthesis of secreted ribonucleases by Bacillus pumilus / M.A. Khari-tonova, V.G. Evtugyn, A.I. Kolpakov // BioNanoScience. – 2017. – V.7, I. 4. – P. 623 - 626.
  Kharitonova_et_al_2017_BioNanoScience.pdf
• Shah Mahmud R. Bacteriophages of soil bacilli: A new multivalent phage of Bacillus altitudinis / R. Shah Mahmud, K. I. Garifulina, V. V. Ulyanova, V. G. Evtugyn, L. N. Mindubaeva, L. R. Khazieva, E. V. Dudkina, V. I. Vershinina, A. I. Kolpakov, O. N. Ilinskaya // Mol. Gen. Microbiol. Virol. - 2017. - V. 32, I. 87. - P. 87-93. DOI:10.3103/S0891416817020082
• Баутиста Х. Выделение галотолерантных нефтеокисляющих бактерий − продуцентов биосурфактантов из прибрежного шельфа северной Кубы/ Баутиста Х., Эрнандес-Гомес Т., Кардинале М.,Колпаков А.И , Багаева Т.В// 1-ый Российский Микробиологический Конгресс. 2017.- c.113
• Shah Mahmud R. Bacteriophages of soil bacilli: A new multivalent phage of Bacillus altitudinis / R. Shah Mahmud, K. I. Garifulina, V. V. Ulyanova, V. G. Evtugyn, L. N. Mindubaeva, L. R. Khazieva, E. V. Dudkina, V. I. Vershinina, A. I. Kolpakov, O. N. Ilinskaya // Mol. Gen. Microbiol. Virol. - 2017. - V. 32, I. 87. - P. 87-93. DOI:10.3103/S0891416817020082
• Kharitonova M.A. Salt stress induced biosynthesis of binase ii, the second Bacillus pumilus 7p ribonuclease with therapeutic potential /Кharitonova М.А. , А.I.Kolpakov., O.N. //BioNanoScience. -2017. -V.7, (1). –P. 148-150.

• Dudkina E. Three-step procedure for preparation of pure Bacillus altitudinis ribonuclease / E. Dudkina, V. Ulyanova, R. Shah Mahmud, V. Khodzhaeva, L. Dao, V. Vershinina, A. Kolpakov, O. Ilinskaya // FEBS Open Bio. - 2016. - V. 6., I. 1. - P. 24-32. doi: 10.1002/feb4.12023
  Three_step_procedure_for_preparation_of_pure_Bacillus_altitudinis_ribonuclease.pdf
• Нгуен, Н.Т. Молекулярно-генетический анализ микроорганизмов с внутриэпителиальной инвазией, выделенных от больных колоректальным раком/Н.Т.Нгуен, Р.Р. Вафин, И.В.Ржанова, А.И.Колпаков, И.Г.Гатауллин, С.В. Тюлькин, М.Н.Синягина, Т.В.Григорьева, О.Н.Ильинская // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. -2016. №1. –C.13-18.
  MGMV16_Colorec.pdf
• Dudkina E. Three-step procedure for preparation of pure Bacillus altitudinis ribonuclease / E. Dudkina, V. Ulyanova, R. Shah Mahmud, V. Khodzhaeva, L. Dao, V. Vershinina, A. Kolpakov, O. Ilinskaya // FEBS Open Bio. - 2016. - V. 6., I. 1. - P. 24-32. doi: 10.1002/feb4.12023
• Kalimullina E.T, Bayazitova A.A, Nizamov I.S, Impact of exogenous autoregulators of intercellular communication in yeast on the growth of Saccharomyces cerevisiae//International Journal of Pharmacy and Technology. - 2016. - Vol.8, Is.4. - P.24496-24507.
• Sokurenko, Yulia The Role of Metals in the Reaction Catalyzed by Metal-Ion-Independent Bacillary RNase [text] / Yulia Sokurenko, Vera Ulyanova, Pavel Zelenikhin, Alexey Kolpakov, Dieter Müller, Dmitriy Blokhin, Vladimir Klochkov and Olga Ilinskaya //Bioinorganic Chemistry and Applications .- 2016.- Volume 2016, Article ID 4121960, 7 pages. http://dx.doi.org/10.1155/2016/4121960
• Sokurenko Y, Ulyanova V, Zelenikhin P, Kolpakov A., Müller D., Blokhin D, Klochkov V, Ilinskaya O. The Role of Metals in the Reaction Catalyzed by Metal-Ion-Independent Bacillary RNase//Bioinorganic Chemistry and Applications. - 2016. - Vol.2016, Is.. - Art. № 4121960. http://dx.doi.org/10.1155/2016/4121960
• Nguyen N.T, Vafin R.R, Rzhanova I.V, Molecular genetic analysis of microorganisms with intraepithelial invasion isolated from patients with colorectal cancer//Molecular Genetics, Microbiology and Virology. - 2016. - Vol.31, Is.1. - P.15-20.

• Сокуренко Ю. В. Идентификация 2',3'-cGMP как интермедиата каталитического расщепления РНК биназой и оценка его биологического действия / Ю. В. Сокуренко, П. В. Зеленихин, В. В. Ульянова, А. И. Колпаков, Д. Мюллер, О. Н. Ильинская // Биоорг. хим. - 2015. - Т. 41, №1. - С. 37-43.
• Sokurenko, Yu.V., Zelenikhin, P.V., Ulyanova, V.V., Kolpakov, A.I., Muller, D., Ilinskaya, O.N. Identification of 2′,3′-cGMP as an intermediate of RNA catalytic cleavage by binase and evaluation of its biological action // Russian Journal of Bioorganic Chemistry.- V. 41, I. 1 , P. 31-36.
• Sokurenko Yu.V. Identification of 2',3'-cGMP as an intermediate of RNA catalytic cleavage by binase and evaluation of its biological action / Yu.V. Sokurenko, P.V. Zelenikhin, V.V. Ulyanova, A.I. Kolpakov, D. Muller, O.N. Ilinskaya // Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 2015. - V. 41, I. 1, - P. 31-36. doi: 10.1134/S1068162015010136.
• Калимуллина, Э.Т. Особенности роста культуры Saccharomyces сerevisiae в присутствии экзогенных ауторегуляторов клеточной плотности популяции [Текст]/Э.Т. Калимуллина, А.Б. Маргулис, А.И. Колпаков, Ф.Г. Куприянова-Ашина// Ученые записки Казанского университета. Серия естественные науки. -2015. –Т.157, кн.4. –с.27-38.
• Пат.2567670 Российская Федерация МПК 2010: C12N 9/22; A61K 38/00; A61K 38/43. Cредство для селективной апоптической элиминации опухолевых клеток / А.А.Макаров, О.Н.Ильинская, А.И.Колпаков. П.В.Зеленихин, В.А.Митькевич, И.Ю.Петрушанко. №2014109636/10, заявл. 13.03.2014; опубл. 10.11.2015 Бюл. № 31.

• Чернов, В.М. Микоплазменные контаминации клеточных культур: везикулярный трафик у бактерий и проблема контроля инфектогенов/ В.М.Чернов, О.А.Чернова, Х.Т. Санчес-Вега, А.И.Колпаков, О.Н.Ильинская // Acta Naturae. 2014. Т.6, №3 (22). –С.43-54.
• Chernov V.M, Chernova O.A, Sanchez-Vega J.T, Mycoplasma contamination of cell cultures: Vesicular traffic in bacteria and control over infectious agents//Acta Naturae. - 2014. - Vol.6, Is.22. - P.41-51.
• Захаров, И.С. Генотоксические эффекты новых гиперразветвленных полимеров [Текст] / И.С. Захаров, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская, И.С. Низамов, В.Я. Пономарев, А.Б. Маргулис // Вестник Казанского технологического университета.- 2014.- Т.17, №14.- С. 367-369.

• Митько, В.Е. Токсические и генотоксические эффекты новых синтезированных фуранонов и их галогенированных производных / В.Е. Митько, А.Б. Маргулис, В.Я. Пономарев, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Вестник Казанского технологического университета.- 2013.- Т.16, №11.- С.211-213.
• Белоногова, Н.В. Галогенированные фураноны как модификаторы физиологической активности Staphylococcus aureus / Н.В. Белоногова, Т.С. Бардина, В.Я. Пономарев, А.И. Колпаков, А.Б. Маргулис, О.Н. Ильинская // Вестник Казанского технологического университета.- 2013.- Т.16, №15.- С. 100-102.
• Несмелов А.А. Биоинформационный поиск новых механизмов цитотоксического действия биназы [Текст] / А.А. Несмелов, М.И. Маркелова, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Ученые записки Казанского государственного университета. Естественные науки.- 2013. - Т.155. - Кн.3. - С.221-230
• Митько, В.Е. Токсические и генотоксические эффекты новых синтезированных фуранонов и их галогенированных производных / В.Е. Митько, А.Б. Маргулис, В.Я. Пономарев, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Вестник Казанского технологического университета.- 2013.- Т.16, №11.- С.211-213.
• Cabrera-Fuentes, H.A. Internalization of Bacillus intermedius ribonuclease (BINASE) induces human alveolar adenocarcinoma cell death [Text] / H.A. Cabrera-Fuentes, M. Aslam, M. Saffarzadeh, A. Kolpakov, P. Zelenikhin, K.T. Preissner, O.N. Ilinskaya // Toxicon.- 2013.- V.69.- P.219-226

• Cabrera-Fuentes, H.A. Binase penetration into alveolar epithelial cells does not induce cell death [Text] / H.A. Cabrera-Fuentes, N.V. Kalacheva, R.T. Mukhametshina, P.V. Zelenikhin, A.I. Kolpakov, G. Barreto, K.T. Preissner, O.N. Ilinskaya // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry.- 2012.- V.6, N.4.- P.316-320.
• Кабрера-Фуентес, Э.А. Проникновение биназы в клетки альвеолярного эпителия легких не индуцирует их гибель [Текст] / Э.А. Кабрера-Фуентес, Н.В. Калачева, Р.Т. Мухаметшина, П.В. Зеленихин, А.И. Колпаков, Г. Баррето, К.Т. Прайсснер, О.Н. Ильинская // Биомедицинская химия.- 2012.- Т.58, вып.3.- С.272-281.
• Кабрера-Фуентес, Э.А. РНКаза с противоопухолевым действием (биназа) вызывает изменение клеточной проницаемости / Э.А. Кабрера-Фуентес, П.В. Зеленихин, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Клеточная трансплантология и тканевая инженерия.- 2012.- Т.7, №3. C.72-76
• Zelenikhin P.V, Makeeva A.V, Nguen T.N, The combined action of binase and bleomycin on human lung adenocarcinoma cells//Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. - 2016. - Vol.10, Is.1. - P.87-90.Karamova N.S, Zelenikhin P.V, Miroshnik N.B, Apoptosis-inducing activity of bacillus pumilus ribonuclease and some egyptian medicinal plants extracts on human alveolar adenocarcinoma cells//Genes and Cells. - 2015. - Vol.10, Is.3. - P.62-67.Kulikov Sergey N., Lisovskaya Svetlana A., Zelenikhin Pavel V., Antifungal activity of oligochitosans (short chain chitosans) against some Candida species and clinical isolates of Candida albicans: Molecular weight-activity relationship//EUROPEAN JOURNAL OF MEDICINAL CHEMISTRY. - 2014. - Vol.74, Is.. - P.169-178.Cabrera-Fuentes H.A, Aslam M, Saffarzadeh M, Internalization of Bacillus intermedius ribonuclease (BINASE) induces human alveolar adenocarcinoma cell death//Toxicon. - 2013. - Vol.69, Is.. - P.219-226.Cabrera Fuentes H.A, Katacheva N.V, Mukhametshina R.T, Binase penetration into alveolar epithelial cells does not induce cell death//Biomeditsinskaya Khimiya. - 2012. - Vol.58, Is.3. - P.272-280.
• Белоногова, Н.В. Гомосеринлактон как модулятор функциональной активности клеток прокариот / Н.В. Белоногова, А.Б. Маргулис, В.Я. Пономарев, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Вестник Казанского технологического университета.- 2012.- Т.15, №23.- С.109-113.
• Колпаков А.И., Куприянова-Ашина Ф.Г. Внеклеточные факторы регуляции развития микроорганизмов Из-во LAP Lambert Aсademic Publishing GmbH & Co.KG, Saarbruecken, Germany, 2012. 155с.
• Маргулис, А.Б. Гомосеринлактон как регулятор индуцибельных и конститутивных ферментов микроорганизмов / А.Б. Маргулис, О.В. Сиадат, Е.В. Никитина, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская // Вестник Казанского технологического университета.- 2012.- Т.15, № 17.- С. 173-176.

• Белоногова, Н.В. Особенности развития стафилококковой инфекции при действии гомосеринлактона in vivo / Н.В.Белоногова, А.И.Колпаков, Б.М.Куриненко, А.Б.Маргулис // "Вестник Уральской медицинской академической науки" (Тематический выпуск по микробиологии, иммунологии и биотехнологии).- 2011.- №4/1(38).- С. 20.

• Роль внутриклеточных NO и АФК в ответе лактобацилл на сигнальные молекулы бактерий гомосеринлактон и гексилрезорцин / А.Б.Маргулис, Д.Р.Яруллина, А.И.Колпаков, О.Н.Ильинская // Ученые записки Казанского государственного университета. Серия Естественные науки.- 2010.- Т.152, кн.2.- С.137-144.
• Гидрофобизованные производные широкопористого криогеля поливинилового спирта: новые возможности применения в биотехнологии / В.Г.Евтюгин, А.Б.Маргулис, О.В.Бушманова, Е.В.Никитина, А.И.Колпаков, Л.Г.Дамшкалн, В.И.Лозинский, О.Н.Ильинская // Вестник Казанского технологического университета
• Физиолого-биохимические изменения S- и R- форм Salmonella typhimurium при действии гексилрезорцина / А.Б.Маргулис, О.В.Бушманова, А.И.Колпаков, О.Н.Ильинская // Материалы Всероссийской конференции Актуальные проблемы современной биохимии и молекулярной биологии.- Казань.- 16-17 сентября 2010 г.- С. 33.
• Кабрера Фуентес Э.А., Зеленихин П.В., Колпаков А.И., Прайсснер К.Т., Ильинская О.Н. Сравнительная цитотоксичность биназы по отношению к опухолевым и нормальным клеткам // Учен. зап. Казан. ун-та. Сер. Естеств. науки. – 2010. – Т. 152, кн. 3. – С. 143–148.
• ГИДРОФОБИЗОВАННЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ ШИРОКОПОРИСТОГО КРИОГЕЛЯ ПОЛИВИНИЛОВОГО СПИРТА: НОВЫЕ ВОЗМОЖНОСТИ ПРИМЕНЕНИЯ В БИОТЕХНОЛОГИИ Вестник Казанского технологического университета. 2010. № 9. С. 89-96.
• Яруллина, Д.Р. Высокотемпературный стресс активирует синтез оксида азота у Lactobacillus plantarum / Д.Р.Яруллина, О.А.Смоленцева, А.И.Колпаков, О.Н. Ильинская //Доклады Академии Наук 2010. Т. 430, № 5, С. 709-711
• Ильинская О.Н. Международная конференция "Ферменты микроорганизмов в биотехнологии и медицине" [Текст] / О.Н.Ильинская, А.И.Колпаков, Н.В.Феоктистова, Д.Р.Яруллина //Вестник РФФИ. -2010. №1 (65) январь-март. -С.33-37.
• Ильинская О.Н., Балабан Н.П., Вершинина В.И., Шарипова М.Р., Колпаков А.И., Зеленихин П.В. Стрептомицинустойчивый штамм Bacillus sp.ВКПМ В-9862- продуцент внеклеточной щелочной рибонуклеазы // Патент № 2384619 от 20.03.2010. Заявка № 2008127925/13(034349). Приоритет 08.07.2008. Положительное решение от 1.10.2009

• Изменение функциональной активности бактериальной клетки сопряжено с изменением ее элементного состава /А.Б. Маргулис, А.В. Волошин, А.Х. Гильмутдинов, А.И. Колпаков, О.Н. Ильинская//Доклады Академии наук.2009.Т.427, №4.С.553-556
• Сорбция микроорганизмов крупнопористыми агарозными криогелями, содержащими привитые алифатические цепи различной длины / В.Г.Евтюгин, А.Б.Маргулис, Л.Г.Дамшкалн, В.И.Лозинский, А.И.Колпаков, О.Н.Ильинская // Микробиология. 2009. Т.78, №5, 667-673
• Chernov V.M., Chernova O.A., Margulis A.B., Mouzykantov A.A., Baranova N.B., Medvedeva E.S., Kolpakov A.I., Ilinskaya O.N. Genotoxic effects of mycoplasma cells (A. laidlawii PG8, M. gallisepticum S6, M. hominis PG37) formed in different growth conditions // Am. Eurasian J. Agric. Environ. Sci. – 2009. – Vol. 6, N 1. – P. 104-107.
• Margulis A.B. Alteration of bacterial cell activity results in element composition change [Text] / A.B. Margulis, A.V. Voloshin, A.K. Gil'mutdinov, A.I. Kolpakov, O.N. Ilinskaya // Doklady Biochemistry and Biophysics. 2009. Т. 427. № 1. С. 202-205
• Евтюгин В.Г., Маргулис А.Б., Дамшкалн Л.Г., Лозинский В.И., Колпаков А.И., Ильинская О.Н. Сорбция микроорганизмов крупнопористыми агарозными криогелями, содержащими привитые алифатические цепи различной длины. // Микробиология, 2009. Т.78, №5.- С.603-608.
• Genotoxic effects of mycoplasma cells (A. laidlawii PG8, M. gallisepticum S6, M. hominis PG37) formed in different growth conditions / V.M. Chernov, O.A. Chernova, A.B. Margulis, A.A. Mouzykantov, N.B. Baranova, E.S. Medvedeva, A.I. Kolpakov, O.N. Ilinskaya // American-Eurasian J. Agric.&Environ.Sci. 2009. V. 104-107. P. 104-106.

• Зеленихин, П.В. Избирательная цитотоксичность биназы в отношении фибробластов, экспрессирующих онкогены AMLи AML/ETO [Текст]/ П.В.Зеленихин, А.И.Колпаков, В.А.Митькевич, Д.Р.Сафиуллина, О.Н.Ильинская, А.А.Макаров// Ученые записки Казанского государственного университета. Серия естественные науки. -2008. Т.150, кн.4. С.268-273.
• Чернов В.М., Чернова О.А., Горшков О.В., Музыкантов А.А., Шаймарданова Г.Ф., Пельникевич А.Д., Маргулис А.Б., Колпаков А.И., Ильинская О.Н. Адаптация Mycoplasma gallisepticum к неблагоприятным условиям роста: изменение морфологических и физиологических свойств// Микробиология.2008. Т.77,№6. С.777- 781.

• Микробная биотехнология, - Казань:Изд-во КГУ, 2007.- 426с.

• Генотоксические эффекты микробного сигнального агента " гомосеринлактона / А.Б.Маргулис, О.В.Бушманова, И.В.Ожиганова, А.И.Колпаков, О.Н.Ильинская // Ученые записки Казанского государственного университета.- Т.148.- Серия Естественные науки.- Кн.2.- 2006.-С.83-89.

• Маргулис А.Б. Индукция гипометаболических форм у неспорообразующих грамположительных бактерий / А.Б.Маргулис, О.Н.Ильинская, А.И.Колпаков, К.Муфер // Ученые записки Каз.гос. уни-та. -2005. Т.147, кн.2. Естественные науки. С.108-114.
• Зеленихин П.В., Колпаков А.И., Черепнев Г.В., Ильинская О.Н. Индукция апоптоза опухолевых клеток биназой. Молекулярная биология, 2005, 39, 3, 404-409

• Pavel Zelenikhin, Olga Ilinskaya, Nazira Karamova,Anna Margulis, Alexey Kolpakov. Cytotoxic and genotoxic effects of the -(triphenylphosphonio)ethyl carboxylate and of the N,N?-bis(dihexylphosphinoylmethyl)-1,4-diaminocyclohexane. Medical Science Monitor. -2004. – V. 10 (8). - BR 294-299.

• Margulis A.B, Il'inskaya O.N, Kolpakov A.I, Induction of SOS response by autoregulatory factors of microorganisms//Genetika. - 2003. - Vol.39, Is.9. - P.1180-1184.
• Хитиназы энтеробактерий Serratia marcescens

• Il'inskaya O.N, Kolpakov A.I, Schmidt M.A, The role of bacterial growth autoregulators (alkyl hydroxybenzenes) in the response of staphylococci to stresses//Mikrobiologiya. - 2002. - Vol.71, Is.1. - P.23-29.

• Doroshenko E.V, Loiko N.G, Ifinskaya O.N, Characterization of bacillus cereus dissociants//Mikrobiologiya. - 2001. - Vol.70, Is.6. - P.811-819.

• Bespalov M.M, Kolpakov A.I, Loiko N.G, The role of microbial dormancy autoinducers in metabolism blockade//Microbiology. - 2000. - Vol.69, Is.2. - P.174-179.
• Kolpakov A.I, Il'inskaya O.N, Bespalov M.M, Stabilization of enzymes by dormancy autoinducers as a possible mechanism of resistance of resting microbial forms//Microbiology. - 2000. - Vol.69, Is.2. - P.180-185.