Сейчас в связи с распространением и удешевлением технологий метагеномики получило развитие одно из ее интересных направлений — экзогеномика видов. Это метод выявления ДНК конкретного вида в той или иной среде, и соответственно, уточнение его экологических предпочтений, генетического разнообразия и т. д.  Ученые показали, что можно выяснить с большой надежностью и генетическое разнообразие, и численность акул, выделив их ДНК из проб воды, где они собираются в большие группы. В водной среде ДНК живет не слишком долго, не больше месяца, поэтому обнаружение ДНК того или иного вида свидетельствует о его недавнем присутствии.