В Институте международных отношений, истории и востоковедения работают 10 НОЦ: "Античность и современность", "Институционализация конфликта как средство обеспечения социальной безопасности", "История и культура еврейского народа (Центр иудаики)", "Письменное наследие и археография", "Центр германских исследований", "Центр польских исследований", "Истоприя и культура тюрко-татарских государств", "Центр евразийских исследований", "Методика преподавания истории и обществознания в высшей и средней школе", "Тюркский мир".