Размер шрифта: A A A Цвет сайта: A A A

НИР

Научные исследования ,НИР, кафедра медицинской физики, ЯМР, МРТ, молекулярные системы, биомедицинские исследования

Научно-исследовательская работа ведется в рамках ОНН КФУ «Исследования медико-биологических систем физическими методами» (29.03.37, 34.17) (соруководители:  проф. А.В.Аганов, проф. В.Д.Скирда) по следующим тематикам

Поддержанные проекты Проекты сотрудников кафедры медицинской физики за последние 5 лет:

  • Министерство образования и науки РФ. Ведомственная целевая программа. Виртуальная научно-исследовательская лаборатория «ЯМР – Структура», проект «Терпеноиды» (2014 г.). Приказ ректора 01-06/305 от 24.03.2014.
  • Министерство образования и науки РФ. Ведомственная целевая программа. Виртуальная научно-исследовательская лаборатория «ЯМР – Структура», проект «Инсулин» (2014 г.). Приказ ректора 01-06/306 от 24.03.2014.
  • Министерство образования и науки РФ. Бюджетное финансирование. Проект № 2611. «Исследование особенностей молекулярной подвижности и пространственного строения лекарственных средств, понижающих уровень холестерина, в растворах и в комплексах с моделями клеточной мембраны современными методами Ядерного Магнитного Резонанса» (2014-2016 г.г.).
  • Министерство образования и науки РФ. Проектная часть бюджетного финансирования. Заявка № 1256. «Особенности пространственного строения модификаций антимикробных пептидов – протегринов в растворах и в комплексах с моделями клеточной мембраны» (2014-2016 г.г.).
  • РФФИ 16-33-60014 мол_а_дк. «Исследование пространственной структуры и механизмов образования стабильных комплексов статинов с моделями клеточной мембраны в растворе современными методами ЯМР спектроскопии» (2015-2017 г.г.) – Галиуллина Л.Ф.
  • РФФИ 16-34-60001 мол_а_дк. «Определение пространственной структуры белка инактивации рибосомы (HPF), бактерии Staphylococcus aureus методами спектроскопии ЯМР спектроскопии» (2015-2017 г.г.) – Усачев К.С.
  • Проект «Качественный и количественный состав нефти и нефтепродуктов по данным современных методов спектроскопии ЯМР» включен в САЕ «Нефть» (2016-2017 г.г.).
  • Проект «Конформации и пространственное строение (координаты атомов в формате pdb) лекарственных средств, в том числе и препаратов на протеиновой основе, в растворах и в комплексах с моделями мембраны клетки по данным современных методов спектроскопии ЯМР» включен в САЕ «Биомедицина» (2016-2017 г.г.)
  • Проект РНФ № 17-75-10124 "Исследование взаимодействия статинов с модельными клеточными мембранами методами современной ЯМР спектроскопии" (2017-2019 г.) - рук. Галиуллина Л.Ф.
  • Проект РНФ № 17-74- 20009 «Структурный и функционально-генетический анализ фактора элонгации EF-P и инициаторного комплекса патогенной бактерии Staphylococcus aureus» (2017-2020 г.) - рук. Усачев К.С.

Публикации сотрудников кафедры медицинской физики за  2016-17 г.:

  1. Galiullina, L.F., Interaction of different statins with model membranes by NMR data/Galiullina, L.F., Aganova, O.V., Latfullin, I.A., Musabirova, G.S., Aganov, A.V., Klochkov, V.V.// Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes. – 2017. – V. 1859, Issue 3. – P.295-300.
  2. Il'yasov, K. A., Validation of MRI-Based Fiber-Tracking Results / Il'yasov, K. A., Konopleva, L. V., Nedopekin, O. V. // APPLIED MAGNETIC RESONANCE. – 2017. – Т. 48, Вып. 3. – С.241-254.
  3. Rakhmatullin, I.Z. Stereodynamics of some pyridoxine derivatives studied by dynamic and 2D NOESY  1H NMR [text] /I.Z. Rakhmatullin, L.F. Galiullina, A.A. Balandina, M.R. Garipov, A.D. Strelnik, A.S. Galiullina, Y.G. Shtyrlin, V.V. Klochkov // Magnetic Resonance in Chemistry. – 2017. – V.55, Issue 4. – P. 304-311. IPP 1.537; ISSN: 07491581. DOI: 10.1002/mrc.4528
  4. Usachev, K.S. Oligomerization of the antimicrobial peptide Protegrin-5 in membrane mimicking environment. Structural studies by high-resolution NMR spectroscopy [text] / K.S. Usachev, O.A. Kolosova, E.A. Klochkova, A.R. Yulmetov, A.V. Aganov, V.V. Klochkov // European Biophysics Journal.- 2017.- V.46, Issue 3.- P.293-300. ISSN: 0175-7571.  DOI 10.1007/s00249-016-1167-5.
  5. Abdrakhmanov, R. NMR Studies of the Mn2+ Interactions with Amyloid Peptide Aβ13-23 in Water Environment [text] / R. Abdrakhmanov, D. Blokhin, K. Usachev, F. Karataeva, V. Klochkov // BioNanoScience. – 2017. – V. 7. – P. 204-206. ISSN: 2191-1630. DOI 10.1007/s12668-016-0317-7.
  6. Латфуллин, И.А. Статины и их взаимодействие с модельными клеточными мембранами по данным спектроскопии Ядерного Магнитного Резонанса [текст] / И.А. Латфуллин, Л.Ф. Галиуллина, Г.С. Мусабирова, О.В. Аганова, З.Ф. Ким, А.В. Аганов, В.В. Клочков // Рациональная Фармакотерапия в Кардиологии . – 2017. – Т. 13, N 2. – C.244-250 (Rational Pharmacotherapy in Cardiology.- 2017.- V.13, Issue 2.- P. 244-250. ISSN: 1819-6446.).
  7. Rakhmatullin, I.Z. Qualitative and quantitative analysis of oil samples extracted from some Bashkortostan and Tatarstan oilfields based on NMR spectroscopy data [text] /I.Z. Rakhmatullin, S.V. Efimov, B.Ya. Margulis, V.V. Klochkov// Journal of Petroleum Science and Engineering. – 2017. – V.156. – P.12-18. ISSN: 0920-4105.
  8. Efimov, S.V.  Detailed NOESY/T-ROESY Analysis as an Effective Method for Eliminating Spin-Diffusion in 2D NOE Spectra of Small Flexible Molecules [Text] / S.V. Efimov, I.A. Khodov, E.L. Ratkova, M.G. Kiselev, S. Berger, V.V. Klochkov // Journal of Molecular Structure. – 2016.- V. 1104. -  P. 63-69.   –ISSN: 00222860; IPP 1.549
  9. Рыжкин, С.А., Опыт использования различных методик одномоментной селективной катетеризации артерий при рентгеноэндоваскулярных вмешательствах с целью снижения лучевой нагрузки на пациентов / С.А. Рыжкин, Б.М. Шарафутдинов, М.К. Михайлов // Вестник рентгенологии и радиологии. – 2017. – Т. 98. – №1. – С. 30-35.
  10. До, Т.З. Влияние рентгеновского излучения на лактобациллы нормальной микрофлоры кишечника человека / До Тхи Зуен, Ж.С. Рычакова, С.А. Рыжкин и др. // Радиационная биология. Радиоэкология. – 2017. – Т.57. – №3. – С. 257-263.
  11. Игнатьев, И.М.  Кальцификация атеросклеротических бляшек и оценка их стабильности / Игнатьев И.М., Челышев Ю.А., Заночкин А.В., Гафуров М.Р., Орлинский С.Б., Мамин Г.В., Хайруллин Р.Н. //ЖУРНАЛ «АНГИОЛОГИЯ И СОСУДИСТАЯ ХИРУРГИЯ» 2017  - ТОМ 23,  №1. - Стр. 13-19
  12. Rakhmatullin, I.Z. Structural studies of pravastatin and simvastatin and their complexes with membrane-like objects by NMR spectroscopy [Text] / I.Z. Rakhmatullin, L.F. Galiullina, E.A. Klochkova, I.A. Latfullin, A.V. Aganov, V.V. Klochkov // Journal of Molecular Structure. – 2016.- V.1105. -  P. 25-29.   –ISSN: 00222860; IPP 1.549
  13. Rakhmatullin I.Z.  1H NMR Characterization of Two New Pyridoxine Derivatives /   I.Z. Rakhmatullin, L.F. Galiullina, M.R. Garipov, A.D. Strel'nik, Y.G. Shtyrlin, V.V. Klochkov //  BioNanoScience. – 2016. – V.6(3) – P. 243-245
  14. Aganova, O.V. Synthesis and NMR study of conformational structure and dynamics of the new quarternary phosphonium salts [Text] / O.V. Aganova, L.F. Galiullina, A.V. Aganov, N.V. Shtyrlin, M.V. Pugachev, A.D. Strel'nik, S.A. Koshkin, Yu.G. Shtyrlin, V.V. Klochkov // Magnetic Resonance in Chemistry. – 2016. – V. 54, Issue 6. – P. 320-327.  IPP 1.226; ISSN: 07491581
  15. Galiullina L.F. NMR study of conformational structure of fluvastatin and its complex with DPC micelles [Text] / Galiullina L.F., Aganova O.V., Latfullin I.A., Musabirova G.S., Aganov A.V., Klochkov V.V.// BioNanoScience. – 2016. – V. 6, N4 – P. 352-354. DOI 10.1007/s12668-016-0232-y
  16. Khodov, I.A. The Importance of Suppressing Spin Diffusion Effects in Determination of the Spatial Structure of a Flexible Molecule by Nuclear Overhauser Effect Spectroscopy [Text]  / I.A. Khodov, S.V. Efimov, M.G. Kiselev, V.V. Klochkov, L.A.E. Batista de Carvalho// Journal of Molecular Structure. – 2016.- V. 1106. -  P. 373-381.   –ISSN: 00222860; IPP 1.549
  17. Khodov, I.A. Document Erratum: The importance of suppressing spin diffusion effects in the accurate determination of the spatial structure of a flexible molecule by nuclear Overhauser effect spectroscopy (Journal of Molecular Structure (2016) 1106 (373-381)) [Text]  / I.A. Khodov, S.V. Efimov, M.G. Kiselev, L.A.E. Batista de Carvalho, V.V. Klochkov // Journal of Molecular Structure. – 2016.- V. 1113. -  P. 191-192.   –ISSN: 00222860; IPP 1.549
  18. Polshakov, V.I. NMR assignments of the N-terminal domain of Ogataea polymorpha telomerase reverse trans­criptase [Text] /V.I. Polshakov, O.A. Petrova, Yu.Yu. Parfenova, S.V. Efimov, V.V. Klochkov, M.I. Zvereva, O.A. Dontsova // Biomolecular NMR Assignments. – 2016.- V. 10, Issue 1. –P. 183-187.   IPP 0.475; ISSN:  1874-2718;  DOI:10.1007/s12104-015-9663-6
  19. Akhmadullin, R.M. Polyquinone synthesis by dehydrogenation agent 3,3ʹ,5,5ʹ-tetra-tert-butyl- 4,4ʹ-diphenoquinone. [Text] / .M. Akhmadullin, D.R. Gatiyatullin, A.G. Akhmadullina, L.V. Verizhnikov, N.A. Mukmeneva, A.R. Gazizov, L.R. Tagirov, V.V. Klochkov, B.V. Yavkin, S.B. Orlinskii, T.F. Nigmatullin // Res. J. Pharm. Biol. Chem. Sci.- 2016.-V. 7, Issue 2. – P. 577-585. ISSN: 09758585
  20. Khodov, I.A. Comment on “Conformational analysis of small organic molecules using NOE and RDC -methylene-γ-butyrolactone”  [Text] / I.A. Khodov, M.G. Kiselev, S.V. Efimov, V.V. Klochkov // Journal of Magnetic Resonance. – 2016. – V. 266. P. 67-68. http://dx.doi.org/10.1016/j.jmr.2016.02.009
  21. Mironov, Vladimir. Stereoselective PCO/POC-Rearrangement of P–C-Cage Phosphorane in the Reaction of 4,5-Dimethyl-2-(2-oxo-1,2-diphenyl)ethoxy-1,3,2-dioxaphospholane with Hexafluoroacetone [Text] /Mironov, Vladimir; Dimukhametov, Mudaris; Efimov, Sergey; Aminova, Roza; Karataeva, Farida; Krivolapov, Dmitry; Mironova, Ekaterina; Klochkov, Vladimir// Journal of Organic Chemistry.- 2016  -V 81, Issue 14.- P. 5837-5850.  ID: jo-2016-003563.R1
  22. Filippov A.V. Effect of curcumin on lateral diffusion in lipid bilayers [Text]  /Filippov A.V, Kotenkov S.A.,Munavirov B. V., Khaliullina A.V., Gnezdilov O.I., Antzutkin O.N. // Journal of Mendeleev Communications.- 2016.- v.26.- pp.109-110.
  23. Kolosova, Olga A.  Antimicrobial Peptide Protegrins Interact with DPC Micelles by Apolar Hydrophobic Cluster: Structural Studies by High-Resolution NMR Spectroscopy /Olga A. Kolosova, Konstantin S. Usachev, Albert V. Aganov, Vladimir V. Klochkov// BioNanoScience. – 2016. – V.6, N4.- P.317-319. DOI 10.1007/s12668-016-0218-9
  24. Davletbaeva, I.M.  Porous polyurethanes based on hyperbranched amino ethers of boric acid [text] / I. Davletbaeva, G. R. Nurgaliyeva, A. Akhmetshina, R. Davletbaev, A. A. Atlaskin, T. Sazanova, V. Klochkov, S. Efimov and I. V. Vorotyntsev//RSC Advances.- 2016.- V.6. P. 111109-111119.  DOI:  10.1039/C6RA21638B
  25. Nikitina, Liliya E.  Extraordinary Behavior of β-Hydroxy Sulfoxides and Sulfone of Pinane Series [text] / Liliya E. Nikitina, Olga A. Lodochnikova, Valeriya A. Startseva, Andrei V. Bodrov, Nadezhda P. Artemova, Alexander E. Klimovitskii, Vladimir V. Klochkov// Phosphorus, Sulfur, and Silicon and the Related Elements.- 2016.- http://dx.doi.org/10.1080/10426507.2016.1255619  - accept for publication
  26. Konkin, A. Light-induced X,W-band Electron Spin Resonance study of double-crystalline donor-acceptor P3HT-b-PPerAcr block copolymers in solid thin films / A. Konkin, C.R. Singh , S. Orlinskii , G. Mamin , A. Aganov , R. Lohwasser , U. Ritter , P. Scharff , M. Thelakkat , H. Hoppe // Synthetic Metals. – 2016. – V.215. – P. 251–259
  27. Gafurov, M. R. Study of the effects of hydroxyapatite nanocrystal codoping by pulsed electron paramagnetic resonance methods / M.R. Gafurov, T.B. Biktagirov, G.V. Mamin // PHYSICS OF THE SOLID STATE. - 2016. - Vol.58, Is.3. - P.469-474
  28. Galukhin, A.V. Mn-catalyzed oxydation of heavy oil in porous media: kinetics and some aspects of mechanism / A.V. Galukhin, M.A. Khelkhal, A.V. Gerasimov, T.B. Biktagirov, M.R Gafurov, A.A. Rodionov, S.B. Orlinskii // Energy and Fuels. - 2016. - V. 30. - P. 7731−7737
  29. Burlaka, A.P. Stomach Cancer: Interconnection between the Redox State, Activity of MMP-2, MMP-9 and Stage of Tumor Growth / A.P. Burlaka, I.I. Ganusevich, M.R. Gafurov //Cancer Microenvironment. - 2016. - Vol.9, Is.1. - P.27-32
  30. Salakhieva D. V.  Kinetic regulation of multi-ligand binding proteins [Text] /D.V. Salakhieva, I.I. Sadreev, Michael Z.Q. Chen, Y. Umezawa, A.I. Evstifeev, G.I. Welsh, N. V. Kotov // BMC Systems Biology. –2016. – V.10. –P. 32. – ISSN:17520509
  31. Gafurov, M. Connection Between the Carotid Plaque Instability and Paramagnetic Properties of the Intrinsic Mn2+ Ions / M. Gafurov, Y. Chelyshev, I. Ignatyev, A. Zanochkin, G. Mamin, K. Iskhakova, A. Kiiamov, F. Murzakhanov, S. Orlinskii // BioNanoSci. – 2016. – Vol.6. – P.558–560. DOI 10.1007/s12668-016-0274-1
  32. Burlaka, A. P. Electron Paramagnetic Resonance in the Experimental Oncology: Implementation Examples of the Conventional Approaches / A.P. Burlaka, M.R. Gafurov, K.B. Iskhakova, S.M. Lukin, A.A. Rodionov, E.P. Sidorik, A.V. Vovk // BioNanoSci. – 2016. – Vol.6. – P.431–436. DOI 10.1007/s12668-016-0238-5
  33. Litvinov, R. I. Characterization of the interactions of Arg-Gly-Asp- and Ala-Gly-Asp-Val-peptides with the platelet integrin αIIbβ3 [text] /R. I. Litvinov, O. Kononova, D. S. Blokhin, V. V. Klochkov, J. W. Weisel, V. Barsegov, J. S. Bennett // Blood .- 2016.- V.128, Issue 22. - P.1350. IPP 11,841.
  34. Suchkov, D. Attenuation of the Early Gamma Oscillations During the Sensory-Evoked Response in the Neonatal Rat Barrel Cortex / D. Suchkov, M. Sintsov,  L. Sharipzyanova, R. Khazipov // Bionanoscience. - 2016. - Vol. 6, Issue 4. - Р. 575–577 doi:10.1007/s12668-016-0289-7
  35. Гафуров, М.Р. Изучение эффектов содопирования нанокристаллов гидроксиапатита методами импульсного электронного парамагнитного резонанса / М.Р. Гафуров, Т.Б. Биктагиров, Г.В. Мамин, Д.В. Шуртакова, Е.С. Климашина, В.И. Путляев, С.Б. Орлинский // Физика твердого тела. - 2016. – T. 58, вып. 3. - C. 458-463
  36. Рыжкина, И.С. Особенности самоорганизации и свойств высокоразбавленных водных растворов полиоксидония / И.С. Рыжкина, С.Ю. Сергеева, Р.А. Сафиуллин, С.А. Рыжкин, А.Б. Маргулис, Л.И. Муртазина, А.П. Тимошева, А.В. Чернова, М.К. Кадиров, А.И. Коновалов / Известия РАН. Серия химическая. – 2016. – № 6. – С.1505-1513
  37. Sokurenko, Yulia  The Role of Metals in the Reaction Catalyzed by Metal-Ion-Independent Bacillary RNase [text] / Yulia Sokurenko, Vera Ulyanova, Pavel Zelenikhin, Alexey Kolpakov, Dmitriy Blokhin,  Dieter Müller, Vladimir Klochkov and Olga Ilinskaya //Bioinorganic Chemistry and Applications .- 2016.- V. 2016.- 7 pages.  Article ID 4121960, http://dx.doi.org/10.1155/2016/4121960.  IPP 1.488.