В настоящее время Этнографический музей является структурным подразделением Института международных отношений.

Музей располагается в своих исторических помещениях (к. 234-238 Главного здания КФУ по адресу Кремлевская, 18), площадь составляет 306 кв.м. Музей оборудован специально разработанными  для музея проф. Б. Ф. Адлером авторскими шкафами и витринами (первая четверть XX вв.), учитывающими специфику экспонатов и залов.

Этнографический музей обладает уникальным экспозиционно-выставочным пространством, характерным для музеев классических университетов и академических сообществ Западной Европы (Оксфорд, Кембридж).  В музее реконструирован экспозиционный принцип проф. Ф. Ратцеля (отсутствие этикетажа, панорамность). Экспонирование осуществляется в соответствии с региональными и монографическими материалами. В этнографическом музее сохранено профильно-предметное назначение музейных помещений по образцу второй половины XIX в. (экспозиционные залы, фондохранилище открытого типа на хорах, музейный лекторий). Большинство экспозиций восстановлены силами сотрудников музея по фотографиям и зарисовкам первой четверти XX в.

На сегодняшний день коллекции Этнографического музея служат ценным материалом для написания научно-исследовательских работ. Музейные экспонаты являются постоянным объектом исследования, что выражается в ряде публикаций в виде тезисов, докладов, статей и монографий, как российских, так  и зарубежных специалистов. Большая часть коллекций Этнографического музея  экспонируется и используется в учебном процессе как наглядно-методический материал (для иллюстрации курсов «Этнологии», «Этнографии народов Волго - Уралья», «Визуальная антропология», «История религий», «Культурология» и др. специализированных дисциплин). В музейном лектории регулярно проводятся лекционные и практические занятия со студентами, слушающими этнографические и музееведческие курсы, а также специальные дисциплины.

Этнографический  музей ежегодно выступает в качестве специализированной базы практики студентов Казанского университета и других вузов по профилю (музейные и  этнографические).

Этнографический музей является участником совместных межмузейных выставок   («Сокровища музеев Казанского университета»), участвует в социальных программах Казанского университета («Казанский университет – детям-сиротам»), занимается пропагандой культурного наследия в СМИ (сотрудничал с телерадиокомпанией «Новый век» в рамках создания представительского фильма об Институте Конфуция на базе Казанского университета), курирует проведение  городских олимпиад по этнографическому музееведению. Сотрудниками Этнографического музея Казанского университета была разработана и апробирована образовательная программа лекций-визуализаций на основе музейных экспонатов  и согласованной с образовательными программами средней школы для учеников 5-11 классов.

Этнографический музей Казанского университета является ассоциированным членом Союза музеев России и включен в перечень «Уникальные объекты системы образования Российской Федерации». В 2009г. Этнографический музей Казанского университета включен в реестр музеев-участников тренингов ЮНЕСКО-СНГ. Сотрудники Этнографического музея являются действительными членами целого ряда научных сообществ: Ассоциации этнографов и антропологов России Института этнологии и антропологии РАН, Российского союза краеведов. Регулярно сотрудники музея проходят специализированные стажировки и курсы повышения квалификации.