НИЛ "Междисциплинарных инновационных и научно-практических археологических и этнологических исследований"
НИЛ "Этническая история"
НИЛ "Электронные исторические ресурсы"
НИЛ "Археографическая лаборатория"
НИЛ "Государственно-конфессиональные и межконфессиональные отношения: отечественный и зарубежный опыт"
НИЛ "Историографическая компаративистика"
НИЛ "Ситуационный центр мониторинга глобальной и региональной безопасности"