Лаборатория оснащена системой пробоподготовки, позволяющей измельчать образцы различного происхождения (клетки грибных и бактериальных изолятов, почвы, отходы, биопрепараты, растения) гомогенизировать и получать лизаты образцов в процессе экстракции нуклеиновых кислот. Также проводится постановка полимеразной цепной реакции (ПЦР) как обычной, так и в реальном времени (ПЦР-РВ).
ПЦР используется для амплификации специфических участков ДНК, выделенных из микробных сообществ почвы или из чистых культур изолятов, это ключевой этап для последующих методов анализа, включая, клонирование и секвенирование.
После амплификации производится оценка концентрации ПЦР-фрагментов и контроль качества выделенных нуклеиновых кислот, разделение ПЦР-продуктов и очистка целевых фрагментов ДНК методом гель-электрофореза, визуализация, анализ и документирование результатов.
В лаборатории также осуществляется количественная оценка целевых микроорганизмов методом ПЦР в реальном времени в образцах окружающей среды с высокой точностью и специфичностью. Имеющееся оборудование решает задачи мониторинга динамики микробных сообществ, детекции патогенных микроорганизмов и оценки эффективности биотехнологических процессов в реальном времени.
Оборудование:
- Гомогенизатор механический для работы с матриксами FastPrep-24 (MP Biomedicals)
- Термоциклер Bio-Rad MyCycler Thermal с комплект (Bio-Rad, США)
- Амплификатор CFX96 Real-Time PCR
- Комплекс для оценки результатов ПЦР, включающий камеру для горизонтального электрофореза Wide Mini-Sub Cell GT (Bio-Rad, США), а также систему гель-документирования Gel Doc XR+ (Bio-Rad, США)
- ПЦР-бокс UVT-S-AR Cleaner DNA для стерильных работ с УФ-рециркулятором (Biosan, Латвия)
- Бокс ламинарный SafeFAST Elite 215 S (PT Fajar Mas Murni, Индонезия)