Штаб гражданской обороны и чрезвычайных ситуаций (штаб ГОиЧС) уполномочен решать задачи гражданской обороны, а также  по предупреждению и ликвидации последствий чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера. Штаб является обслуживающим подразделением и подчиняется заместителю директора по общим вопросам.

Основные задачи и функции штаба ГОиЧС:

     - планирование и контроль выполнения мероприятий по переводу института с мирного на военное положение и мероприятий по защите служащих и студентов института от возможных ЧС природного и техногенного характера; 

      - участие в разработке и осуществлении мероприятий, направленных на повышение устойчивости функционирования института  в ЧС мирного и военного времени; 

    - планирование, организация подготовки и обучения руководящего состава, формирований ГО, служащих и студентов университета действиям в ЧС мирного и военного времени; 

    - оказание методической помощи руководителям учебных групп в проведении занятий и тренировок по ГО; 

    - разработка и осуществление мер, направленных на сохранность объектов института, необходимых для устойчивого функционирования и выживания студентов, сотрудников и профессорско-преподавательского состава в военное время.