Затем следуют амфибии и рептилии. Количество земноводных в музее относительно невелико. Очень интересны протеи, саламандры, амбистомы и другие амфибии.

Большое научное значение имеет чучело самого примитивного современного пресмыкающегося - гаттерии, которую нередко называют живым ископаемым третичного периода. Из ящериц выделяются гекконы, вараны, круглоголовки. Рядом можно увидеть различные виды змей, - от слепуна и питонов до морских змей и гремучников.

Отряд черепах также представлен достаточно разнообразно, от тропических морских черепах до самой северной болотной черепахи, ареал которой доходит до Татарстана. Впечатляют чучела крокодилов из всех трёх семейств - от миссисипского аллигатора до гангского гавиала.