Регуляторная транскриптомика для оценки потенциала модификации генома и изучения регенерации в животноводстве

Проект выполняется в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий. Соглашение от 04.10.2021 № 075-15-2021-1344

Руководитель – Олег Гусев

Срок исполнения: 2021-2023


Проблема:

Геномы 3278 видов животных расшифрованы, но лишь для 2% из них доступна детальная аннотация генома. 99% генома представлены некодирующими участками. Нет установленной связи вариантов в некодирующих участках с фенотипами (включая полезные свойства или заболевания).


Задачи:

1.Птицеводство. Идентификация маркерных генов, выявление маркеров для выявления полезных свойств пород кур.

2.Рыбоводство. Транскриптомный анализ регуляторных сетей связанных с эффектом ускорения развития у лягушек и рыб.

3.Регенерация. Изучение регенерации у иглистых мышей. Транскриптомное профилирование.

4.Поведение. scRNAseq-профилирование гипоталамуса животных с различным уровнем агрессии.

5.Животноводство. Создание генетических панелей для отбора животных с заданными признаками.