В ИТИС действуют четыре кафедры:

Кафедра программной инженерии (зав. кафедрой - Ирина Голицына);

Кафедра интеллектуальной робототехники (зав. кафедрой - Евгений Магид);

Кафедра цифровой аналитики и технологий искусственного интеллекта (зав.кафедрой - Александр Тощев);

Кафедра индустрии разработки видеоигр (зав. кафедрой -  Влада Кугуракова).