Взаимодействие НОЦ с РАО направлено на научную поддержку процессов саморазвития и самоорганизации образовательных организаций – участников сетевого взаимодействия. В условиях научно-образовательной сети в основу этих процессов был положен функциональный и системно-деятельностный подходы, обеспечивающие рациональное распределение задач между участниками взаимодействия.

В системе ведется самодиагностика и внешняя экспертиза профессиональных оснований деятельности участников взаимодействия, разработаны и апробированы критериальные комплексы, позволяющие рассматривать процесс изменений, проводимых в образовательных организациях – участниках взаимодействия как инновационный процесс.

Взаимодействие выражается в проводимых совместно с РАО научно-практических конференций, семинаров, в проведении сетевых исследований с университетами Приволжского федерального округа.