Занятия по физической культуре проходят в большом спортивном зале. Кроме того, на базе IT-лицея функционируют 2 спортивные площадки, где проводятся занятия в теплое время года. В зимнее время года проводятся занятия по лыжному спорту.

Также в лицее есть тренажерный зал, где в вечернее проводятся кружки по физической подготовке.