В настоящее время кафедра проводит исследования по трем основным научным направлениям:

Направление Биотехнологии в сельском хозяйстве и экологии включает: изучение возможности применения перспективных почвенных мелиорантов - пироуглей - для решения различных сельскохозяйственных (долговременного улучшения плодородия почв) и экологических задач, в том числе и на решение фундаментальной проблемы современной экологии – сокращения эмиссии парниковых газов из почв в атмосферу. Проводится изучение физических и химических свойств пироуглей, оценка их устойчивости в естественных условиях, исследование влияния лабильной органической фракции пироуглей на биохимические показатели почвы.

В рамках данного направления также ведется разработка новых приемов позволяющих регулировать содержание и состав пула свободных почвенных аминокислот, как дополнительного источника азотного питания растений, а так же с целью обеспечения растений ненитратными формами азота, что позволит получить экологически чистую и безопасную продукцию.

Направление Экологический мониторинг почв включает: анализ влияния педогенных, геоморфометрических и антропогенных факторов на пространственное распределение органических и минеральных поллютантов в почвах; разработку методов определение влияния загрязняющих веществ на почвы  и геостатических моделей их пространственного распределения; почвенно-экологический анализ данных дистанционного зондирования Земли.

Направление Сельское и лесное хозяйство включает исследование целинных, пахотных и залежных почв лесостепи в аспекте оценке пространственной неоднородности вторичной аккумуляции гумуса в залежных почвах и разработки методических основ прогнозирования трансформации вторично накопленного гумуса под влиянием антропогенного воздействия и вклада залежных почв в секвестрацию атмосферного углерода.

В рамках данного направления также ведется разработка новых подходов к оценке вариабельности основных агрохимических свойств пахотных угодий для обеспечения рационального внедрения технологий точного земледелия с применением современных ГИС технологий.