Центр превосходства в области стратиграфии и палегеореконструкции:
НИЛ Палеоклиматологии, палеоэкологии и палеомагнетизма
НИЛ Стратиграфии нефтегазоносных резервуаров
НИЛ Фазового анализа геоматериалов
НИЛ Биоконтроль
Центр превосходства в области новых технологий добычи высоковзякой нефти и битумов:
Центр превосходства в области моделирования разработки залежей углеводородов:
НИЛ Междисциплинарная многофункциональная лаборатория «3D GEO Center»
НИЛ Механики грунтов
НИЛ Рентгеновской и компьютерной томографии
Учебно-научная гидрогеохимическая лаборатория
Центра превосходства в области разработки катализаторов для нефтепереработки и нефтехимии:
НИЛ Сорбционных и каталитических процессов
НИЛ Новые катализаторы для нефтехимии