Преподаватели кафедры ежегодно проходят курсы повышения квалификации: на ФПК КФУ, ИБФМ, г. Пущино, Санкт-Петербургский технологический Институт, Центр тестирования процессов образования при МГУП, г. Москва.
В 2007 г. профессором О.Н.Ильинской разработан и проведен на базе биолого-почвенного факультета КГУ двухнедельный (72 аудиторных часа) курс повышения квалификации преподавателей и научных сотрудников «Актуальные проблемы современной биологии». В повышении квалификации приняли участие 26 человек из различных городов Поволжского региона.
В 2009 г. проведен цикл образовательных лекций в области современной биологии для сотрудников кафедры микробиологии и научных лабораторий силами приглашенных коллег партнерского университета г. Гиссена, Германия:
В 2010 г. молодые специалисты кафедры ст. преп. Яруллина Д.Р., и асс. Григорьева Т.В. прошли курс повышения квалификации по программе «Основы коммерциализации технологий», (программа FAST TRAC, обучающие программы и тренинги «Искусство убедительной презентации перед инвестором», «Продвижение инноваций» и др.), проводимого Центром предпринимательства США–Россия. Ст. преп.. кафедры Яруллина Д.Р. прошла курс повышения квалификации по программе «Менеджмент в образовании в ходе модернизации высшего профессионального образования», КФУ. Организована аттестация сотрудников кафедры в области безопасности работы в лаборатории. Проведен обучающий курс делопроизводства (О.П.Лаврентьева).
В 2010 г. в рамках мероприятий, посвященных году Франций в России проведена лекция «Источники новых эпидемических заболеваний» профессора Франсуа Родена (Института Пастера, г. Париж, Франция).
В 2011 г. цикл лекций прочитан приглашенными зарубежными профессорами
«Регуляция биосинтеза ферментов бацилл» (проф. К. Харвуд, университет Нью-Касла, Англия)
«Технологии биоремедиации» (Проф. Д. Мюллер, Технологический университет Гамбурга)
В 2012 г. проведен цикл образовательных лекций для сотрудников и студентов кафедры микробиологии и научных лабораторий силами приглашенных коллег из США и Германии:
В 2015 г. сотрудники кафедры (зав.каф. О.Н.Ильинская, доц. А.М. Марданова, доц. Д.Р. Яруллина, доц. Г.Ю. Яковлева, н.с. М.А. Харитонова) прошли курс повышения квалификации по программе «Бактериология» (576 часов) в ГБОУ ДПО КГМА Минздрава России. По окончании обучения были получены дипломы о профессиональной переподготовке, предоставляющий право на ведение профессиональной деятельности в сфере «Бактериология».