Кафедра сотрудничает с более, чем с 70 российскими организациями:
- институтами РАН
Мурманский морской биологический институт (г. Мурманск)
Зоологический институт (г. Санкт-Петербург)
Институт проблем эволюции и экологии им. А.Н.Северцова (г. Москва)
- ведомственными НИИ
Полярный НИИ морского рыбного хозяйства и океанографии (г. Мурманск)
Атлантический НИИ рыбного хозяйства и океанографии (г. Калининград)
Сахалинский НИИ морского рыбного хозяйства и океанографии
(г. Южно-Сахалинск)
(г. Москва)
Магаданский НИИ морского рыбного хозяйства и океанографии (г. Магадан)
Чукотский НИИ морского рыбного хозяйства и океанографии (г. Анадырь)
Татарское отделение ГосНИОРХ (г.Казань)
Институт проблем экологии и недропользования АНТ (г.Казань)
- классическими университетами
Санкт-Петербургский государственный университет
Московский государственный университет им М.В.Ломоносова
Нижегородский государственный университет
- заповедниками
Северо-Осетинский государственный природный заповедник
Волжско-Камский государственный природный биосферный заповедник
Национальный парк «Нижняя Кама»
ГУЗ «Республиканская клиническая больница» МЗ РТ (патологоанатомическое отделение, цитологическая лаборатория, г.Казань), управлениями по РТ Росприроднадзора, Россельхознадзора, Роспотребнадзора (Санэпидемстанция), Средневолжрыбвода, структурами Министерства экологии и природных ресурсов РТ, Министерства сельского хозяйства РТ и Министерства лесного хозяйства РТ, станциями защиты растений,
Среди зарубежных организаций-партнеров:
Окаямский университет (Япония)
Хирошимский университет (Япония)
Национальный институт агробиологии (Япония)
Институт прибрежных исследований Клайпедского университета (Литва)
Гиссенский университет им. Юстуса Либиха (Германия)
Мюнстерский университет имени Вильгельма II (Германия)
Институт полярных и морских исследований им. А.Вегенера (Германия)
Колледж наук о жизни и технологии Синьцзянского университета (Китай)
Национальный автономный университет Мексики (Мексика)