В микрофлоре кишечника ученые обнаружили новые виды бактерий

Международная группа китайских и датских ученых обнаружила свыше 500 новых видов обитающих в кишечнике микроорганизмов и 800 новых бактериальных вирусов, способных их атаковать. Это открытие может привести к появлению новых средств борьбы с супербактериями.

Большой международной группе ученых их Китая, Дании, Великобритании, Германии, Франции и Саудовской Аравии удалось секвенировать геном 238 бактерий, обитающих в кишечнике человека. С помощью собственной методики анализа последовательностей ДНК исследователи почти удвоили число известных видов, обитающих в кишечнике – 75% видов оказались новыми. По словам авторов, вполне возможно, что их исследование поможет в лечении сахарного диабета 2-го типа, астмы и ожирения.

Сложность определения этих микроорганизмов состоит в том, что многие из них не растут в культуре. А именно на выращивании в культуре и основаны многие методы определения их видовой принадлежности. До настоящего времени для определения состава микробиоты использовался подход, когда секвенировался геном бактерий и сравнивался с базой данных уже известных микроорганизмов. Поэтому геном бактерий, которые не могли вырастить в культуре, было просто невозможно определить.

Новый же подход, который был разработан авторами нынешнего исследования, предполагает больше количественный анализ.

«Используя этот подход, теперь можно определять и вносить в базу данных геном неизвестных раньше микроорганизмов даже в очень сложно организованных микробных сообществах», - говорит один из авторов исследования профессор Сорен Брунак (Søren Brunak) из Копенгагенского университета.

Исследователи также отмечают, что их работа имеет большую важность в связи с тем, что количество бактерий, способных оказывать сопротивление воздействию антибиотиков, постоянно растет. Ученые говорят, что начинали исследование с целью поиска новых методов лечения заболеваний, однако позднее сосредоточились на борьбе с супербактериями, поскольку эта проблема стремительно набрала остроту.

Статья с описанием микробиома кишечника и взаимоотношений между бактериями и вирусами опубликована в последнем номере журнала Nature Biotechnology.