Цикл лекций ведущих ученых для студентов и аспирантов КФУ
2016 год
15, 16, 17, 19 декабря
Лектор: Серебрийский Илья Генрихович, доктор химических наук, Руководитель НИЛ «Молекулярные основы патогенеза опухолевых заболеваний». PhD Assistant Professor (h-index-21), Fox Chase Cancer Center– FCCC, США
Лекции будут проходить в актовом зале восточного корпуса главного здания (026 ауд)
Пожалуйста, приходите заранее, чтобы не отвлекать лектора.
Приглашенные слушатели – пожалуйста, позаботьтесь о пропуске в ГЗ заранее!
Приглашаются все желающие!
15 декабря
Место и время: 10.00, актовый зал восточного крыла главного здания КФУ (026 ауд.)
Тема: Системная биология: проблемы и перспективы
Этапы становления системной биологии. Свойства биологических систем. Омиксные технологии - основные источники информации в системной биологии. Построение моделей – важнейшая задача системной биологии. Подходы для описания метаболических и биохимических путей на глобальном уровне. Модели отдельных процессов, модели организмов, первая модель живой клетки.
16 декабря
Место и время: 10.00, актовый зал восточного крыла главного здания КФУ (026 ауд.)
Тема лекции: Сети взаимодействий
В лекции будут освещены топологические характеристики сети: случайная, без масштабная, иерархическая сеть. Параметры сети: коэффициент кластеризации, промежуточная центральность, связность окружения. Построение и визуализация сетей.
17 декабря
Тема лекции: "Топология сетей"
Место и время: 15.30 в ауд.117В (восточное крыло главного здания КФУ)
Практическое занятие по построению сетей взаимодействий
Место и время: в 17.00 в ауд.116В (восточное крыло главного здания КФУ)
Cytoscape. Знакомство с интерфейсом. Популярные плагины. Интеграция анализов из R в Cytoscape. Использование онлайн-инструментов. GeneMania, String DB, GAM
19 декабря
Место и время: 10.00, актовый зал восточного крыла главного здания КФУ (026 ауд.)
Тема лекции: Интерактомика
В лекции будет представлен обзор экспериментальных методов изучения белок-белковых взаимодействий. Будут рассмотрены биохимические методы: химическое сшивание, совместное фракционирование в процессе хроматографии, ко-иммунопреципитация. Высокоэффективные и высокопроизводительные экспериментальные методы, такие как дрожжевой двугибридный анализ, фаговый дисплей, аффинная очистка в тандеме с масс - спектрометрией. Экспрессия генов в клетках дрожжей. Доменная структура дрожжевого активатора транскрипции Gal4. Модель дрожжевой двухгибридной системы. Элементы дрожжевой двугибридной системы. Репортерные гены, используемые в дрожжевой двугибридной системе. Схема скрининга библиотеки кДНК для поиска белков, взаимодействующих с заданным белком Х. Проверка специфичности взаимодействия в двугибридной системе.
20 декабря
Место и время: 10.00, актовый зал восточного крыла главного здания КФУ (026 ауд.)
Тема лекции: Вклад системной биологии в развитие молекулярной медицины
В лекции будут обсуждены основные вопросы и задачи молекулярной медицины: построение глобальных сетей генетических взаимодействий; идентификация биомаркеров заболеваний на основе изучения и моделирования биохимических путей и путей передачи сигнала; идентификация генов, изменения которых приводят к заболеваниям. Знакомство с базами данных. Общедоступные ресурсы. Cell miner. cBioPortal: исследование одного гена, исследование нескольких генов
Январь-2017
ВЕДУЩИЕ МИРОВЫЕ ШКОЛЫ – СТУДЕНТАМ КФУ
Приглашаются все желающие!
Лекции будут проходить в актовом зале восточного корпуса главного здания университета;
Начало лекций: 10.00;
«Структура и функции мембран» (3 лекции) доцент кафедры биохимии и молекулярной биологии Медицинской Школы Центра Наук о Здоровье Университета Техас - Хьюстон (США), к.б.н. Богданов М. В.
В цикле лекций будут освещены вопросы гидрофобного эффекта и мембранные структуры: почему мембраны? Амфипатические молекулы. Детергенты, мицеллы и визикулы. Взаимодействие Белок-SDS. Взаимодействие между белками и неденатурированными детергентами. Липиды: структура, функции и физиологическое значение. Липидная ассиметрия в бактериальных мембранях: содержание и физиологическое значение. Структура белка мембраны. Понимание фолдинга, вставки и транслокации мембранных белков. Липидо-белковые взаимодействия. Липидные ассоциации и комплексы белков с мембраной.
Январь-2017
«Lipid-assisted Membrane Protein Folding: Implications to Membrane-Linked Protein Folding Disorders» (2 лекции) - доцент кафедры биохимии и молекулярной биологии Медицинской Школы Центра Наук о Здоровье Университета Техас - Хьюстон (США) к.б.н. Богданов М. В
В цикле лекций будут освещены вопросы основанные на открытиях авторами первого молекулярного шаперона небелкового происхождения (lipochaperone) и его применение.
Март-2017
«Введение в структурную биологию макромолекулярных комплексов клетки и механизм биосинтеза белка» Руководитель лаборатории «Ribosome structure and function», Department of Integrated Structural Biology IGBMC, Страсбург, Франция, почетный доктор КФУ Юсупов М.М.
В цикле лекций будут освещены вопросы крио-электронной микроскопии и рентгеноструктурного анализа в качестве основных методов структурного изучения механизма синтеза белка системы клетки.
Биохимические подходы к выделению больших комплексов нуклеиновых кислот с белками и характеристика качества их структуры. Кристаллизация рибосомы и ее функциональных комплексов для рентгеноструктурного анализа. Крио-электронная микроскопия рибосомальных комплексов. Сравнение структуры рибосом прокариот и эукариот.
Механизм синтеза белка, инициирование, елонгация, терминация и ре-циклинг. Механизм декодирования матричной РНК. Механизм образования пептидной связи. Механизм транслокации. Структурная основа механизма ингибирования системы синтеза белка и разработка антибактериальных, фунгицидных и противоопухолевых препаратов.
Апрель-2017
«Введение в сравнительную и функциональную геномику»
Заместитель директора по науке Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича РАН, профессор Сколковского института науки и технологий, факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ, факультета компьютерных наук Высшей школы экономики, д.х.н. Гельфанд М.С.
В цикле лекций будут освещены вопросы:
1.Функциональная аннотация геномов: задачи, методы и примеры
2.Эволюция регуляторных взаимодействий у бактерий.
Открытый научный кружок: NSG модель (ассистент Козлова Ольга)
Открытый научный кружок: Data mining (ассистент Козлова Ольга)
Май-2017
«Современные представления о цитоскелете: миротрубочки и микрофиламенты» Профессор кафедры клеточной биологии и гистологии МГУ, д.б.н. Воробьев И. А. (3-5 лекций)
В цикле лекций будут освещены вопросы динамики микротрубочек и клеточная подвижность. Общие проблемы апоптоза. Методические разработки: многоцветная проточная цитометрия с визуализацией, сортировка клеток; прижизненная высокопроизводительная микроскопия.