1. Грант ФЦП № 14.581.21.0024. Разработка и внедрение комплекса технологических решений точного внесения удобрений и биологических средств защиты растений для перехода к высокопродуктивному и экологически чистому производству. Руководитель проекта – Селивановская С.Ю. Объем финансирования – 250 000 000 руб.

2.  Грант РНФ № 17-74-20183. Изменения пула генов сообществ микроорганизмов при нефтяных загрязнениях почв. 2017-2019 гг. Руководитель проекта - Галицкая П.Ю. Объем финансирования - 15 000 000 руб.

Проект направлен на получение новых знаний о роли горизонтального трансфера генов в формировании свойств микробных сообществ почв при их загрязнении нефтепродуктами. В рамках проекта будет осуществлено лабораторное моделирования процесса загрязнения почв и в динамике проведена оценка агрохимических характеристик, содержания нефтепродуктов, структуры микробного сообщества, количества копий генов бактериальных 16S и грибных 18S рРНК, анализ экспрессии генов, обеспечивающих процесс горизонального трансфера, для выявления наличия горизонтального трансфера генов, кодирующих синтез углеводород-окисляющих ферментов. 
Будут проведены полевые исследования сообществ углеводородокисляющих микроорганизмов почв; выбраны репрезентативные площадки на участках с различными типами почв, попарно - с наличием и отсутствием нефтяного загрязнения. В них будут проанализированы те же параметры, что и в лабораторном эксперименте. 
На основании полученных результатов будет создана база данных генов, кодирующих синтез углеводород-окисляющих ферментов, в почвах разных типов, а также установлена зависимость распространенности этих генов от почвенных характеристик. 
На основании сопоставления результатов, полученных для загрязненных и незагрязненных почвенных образцов, будет выявлен преимущественный механизм ответной реакции почвенных микроорганизмов на поступление в почву углеводородов. Будет сделан вывод о большей или меньшей распространенности указанных механизмов в почвах разных типов.

3. Грант РФФИ №16-04-00443 А. Свойства антибиотикорезистентности микробных сообществ почв, обрабатываемых навозами. 2016-2018 гг. Руководитель проекта - Галицкая П.Ю. Объем финансирования - 1 485 000 руб.

Проект направлен на изучение влияния антибиотика тетрациклина, применяемого в животноводстве и вносимого в почву в составе удобрений, получаемых из навоза, на структуру, функционирование и антибиотикорезистентность микробного сообщества почвы. В ходе проекта будет реализовано четыре направления исследований, позволяющих в совокупности получить системное представление о поведении и влиянии антибиотиков на почвенные микробоценозы: первое будет направлено оценку загрязненности навозов разных типов генами антибиотикорезистентности, второе - на изучение механизмов поведения препарата антибиотика в почве – его трансформации и влияния на почвенную микрофлору и агрохимические характеристики почв. В рамках третьего направления будут проанализированы особенности процессов компостирования навоза в присутствии тетрациклина: будут охарактеризованы процессы компостирования чистого навоза и навоза с антибиотиком, определены механизмы формирования сообщества под влиянием антибиотиков, определен метагеном микробного сообщества, осуществляющего процесс трансформации органического вещества. Четвертое направление будет связано с рассмотрением взаимного влияния микробного сообществ компоста и аборигенного сообщества почвы, влияния компостов (навозов) с антибиотиками на качество почв, возможности процессов переноса генов антибиотикорезистентности.

4. Грант УМНИК № 0033549. Разработка биопрепарата, стимулирующего развитие фунгицидных свойств у компостов. Руководитель проекта - Курынцева П.А. Объем финансирования - 500 000 руб.

5. Грант Fulbright на стажировку П.Ю. Галицкой в Университете Беркли. Объем финансирования - 21 500 $.

6. Грант РФФИ № 18-29-25054 мк. Применение биочара для управления микробиологическими сообществами в процессе переработки отхода птицеводства, содержащего антибиотики, с целью улучшения удобрительных свойств продукта и снижения риска распространения антибиотикорезистентности. 2018-2020 гг. Руководитель проекта - Галицкая П.Ю. Объем финансирования - 18 000 000 руб.

Отсутствие безопасных и эффективных методов утилизации куриного помета, особенно такого, который содержит антибиотики и гены устойчивости к ним, является серьезной экологической проблемой. Несмотря на перспективность применения компостирования для этих целей, имеется ряд технологических сложностей: отсутствие доступных структурирующих агентов, нестабильность процессов микробной трансформации органических соединений, неэффективное удаление антибиотиков и генов устойчивости.
В рамках данного проекта предлагается использование биочара на основе куриного помета для повышения эффективности компостирования куриного помета. В процессе компостирования будут выявлены пути трансформации антибиотиков и генов устойчивости, а также факторы, влияющие на такую трансформацию. Будут оценены изменения в структуре и функционировании микробных сообществ компоста, и предложен механизм этих изменений. Полученные знания лягут в основу способа управления микробными сообществами компостов с целью получения продуктов с высокими удобрительными свойствами и не загрязненных антибиотиками и генами устойчивости к ним.